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Entwicklung genetisch kodierter K+-Fluoreszenzsensoren

Development of genetically encoded fluorescent K+ probes

Roland Malli (ORCID: 0000-0001-6327-8729)
  • Grant-DOI 10.55776/I3716
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2018
  • Projektende 31.12.2022
  • Bewilligungssumme 389.337 €
  • Projekt-Website

DACH: Österreich - Deutschland - Schweiz

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (20%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (80%)

Keywords

    Genetically Encoded Fret Probes, Fluorescence Micoscopy, Live-Cell Imaging, Intravital Microscopy, Potassium Ion Signaling, Biosensors And Biotechnology

Abstract Endbericht

Die subzelluläre Anreicherung von Kaliumionen (K+) ist ein unerlässlicher biochemischer Vorgang, welche wichtige zellphysiologische Abläufe steuert. Vor allem erregbare Zellen wie Muskel-, Nerven- und Drüsenzellen sind in der Lage über Zellmembranen ihre K+-Konzentrationen zu verändern, um damit auf unterschiedliche Reize adäquat reagieren und spezifische Funktionen richtig erfüllen zu können. Störungen der Kaliumhomöostase auf zellulärer Ebene führen daher zu schweren Ausfallserscheinungen von Zellen und ganzen Organen. Solche Defekte im zellulären Kaliumhaushalt könnenunterschiedliche Erkrankungen des Herzkreislauf- und Nervensystems, sowie Stoffwechselstörungen, Muskelerkrankungen und möglicherweise sogar Krebs auslösen und Altersvorgänge beeinflussen. Man nimmt an, dass für die Aufrechterhaltung normaler Zellfunktionen auch innerhalb einer Zelle K+ in den verschiedenen Zellorganellen unterschiedlich stark angereichert und gezielt zwischen den einzelnen Zellkompartimenten ausgetauscht werden. Diese offenbar wichtigen intrazellulären Verschiebungen sind kaum erforscht, weil es bisher an Techniken fehlt, welche Messungen von K+-Konzentrationsänderungen innerhalb von lebenden Zellen mit hoher zeitlich- und räumlicher Auflösung ermöglichen. In diesem Forschungsprojekt werden nun neuartige, aus fluoreszierenden Eiweißmolekülen aufgebaute K+ Sensoren entwickelt. Diese nanoskopischen Biosensoren können in Zellkompartimenten eingebracht werden, wodurch Echtzeitmessungen von lokalen K+ Änderungen erstmals zugänglich werden. Die Entwicklung, Testung und Anwendung der neuen leuchtenden K+ Biosensoren für bestehende hochauflösenden Fluoreszenzmesssystemen soll ein besseres Verständnisüber selbst kleinste Ionenveränderungenliefern - winzige Ionenveränderungen mit womöglich großen Auswirkungen auf die Gesundheit.

In diesem Projekt haben wir neuartige, fluoreszierende Biosensoren entwickelt, die es ermöglichen, Veränderungen in der Konzentration von Kaliumionen ([K+]) in lebenden Zellen präzise und sensibel zu messen. Diese Nano-Maschinen bestehen aus fluoreszierenden Eiweißmolekülen und können sowohl in Zellen als auch an Zelloberflächen und in Körperflüssigkeiten eingesetzt werden. Durch die Verwendung dieser Sensoren können lokale Veränderungen in [K+] erstmals mit hoher Präzision erfasst und auf ihre Auswirkungen auf das Signalverhalten und den Stoffwechsel von Zellen untersucht werden. Socher Veränderungen sind unter anderem bei neurologischen Defekten, Stoffwechselerkrankungen und bei Krebs von Bedeutung. Wir hoffen, dass unsere neuen Sensoren dazu beitragen werden, diese Erkrankungen besser verstehen zu können, um ihnen dann effizient entgegenzuwirken.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Markus Rehberg, Klinikum der Universität München - Deutschland
  • Nikolaus Plesnila, Klinikum der Universität München - Deutschland

