Computer Aided Molecular Modelling of HIV-1 Reverse Trans- criptase Inhibitors: Structural Parameters and Molecular Design

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (100%)

Keywords

NON-NUCLEOSIDIC RTI, HEPT, MOLECULAR DOCKING, MOLECULAR MODELLING, HEPT molecular model, Non-nucleosidic reve, Transcriptase Inhibi

Abstract

Nichtnucleosidische HIV-1 Reverse Transcriptase Inhibitoren sollen im vorliegenden Projekt mit Hilfe von Molecular Modelling Techniken entwickelt werden. In einer Arbeitsgruppe an der Kasetsart Universität in Bangkok wurden eine Reihe von Hydroxyethoxy-methylphenylthiothyminderivate (HEPT) synthetisiert und auf ihre Aktivität überprüft. In Verbindung mit Kristallstrukturen der Reverse Transcriptase komplexiert mit HEPT soll zunächst die Struktur-Wirkungsbeziehung dieser Verbindungsklasse mit den Methoden des Molecular Modelling erklärt werden. Verschiedene Docking Methoden sollen für die Berechnung der Geometrien und der elektronischen Eigenschaften der Assoziationskomplexe herangezogen werden. Sterische und elektrostatische Wechselwirkungen innerhalb des Komplexes sollen studiert werden, um Informationen über den Blockierungsmechanismus dieser Verbindungen zu erhalten. Aus diesen Erkenntnissen heraus sollen neue Inhibitoren entwickelt, synthetisiert und getestet werden.