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cAMP-vermittelte Regulation von onkogenen Kinasekaskaden

cAMP-mediated regulation of proliferative kinase circuits

Eduard Stefan (ORCID: 0000-0003-3650-4713)
  • Grant-DOI 10.55776/P32960
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.02.2020
  • Projektende 31.07.2024
  • Bewilligungssumme 398.349 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (75%); Chemie (25%)

Keywords

    Gpcr, Melanoma, Phosphorylation, Scaffold, Kinase, Camp

Abstract Endbericht

Es ist seit langem bekannt, dass das evolutionär konservierte second-messenger Molekül cAMP die Zellproliferation zelltypspezifisch entweder verstärkt oder reduziert. Daran beteiligt sind zum einen die cAMP-abhängige Kinase PKA und zum anderen deren Gerüstproteine, die involvierte Kinasefunktionen koordinieren. Die Auswirkung von cAMP Mobilisierung auf RAF-Kinasefunktionen wurde schon dokumentiert. Diesbezüglich ist es von Interesse, dass eine Reihe von BRAF-Krebsmutationen beschrieben wurden, die die Kinase vom vorgeschalteten Regulator RAS entkoppeln. Klinisch angewandte BRAF-Inhibitoren reduzieren das Wachstum von malignen Melanomen. Ihr therapeutischer Nutzen bei Melanompatienten ist jedoch nur temporär. Wir vermuten, dass die Gerüstproteine für die beschriebenen Kinasen das Zusammenspiel von RAF- und PKA-Aktivitäten koordinieren. Die Aktivierung von sogenannten cAMP-Kompartimenten oder Nanodomänen in der Nähe von mutiertem RAF könnte der pathologischen Kinasefunktion entgegenwirken. Zuerst charakterisieren wir makromolekulare und zellspezifische RAF:PKA-Komplexe. Zweitens wollen wir den Einfluss der reziproken Kinaseaktivierung auf die metabolischen und pathologischen RAF Downstream-Signale bestimmen. Drittens planen wir, cAMP-verlinkte Signalwege pharmakologisch zu modulieren, um die pathologische BRAF-Signalübertragung in Melanomzelllinien zu reduzieren.

