Detektion neu entstehender infektiöser Lungenkrankheiten
Emerging Infectious Lung Disease Monitor
Wissenschaftsdisziplinen
Informatik (60%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (40%)
Keywords
-
Machine Learning,
Medical Imaging,
Lung Disease,
Computed Tomography
Die weltweite Ausbreitung von COVID-19 führte zu einer globalen Gesundheitskrise, die deutlich gemacht hat, dass wir Methoden benötigen um eine Epidemie oder Pandemie früher zu erkennen, und die Krankheit bei Patienten rascher zu diagnostizieren. Wir benötigen Techniken um rasch von ersten Fällen zu lernen und damit Patienten eine optimale und oft individuelle - Behandlung zuordnen zu können. Die Lungenbildgebung spielte zunächst bei der Diagnose, und im weiteren Verlauf bei der Prognose eine wichtige Rolle. Das Projekt ist eine enge interdisziplinäre Zusammenarbeit zwischen Experten für maschinelles Lernen und Radiologie. Das Projekt wird basierend auf Lungenbilddaten neue Methoden im Bereich des maschinellen Lernens und der Bildanalyse entwickeln, um diesen Herausforderungen zu begegnen. Es wird Methoden zur Erkennung von Anomalien untersuchen und weiterentwickeln und Techniken zur Identifizierung neu auftretender Phänotypen in der Patientenpopulation erstellen. Die Modelle werden auf Bilddaten und klinischen Informationen von Patienten basieren, und der Herausforderung begegnen noch nicht bekannte Marker zu identifizieren. Das zweite Hauptziel besteht darin, Modelle zu entwickeln, die den Verlauf einzelner Patienten während ihrer Krankheit und Genesung vorhersagen können, um eine optimale individuelle Behandlung zu ermöglichen. Hier besteht die Herausforderung darin, aus realen Alltagsdaten zu lernen, die in der Frühphase einer Pandemie gesammelt werden, während noch keine Behandlungsrichtlinien verfügbar sind. Das Projekt ist in ein Netzwerk internationaler Kollaborationen eingebettet, die die Validierung der neuen Methoden ermöglichen werden.
- Helmut Prosch, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
- Lucian Beer, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
- Ulrike Attenberger, Universitätsklinikum Bonn - Deutschland
- Evis Sala, Policlinico Universitario Agostino Gemelli - Italien
- Carola Bibiane Schönlieb, University of Cambridge - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 149 Zitationen
- 13 Publikationen
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2022
Titel Spatio-temporal motion correction and iterative reconstruction of in-utero fetal fMRI DOI 10.48550/arxiv.2209.08272 Typ Preprint Autor Taymourtash A -
2022
Titel Fetal Brain Tissue Annotation and Segmentation Challenge Results DOI 10.48550/arxiv.2204.09573 Typ Preprint Autor Payette K -
2022
Titel Motion correction and volumetric reconstruction for fetal functional magnetic resonance imaging data DOI 10.1016/j.neuroimage.2022.119213 Typ Journal Article Autor Sobotka D Journal NeuroImage Seiten 119213 Link Publikation -
2022
Titel Impact of a content-based image retrieval system on the interpretation of chest CTs of patients with diffuse parenchymal lung disease DOI 10.1007/s00330-022-08973-3 Typ Journal Article Autor Röhrich S Journal European Radiology Seiten 360-367 Link Publikation -
2022
Titel Motion Correction and Volumetric Reconstruction for Fetal Functional Magnetic Resonance Imaging Data DOI 10.48550/arxiv.2202.05863 Typ Preprint Autor Sobotka D -
2022
Titel Continual Active Learning Using Pseudo-Domains for Limited Labelling Resources and Changing Acquisition Characteristics DOI 10.59275/j.melba.2022-4g6b Typ Journal Article Autor Perkonigg M Journal Machine Learning for Biomedical Imaging Seiten 1-28 Link Publikation -
2022
Titel Unsupervised machine learning identifies predictive progression markers of IPF DOI 10.1007/s00330-022-09101-x Typ Journal Article Autor Pan J Journal European Radiology Seiten 925-935 Link Publikation -
2021
Titel Dynamic memory to alleviate catastrophic forgetting in continual learning with medical imaging DOI 10.1038/s41467-021-25858-z Typ Journal Article Autor Perkonigg M Journal Nature Communications Seiten 5678 Link Publikation -
2022
Titel Spatio-Temporal Motion Correction and Iterative Reconstruction of In-Utero Fetal fMRI DOI 10.1007/978-3-031-16446-0_57 Typ Book Chapter Autor Taymourtash A Verlag Springer Nature Seiten 603-612 -
2021
Titel Continual Active Learning Using Pseudo-Domains for Limited Labelling Resources and Changing Acquisition Characteristics DOI 10.48550/arxiv.2111.13069 Typ Preprint Autor Perkonigg M -
2021
Titel Pseudo-domains in imaging data improve prediction of future disease status in multi-center studies DOI 10.48550/arxiv.2111.07634 Typ Preprint Autor Perkonigg M -
2021
Titel 4D iterative reconstruction of brain fMRI in the moving fetus DOI 10.48550/arxiv.2111.11394 Typ Preprint Autor Taymourtash A -
2022
Titel Fetal development of functional thalamocortical and cortico–cortical connectivity DOI 10.1093/cercor/bhac446 Typ Journal Article Autor Taymourtash A Journal Cerebral Cortex (New York, NY) Seiten 5613-5624 Link Publikation