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Regeln für ESCRT-III Assemblierung auf Organellen

Organelle specific rules for the self-assembly of ESCRT-III

David Teis (ORCID: 0000-0002-8181-0253)
  • Grant-DOI 10.55776/P34907
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2021
  • Projektende 30.06.2025
  • Bewilligungssumme 403.148 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    ESCRT, Endosome, Plasma Membrane, Nuclear Envelop

Abstract Endbericht

Eukaryotischen Zellen benutzen molekulare Maschinen für die Biogenese ihrer Organellen. Einer der faszinierendsten molekularen Maschinen, die Membrane verformen kann und somit für Form und Funktion von Organellen verantwortlich ist, ist die sogenannte endosomal sorting complexes required for transport (ESCRT) Maschine. Die Bestandteile der ESCRT Maschine sind gut bekannt. Außerdem ist mittlerweile gut beschrieben dass die ESCRT Maschine transient an unterschiedlichsten Membrane assembliert, wie zum Beispiel an der Plasma Membran, an den Membrane des endo-lysosomalen Kompartiments, sowie an der inneren Membran des Zellkerns. Interessanterweise übt die ESCRT Maschine an diese Organellen spezifische Funktionen aus, die im Grunde alle mit Membran-Verformungen assoziiert sind. Wie genau die ESCRT Maschine diese unterschiedlichen Prozesse katalysiert ist nicht klar. In diesem Antrag gehen wir genau dieser Frage nach und planen die Assemblierung der ESCRT Maschine an der Plasma Membrane, an Endosomen und an der inneren Kern-Membran im molekularen Detail zu charakterisieren. Um diese Frage in lebenden Zellen zu beantworten werden wir neue molekulare Werkzeuge entwickeln. Dazu verwenden wir eine Kombination aus genetischen, biochemischen und bildgebenden Verfahren in Bäckerhefe (S. cerevisiae) und Spalthefe (S. japonicus), die dazu als die am besten geeigneten Modelsysteme herangezogen werden. Wir erwarten, dass die Resultate dieses Forschungs-Projekts, es erlauben werden, ein molekulares Regel-Werk für die Assemblierung von der ESCRT Maschine auf unterschiedlichen Organellen zu definieren. Im weiteren Sinne werden wir dadurch bessere Einblicke in die Prozesse erhalten, die für die Entstehung, die Funktion, und die Reparatur von Organellen verantwortlich sind. Damit werden wir die molekularen Mechanismen besser verstehen, die für Architektur von eukaryotischen Zellen verantwortlich sind.

