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Zähmung des IL-1 Signalweges durch mRNA-Abbau

Taming IL-1 signaling by mRNA decay

Pavel Kovarik (ORCID: 0000-0003-2956-0944)
  • Grant-DOI 10.55776/P33000
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2020
  • Projektende 31.12.2022
  • Bewilligungssumme 362.324 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (70%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (30%)

Keywords

    Mrna Decay, Mrna-Associated Proteom, IL-1, RNA-binding protein, Immune Homeostasis

Abstract Endbericht

Die Abwehr von mikrobiellen Krankheitserregern erfordert eine angemessene Aktivierung der Immunantwort und wirksame Bremsen, um die Reaktion zu deaktivieren, sobald der Krankheitserreger besiegt ist. Die Aktivierung des Immunsystems erfolgt durch Proteine, die als Zytokine bezeichnet werden. Zytokine werden von Zellen sekretiert, die den Erreger als erste detektieren. Die Zytokine der IL-1-Familie sind außerordentlich starke Aktivatoren der Immunantwort. IL-1-Zytokine können zur Überstimulation des Immunsystems führen und so schwere Gewebe- oder Organschäden verursachen. Dysregulierte IL-1-Produktion ist an einer Reihe vonErkrankungen beteiligt, darunter chronische Entzündungen, Neurodegeneration und Krebs. Um solche schädlichen Wirkungen zu vermeiden, unterliegt die Produktion von IL-1-Zytokinen einer strengen mehrschichtigen Kontrolle. Die Mehrzahl der neueren Studien konzentrierte sich auf die IL-1-Regulation durch Proteinverarbeitung und -sekretion, während über die Rolle des Abbaus von IL-1-mRNA wenig bekannt ist. Der mRNA-Abbau ist ein grundlegender Mechanismus der regulierten Genexpression und stellt eine wichtige Bremse dar, die die Aktivierung des Immunsystems stoppt. Es bleibt jedoch unklar, ob und wie sich der Abbau von IL-1-mRNA auf die Immunantwort und den gesamten Organismus auswirkt. Das vorgeschlagene Projekt wird Antworten auf diese wichtigen Fragen liefern, indem innovative biochemische Ansätze mit Immunbiologie kombiniert werden. Das Projekt befasst sich mit dem mRNA-bindenden Protein Tristetraprolin (TTP), das den Abbau vieler mRNAs fördert, die während einer Immunantwort induziert werden. Folglich hat TTP robuste entzündungshemmende Eigenschaften und ist ein wesentlicher Dämpfer der Immunantwort. Wir haben klare Beweise dafür erhalten, dass TTP für den Abbau von IL-1-mRNA wichtig ist und dass dieser Abbau für die Gesundheit wesentlich ist. Interessanterweise ist diese lebenswichtige Funktion von TTP zelltypabhängig, da IL-1-mRNA nur in einer Untergruppe von Immunzellen durch TTP abgebaut wird. Das Hauptziel des Forschungsprojekts ist es, molekulare Mechanismen zu identifizieren, wie TTP IL-1-mRNA destabilisiert und wie dies zelltypspezifisch erreicht wird. Das Projekt wird unter Einsatz von Proteomics wichtige Proteine charakterisieren, die zusammen mit TTP den Abbau von IL-1-mRNA steuern. Die Projektergebnisse werden mechanistische und funktionelle Einblicke in die IL-1-Regulation durch mRNA-Abbau liefern. Die Ergebnisse werden therapeutische Auswirkungen auf IL-1- abhängige Krankheiten haben.

