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MORN repeat Proteins und der Trypanosoma brucei bilobe

MORN repeat proteins and the Trypanosoma brucei bilobe

Graham Warren (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P22276
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.02.2010
  • Projektende 28.02.2013
  • Bewilligungssumme 374.566 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Chemie (20%)

Keywords

    Golgi, T. brucei, Biogenesis, Bilobe, Three-dimensional structure, MORN repeat protein

Abstract Endbericht

Der Protist Trypanosoma brucei, Verursacher der Afrikanischen Schlafkrankheit in Menschen und Nagana in Vieh, ist ein früh abzweigender Eukaryot von fundamentalem biologischen Interesse. In diesem Organismus haben wir eine neue zytoskelettale Struktur entdeckt, die eine zweilappige Morphologie aufweist und TbCentrin2 und TbCentrin4 enthält. Centrine sind kleine Proteine der EF-Hand Familie und hoch konservierte Komponenten des Mikrotubuliorganisationszentrums eukaryotischer Zellen. Der Schwerpunkt dieses Antrags liegt auf einer neuen Komponente dieser zweilappigen Struktur, TbMORN1, die wir kürzlich entdeckt haben. TbMORN1 besteht aus 15 aneinandergereihten 23 Aminosäuren-langen MORN-Wiederholungen, die auch in zahlreichen anderen Organismen vorkommen. Die genaue Funktion der MORN-Wiederholungen ist noch unbekannt, sie dienen jedoch vermutlich als Protein-Protein- oder Protein-Lipid-Interaktionsdomänen. TbMORN1 ist ausschließlich an der zweilappigen Struktur lokalisiert, im Gegensatz zu den TbCentrinen, die auch im Basalkörper und anderen zytoskelettalen Strukturen vorkommen. Für das Blutstadium des Parasiten ist TbMORN1 lebensnotwendig. Mit Hilfe von RNAi wollen wir ein besseres Verständnis der biologischen Funktion von TbMORN1 erreichen. Durch die Identifizierung von TbMORN1 Bindungspartnern wollen wir auch andere Komponenten der zweilappigen Struktur bestimmen. Außerdem streben wir an, durch hochauflösende Strukturanalyse Erkenntnisse über die Funktionsweise der zweilappigen Struktur zu erlangen.

