MORN repeat Proteins und der Trypanosoma brucei bilobe
MORN repeat proteins and the Trypanosoma brucei bilobe
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Chemie (20%)
Keywords
-
Golgi,
T. brucei,
Biogenesis,
Bilobe,
Three-dimensional structure,
MORN repeat protein
Der Protist Trypanosoma brucei, Verursacher der Afrikanischen Schlafkrankheit in Menschen und Nagana in Vieh, ist ein früh abzweigender Eukaryot von fundamentalem biologischen Interesse. In diesem Organismus haben wir eine neue zytoskelettale Struktur entdeckt, die eine zweilappige Morphologie aufweist und TbCentrin2 und TbCentrin4 enthält. Centrine sind kleine Proteine der EF-Hand Familie und hoch konservierte Komponenten des Mikrotubuliorganisationszentrums eukaryotischer Zellen. Der Schwerpunkt dieses Antrags liegt auf einer neuen Komponente dieser zweilappigen Struktur, TbMORN1, die wir kürzlich entdeckt haben. TbMORN1 besteht aus 15 aneinandergereihten 23 Aminosäuren-langen MORN-Wiederholungen, die auch in zahlreichen anderen Organismen vorkommen. Die genaue Funktion der MORN-Wiederholungen ist noch unbekannt, sie dienen jedoch vermutlich als Protein-Protein- oder Protein-Lipid-Interaktionsdomänen. TbMORN1 ist ausschließlich an der zweilappigen Struktur lokalisiert, im Gegensatz zu den TbCentrinen, die auch im Basalkörper und anderen zytoskelettalen Strukturen vorkommen. Für das Blutstadium des Parasiten ist TbMORN1 lebensnotwendig. Mit Hilfe von RNAi wollen wir ein besseres Verständnis der biologischen Funktion von TbMORN1 erreichen. Durch die Identifizierung von TbMORN1 Bindungspartnern wollen wir auch andere Komponenten der zweilappigen Struktur bestimmen. Außerdem streben wir an, durch hochauflösende Strukturanalyse Erkenntnisse über die Funktionsweise der zweilappigen Struktur zu erlangen.
Durch dieses Projekt konnten neue grundlegende Erkenntnisse über einen menschlichen Parasiten namens Trypanosoma brucei gewonnen werden. Dieser einzellige Parasit verursacht die vernachlässigte Tropenkrankheit Menschliche Afrikanische Trypanosomiasis (umgangssprachlich auch Schlafkrankheit genannt). T. brucei alternieren zwischen zwei Lebensstadien in ihren Wirten, der Tsetsefliege und Säugetieren. Auf Grund der derzeitig sehr limitierten Behandlungsmöglichkeiten und deren hoher Toxizität herrscht ein dringender Bedarf an neuen Medikamenten gegen T. brucei. Ein Problem bei der Suche nach neuen therapeutischen Ansatzpunkten liegt darin, dass es sich bei T. brucei um Eukaryoten (ihr genetisches Material ist von einem Nukleus umhüllt) handelt. Da Menschen ebenfalls Eukaryoten sind, ist es erheblich schwieriger ein Medikament zu entwickeln, das zwar T. brucei eliminiert aber nicht toxisch für den Menschen ist. Im Gegensatz dazu können Prokaryoten (Bakterien), die sich vom Menschen in ausreichendem Maße unterscheiden, sicher mit Antibiotika behandelt werden. Wie alle eukaryotischen Zellen weisen auch T. brucei eine Innenarchitektur auf das Zytoskelett. Diverse Studien haben gezeigt, dass das Zytoskelett von T. brucei essentiell für deren Lebensfähigkeit und Pathogenität ist. Der Fokus dieses Projekts lag auf einer unlängst entdeckten Komponente des T. brucei Zytoskeletts, dem sogenannten Bilobe. Zum Zeitpunkt des Projektstarts war nur ein einziges Protein bekannt, welches ausschließlich am Bilobe präsent war TbMORN1. Durch spezifische Verminderung von TbMORN1 in den Zellen wurde gezeigt, dass der Bilobe essentiell für das Überleben der Säugetier-infektiösen Form von T. brucei ist. Der Bilobe wurde mittels Fluoreszenz- und Elektronenmikroskopie in hoher Auflösung untersucht. Daraufhin konnte ein neues Modell dessen Morphologie aufgestellt werden. Anhand einer neuen Methode namens Nähe abhängiger Biotin Identifizierung (BioID) konnten insgesamt sieben neue Bilobe Proteine identifiziert werden. Des weiteren konnten diverse Subdomänen innerhalb des Bilobes abgegrenzt werden. Zusätzlich wurde TbMORN1 mittels diverser biochemischer und biophysikalischer Methoden in vitro untersucht um ein Strukturmodell auf atomarer Ebene aufzustellen.
