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Die Rolle der Kernporen für die Regulation der Genexpression

The role of nuclear pores in regulating gene expression

Alwin Köhler (ORCID: 0000-0003-4293-7873)
  • Grant-DOI 10.55776/Y557
  • Förderprogramm FWF-START-Preis
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.08.2011
  • Projektende 31.07.2016
  • Bewilligungssumme 1.198.680 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Nuclear pore complex, Ubiquitin, Chromatin, Gene expression

Abstract Endbericht

Kernporen sind riesige makromolekulare Strukturen in der Kernhülle, die den Transport von Molekülen zwischen dem Zellkern und Zytoplasma vermitteln. Die letzten Jahre haben gezeigt, dass Kernporen nicht nur Transportkanäle darstellen, sondern zahlreiche andere Prozesse im Zellkern beeinflussen. Die Genexpression in Eukaryonten benötigt zahlreiche Proteinmaschinerien, die aufeinanderfolgende Schritte in der Genexpression ausführen. Dazu gehören Transkription, mRNA Prozessierung und Export der mRNA in Zytoplasma. Die Kernporenkomplexe koordinieren diese Schritte indem sie direkt an aktivierte Gene binden und die Genexpressionsmaschine an der Kernhülle verankern. Für diese Interaktion sind spzialisierte Adaptorprotein notwendig, die eine Verbindung zwischen Gen und Kernpore herstellen. Wir untersuchen diese Prozesse, um herauszufinden wie Kernporen die globale Architektur und Funktion des Genoms regulieren.

Der Zellkern kann mit einer befestigten Stadt verglichen werden, in der Lipid-Membranen die Verteidigungsmauern bilden und Kernporenkomplexe den Transport von Gütern in die Stadt vermitteln. In Analogie zu einem Stadttor sind Kernporen nicht nur für den Gütertransport zuständig, sondern erlauben Kommunikation und Handel auf der molekularen Ebene. In diesem Projekt haben wir einen Mechanismus entdeckt, mit dem Kernporen mit der Erbinformation Kontakt aufnehmen und das Ablesen der DNA beeinflussen. Darüber hinaus haben wir herausgefunden, wie das Verpackungsmaterial der DNA, das Chromatin, durch Ubiquitin modifiziert wird, um das Ablesen der Erbinformation zu regulieren. Wir haben außerdem eine neue Funktion der Kernporen entdeckt, da wir zeigen konnten das eine bestimmter Teil der Kernpore, die Korbstruktur, für die Integrität der Kernmembran und die Assemblierung der Kernporen als Ganzes wichtig ist. Diese Ergebnisse beleuchten wichtige Aspekte der Biologie des Zellkerns und haben Relevanz für das Verständnis gesunder und kranker Zellen.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Tom W. Muir, Princeton University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Ning Zheng, University of Washington - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 338 Zitationen
  • 5 Publikationen
Publikationen
  • 2014
    Titel Monoubiquitination of Histone H2B Is Intrinsic to the Bre1 RING Domain-Rad6 Interaction and Augmented by a Second Rad6-binding Site on Bre1*
    DOI 10.1074/jbc.m114.626788
    Typ Journal Article
    Autor Turco E
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 5298-5310
    Link Publikation
  • 2015
    Titel The Nuclear Pore-Associated TREX-2 Complex Employs Mediator to Regulate Gene Expression
    DOI 10.1016/j.cell.2015.07.059
    Typ Journal Article
    Autor Schneider M
    Journal Cell
    Seiten 1016-1028
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Structural mechanism for the recognition and ubiquitination of a single nucleosome residue by Rad6–Bre1
    DOI 10.1073/pnas.1606863113
    Typ Journal Article
    Autor Gallego L
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 10553-10558
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Mediator and TREX-2: Emerging links between transcription initiation and mRNA export
    DOI 10.1080/19491034.2016.1169352
    Typ Journal Article
    Autor Schubert T
    Journal Nucleus
    Seiten 126-131
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Nuclear Pore Basket Proteins Are Tethered to the Nuclear Envelope and Can Regulate Membrane Curvature
    DOI 10.1016/j.devcel.2015.02.017
    Typ Journal Article
    Autor Mészáros N
    Journal Developmental Cell
    Seiten 285-298
    Link Publikation

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