Unsere Forschung konzentrierte sich auf zwei zentrale Signalmoleküle, PKA und RAF, die sowohl bei physiologischen als auch bei pathologischen Signalübertragungen eine entscheidende Rolle spielen. Wir identifizierten neue physiologische und funktionelle Interaktionen dieser Kinasen und erklärten Kinase-Crosstalk, was unser Verständnis der zellulären Regulation dieser zentralen Signalknoten erweiterte. Darüber hinaus untersuchten wir die molekularen Mechanismen des RAF-Target-Engagements in Krebszellmodellen und zeigten mutationsspezifische Effekte, insbesondere bei BRAF. Diese Erkenntnisse unserer Grundlagenforschung sind bedeutsam für die Entwicklung zielgerichteter Therapien und liefern Einblicke in die Wirkungsweise molekulare Schalter die bei Krebs dereguliert sind. Wir haben die zentralen Ergebnisse dieses Projektes veröffentlicht. Wir identifizierten neue PKA-Interaktionen, insbesondere mit GPR161 und TAF15, und erweiterten unser Wissen über kompartimentierte PKA-Komplexe. In der Folge untersuchten wir die Rolle von PKA bei der Regulierung von Ziliensignalwegen und der Rückkopplungskontrolle der Gpr161-Gs-PKA-Achse in der Hedgehog-Signalweiterleitung (PNAS 2016, Nat Struct Mol Biol 2024, EMBO 2021, Development 2021, Cells 2020). Wir enthüllten, dass TAF15 ein nukleares PKA-Substrat ist und Phosphotrylierung RNA-Bindungsdynamiken beeinflußt (CMLS 2024). Im Kontext der BRAF-Signalübertragung untersuchten wir neue Mechanismen der RAF-Aktivierung und -Regulation bei Krebs (Sci Adv 2019, PNAS 2020, eLife 2024). Unsere Forschung untersuchte die Auswirkungen von RAF-Mutationen auf die MAPK-Signaldynamik und lieferte Einblicke in die Krebsentwicklung und potenzielle therapeutische Ziele (Biomolecules 2021, Cell Cyst 2022, PNAS Nexus 2023). Zudem konnten wir u.a. die Auswirkung von Kinsasefunktionen auf Mitochondrienaktivitäten untersuchen (Cancers 2022, Bionerg. comm. 2022). Diese Erkenntnisse haben unser Verständnis der Kinaseregulation sowohl in normalen als auch in pathologischen Kontexten verbessert und eröffnen neue Wege für zielgerichtete Therapien bei Krankheiten wie Krebs aber auch neurodegenerativen Störungen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Ronald Micura, Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Silvio J. Gutkind, University of California San Diego - Vereinigte Staaten von Amerika
  • George Baillie, University of Glasgow - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 266 Zitationen
  • 28 Publikationen
  • 2 Datasets & Models
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2020
    Titel KinCon: Cell-based recording of full-length kinase conformations
    DOI 10.1002/iub.2241
    Typ Journal Article
    Autor Enzler F
    Journal IUBMB Life
    Seiten 1168-1174
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Hedgehog and Gpr161: Regulating cAMP Signaling in the Primary Cilium
    DOI 10.3390/cells9010118
    Typ Journal Article
    Autor Tschaikner P
    Journal Cells
    Seiten 118
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Kinases in motion: impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations
    DOI 10.1101/2024.01.11.575270
    Typ Preprint
    Autor Kugler V
    Seiten 2024.01.11.575270
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations
    DOI 10.7554/elife.94755
    Typ Journal Article
    Autor Kugler V
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Phosphorylation of the compartmentalized PKA substrate TAF15 regulates RNA–protein interactions
    DOI 10.1007/s00018-024-05204-4
    Typ Journal Article
    Autor Feichtner A
    Journal Cellular and Molecular Life Sciences
    Seiten 162
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Enhanced TROSY Effect in [2-19F, 2-13C] Adenosine and ATP Analogs Facilitates NMR Spectroscopy of Very Large Biological RNAs in Solution
    DOI 10.1002/ange.202316273
    Typ Journal Article
    Autor Juen F
    Journal Angewandte Chemie
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Enhanced TROSY Effect in [2-19F, 2-13C] Adenosine and ATP Analogs Facilitates NMR Spectroscopy of Very Large Biological RNAs in Solution
    DOI 10.1002/anie.202316273
    Typ Journal Article
    Autor Juen F
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The TBC1D31/praja2 complex controls primary ciliogenesis through PKA-directed OFD1 ubiquitylation
    DOI 10.15252/embj.2020106503
    Typ Journal Article
    Autor Senatore E
    Journal The EMBO Journal
    Link Publikation
  • 2021
    Titel mTORC2 controls the activity of PKC and Akt by phosphorylating a conserved TOR interaction motif
    DOI 10.1126/scisignal.abe4509
    Typ Journal Article
    Autor Baffi T
    Journal Science Signaling
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Allosteric Kinase Inhibitors Reshape MEK1 Kinase Activity Conformations in Cells and In Silico
    DOI 10.3390/biom11040518
    Typ Journal Article
    Autor Fleischmann J
