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Ku-Komplex am Arapidopsis-Telomer

Functional study of the KU complex at Arabidopsis telomeres

Karel Riha (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P16405
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2003
  • Projektende 30.06.2007
  • Bewilligungssumme 371.322 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Telomere, Telomerase, DNA-repair, Arabidopsis thaliana, Ku-complex

Abstract Endbericht

Das längerfristige Ziel meiner Forschungsarbeit ist das Studium grundlegender Fragen der Telomerbiologie und Genomstabilität unter Verwendung von Arabidopsis thaliana als höherem eukaryotischen Modellorganismus. Telomere sind Nukleoprotein (RNP)-Komplexe an den Enden der linearen eukaryotischen Chromosomen. Indem sie die Chromosomenenden maskieren verhindern sie, daß diese von der zellulären Checkpoint- und Reparaturmaschinerie fälschlicherweise als DNA-Doppelstrangbrüche erkannt und entsprechend prozessiert werden. In Anbetracht dessen erscheint es paradox, daß einige kürzlich in Säugersystemen und für die Bäckerhefe beschriebene DNA Reparatur- und Checkpoint-Komponenten den Telomer-RNP-Komplexen zugeordnet wurden. Dabei kommt dem Ku70/80 Heterodimer, einer essentiellen Komponente des sog. Non Homologous End Joining (NHEJ) Doppelstrangbruch Reparaturweges, die widersprüchlichste Rolle zu. Ku ist einerseits notwendig für korrekte Telomer-Funktion und -Stabilität, spielt andererseits aber auch eine unterstützende Rolle bei der Fusion ungeschützter Chromosomenenden. In früheren Untersuchungen haben wir Arabidopsis Mutanten mit Funktionsdefekten in der katalytischen Untereinheit der Telomerase und im Ku70 Protein studiert. Wir konnten nachweisen, daß Ku als negativer Regulator der Telomerase wirkt und an den Arabidopsis Telomeren lokalisiert ist und auch für die korrekte Aufrechterhaltung des telomerischen C-Stranges gebraucht wird. Im vorliegenden Forschungsantrag schlage ich eine detaillierte Analyse der telomerischen Rolle von Ku bei Arabidopsis vor. Ich werde die funktionellen Wechselwirkungen zwischen Ku, der Telomerase und anderen DNA Reparatur-Komplexen in Verbindung mit der Telomer-Funktion und -Biogenese studieren. Parallel dazu wird nach neuartigen mit Ku in Wechselwirkung tretenden Proteinen gesucht werden.

Das längerfristige Ziel meiner Forschungsarbeit ist das Studium grundlegender Fragen der Telomerbiologie und Genomstabilität unter Verwendung von Arabidopsis thaliana als höherem eukaryotischen Modellorganismus. Telomere sind Nukleoprotein (RNP)-Komplexe an den Enden der linearen eukaryotischen Chromosomen. Indem sie die Chromosomenenden maskieren verhindern sie, daß diese von der zellulären Checkpoint- und Reparaturmaschinerie fälschlicherweise als DNA-Doppelstrangbrüche erkannt und entsprechend prozessiert werden. In Anbetracht dessen erscheint es paradox, daß einige kürzlich in Säugersystemen und für die Bäckerhefe beschriebene DNA Reparatur- und Checkpoint-Komponenten den Telomer-RNP-Komplexen zugeordnet wurden. Dabei kommt dem Ku70/80 Heterodimer, einer essentiellen Komponente des sog. Non Homologous End Joining (NHEJ) Doppelstrangbruch Reparaturweges, die widersprüchlichste Rolle zu. Ku ist einerseits notwendig für korrekte Telomer-Funktion und -Stabilität, spielt andererseits aber auch eine unterstützende Rolle bei der Fusion ungeschützter Chromosomenenden. In früheren Untersuchungen haben wir Arabidopsis Mutanten mit Funktionsdefekten in der katalytischen Untereinheit der Telomerase und im Ku70 Protein studiert. Wir konnten nachweisen, daß Ku als negativer Regulator der Telomerase wirkt und an den Arabidopsis Telomeren lokalisiert ist und auch für die korrekte Aufrechterhaltung des telomerischen C-Stranges gebraucht wird. Im vorliegenden Forschungsantrag schlage ich eine detaillierte Analyse der telomerischen Rolle von Ku bei Arabidopsis vor. Ich werde die funktionellen Wechselwirkungen zwischen Ku, der Telomerase und anderen DNA Reparatur-Komplexen in Verbindung mit der Telomer-Funktion und -Biogenese studieren. Parallel dazu wird nach neuartigen mit Ku in Wechselwirkung tretenden Proteinen gesucht werden.

Forschungsstätte(n)
  • Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Dorothy E. Shippen, Texas A&M University - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 503 Zitationen
  • 4 Publikationen
Publikationen
  • 2007
    Titel Ku Suppresses Formation of Telomeric Circles and Alternative Telomere Lengthening in Arabidopsis
    DOI 10.1016/j.molcel.2007.05.025
    Typ Journal Article
    Autor Zellinger B
    Journal Molecular Cell
    Seiten 163-169
    Link Publikation
  • 2007
    Titel Composition of plant telomeres
    DOI 10.1016/j.bbaexp.2007.02.001
    Typ Journal Article
    Autor Zellinger B
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Structure and Expression
    Seiten 399-409
  • 2004
    Titel Molecular analysis of telomere fusions in Arabidopsis: multiple pathways for chromosome end-joining
    DOI 10.1038/sj.emboj.7600236
    Typ Journal Article
    Autor Heacock M
    Journal The EMBO Journal
    Seiten 2304-2313
    Link Publikation
  • 2004
    Titel Mre11 Deficiency in Arabidopsis Is Associated with Chromosomal Instability in Somatic Cells and Spo11-Dependent Genome Fragmentation during Meiosis
    DOI 10.1105/tpc.104.022749
    Typ Journal Article
    Autor Puizina J
    Journal The Plant Cell
    Seiten 1968-1978
    Link Publikation

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