Funktionelle Charakterisierung des S. pombe Genoms

Die Spalthefe Schizosaccharomyces pombe ist ein wichtiger Modellorganismus, um verschiedenste Aspekte er Biologie zu untersuchen. Das Ergebnis der Sequenzierung des S. pombe Genoms zeigte circa 5000 Open Reading Frames. Einige davon wiesen signifikante Ähnlichkeiten zu humanen Genen auf, die auch für diverse Krankheiten verantwortlich sind. Die Funktion vieler Open Reading Frames ist noch unbekannt. Eine systematische, genomweite Untersuchung ist nötig, um ihre Funktion bestimmen zu können. Das KRIBB-Bioneer-CRUK Konsortium hat beinahe eine Gen knock-out Stammsammlung fertig gestellt und ist im Moment damit beschäftigt die Phänotypen der so entstandenen Mutanten zu untersuchen. Allerdings war es nicht möglich ungefähr 300 Gene mittels konventioneller knock-out Techniken zu deletieren. Wir haben unlängst die effizienteste Methode entwickelt, um in großem Maßstab Gene in Spalthefe auszuschalten. Wir würden diese Technik gerne anwenden um die verbleibenden 300 Gene zu deletieren und den Phänotyp der daraus resultierenden Mutanten zu untersuchen. Dies würde uns erlauben, den genomweiten Screen fertig zu stellen und die Biologie der Spalthefe auf genomischer Ebenen zu untersuchen und zu interpretieren.

Die Spalthefe Schizosaccharomyces pombe ist ein wichtiger Modellorganismus, um verschiedenste Aspekte er Biologie zu untersuchen. Das Ergebnis der Sequenzierung des S. pombe Genoms zeigte circa 5000 Open Reading Frames. Einige davon wiesen signifikante Ähnlichkeiten zu humanen Genen auf, die auch für diverse Krankheiten verantwortlich sind. Die Funktion vieler Open Reading Frames ist noch unbekannt. Eine systematische, genomweite Untersuchung ist nötig, um ihre Funktion bestimmen zu können. Das KRIBB- Bioneer-CRUK Konsortium hat beinahe eine Gen knock-out Stammsammlung fertig gestellt und ist im Moment damit beschäftigt die Phänotypen der so entstandenen Mutanten zu untersuchen. Allerdings war es nicht möglich einige Gene mittels konventioneller knock-out Techniken zu deletieren. Wir haben unlängst die effizienteste Methode entwickelt, um in großem Maßstab Gene in Spalthefe auszuschalten. In diesem Projekt verwendet wir diese Knockout Strategie, Gene, die nicht von dem KRIBB-Bioneer-CRUK Konsortium gelöscht werden konnten auszuschalten. Dies erlaubte uns, fast vollständige Sammlung von Spalthefe knock-out-Stämmen, die ein wertvolles Werkzeug für die Analyse der Spalthefe Biologie, geschaffen werden.