Next Generation CEST MRI for Accelerated Non-invasive Metabo
Next Generation Chemical Exchange saturation transfer MRI
DACH: Österreich - Deutschland - Schweiz
Wissenschaftsdisziplinen
Klinische Medizin (35%); Mathematik (25%); Medizintechnik (40%)
Keywords
-
CEST MRI,
RF pulse optimization,
Compressed Sensing,
Model based Reconstruction,
Ultra-High Magnetic Fields
Die Magnetresonanzbildgebung (MRI) ist ein wichtiges medizinisches Bildgebungsverfahren, das exzellenten Weichteilkontrast mit einer hohen räumlichen Auflösung vereint und auch funktionelle Informationen liefern kann. Pathologische Prozesse sind aber oft durch molekulare oder metabolische Veränderungen charakterisiert die vor morphologischen Effekten zu beobachten sind. Manche Metaboliten sind mit der verwandten Methode der MR-Spektroskopie erfassbar, die Sensitivität dieses Verfahrens ist jedoch relativ gering und sie wird meist auch nur lokal für ein bestimmtes Volumen eingesetzt. Das CEST MRI ist ein Verfahren, das Bilder der Verteilung von bestimmten Metaboliten im Gewebe anfertigen kann und daher die Anwendungsmöglichkeiten des MRI für die Präzisionsmedizin entscheidend verbreitert. Dazu wird der sogenannte Chemical Exchange Saturation Transfer von Wasserstoffkernen genutzt. Mit diesem Effekt kann durch den hohen Wassergehalt im Gewebe die Sensitivität für spezifische Molekülgruppen bis zum tausendfachen oder auch darüber erhöht werden. Diese vielversprechende Technik verlangt aber noch essentielle methodische Entwicklungen für die diagnostische Anwendung in der Klinik. Dementsprechend zielt diese Projekt zielt darauf ab, CEST-MRI entscheidend weiterzuentwickeln, indem es neue Methoden in der Bild- und Kontrastkodierung mit aktuellen mathematischen Ansätzen zur Bildrekonstruktion und Datenanalyse kombiniert. Damit soll eine schnelle und quantitative metabolischer Bildgebung an klinischem verwendbaren MR-Systemen erreichen werden. Dabei werden etablierten Grenzen, wie sie zum Beispiel vom Nyquist-Shannon-Abtasttheorem vorgegeben werden, deutlich überschritten. Das Projekt gliedert sich in zwei überlappende Arbeitsbereiche. Einerseits wird die Signalanregung zur Kodierung der metabolischen Information optimiert. Anderseits wird durch die Entwicklung neuer Mess- und Rekonstruktionsverfahren die Untersuchungszeit massive verkürzt. Die neu entwickelten Verfahren werden auf verschiedenen Magnetfeldstärken untersucht, von 3T bis zu allerhöchsten in-vivo Feldstärken mit 9.4T. Um diese Ziel zu erreichen bedarf es einer interdisziplinären internationalen Kooperation. Die österreichische Gruppe (R. Stollberger, K. Bredies) hat ihre Stärke in der Entwicklung und Implementierung neuer MRI-Methoden, die auf mathematischer Optimierung und variationellen Bildrekonstruktionsverfahren basieren. Die deutsche Gruppe (M. Zaiss) verfügt über umfassende Erfahrungen mit allen Aspekten des CEST-MRI und hat auch Zugang zu modernsten in-vivo UHF-Systemen. Bei erfolgreicher Projektumsetzung kann ein entscheidender Beitrag für eine bessere und patienten- freundlichere Erfassung metabolischer Information mittels MRI geleistet werden. Dies ist eine wichtige Basis für breitere klinische Anwendung im Biomarker Imaging und in der Präzisionsmedizin.
Pathologische Prozesse sind typischerweise durch molekulare und metabolische Veränderungen charakterisiert. Die in-vivo Bestimmung diese Größen ist daher von großem Interesse für die Medizin. Im Bereich der MR-Tomographie bietet das CEST ("chemical exchange saturation transfer") Verfahren eine Möglichkeit molekulare Information als Bild zu bestimmen. Die Nutzung dieser Methode ist nach wie vor Gegenstand von Forschung und Entwicklung. In diesem Projekt wurden nun wesentliche Elemente der noch immer gegebenen Herausforderungen substantiell verbessert. So ist es gelungen die gepulste Kodierung der CEST-Information so zu optimieren, dass die gemessene spektrale Information den theoretischen Voraussetzungen für Quantifizierungsverfahren genügt, dass sie robust in verschiedenen Anwendungsfällen ist und darüber hinaus auf den üblichen klinischen MR Tomographen gewonnen werden können. Im einem weiteren Projektbereich wurde untersucht wie dynamische Ausgleichsvorgänge der Kernmagnetisierung von wassergebundenen Protonen und solchen in sogenannten labilen Molekülen für die integrierte Messung aller notwendigen Informationen verwendet werden kann. Durch neu entwickelte bio-physikalische Modelle ist es nun möglich die quantitative Auswertung mittels modellbasierter Rekonstruktion durchzuführen. Dieser Ansatz führt in einem Schritt zum gewünschten quantitativen Ergebnis. Darüber hinaus kann durch die Art der Rekonstruktion eine deutlich bessere Bildqualität bei kürzere Messzeit erzielt werden. Das Rekonstruktionsverfahren verwendet mathematische Optimierungsverfahren, die auch elementare Bestandteil des Maschine Learning sind. Im Rahmen der internationalen Kooperation wurde bei Messungen an Ultra-Hochfeldsystem entdeckt, dass die Annahmen von singulären Pools für spezifische CEST Resonanzen nicht hinreichend ist und, dass für die Optimierung der Sättigungspulse bei diesen Feldstärken ein Multipool Model verwendet werden muss. Dadurch und durch Änderung einer Randbedingung der Optimierung konnte auch in diesen Fällen die gepulste Sättigung die gewünschte Performance erreichen. Im Kooperationsteil des Projektes wurde auch erfolgreich an Strategien geforscht damit die Messequenzen die gewünschten und modellierten Signalverläufe erzielen.