- Universität Wien - 100%
- Dmitri I. Svergun, European Molecular Biology Laboratory Hamburg - Deutschland
- Markus Engstler, Technische Universität Darmstadt - Deutschland
- Cynthia He, National University of Singapore - Singapur
- Gregor Anderluh, National Institute of Chemistry - Slowenien
- Elisabetta Ullu, Yale University - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 1097 Zitationen
- 31 Publikationen
-
2020
Titel Molecular basis of F-actin regulation and sarcomere assembly via myotilin DOI 10.1101/2020.09.25.310029 Typ Preprint Autor Kostan J Seiten 2020.09.25.310029 Link Publikation -
2020
Titel X-ray–induced photoreduction of heme metal centers rapidly induces active-site perturbations in a protein-independent manner DOI 10.1074/jbc.ra120.014087 Typ Journal Article Autor Pfanzagl V Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 13488-13501 Link Publikation -
2021
Titel FLNC-Associated Myofibrillar Myopathy DOI 10.1212/nxg.0000000000000590 Typ Journal Article Autor Kley R Journal Neurology: Genetics Link Publikation -
2021
Titel Order from disorder in the sarcomere: FATZ forms a fuzzy but tight complex and phase-separated condensates with a-actinin DOI 10.1126/sciadv.abg7653 Typ Journal Article Autor Sponga A Journal Science Advances Link Publikation -
2021
Titel Molecular basis of F-actin regulation and sarcomere assembly via myotilin DOI 10.1371/journal.pbio.3001148 Typ Journal Article Autor Kostan J Journal PLOS Biology Link Publikation -
2020
Titel PHF3 regulates neuronal gene expression through the new Pol II CTD reader domain SPOC DOI 10.1101/2020.02.11.943159 Typ Preprint Autor Appel L Seiten 2020.02.11.943159 Link Publikation -
2020
Titel Structures of three MORN repeat proteins and a re-evaluation of the proposed lipid-binding properties of MORN repeats DOI 10.1371/journal.pone.0242677 Typ Journal Article Autor Sajko S Journal PLOS ONE Link Publikation -
2020
Titel In-depth interrogation of protein thermal unfolding data with MoltenProt DOI 10.1002/pro.3986 Typ Journal Article Autor Kotov V Journal Protein Science Seiten 201-217 Link Publikation -
2023
Titel Unlocking Predictive Power: A Machine Learning Tool Derived from In-Depth Analysis to Forecast the Impact of Missense Variants in Human Filamin C DOI 10.1101/2023.08.05.552086 Typ Preprint Autor Nagy M Seiten 2023.08.05.552086 Link Publikation -
2020
Titel Calcium modulates the domain flexibility and function of an a-actinin similar to the ancestral a-actinin DOI 10.1073/pnas.1917269117 Typ Journal Article Autor Pinotsis N Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 22101-22112 Link Publikation -
2018
Titel Phosphorylation of HspB1 regulates its mechanosensitive molecular chaperone interaction with native filamin C DOI 10.1101/325712 Typ Preprint Autor Collier M Seiten 325712 Link Publikation -
2021
Titel PHF3 regulates neuronal gene expression through the Pol II CTD reader domain SPOC DOI 10.1038/s41467-021-26360-2 Typ Journal Article Autor Appel L Journal Nature Communications Seiten 6078 Link Publikation -
2017
Titel Conformational plasticity and evolutionary analysis of the myotilin tandem Ig domains DOI 10.1038/s41598-017-03323-6 Typ Journal Article Autor Puž V Journal Scientific Reports Seiten 3993 Link Publikation -
2017
Titel Deciphering the BAR code of membrane modulators DOI 10.1007/s00018-017-2478-0 Typ Journal Article Autor Salzer U Journal Cellular and Molecular Life Sciences Seiten 2413-2438 Link Publikation -
2017
Titel a-Actinin/titin interaction: A dynamic and mechanically stable cluster of bonds in the muscle Z-disk DOI 10.1073/pnas.1612681114 Typ Journal Article Autor Grison M Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 1015-1020 Link Publikation -