Interleukin 1 alpha (IL-1alpha) und Interleukin 1 beta (IL-1beta) sind Signalmoleküle, die Entzündungsreaktionen und Immunität auf Infektionen regulieren. Sie binden an denselben Rezeptor und wurden früher für redundant gehalten. IL-1beta und IL-1beta sind bei Säugetieren hoch konserviert, haben aber nur geringe Ähnlichkeit miteinander. Angesichts der Tatsache, dass sie an denselben Rezeptor binden, und auf der Grundlage früherer Studien wurde angenommen, dass sie ähnliche Funktionen haben. Das Forschungsprojekt zeigte, dass IL-1alpha und IL-1beta gewebespezifische Expressionsmuster aufweisen und unterschiedliche Funktionen bei der Abwehr von bakteriellen Infektionen haben. Während IL-1beta die Beseitigung von Bakterien und damit die Resistenz fördert, unterstützt IL-1alpha die Wirtsabwehr und sorgt für Toleranz gegenüber Infektionen. Sowohl Resistenz als auch Toleranz sind für eine erfolgreiche Abwehr von Infektionen unerlässlich. Die Projektergebnisse haben weitreichende Bedeutung, da bei den Experimenten zwei Infektionsmodelle verwendet wurden: eine Hautinfektion mit Streptococcus pyogenes und eine Lungeninfektion mit Streptococcus pneumoniae. Beide Bakterien sind wichtige Infektionserreger beim Menschen. Eine detaillierte Analyse ergab, dass IL-1beta für die Förderung der Produktion von neutrophilen Granulozyten, d. h. von Leukozyten, die an der Beseitigung des Erregers maßgeblich beteiligt sind, von wesentlicher Bedeutung ist. IL-1alpha hingegen ist für diesen Prozess entbehrlich, sorgt aber für die Feinabstimmung der Immunantwort in der Leber, die bekanntlich ein zentraler Knotenpunkt für Stoffwechselprozesse ist. Folgerichtig zeigten die Daten, dass IL-1alpha die Stoffwechselwege der Leber während der Infektion umprogrammiert. Die Projektergebnisse haben das Bewusstsein für die Bedeutung der IL-1alpha- und IL-1beta-Regulierung weiter gestärkt. Unzureichende oder überhöhte Spiegel dieser beiden Zytokine können Krankheiten verursachen. Die Produktion von IL-1alpha und IL-1beta wird auf mehreren Ebenen reguliert, unter anderem durch Transkription und Proteinverarbeitung. Das Projekt entdeckte eine neue Art der IL-1alpha- und IL-1beta-Regulierung, nämlich die Regulierung auf der Ebene der Stabilität der mRNAs für diese Zytokine. Das Projekt erbrachte den Nachweis, dass die mRNAs für IL-1alpha und IL-1beta durch das mRNA-destabilisierende Protein TTP gesteuert werden. Der durch TTP vermittelte Abbau der mRNAs für IL-1alpha und IL-1beta ist für die Aufrechterhaltung der Immunhomöostase von entscheidender Bedeutung, und eine Störung dieses Abbaus führt zu schweren Entzündungszuständen in verschiedenen Organen. Die Projektergebnisse bereichern unser Wissen über Prozesse, die für eine präzise Ausbalancierung der Aktivität des Immunsystems verantwortlich sind.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Martin Turner, Biotechnology and Biological Sciences Research Council - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 105 Zitationen
  • 8 Publikationen
  • 2 Policies
  • 3 Methoden & Materialien
  • 2 Datasets & Models
  • 4 Disseminationen
  • 8 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2021
    Titel Conceptual Advances in Control of Inflammation by the RNA-Binding Protein Tristetraprolin
    DOI 10.3389/fimmu.2021.751313
    Typ Journal Article
    Autor Kovarik P
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 751313
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The ubiquitin ligase HOIL-1L regulates immune responses by interacting with linear ubiquitin chains
    DOI 10.1016/j.isci.2021.103241
    Typ Journal Article
    Autor Gomez-Diaz C
    Journal iScience
    Seiten 103241
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Context-Dependent IL-1 mRNA-Destabilization by TTP Prevents Dysregulation of Immune Homeostasis Under Steady State Conditions
    DOI 10.3389/fimmu.2020.01398
    Typ Journal Article
    Autor Sneezum L
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 1398
    Link Publikation
  • 2022
    Titel HUWE1 controls tristetraprolin proteasomal degradation by regulating its phosphorylation
    DOI 10.1101/2022.08.29.505645
    Typ Preprint
    Autor Scinicariello S
    Seiten 2022.08.29.505645
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Stress signaling boosts interferon-induced gene transcription in macrophages
    DOI 10.1126/scisignal.abq5389
    Typ Journal Article
    Autor Boccuni L
    Journal Science Signaling
  • 2023
    Titel HUWE1 controls tristetraprolin proteasomal degradation by regulating its phosphorylation.
    DOI 10.7554/elife.83159
    Typ Journal Article
    Autor Scinicariello S
    Journal eLife
  • 2022
    Titel Nonredundancy of IL-1a and IL-1ß is defined by distinct regulation of tissues orchestrating resistance versus tolerance to infection
    DOI 10.1126/sciadv.abj7293
    Typ Journal Article
    Autor Eislmayr K
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Dysregulated NADPH Oxidase Promotes Bone Damage in Murine Model of Autoinflammatory Osteomyelitis.
    DOI 10.4049/jimmunol.1900953
    Typ Journal Article
    Autor Kralova J
    Journal Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
    Seiten 1607-1620
Policies
  • 2023 Link
    Titel development of doctoral programs
    Typ Participation in a guidance/advisory committee
    Link Link
  • 2023
    Titel development of doctoral programs
    Typ Participation in a guidance/advisory committee
Methoden & Materialien
  • 2022 Link
    Titel mouse model for assessment of functions of the cytokines Il-1alpha and Il-1beta
    Typ Model of mechanisms or symptoms - mammalian in vivo
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Mouse model providing evidence of the critical role mRNA stability of the Il1a and Il1b genes in immune homeostasis
    Typ Model of mechanisms or symptoms - mammalian in vivo
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2016 Link
    Titel TTP atlas - web interface for finding all mapped TTP binding sites in the macrophage transcriptome
    Typ Improvements to research infrastructure
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Datasets & Models
  • 2022 Link
    Titel RNA-seq, mouse liver and spleen, Il1a KO and Il1b KO, S.pyogenes infection model
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel RNA-seq, effects of TTP/mRNA decay in DCs
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 2020
    Titel Interview for Ö1 about the Nobel prize laureate Emmanuelle Charpentier
    Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press)
  • 2021
    Titel discussion with the delegation of the International Vaccine Institute
    Typ A formal working group, expert panel or dialogue
  • 2020 Link
    Titel SARS-CoV-2/Covid-19 web page of the Max Perutz Labs: https://www.maxperutzlabs.ac.at/vcdi
    Typ Engagement focused website, blog or social media channel
    Link Link
  • 2023
    Titel Interview for the newspaper "Die Presse" about the importance of internationality in research
    Typ A magazine, newsletter or online publication
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2022
    Titel Lecture at InCheck doctoral school kickoff meeting
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel review editor for Frontiers in Immunology
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel talk "Non-redundancy of IL-1α and IL-1β is defined by distinct regulation of tissues orchestrating tolerance versus resistance to infection"
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel spokesperson of the Max Perutz Labs
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Förderungstipendium
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2019
    Titel talk "IL-1 cytokines in Streptococcus pyogenes infection: new view of known players"
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Elected international member to the Academic senate of the Czech Academy of Sciences
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2015
    Titel ANR immunology panel member
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2022
    Titel Distinct functions of IL-1a versus IL-1ß in host defense
    Typ Other
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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