Evolution von Geschlechtsdetermination bei Amphioxus
The regulation and evolution of amphioxus sex determination
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Amphioxus,
Sex determination,
Evolution,
Epigenetics,
Genomics
Das Geschlecht der Tiere wird häufig durch eines der Chromosomen bestimmt. Beim Menschen haben Männer ein Y- und ein X-Chromosom und Frauen zwei X-Chromosomen. Bei Vögeln ist das Gegenteil der Fall: Weibchen haben zwei verschiedene Chromosomen, Z- und W- Chromosomen genannt, und Männchen haben zwei Z-Chromosomen. Die XY- oder ZW- Chromosomen werden Geschlechtschromosomen genannt. Bei vielen anderen Arten ist es jedoch unklar, ob sie Geschlechtschromosomen haben. Dieses Projekt untersucht das geschlechtsbestimmende System bei Amphioxus. Amphioxus ist eine Gruppe wirbelloser Tiere, ist aber eng mit den Wirbeltieren verwandt. Da Amphioxus viele morphologische und physiologische Merkmale mit Wirbeltieren gemeinsam hat und sich langsam entwickelt, wird davon ausgegangen, dass Amphioxus ein geeignetes Modell zur Untersuchung der Evolution von Wirbeltieren darstellt. Wir haben die Genome von drei Amphioxusarten entschlüsselt: Amphioxus aus Florida , Japan und China, und wir werden in ihren Genomen nach den Geschlechtschromosomen suchen. Dazu werden wir die männlichen und weiblichen Genome vieler Individuen vergleichen und den Unterschied herausfinden. Da sich die Geschlechtschromosomen bei Männchen und Weibchen unterscheiden, sollte das Chromosom, das den geschlechtsgebundenen Unterschied trägt, das Geschlechtschromosom sein. Sobald wir die Geschlechtschromosomen identifiziert haben, werden wir untersuchen, wie die Geschlechtschromosomen zu den physiologischen Unterschieden zwischen Männern un d Frauen beitragen, insbesondere bezüglich der Keimdrüsen. Wir werden untersuchen, welche Gene der Geschlechtschromosomen in den Keimdrüsen differentiell exprimiert werden. Diese Gene entscheiden darüber, ob sich die undifferenzierten Keimdrüsen zu Hoden u nd Eierstöcken entwickeln, die das Geschlecht der Tiere bestimmen. Diese Gene werden geschlechtsbestimmende Gene genannt. Wir werden dann fragen, was die geschlechtsspezifische Expression der geschlechtsbestimmenden Gene in den Keimdrüsen reguliert. Dazu werden wir Sequenzelemente untersuchen, die für die Genregulation verantwortlich sind. Zu diesen Elementen gehören Promotoren und Enhancer. Wir werden modernste Sequenziertechnologien (ATAC-seq und ChIP-seq) einsetzen, um die Aktivitäten dieser Elemente während der Gonadenentwicklung zwischen Männchen und Weibchen zu vergleichen. Um schließlich die Funktionen des geschlechtsbestimmenden Gens und der regulatorischen Elemente zu überprüfen, werden wir sie mit Hilfe der "Genschere" CRISPR/Cas9 aus dem Genom entfernen. Es wird erwartet, dass die Deletion des geschlechtsbestimmenden Gens oder der regulatorischen Elemente eine Geschlechtsumkehr bei den Tieren bewirkt.
Das Geschlecht der Tiere wird häufig durch eines der Chromosomen bestimmt. Beim Menschen haben Männer ein Y- und ein X-Chromosom und Frauen zwei X-Chromosomen. Bei Vögeln ist das Gegenteil der Fall: Weibchen haben zwei verschiedene Chromosomen, Z- und W-Chromosomen genannt, und Männchen haben zwei Z-Chromosomen. Die XY- oder ZW-Chromosomen werden Geschlechtschromosomen genannt. Bei vielen anderen Arten ist es jedoch unklar, ob sie Geschlechtschromosomen haben. Dieses Projekt untersucht das geschlechtsbestimmende System bei Amphioxus. Amphioxus ist eine Gruppe wirbelloser Tiere, ist aber eng mit den Wirbeltieren verwandt. Da Amphioxus viele morphologische und physiologische Merkmale mit Wirbeltieren gemeinsam hat und sich langsam entwickelt, wird davon ausgegangen, dass Amphioxus ein geeignetes Modell zur Untersuchung der Evolution von Wirbeltieren darstellt. Wir haben die Genome von drei Amphioxusarten entschlüsselt: Amphioxus aus Florida , Japan und China, und wir werden in ihren Genomen nach den Geschlechtschromosomen suchen. Dazu werden wir die männlichen und weiblichen Genome vieler Individuen vergleichen und den Unterschied herausfinden. Da sich die Geschlechtschromosomen bei Männchen und Weibchen unterscheiden, sollte das Chromosom, das den geschlechtsgebundenen Unterschied trägt, das Geschlechtschromosom sein. Sobald wir die Geschlechtschromosomen identifiziert haben, werden wir untersuchen, wie die Geschlechtschromosomen zu den physiologischen Unterschieden zwischen Männern und Frauen beitragen, insbesondere bezüglich der Keimdrüsen. Wir werden untersuchen, welche Gene der Geschlechtschromosomen in den Keimdrüsen differentiell exprimiert werden. Diese Gene entscheiden darüber, ob sich die undifferenzierten Keimdrüsen zu Hoden und Eierstöcken entwickeln, die das Geschlecht der Tiere bestimmen. Diese Gene werden geschlechtsbestimmende Gene genannt. Wir werden dann fragen, was die geschlechtsspezifische Expression der geschlechtsbestimmenden Gene in den Keimdrüsen reguliert. Dazu werden wir Sequenzelemente untersuchen, die für die Genregulation verantwortlich sind. Zu diesen Elementen gehören Promotoren und Enhancer. Wir werden modernste Sequenziertechnologien (ATAC-seq und ChIP-seq) einsetzen, um die Aktivitäten dieser Elemente während der Gonadenentwicklung zwischen Männchen und Weibchen zu vergleichen. Um schließlich die Funktionen des geschlechtsbestimmenden Gens und der regulatorischen Elemente zu überprüfen, werden wir sie mit Hilfe der "Genschere" CRISPR/Cas9 aus dem Genom entfernen. Es wird erwartet, dass die Deletion des geschlechtsbestimmenden Gens oder der regulatorischen Elemente eine Geschlechtsumkehr bei den Tieren bewirkt.