2015
Titel Structure and heme-binding properties of HemQ (chlorite dismutase-like protein) from Listeria monocytogenes DOI 10.1016/j.abb.2015.01.010 Typ Journal Article Autor Hofbauer S Journal Archives of Biochemistry and Biophysics Seiten 36-48 Link Publikation -
2015
Titel Structural Insights into Ca2+-Calmodulin Regulation of Plectin 1a-Integrin ß4 Interaction in Hemidesmosomes DOI 10.1016/j.str.2015.01.011 Typ Journal Article Autor Song J Journal Structure Seiten 558-570 Link Publikation -
2015
Titel Dimeric chlorite dismutase from the nitrogen-fixing cyanobacterium Cyanothece sp. PCC7425 DOI 10.1111/mmi.12989 Typ Journal Article Autor Schaffner I Journal Molecular Microbiology Seiten 1053-1068 Link Publikation -
2014
Titel The Structure and Regulation of Human Muscle a-Actinin DOI 10.1016/j.cell.2014.10.056 Typ Journal Article Autor De Almeida Ribeiro E Journal Cell Seiten 1447-1460 Link Publikation -
2014
Titel Transiently Produced Hypochlorite Is Responsible for the Irreversible Inhibition of Chlorite Dismutase DOI 10.1021/bi500401k Typ Journal Article Autor Hofbauer S Journal Biochemistry Seiten 3145-3157 Link Publikation -
2014
Titel Manipulating Conserved Heme Cavity Residues of Chlorite Dismutase: Effect on Structure, Redox Chemistry, and Reactivity DOI 10.1021/bi401042z Typ Journal Article Autor Hofbauer S Journal Biochemistry Seiten 77-89 Link Publikation -
2014
Titel Direct interaction of actin filaments with F-BAR protein pacsin2 DOI 10.15252/embr.201439267 Typ Journal Article Autor Kostan J Journal The EMBO Reports Seiten 1154-1162 Link Publikation -
2019
Titel HspB1 phosphorylation regulates its intramolecular dynamics and mechanosensitive molecular chaperone interaction with filamin C DOI 10.1126/sciadv.aav8421 Typ Journal Article Autor Collier M Journal Science Advances Link Publikation -
2017
Titel Molecular Mechanism of Enzymatic Chlorite Detoxification: Insights from Structural and Kinetic Studies DOI 10.1021/acscatal.7b01749 Typ Journal Article Autor Schaffner I Journal ACS Catalysis Seiten 7962-7976 Link Publikation -
2019
Titel Structures of three MORN repeat proteins and a re-evaluation of the proposed lipid-binding properties of MORN repeats DOI 10.1101/826180 Typ Preprint Autor Sajko S Seiten 826180 Link Publikation -
2012
Titel Novel Bilobe Components in Trypanosoma brucei Identified Using Proximity-Dependent Biotinylation DOI 10.1128/ec.00326-12 Typ Journal Article Autor Morriswood B Journal Eukaryotic Cell Seiten 356-367 Link Publikation -
2012
Titel Morphology of the Trypanosome Bilobe, a Novel Cytoskeletal Structure DOI 10.1128/ec.05287-11 Typ Journal Article Autor Esson H Journal Eukaryotic Cell Seiten 761-772 Link Publikation -
2022
Titel A Potential Citrate Shunt in Erythrocytes of PKAN Patients Caused by Mutations in Pantothenate Kinase 2 DOI 10.3390/biom12020325 Typ Journal Article Autor Werning M Journal Biomolecules Seiten 325 Link Publikation -
2016
Titel The structure and DNA-binding properties of Mgm101 from a yeast with a linear mitochondrial genome DOI 10.1093/nar/gkv1529 Typ Journal Article Autor Pevala V Journal Nucleic Acids Research Seiten 2227-2239 Link Publikation -
2016
Titel Structure and calcium-binding studies of calmodulin-like domain of human non-muscle a-actinin-1 DOI 10.1038/srep27383 Typ Journal Article Autor Drmota Prebil S Journal Scientific Reports Seiten 27383 Link Publikation -
2016
Titel Congenital macrothrombocytopenia-linked mutations in the actin-binding domain of a-actinin-1 enhance F-actin association DOI 10.1002/1873-3468.12101 Typ Journal Article Autor Murphy A Journal FEBS Letters Seiten 685-695 Link Publikation