Research Output

  • 561 Zitationen
  • 33 Publikationen
  • 1 Patente
  • 1 Ausgründungen
  • 3 Methoden & Materialien
  • 1 Disseminationen
  • 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2021
    Titel A Co-Culture-Based Multiparametric Imaging Technique to Dissect Local H2O2 Signals with Targeted HyPer7
    DOI 10.3390/bios11090338
    Typ Journal Article
    Autor Secilmis M
    Journal Biosensors
    Seiten 338
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Unveiling the K+-sensitivity of cell metabolism using genetically encoded, FRET-based K+, glucose, and ATP biosensors
    DOI 10.1016/j.xpro.2021.100843
    Typ Journal Article
    Autor Bischof H
    Journal STAR Protocols
    Seiten 100843
    Link Publikation
  • 2022
    Titel MICU1 controls spatial membrane potential gradients and guides Ca2+ fluxes within mitochondrial substructures
    DOI 10.1038/s42003-022-03606-3
    Typ Journal Article
    Autor Gottschalk B
    Journal Communications Biology
    Seiten 649
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Probing intracellular potassium dynamics in neurons with the genetically encoded sensor lc-LysM GEPII 1.0 in vitro and in vivo.
    DOI 10.1038/s41598-024-62993-1
    Typ Journal Article
    Autor Calandra Gm
    Journal Scientific reports
    Seiten 13753
  • 2023
    Titel Probing Intracellular Potassium Dynamics in Neurons with the Genetically Encoded Sensor lc-LysM GEPII 1.0 in vitro and in vivo
    DOI 10.21203/rs.3.rs-3715395/v1
    Typ Preprint
    Autor Calandra G
  • 2023
    Titel Annexin-A5 is fundamental for VDAC1-dependent mitochondrial Ca2+ homeostasis and determines the susceptibility to apoptosis.
    DOI 10.21203/rs.3.rs-3338004/v1
    Typ Preprint
    Autor Graier W
  • 2020
    Titel Metabolic Profiling of Single Cancer Cells Using Mitochondrial ATP Probes
    DOI 10.1016/j.xpro.2020.100048
    Typ Journal Article
    Autor Rauter T
    Journal STAR Protocols
    Seiten 100048
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Yes (again) to local NO
    DOI 10.1038/s41589-020-0552-7
    Typ Journal Article
    Autor Eroglu E
    Journal Nature Chemical Biology
    Seiten 606-607
  • 2025
    Titel Tracking Intracellular Labile Iron with a Genetically Encoded Fluorescent Reporter System Based on Protein Stability
    DOI 10.1021/acssensors.5c01165
    Typ Journal Article
    Autor Akyol A
    Journal ACS Sensors
  • 2018
    Titel The enigmatic ATP supply of the endoplasmic reticulum
    DOI 10.1111/brv.12469
    Typ Journal Article
    Autor Depaoli M
    Journal Biological Reviews
    Seiten 610-628
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Dynamic Control of Mitochondrial Ca2+ Levels as a Survival Strategy of Cancer Cells
    DOI 10.3389/fcell.2021.614668
    Typ Journal Article
    Autor Madreiter-Sokolowski C
    Journal Frontiers in Cell and Developmental Biology
    Seiten 614668
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Immobilization of Recombinant Fluorescent Biosensors Permits Imaging of Extracellular Ion Signals
    DOI 10.1021/acssensors.1c01369
    Typ Journal Article
    Autor Burgstaller S
    Journal ACS Sensors
    Seiten 3994-4000
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Investigating the K+ sensitivity of cellular metabolism by extracellular flux analysis
    DOI 10.1016/j.xpro.2021.100876
    Typ Journal Article
    Autor Burgstaller S
    Journal STAR Protocols
    Seiten 100876
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Near-UV Light Induced ROS Production Initiates Spatial Ca2+ Spiking to Fire NFATc3 Translocation
    DOI 10.3390/ijms22158189
    Typ Journal Article
    Autor Oflaz F
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 8189
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Sigma-1 Receptor Promotes Mitochondrial Bioenergetics by Orchestrating ER Ca2+ Leak during Early ER Stress
    DOI 10.3390/metabo11070422
    Typ Journal Article
    Autor Koshenov Z
    Journal Metabolites
    Seiten 422
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Tracking intra- and inter-organelle signaling of mitochondria
    DOI 10.3929/ethz-b-000379999
    Typ Other
    Autor Madreiter-Sokolowski
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Citrin mediated metabolic rewiring in response to altered basal subcellular Ca2+ homeostasis
    DOI 10.1038/s42003-022-03019-2
    Typ Journal Article
    Autor Koshenov Z
    Journal Communications Biology
    Seiten 76
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Sigma-1 Receptor Modulation by Ligands Coordinates Cancer Cell Energy Metabolism
    DOI 10.3390/biom12060762
    Typ Journal Article
    Autor Oflaz F
    Journal Biomolecules
    Seiten 762
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Salivary potassium measured by genetically encoded potassium ion indicators as a surrogate for plasma potassium levels in hemodialysis patients—a proof-of-concept study
    DOI 10.1093/ndt/gfac195
    Typ Journal Article
    Autor Deak A
    Journal Nephrology Dialysis Transplantation
    Seiten 757-763
  • 2020
