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Detektion neu entstehender infektiöser Lungenkrankheiten

Emerging Infectious Lung Disease Monitor

Georg Langs (ORCID: 0000-0002-5536-6873)
  • Grant-DOI 10.55776/P35189
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.10.2021
  • Projektende 30.09.2026
  • Bewilligungssumme 391.671 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Informatik (60%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (40%)

Keywords

    Machine Learning, Medical Imaging, Lung Disease, Computed Tomography

Abstract

Die weltweite Ausbreitung von COVID-19 führte zu einer globalen Gesundheitskrise, die deutlich gemacht hat, dass wir Methoden benötigen um eine Epidemie oder Pandemie früher zu erkennen, und die Krankheit bei Patienten rascher zu diagnostizieren. Wir benötigen Techniken um rasch von ersten Fällen zu lernen und damit Patienten eine optimale und oft individuelle - Behandlung zuordnen zu können. Die Lungenbildgebung spielte zunächst bei der Diagnose, und im weiteren Verlauf bei der Prognose eine wichtige Rolle. Das Projekt ist eine enge interdisziplinäre Zusammenarbeit zwischen Experten für maschinelles Lernen und Radiologie. Das Projekt wird basierend auf Lungenbilddaten neue Methoden im Bereich des maschinellen Lernens und der Bildanalyse entwickeln, um diesen Herausforderungen zu begegnen. Es wird Methoden zur Erkennung von Anomalien untersuchen und weiterentwickeln und Techniken zur Identifizierung neu auftretender Phänotypen in der Patientenpopulation erstellen. Die Modelle werden auf Bilddaten und klinischen Informationen von Patienten basieren, und der Herausforderung begegnen noch nicht bekannte Marker zu identifizieren. Das zweite Hauptziel besteht darin, Modelle zu entwickeln, die den Verlauf einzelner Patienten während ihrer Krankheit und Genesung vorhersagen können, um eine optimale individuelle Behandlung zu ermöglichen. Hier besteht die Herausforderung darin, aus realen Alltagsdaten zu lernen, die in der Frühphase einer Pandemie gesammelt werden, während noch keine Behandlungsrichtlinien verfügbar sind. Das Projekt ist in ein Netzwerk internationaler Kollaborationen eingebettet, die die Validierung der neuen Methoden ermöglichen werden.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Helmut Prosch, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Lucian Beer, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Ulrike Attenberger, Universitätsklinikum Bonn - Deutschland
  • Evis Sala, Policlinico Universitario Agostino Gemelli - Italien
  • Carola Bibiane Schönlieb, University of Cambridge - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 149 Zitationen
  • 13 Publikationen
Publikationen
  • 2022
    Titel Spatio-temporal motion correction and iterative reconstruction of in-utero fetal fMRI
    DOI 10.48550/arxiv.2209.08272
    Typ Preprint
    Autor Taymourtash A
  • 2022
    Titel Fetal Brain Tissue Annotation and Segmentation Challenge Results
    DOI 10.48550/arxiv.2204.09573
    Typ Preprint
    Autor Payette K
  • 2022
    Titel Motion correction and volumetric reconstruction for fetal functional magnetic resonance imaging data
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2022.119213
    Typ Journal Article
    Autor Sobotka D
    Journal NeuroImage
    Seiten 119213
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Impact of a content-based image retrieval system on the interpretation of chest CTs of patients with diffuse parenchymal lung disease
    DOI 10.1007/s00330-022-08973-3
    Typ Journal Article
    Autor Röhrich S
    Journal European Radiology
    Seiten 360-367
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Motion Correction and Volumetric Reconstruction for Fetal Functional Magnetic Resonance Imaging Data
    DOI 10.48550/arxiv.2202.05863
    Typ Preprint
    Autor Sobotka D
  • 2022
    Titel Continual Active Learning Using Pseudo-Domains for Limited Labelling Resources and Changing Acquisition Characteristics
    DOI 10.59275/j.melba.2022-4g6b
    Typ Journal Article
    Autor Perkonigg M
    Journal Machine Learning for Biomedical Imaging
    Seiten 1-28
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Unsupervised machine learning identifies predictive progression markers of IPF
    DOI 10.1007/s00330-022-09101-x
    Typ Journal Article
    Autor Pan J
    Journal European Radiology
    Seiten 925-935
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Dynamic memory to alleviate catastrophic forgetting in continual learning with medical imaging
    DOI 10.1038/s41467-021-25858-z
    Typ Journal Article
    Autor Perkonigg M
    Journal Nature Communications
    Seiten 5678
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Spatio-Temporal Motion Correction and Iterative Reconstruction of In-Utero Fetal fMRI
    DOI 10.1007/978-3-031-16446-0_57
    Typ Book Chapter
    Autor Taymourtash A
    Verlag Springer Nature
    Seiten 603-612
  • 2021
    Titel Continual Active Learning Using Pseudo-Domains for Limited Labelling Resources and Changing Acquisition Characteristics
    DOI 10.48550/arxiv.2111.13069
    Typ Preprint
    Autor Perkonigg M
  • 2021
    Titel Pseudo-domains in imaging data improve prediction of future disease status in multi-center studies
    DOI 10.48550/arxiv.2111.07634
    Typ Preprint
    Autor Perkonigg M
  • 2021
    Titel 4D iterative reconstruction of brain fMRI in the moving fetus
    DOI 10.48550/arxiv.2111.11394
    Typ Preprint
    Autor Taymourtash A
  • 2022
    Titel Fetal development of functional thalamocortical and cortico–cortical connectivity
    DOI 10.1093/cercor/bhac446
    Typ Journal Article
    Autor Taymourtash A
    Journal Cerebral Cortex (New York, NY)
    Seiten 5613-5624
    Link Publikation

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