Epigenetik & Interphase Chromosomen in lebenden Pflanzen

Für ein umfassendes Verständnis der Funktionen des Genoms sowie dessen Regulations -mechanismen wird nicht nur die Information über die lineare DNA Sequenz und den damit assozierten Proteinen benötigt, sondern ebenso Information darüber, wie diese molekularen Komponenten im Interphasen Zellkern von Pflanzen- und Tierzellen angeordnet sind, und wie die jeweilige Anordnung dynamisch kontrolliert wird. In Lehrbüchern und Überblick Artikeln über eukaryotische Gen Regulation werden hauptsächlich die strukturellen und epigenetischen Eigenschaften von Chromatin selbst, als auch die räumliche Anordnung im dreidimensionalen (3D) Raum des Zellkerns beschrieben. Eine wesentliche Heraus-forderung ist es nicht nur die 3D Architektur des Interphasen Chromatins in vivo genau zu beschreiben, sondern die Integration von räumlicher Information einerseits, und epigenetischen Modifikationen und Chromatin Mobilität andererseits. Der Zweck der hier vorgeschlagenen Arbeiten ist es zu studieren, welchen Einfluss epigenetische Vorgänge auf Genexpression und die 3D Anordnung von Chromosomen in der Interphase in lebenden Zellen haben. Diese Experimente werden unter Verwendung der Modellpflanze Arabidopsis thaliana durchgeführt werden, für die die notwendigen Werkzeuge vorhanden sind: (1) transgene Linien in denen verschiedene Stellen im Genom durch fluoreszierende Proteine markiert sind, und die in Interphasen Zellkernen lebender Pflanzen beobachtet werden können, (2) Mutanten die in den verschiedenen Typen epigenetischer Geninaktivierung beeinträchtigt sind. Resultate dieser Untersuchungen werden helfen epigenetische Modifikationen in ein umfassendes Bild über die 3D Organisation und dynamische Natur des interphasen Chromatins in lebenden Zellen zu integrieren.

Für ein umfassendes Verständnis der Funktionen des Genoms sowie dessen Regulations -mechanismen wird nicht nur die Information über die lineare DNA Sequenz und den damit assozierten Proteinen benötigt, sondern ebenso Information darüber, wie diese molekularen Komponenten im Interphasen Zellkern von Pflanzen- und Tierzellen angeordnet sind, und wie die jeweilige Anordnung dynamisch kontrolliert wird. In Lehrbüchern und Überblick Artikeln über eukaryotische Gen Regulation werden hauptsächlich die strukturellen und epigenetischen Eigenschaften von Chromatin selbst, als auch die räumliche Anordnung im dreidimensionalen (3D) Raum des Zellkerns beschrieben. Eine wesentliche Heraus-forderung ist es nicht nur die 3D Architektur des Interphasen Chromatins in vivo genau zu beschreiben, sondern die Integration von räumlicher Information einerseits, und epigenetischen Modifikationen und Chromatin Mobilität andererseits. Der Zweck der hier vorgeschlagenen Arbeiten ist es zu studieren, welchen Einfluss epigenetische Vorgänge auf Genexpression und die 3D Anordnung von Chromosomen in der Interphase in lebenden Zellen haben. Diese Experimente werden unter Verwendung der Modellpflanze Arabidopsis thaliana durchgeführt werden, für die die notwendigen Werkzeuge vorhanden sind: (1) transgene Linien in denen verschiedene Stellen im Genom durch fluoreszierende Proteine markiert sind, und die in Interphasen Zellkernen lebender Pflanzen beobachtet werden können, (2) Mutanten die in den verschiedenen Typen epigenetischer Geninaktivierung beeinträchtigt sind. Resultate dieser Untersuchungen werden helfen epigenetische Modifikationen in ein umfassendes Bild über die 3D Organisation und dynamische Natur des interphasen Chromatins in lebenden Zellen zu integrieren.