- Technische Universität Graz - 67%
- Universität Graz - 33%
- Kristian Bredies, Universität Graz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Moritz Zaiss, Friedrich-Alexander-Universität Erlangen - Deutschland
Research Output
- 21 Publikationen
- 2 Datasets & Models
- 3 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2025
Titel Dynamic transitions for fast joint acquisition and reconstruction of CEST-Rex and T1 DOI 10.48550/arxiv.2509.21184 Typ Preprint Autor Huemer M Link Publikation -
2025
Titel Radio Frequency Pulse Design for Chemical Exchange Saturation Transfer Magnetic Resonance Imaging by Optimal Control Typ PhD Thesis Autor Clemens Stillianu -
2025
Titel Generalization of Optimal Control Saturation Pulse Design for Robust and High CEST Contrast DOI 10.1101/2025.08.21.671490 Typ Preprint Autor Huemer M -
2025
Titel Dynamic transitions for fast joint determination of CEST-Rex and T1 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Daniel Mackner Konferenz ISMRM & ISMRT Annual Meeting & Exhibition 2025 Seiten #1356 -
2024
Titel MR -zero meets FLASH -controlling the transient signal decay in gradient- and RF-spoiled gradient echo sequences DOI 10.1002/mrm.30318 Typ Journal Article Autor Endres J Journal Magnetic Resonance in Medicine -
2024
Titel Improved quantification in CEST-MRI by joint spatial total generalized variation DOI 10.1002/mrm.30129 Typ Journal Article Autor Huemer M Journal Magnetic Resonance in Medicine -
2024
Titel Enhanced and robust contrast in CEST MRI: Saturation pulse shape design via optimal control DOI 10.1002/mrm.30164 Typ Journal Article Autor Graf C Journal Magnetic Resonance in Medicine -
2024
Titel Simultaneous Measurement of CEST using Model-based Multi-Pool-Lorentzian Look-Locker Reconstruction Typ Conference Proceeding Abstract Autor Markus Huemer Konferenz ISMRM & ISMRT Annual Meeting & Exhibition. 2024 Seiten #4477 -
2024
Titel Fully Transient 3D Model Based CEST Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Stilianu Konferenz 10th International Workshop on Chemical Exchange Saturation Transfer: CEST 2024 Link Publikation -
2024
Titel Generalization of CEST Saturation Pulses designed by Optimal Control A Pulse Pair Approach Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Stilianu Link Publikation -
2024
Titel Transient model based CEST imaging-tCEST Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Stilianu Konferenz Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine 2024 Seiten 31-33 Link Publikation -
2024
Titel Generalized representation of optimal control CEST saturation pulses Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Stilianu Konferenz Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine 2024 Seiten 213-215 Link Publikation -
2022
Titel Robust Lorentzian fitting of CEST spectra utilizingjoint spatial regularization Typ Conference Proceeding Abstract Autor M Fabian Konferenz ISMRM & ISMRT Annual Meeting & Exhibition 2023 Seiten #2079 -
2022
Titel Optimization of pulsed chemical exchange saturation transfer mri by optimal control. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Christina Graf Konferenz Joint Annual Meeting ISMRM-ESMRMB & ISMRT 31st Annual Meeting, 2022 Seiten #2077 -
2023
Titel Performance of Multipool-Lorentzian fitting for CEST-MRI using joint spatial regularization Typ Conference Proceeding Abstract Autor Markus Huemer Konferenz ISMRM & ISMRT Annual Meeting & Exhibition. 2023 Seiten #3434 -
2023
Titel Lorentzian model based reconstruction for CEST-MRI Typ Conference Proceeding Abstract Autor Markus Huemer Konferenz Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine 2023 Seiten 182-183 Link Publikation -
2023
Titel Validate your CEST simulation! Typ Conference Proceeding Abstract Autor Kai Herz Konferenz ISMRM & ISMRT Annual Meeting & Exhibition. 2023 Seiten #0907 -
2023
Titel Improving the accuracy of Multipool-Lorentzian fitting in CEST MRI by use of a Pseudo-Voigt lineshape for direct water saturation Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Stilianu Konferenz ISMRM & ISMRT Annual Meeting & Exhibition. 2023 Seiten #3116 -
2023
Titel Creatine and phosphocreatine cest contrast of an optimal control pulse train compared to an optimized gaussian pulse train for cest imaging in calf muscle. Typ Conference Proceeding Abstract Autor A. Chubarov Konferenz European Society for Magnetic Resonance in Medicine and Biology (ESMRMB), 2023 Seiten 86 Link Publikation -
2023
Titel B0-robustness and exchange weighting of optimal control pulses compared to state of the art pulses for cest imaging Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Stillianu Konferenz 2023 ISMRM & ISMRT Annual Meeting & Exhibition (ISMRM 2023), 2023 -
2021
Titel Accuracy and performance analysis for Bloch and Bloch-McConnell simulation methods. DOI 10.1016/j.jmr.2021.107011 Typ Journal Article Autor Graf C Journal Journal of magnetic resonance (San Diego, Calif. : 1997) Seiten 107011
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2025
Titel ISMRM Magna cum Laude Merit Award Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel Best paper award 2024 in biomedical engineering. Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2024
Titel 1st place award for methology: Abstract Award CEST Study group 2023 ISMRM Annual Meeting Toronto Canada Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International