Eukaryotische Zellen nutzen molekulare Maschinen für die Biogenese ihrer Organellen. Eine der faszinierendsten dieser Maschinen ist der endosomal sorting complex required for transport (ESCRT), der Membranen verformen kann und somit entscheidend für Form und Funktion von Organellen ist. Die Bestandteile der ESCRT-Maschine sind inzwischen gut charakterisiert. Ebenso ist beschrieben, dass ESCRT transient an sehr unterschiedlichen Membranen assembliert, etwa an der Plasmamembran, an Membranen des endo-lysosomalen Kompartiments sowie an der inneren Kernmembran. Interessanterweise erfüllt ESCRT an diesen Organellen jeweils spezifische Funktionen, die jedoch alle mit Membranverformungen verknüpft sind. Wie genau die ESCRT-Maschine diese unterschiedlichen Prozesse katalysiert, ist bislang unklar. In diesem Antrag gehen wir dieser Frage nach, indem wir die Assemblierung der ESCRT-Maschine an der Plasmamembran und an Endosomen im molekularen Detail charakterisieren. Um dies in lebenden Zellen zu untersuchen, haben wir neue molekulare Werkzeuge entwickelt und nutzen eine Kombination genetischer, biochemischer und bildgebender Verfahren in Saccharomyces cerevisiae, das hierfür das am besten geeignete Modellsystem darstellt. Unsere Daten zeigen, dass ESCRT-Komplexe an Endosomen und an der gestressten Plasmamembran zwar auf denselben intermolekularen Interaktionen beruhen, aber dennoch unterschiedlich arbeiten: An Endosomen sind die Komplexe kleiner und weniger dynamisch, um intraluminale Vesikel zu bilden. An der Plasmamembran hingegen sind sie größer und dynamischer und spielen eine zentrale Rolle bei der Reaktion auf Schwankungen im Sphingolipid-Haushalt sowie bei der Verhinderung von Membranschäden. Damit konnten wir ein molekulares Regelwerk für die Assemblierung der ESCRT-Maschine an verschiedenen Organellen definieren. Im weiteren Sinne liefern unsere Ergebnisse neue Einblicke in die Prozesse, die Entstehung, Funktion und Reparatur von Organellen steuern, und tragen so zum besseren Verständnis der molekularen Mechanismen bei, die die Architektur eukaryotischer Zellen bestimmen.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Innsbruck - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Lukas A. Huber, Medizinische Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Taras Stasyk, Medizinische Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Snezhana Oliferenko, Francis Crick Institute - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 6 Publikationen
  • 3 Methoden & Materialien
  • 3 Datasets & Models
  • 2 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Lipid juggling: Any1 scrambles membranes for endosome biogenesis
    DOI 10.1083/jcb.202502158
    Typ Journal Article
    Autor Schwabl S
    Journal Journal of Cell Biology
  • 2024
    Titel The Dsc complex and its role in Golgi quality control.
    DOI 10.1042/bst20230375
    Typ Journal Article
    Autor Teis D
    Journal Biochemical Society transactions
    Seiten 2023-2034
  • 2024
    Titel The Dsc ubiquitin ligase complex identifies transmembrane degrons to degrade orphaned proteins at the Golgi
    DOI 10.1101/2024.03.11.584465
    Typ Preprint
    Autor Schwabl S
  • 2024
    Titel The structure of the Orm2-containing serine palmitoyltransferase complex reveals distinct inhibitory potentials of yeast Orm proteins
    DOI 10.1101/2024.01.30.577963
    Typ Preprint
    Autor Körner C
  • 2024
    Titel Functional characterization of a novel post-ER associated degradation system
    Typ PhD Thesis
    Autor Yannick Weyer
  • 2024
    Titel The Dsc ubiquitin ligase complex identifies transmembrane degrons to degrade orphaned proteins at the Golgi.
    DOI 10.1038/s41467-024-53676-6
    Typ Journal Article
    Autor Schwabl Si
    Journal Nature communications
    Seiten 9257
Methoden & Materialien
  • 2024
    Titel yeast strains
    Typ Cell line
    Öffentlich zugänglich
  • 2021
    Titel Fatty acid uptake assay
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
  • 0
    Titel Fluorescence correlation spectroscopy (FCS) on organelle specific ESCRT assemblies
    Typ Technology assay or reagent
Datasets & Models
  • 2024 Link
    Titel Molecular Dynamics Simulation_1 from: The Dsc ubiquitin ligase complex identifies transmembrane degrons to degrade orphaned proteins at the Golgi (doi: 10.1038/s41467-024-53676-6)
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel Molecular Dynamics Simulation_2 from: The Dsc ubiquitin ligase complex identifies transmembrane degrons to degrade orphaned proteins at the Golgi (doi: 10.1038/s41467-024-53676-6)
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel Proteome data from: The Dsc ubiquitin ligase complex identifies transmembrane degrons to degrade orphaned proteins at the Golgi (https://doi.org/10.1038/s41467-024-53676-6)
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 2022
    Titel I participated in the Open Lab Day at the Medical University of Innsbruck
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2023
    Titel Lange Nacht der Forschung
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2024
    Titel ESCRT meeting
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2023
    Titel Organelle proteostasis in cellular quiescence and growth
    Typ Research grant (including intramural programme)
    DOI 10.55776/fg20
    Förderbeginn 2023
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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