Durch dieses Projekt konnten neue grundlegende Erkenntnisse über einen menschlichen Parasiten namens Trypanosoma brucei gewonnen werden. Dieser einzellige Parasit verursacht die vernachlässigte Tropenkrankheit Menschliche Afrikanische Trypanosomiasis (umgangssprachlich auch Schlafkrankheit genannt). T. brucei alternieren zwischen zwei Lebensstadien in ihren Wirten, der Tsetsefliege und Säugetieren. Auf Grund der derzeitig sehr limitierten Behandlungsmöglichkeiten und deren hoher Toxizität herrscht ein dringender Bedarf an neuen Medikamenten gegen T. brucei. Ein Problem bei der Suche nach neuen therapeutischen Ansatzpunkten liegt darin, dass es sich bei T. brucei um Eukaryoten (ihr genetisches Material ist von einem Nukleus umhüllt) handelt. Da Menschen ebenfalls Eukaryoten sind, ist es erheblich schwieriger ein Medikament zu entwickeln, das zwar T. brucei eliminiert aber nicht toxisch für den Menschen ist. Im Gegensatz dazu können Prokaryoten (Bakterien), die sich vom Menschen in ausreichendem Maße unterscheiden, sicher mit Antibiotika behandelt werden. Wie alle eukaryotischen Zellen weisen auch T. brucei eine Innenarchitektur auf das Zytoskelett. Diverse Studien haben gezeigt, dass das Zytoskelett von T. brucei essentiell für deren Lebensfähigkeit und Pathogenität ist. Der Fokus dieses Projekts lag auf einer unlängst entdeckten Komponente des T. brucei Zytoskeletts, dem sogenannten Bilobe. Zum Zeitpunkt des Projektstarts war nur ein einziges Protein bekannt, welches ausschließlich am Bilobe präsent war TbMORN1. Durch spezifische Verminderung von TbMORN1 in den Zellen wurde gezeigt, dass der Bilobe essentiell für das Überleben der Säugetier-infektiösen Form von T. brucei ist. Der Bilobe wurde mittels Fluoreszenz- und Elektronenmikroskopie in hoher Auflösung untersucht. Daraufhin konnte ein neues Modell dessen Morphologie aufgestellt werden. Anhand einer neuen Methode namens Nähe abhängiger Biotin Identifizierung (BioID) konnten insgesamt sieben neue Bilobe Proteine identifiziert werden. Des weiteren konnten diverse Subdomänen innerhalb des Bilobes abgegrenzt werden. Zusätzlich wurde TbMORN1 mittels diverser biochemischer und biophysikalischer Methoden in vitro untersucht um ein Strukturmodell auf atomarer Ebene aufzustellen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Dmitri I. Svergun, European Molecular Biology Laboratory Hamburg - Deutschland
  • Markus Engstler, Technische Universität Darmstadt - Deutschland
  • Cynthia He, National University of Singapore - Singapur
  • Gregor Anderluh, National Institute of Chemistry - Slowenien
  • Elisabetta Ullu, Yale University - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 1097 Zitationen
  • 31 Publikationen
Publikationen
  • 2020
    Titel Molecular basis of F-actin regulation and sarcomere assembly via myotilin
    DOI 10.1101/2020.09.25.310029
    Typ Preprint
    Autor Kostan J
    Seiten 2020.09.25.310029
    Link Publikation
  • 2020
    Titel X-ray–induced photoreduction of heme metal centers rapidly induces active-site perturbations in a protein-independent manner
    DOI 10.1074/jbc.ra120.014087
    Typ Journal Article
    Autor Pfanzagl V
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 13488-13501
    Link Publikation
  • 2021
    Titel FLNC-Associated Myofibrillar Myopathy
    DOI 10.1212/nxg.0000000000000590
    Typ Journal Article
    Autor Kley R
    Journal Neurology: Genetics
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Order from disorder in the sarcomere: FATZ forms a fuzzy but tight complex and phase-separated condensates with a-actinin
    DOI 10.1126/sciadv.abg7653
    Typ Journal Article
    Autor Sponga A
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Molecular basis of F-actin regulation and sarcomere assembly via myotilin
    DOI 10.1371/journal.pbio.3001148
    Typ Journal Article
    Autor Kostan J
    Journal PLOS Biology
    Link Publikation
  • 2020
    Titel PHF3 regulates neuronal gene expression through the new Pol II CTD reader domain SPOC
    DOI 10.1101/2020.02.11.943159
    Typ Preprint
    Autor Appel L
    Seiten 2020.02.11.943159
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Structures of three MORN repeat proteins and a re-evaluation of the proposed lipid-binding properties of MORN repeats
    DOI 10.1371/journal.pone.0242677
    Typ Journal Article
    Autor Sajko S
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
  • 2020
    Titel In-depth interrogation of protein thermal unfolding data with MoltenProt
    DOI 10.1002/pro.3986
    Typ Journal Article
    Autor Kotov V
    Journal Protein Science
    Seiten 201-217
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Unlocking Predictive Power: A Machine Learning Tool Derived from In-Depth Analysis to Forecast the Impact of Missense Variants in Human Filamin C
    DOI 10.1101/2023.08.05.552086
    Typ Preprint
    Autor Nagy M
    Seiten 2023.08.05.552086
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Calcium modulates the domain flexibility and function of an a-actinin similar to the ancestral a-actinin
    DOI 10.1073/pnas.1917269117
    Typ Journal Article
    Autor Pinotsis N
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 22101-22112
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Phosphorylation of HspB1 regulates its mechanosensitive molecular chaperone interaction with native filamin C
    DOI 10.1101/325712
    Typ Preprint