    Journal Biomolecules
    Seiten 518
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Resistor: an algorithm for predicting resistance mutations using Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures
    DOI 10.1101/2022.01.18.476733
    Typ Preprint
    Autor Guerin N
    Seiten 2022.01.18.476733
    Link Publikation
  • 2025
    Titel CDK6 kinase inhibition unmasks metabolic dependencies in BCR::ABL1+ leukemia
    DOI 10.1038/s41419-025-07434-1
    Typ Journal Article
    Autor Scheiblecker L
    Journal Cell Death & Disease
    Seiten 107
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Characterization and Inhibition of deregulated kinase signaling hubs
    Typ PhD Thesis
    Autor Andreas Feichtner
  • 2024
    Titel Cdk6’s functions are critically regulated by its unique C-terminus
    DOI 10.1016/j.isci.2024.111697
    Typ Journal Article
    Autor Schirripa A
    Journal iScience
    Seiten 111697
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations
    DOI 10.7554/elife.94755.3
    Typ Journal Article
    Autor Kugler V
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Mutation-oriented profiling of autoinhibitory kinase conformations predicts RAF inhibitor efficacies
    DOI 10.1073/pnas.2012150117
    Typ Journal Article
    Autor Mayrhofer J
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 31105-31113
    Link Publikation
  • 2020
    Titel SATB2-LEMD2 interaction links nuclear shape plasticity to regulation of cognition-related genes
    DOI 10.15252/embj.2019103701
    Typ Journal Article
    Autor Feurle P
    Journal The EMBO Journal
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Resistor: An algorithm for predicting resistance mutations via Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures
    DOI 10.1016/j.cels.2022.09.003
    Typ Journal Article
    Autor Guerin N
    Journal Cell Systems
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM-F3 domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function
    DOI 10.1101/2022.12.11.519953
    Typ Preprint
    Autor Moesslacher C
    Seiten 2022.12.11.519953
    Link Publikation
  • 2022
    Titel DISRUPTOR: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein interactions
    DOI 10.1101/2022.11.02.514903
    Typ Preprint
    Autor Kugler V
    Seiten 2022.11.02.514903
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Kinase perturbations redirect mitochondrial function in cancer
    DOI 10.26124/bec:2022-0013
    Typ Journal Article
    Autor Torres-Quesada O
    Journal Bioenergetics communications
    Seiten 17
  • 2022
    Titel Physiological Cell Culture Media Tune Mitochondrial Bioenergetics and Drug Sensitivity in Cancer Cell Models
    DOI 10.3390/cancers14163917
    Typ Journal Article
    Autor Torres-Quesada O
    Journal Cancers
    Seiten 3917
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Tracking and blocking interdependencies of cellular BRAF-MEK oncokinase activities
    DOI 10.1093/pnasnexus/pgad185
    Typ Journal Article
    Autor Fleischmann J
    Journal PNAS Nexus
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function
    DOI 10.26508/lsa.202302043
    Typ Journal Article
    Autor Moesslacher C
    Journal Life Science Alliance
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Disruptor: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein-protein and protein-DNA interactions
    DOI 10.1038/s42003-023-05089-2
    Typ Journal Article
    Autor Kugler V
    Journal Communications Biology
    Seiten 720
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Tracking mutation and drug-driven alterations of oncokinase conformations
    DOI 10.1007/s12254-021-00790-6
    Typ Journal Article
    Autor Feichtner A
    Journal memo - Magazine of European Medical Oncology
    Seiten 137-142
    Link Publikation
  • 2025
    Titel A Catalytically Inactive Protein Kinase C alpha Mutation Drives Chordoid Glioma by Pathway Rewiring
    DOI 10.1101/2025.05.30.657104
    Typ Preprint
    Autor Bellamy C
    Seiten 2025.05.30.657104
    Link Publikation
  • 2024
    Titel A mutation in the PRKAR1B gene drives pathological mechanisms of neurodegeneration across species
    DOI 10.1093/brain/awae154
    Typ Journal Article
    Autor Benjamin-Zukerman T
    Journal Brain
    Seiten 3890-3905
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2024 Link
    Titel Kinases in motion: impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations
    DOI 10.5281/zenodo.12073536
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2023 Link
    Titel Tracking and blocking interdependencies of cellular BRAF-MEK oncokinase activities
    DOI 10.5281/zenodo.8017900
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Weitere Förderungen
  • 2020
    Titel cAMP-mediated regulation of proliferative kinase circuits
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2020

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