Die Dynamiken von Umwelt-DNA in subtropischen Wasserlöchern
The dynamics of environmental DNA in subtropical waterholes
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (95%); Chemie (5%)
Keywords
-
Edna,
Mammals,
Metabarcoding,
Waterholes,
Camera Trapping,
Biodiversity Monitoring
Die Menschheit verändert derzeit in einem noch nie dagewesenen Ausmaß Ökosysteme weltweit. Aufgrund menschlicher Einflüsse verändern Tier- und Pflanzenarten ihre Verbreitung drastisch und ganze Arten sterben in alarmierendem Tempo aus. Um diesen Auswirkungen entgegenzuwirken, brauchen wir effiziente Biomonitoring-Methoden. Mithilfe solcher Methoden wird ermittelt, welche Arten in einem bestimmten Lebensraum oder Gebiet vorkommen. Beispiele hierfür sind Kamerafallen (für Landsäugetiere) oder Elektrofischen (für Fische). In den letzten zwei Jahrzehnten hat sich die Nutzung von Umwelt-DNA (oder eDNA) zu einem neuen, leistungsstarken Instrument für solche Erhebungen entwickelt. Umwelt-DNA ist genetisches Material, das jeder Organismus in die Umwelt abgibt, z. B. durch verlorene Haare, Schuppen oder Hautzellen oder durch Körperausscheidungen. Diese DNA bleibt eine Zeit lang in der Umwelt, bis sie zerfällt. Davor kann die eDNA aus z. B. Wasser, Boden oder Luft gewonnen und für genetische Analysen verwendet werden, um zu ermitteln, welche Arten sich in der Umgebung aufgehalten haben. Die meisten Forschungsarbeiten an und mit eDNA haben sich auf aquatische Systeme und auf Fische konzentriert. Für diese ist am besten bekannt, wie lange eDNA in der Umwelt verbleibt, bevor sie nicht mehr nachweisbar ist. eDNA könnte jedoch auch ein hervorragendes Instrument für das Biomonitoring in anderen Systemen sein, z. B. für das Monitoring von Säugetieren in afrikanischen Savannen. In diesen sehr trockenen Lebensräumen müssen Säugetiere regelmäßig Wasserlöcher zum Trinken aufsuchen. Beim Trinken oder Baden in diesen geben sie ihre DNA in das Wasser ab, die für eine eDNA-basierte Überwachung genutzt werden könnte. Derzeit ist jedoch nur sehr wenig darüber bekannt, wie viel DNA von Landsäugern in das Wasser abgegeben wird, wenn sie mit dem Wasser interagieren (z.B. durch Trinken, Durchqueren oder Suhlen), und wie schnell diese DNA in Wasserlöchern abgebaut wird bis sie nicht mehr nachweisbar ist. In diesem Projekt wird untersucht, wie viel DNA von Landsäugetieren bei bestimmten Interaktionen (Trinken, Durchqueren, Suhlen oder Koten) ins Wasser abgegeben wird und wie lange diese DNA in subtropischen Wasserlöchern nachweisbar ist. Dabei wird auch der Einfluss bestimmter Umweltfaktoren (wie UV-Strahlung, pH-Wert oder bakterielle Aktivität) auf den eDNA-Abbau untersucht. Schließlich wird in einer Feldstudie eDNA-basierten Biomonitorings südafrikanischer Säugetiere mit dem Monitoring durch Kamerafallen an Wasserlöchern verglichen. Wir werden untersuchen, ob das eDNA-basierte Monitoring Säugetierarten mit höherer Empfindlichkeit und Effizienz nachweisen kann und wie lange nach dem Besuch eines Tieres am Wasserloch dieses anhand der aus Wasserproben extrahierten eDNA nachgewiesen werden kann. Wenn sich diese Methode in diesen subtropischen Systemen als effektiv erweist, könnte sie in großem Maßstab für die Überwachung von Landsäugetieren im südlichen Afrika eingesetzt werden.
- Universität Graz - 100%
- Gareth Mann, Panthera - Südafrika
- Monica Mwale, South African National Biodiversity Institute (SANBI) - Südafrika
Research Output
- 8 Publikationen
- 5 Datasets & Models
- 4 Disseminationen
- 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2024
Titel eDNA State and Medium Affect DNA Degradation Patterns in Seminatural Systems of Southern African Waterholes DOI 10.1002/edn3.70025 Typ Journal Article Autor Schenekar T Journal Environmental DNA -
2024
Titel Environmental DNA shedding rates reveal defecation as a major source of terrestrial mammal eDNA in surface water bodies DOI 10.22541/au.172540804.47307984/v1 Typ Preprint Autor Sauseng G -
2024
Titel Optimizing waterborne eDNA capture from waterholes in savanna systems under remote field conditions. DOI 10.1111/1755-0998.13942 Typ Journal Article Autor Baxter J Journal Molecular ecology resources -
2025
Titel The promise of environmental RNA research beyond mRNA DOI 10.32942/x2kw64 Typ Preprint Autor Ahi E -
2025
Titel The Promise of Environmental RNA Research Beyond mRNA Typ Journal Article Autor Ahi Ep Journal Molecular Ecology Seiten 1-17 Link Publikation -
2023
Titel Applying molecular genetic data at different scales to support conservation assessment of European Habitats Directive listed species: A case study of Eurasian otter in Austria. DOI 10.1111/eva.13597 Typ Journal Article Autor Schenekar T Journal Evolutionary applications Seiten 1735-1752 -
2023
Titel Arterfassungen mittels Umwelt-DNA (eDNA) und die Bedeutung digitaler Sequenzinformationen für die Biodiversitätsforschung Typ Journal Article Autor Schenekar T Journal Natur und Landschaft Seiten 283-289 Link Publikation -
2023
Titel Tracking with eDNA: The development of a Taqman qPCR assay for the Blesbok (Damaliscus pygargus phillipsi) and its application on environmental samples gathered from a waterhole in a savanna system. Master's Thesis Typ Other Autor Sedlmayr Link Publikation
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2023
Link
Titel Lutra lutra microsatellite dataset DOI 10.1111/eva.13597 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2025
Link
Titel qPCR dataset eDNA shedding rates Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel qPCR dataset mesocosm experiments DOI 10.1002/edn3.70025 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel Metabarcoding data work flow optimization Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel DNA quantification and quality assessment dataset Protocol optimization DOI 10.1111/1755-0998.13942 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2022
Titel Biodiversity assessments using environmental DNA - Part I Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2023
Titel Biodiversity assessments using environmental DNA - Part II Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2024
Link
Titel Conservation Genomics Workshop Typ Participation in an activity, workshop or similar Link Link -
2024
Titel Kinderuni Typ Participation in an open day or visit at my research institution
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2025
Titel Research Visit Nikol Kmentova UHasselt Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel Tamara Schenekar as a guest speaker at eDNA mini symposium at RBINS/ Brussels/Belgium Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International