- Xiamen University - 100%
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 245 Zitationen
- 14 Publikationen
- 17 Datasets & Models
-
2021
Titel Joint profiling of gene expression and chromatin accessibility of amphioxus development at single cell resolution DOI 10.21203/rs.3.rs-504113/v1 Typ Preprint Autor Ma P Link Publikation -
2020
Titel The Female-Specific W Chromosomes of Birds Have Conserved Gene Contents but Are Not Feminized DOI 10.3390/genes11101126 Typ Journal Article Autor Xu L Journal Genes Seiten 1126 Link Publikation -
2020
Titel Sequence Transpositions Restore Genes on the Highly Degenerated W Chromosomes of Songbirds DOI 10.3390/genes11111267 Typ Journal Article Autor Xu L Journal Genes Seiten 1267 Link Publikation -
2021
Titel Pericentromeric heterochromatin impacts genome compartmentalization and sex chromosome evolution in a fish DOI 10.1101/2021.03.01.433482 Typ Preprint Autor Xue L Seiten 2021.03.01.433482 Link Publikation -
2021
Titel Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.1186/s13059-021-02430-y Typ Journal Article Autor Xue L Journal Genome Biology Seiten 203 Link Publikation -
2021
Titel Recurrent chromosome reshuffling and the evolution of neo-sex chromosomes in parrots DOI 10.1101/2021.03.08.434498 Typ Preprint Autor Huang Z Seiten 2021.03.08.434498 Link Publikation -
2021
Titel Additional file 1 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966156.v1 Typ Other Autor Gao Y Link Publikation -
2021
Titel Additional file 1 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966156 Typ Other Autor Gao Y Link Publikation -
2021
Titel Additional file 10 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966150.v1 Typ Other Autor Gao Y Link Publikation -
2021
Titel Additional file 10 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966150 Typ Other Autor Gao Y Link Publikation -
2023
Titel Evolutionary analysis of a complete chicken genome. DOI 10.1073/pnas.2216641120 Typ Journal Article Autor Huang Z Journal Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America Link Publikation -
2022
Titel Three amphioxus reference genomes reveal gene and chromosome evolution of chordates DOI 10.1101/2022.01.04.475009 Typ Preprint Autor Huang Z Seiten 2022.01.04.475009 Link Publikation -
2022
Titel Recurrent chromosome reshuffling and the evolution of neo-sex chromosomes in parrots DOI 10.1038/s41467-022-28585-1 Typ Journal Article Autor Huang Z Journal Nature Communications Seiten 944 Link Publikation -
2023
Titel Three amphioxus reference genomes reveal gene and chromosome evolution of chordates DOI 10.1073/pnas.2201504120 Typ Journal Article Autor Huang Z Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation
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2021
Link
Titel Additional file 7 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966177 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 9 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966183 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 8 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966180.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 8 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966180 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 7 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966177.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 6 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966174.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 6 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966174 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 5 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966171.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 5 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966171 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 4 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966168.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 4 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966168 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 3 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966165.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 3 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966165 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 2 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966159 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel lurebgi/amphioxusGenome: publish with Zenodo DOI 10.5281/zenodo.5526626 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 9 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966183.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Additional file 2 of Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin of a young sex chromosome pair DOI 10.6084/m9.figshare.14966159.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link