    Titel ER-to-Golgi Transport in HeLa Cells Displays High Resilience to Ca2+ and Energy Stresses
    DOI 10.3390/cells9102311
    Typ Journal Article
    Autor Rauter T
    Journal Cells
    Seiten 2311
    Link Publikation
  • 2022
    Titel TRPC3 governs the spatiotemporal organization of cellular Ca2+ signatures by functional coupling to IP3 receptors
    DOI 10.1016/j.ceca.2022.102670
    Typ Journal Article
    Autor Curcic S
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102670
  • 2021
    Titel Potassium ions promote hexokinase-II dependent glycolysis
    DOI 10.1016/j.isci.2021.102346
    Typ Journal Article
    Autor Bischof H
    Journal iScience
    Seiten 102346
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Development, characterization and application of novel genetically encoded, fluorescent potassium ion indicators
    Typ PhD Thesis
    Autor Helmut Bischof
  • 2025
    Titel Annexin A5 controls VDAC1-dependent mitochondrial Ca2+ homeostasis and determines cellular susceptibility to apoptosis
    DOI 10.1038/s44318-025-00454-9
    Typ Journal Article
    Autor Bondarenko A
    Journal The EMBO Journal
  • 2019
    Titel Live-Cell Imaging of Physiologically Relevant Metal Ions Using Genetically Encoded FRET-Based Probes
    DOI 10.3390/cells8050492
    Typ Journal Article
    Autor Bischof H
    Journal Cells
    Seiten 492
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Visualization of Sirtuin 4 Distribution between Mitochondria and the Nucleus, Based on Bimolecular Fluorescence Self-Complementation
    DOI 10.3390/cells8121583
    Typ Journal Article
    Autor Ramadani-Muja J
    Journal Cells
    Seiten 1583
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Glycogen Synthase Kinase 3 Beta Controls Presenilin-1-Mediated Endoplasmic Reticulum Ca2+ Leak Directed to Mitochondria in Pancreatic Islets and beta-Cells
    DOI 10.33594/000000005
    Typ Journal Article
    Autor Klec C
    Journal Cellular Physiology & Biochemistry
    Seiten 57-75
    Link Publikation
  • 2019
    Titel pH-Lemon, a Fluorescent Protein-Based pH Reporter for Acidic Compartments
    DOI 10.1021/acssensors.8b01599
    Typ Journal Article
    Autor Burgstaller S
    Journal ACS Sensors
    Seiten 883-891
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Purification and Application of Genetically Encoded Potassium Ion Indicators for Quantification of Potassium Ion Concentrations within Biological Samples
    DOI 10.1002/cpch.71
    Typ Journal Article
    Autor Bischof H
    Journal Current Protocols in Chemical Biology
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Mitochondrial–Endoplasmic Reticulum Interplay: A Lifelong On–Off Relationship?
    DOI 10.1177/2515256419861227
    Typ Journal Article
    Autor Madreiter-Sokolowski C
    Journal Contact
    Seiten 2515256419861227
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Tracking intra- and inter-organelle signaling of mitochondria
    DOI 10.1111/febs.15103
    Typ Journal Article
    Autor Madreiter-Sokolowski C
    Journal The FEBS Journal
    Seiten 4378-4401
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Presenilin-1 Established ER-Ca2+ Leak: a Follow Up on Its Importance for the Initial Insulin Secretion in Pancreatic Islets and ß-Cells Upon Elevated Glucose
    DOI 10.33594/000000158
    Typ Journal Article
    Autor Klec C
    Journal Cellular Physiology & Biochemistry
    Seiten 573-586
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Edible insects – defining knowledge gaps in biological and ethical considerations of entomophagy
    DOI 10.1080/10408398.2018.1468731
    Typ Journal Article
    Autor Pali-Schöll I
    Journal Critical Reviews in Food Science and Nutrition
    Seiten 2760-2771
    Link Publikation
Patente
  • 2018 Patent Id: CA3062431
    Titel GENETICALLY ENCODED POTASSIUM ION INDICATORS
    Typ Patent application published
    patentId CA3062431
    Website Link
Ausgründungen
  • 2016 Link
    Titel NGFI GmbH
    Link Link
Methoden & Materialien
  • 2019 Link
    Titel pH-Lemon
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2017 Link
    Titel Genetically encoded fluorescent potassium ion indicators (GEPIIs)
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 0 Link
    Titel mito-STAR
    Typ Technology assay or reagent
    Link Link
Disseminationen
  • 2019
    Titel Lecture followed by discussions and cooperation talks
    Typ A talk or presentation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2022
    Titel Guest Editor for FRBM
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Best Poster Prize to JP
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel Invitation as a speaker at the international EUR BIOPHYS conference
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Award as inventor of SALI-LUX
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
Weitere Förderungen
  • 2021
    Titel Targeting intra- and extracellular K+ in cancer
    Typ Other
    Förderbeginn 2021
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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