    Autor Collier M
    Seiten 325712
    Link Publikation
  • 2021
    Titel PHF3 regulates neuronal gene expression through the Pol II CTD reader domain SPOC
    DOI 10.1038/s41467-021-26360-2
    Typ Journal Article
    Autor Appel L
    Journal Nature Communications
    Seiten 6078
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Conformational plasticity and evolutionary analysis of the myotilin tandem Ig domains
    DOI 10.1038/s41598-017-03323-6
    Typ Journal Article
    Autor Puž V
    Journal Scientific Reports
    Seiten 3993
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Deciphering the BAR code of membrane modulators
    DOI 10.1007/s00018-017-2478-0
    Typ Journal Article
    Autor Salzer U
    Journal Cellular and Molecular Life Sciences
    Seiten 2413-2438
    Link Publikation
  • 2017
    Titel a-Actinin/titin interaction: A dynamic and mechanically stable cluster of bonds in the muscle Z-disk
    DOI 10.1073/pnas.1612681114
    Typ Journal Article
    Autor Grison M
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 1015-1020
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Structure and heme-binding properties of HemQ (chlorite dismutase-like protein) from Listeria monocytogenes
    DOI 10.1016/j.abb.2015.01.010
    Typ Journal Article
    Autor Hofbauer S
    Journal Archives of Biochemistry and Biophysics
    Seiten 36-48
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Structural Insights into Ca2+-Calmodulin Regulation of Plectin 1a-Integrin ß4 Interaction in Hemidesmosomes
    DOI 10.1016/j.str.2015.01.011
    Typ Journal Article
    Autor Song J
    Journal Structure
    Seiten 558-570
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Dimeric chlorite dismutase from the nitrogen-fixing cyanobacterium Cyanothece sp. PCC7425
    DOI 10.1111/mmi.12989
    Typ Journal Article
    Autor Schaffner I
    Journal Molecular Microbiology
    Seiten 1053-1068
    Link Publikation
  • 2014
    Titel The Structure and Regulation of Human Muscle a-Actinin
    DOI 10.1016/j.cell.2014.10.056
    Typ Journal Article
    Autor De Almeida Ribeiro E
    Journal Cell
    Seiten 1447-1460
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Transiently Produced Hypochlorite Is Responsible for the Irreversible Inhibition of Chlorite Dismutase
    DOI 10.1021/bi500401k
    Typ Journal Article
    Autor Hofbauer S
    Journal Biochemistry
    Seiten 3145-3157
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Manipulating Conserved Heme Cavity Residues of Chlorite Dismutase: Effect on Structure, Redox Chemistry, and Reactivity
    DOI 10.1021/bi401042z
    Typ Journal Article
    Autor Hofbauer S
    Journal Biochemistry
    Seiten 77-89
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Direct interaction of actin filaments with F-BAR protein pacsin2
    DOI 10.15252/embr.201439267
    Typ Journal Article
    Autor Kostan J
    Journal The EMBO Reports
    Seiten 1154-1162
    Link Publikation
  • 2019
    Titel HspB1 phosphorylation regulates its intramolecular dynamics and mechanosensitive molecular chaperone interaction with filamin C
    DOI 10.1126/sciadv.aav8421
    Typ Journal Article
    Autor Collier M
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Molecular Mechanism of Enzymatic Chlorite Detoxification: Insights from Structural and Kinetic Studies
    DOI 10.1021/acscatal.7b01749
    Typ Journal Article
    Autor Schaffner I
    Journal ACS Catalysis
    Seiten 7962-7976
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Structures of three MORN repeat proteins and a re-evaluation of the proposed lipid-binding properties of MORN repeats
    DOI 10.1101/826180
    Typ Preprint
    Autor Sajko S
    Seiten 826180
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Novel Bilobe Components in Trypanosoma brucei Identified Using Proximity-Dependent Biotinylation
    DOI 10.1128/ec.00326-12
    Typ Journal Article
    Autor Morriswood B
    Journal Eukaryotic Cell
    Seiten 356-367
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Morphology of the Trypanosome Bilobe, a Novel Cytoskeletal Structure
    DOI 10.1128/ec.05287-11
    Typ Journal Article
    Autor Esson H
    Journal Eukaryotic Cell
    Seiten 761-772
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A Potential Citrate Shunt in Erythrocytes of PKAN Patients Caused by Mutations in Pantothenate Kinase 2
    DOI 10.3390/biom12020325
    Typ Journal Article
    Autor Werning M
    Journal Biomolecules
    Seiten 325
    Link Publikation
  • 2016
    Titel The structure and DNA-binding properties of Mgm101 from a yeast with a linear mitochondrial genome
    DOI 10.1093/nar/gkv1529
    Typ Journal Article
    Autor Pevala V
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 2227-2239
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Structure and calcium-binding studies of calmodulin-like domain of human non-muscle a-actinin-1
    DOI 10.1038/srep27383
    Typ Journal Article
    Autor Drmota Prebil S
    Journal Scientific Reports
    Seiten 27383
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Congenital macrothrombocytopenia-linked mutations in the actin-binding domain of a-actinin-1 enhance F-actin association
    DOI 10.1002/1873-3468.12101
    Typ Journal Article
    Autor Murphy A
    Journal FEBS Letters
    Seiten 685-695
    Link Publikation

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