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Struktur und Elastizität von Fluid-Geordneten / Fluid-Ungeordneten Domänen

Structure and Elasticity of Liquid Ordered / Liquid Disordered Domains

Georg Pabst (ORCID: 0000-0003-1967-1536)
  • Grant-DOI 10.55776/P24459
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2012
  • Projektende 31.08.2016
  • Bewilligungssumme 267.561 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (75%); Chemie (25%)

Keywords

    Membrane Biophysics, Membrane Raft Model, Phase Coexistence, Lipid-Domains

Abstract Endbericht

Biologische Membranen steuern eine Vielzahl von Vorgängen auf der zellulären Ebene, wie z.B. Materialtransport, Signalübertragung und zahlreiche chemische Reaktionen. Das zentrale Element dieser Membranen ist eine etwa 4 nm dünne Schicht aus Phospholipiden und Proteinen, wobei es zahlreiche Hinweise für eine gegenseitige Beeinflussung von Lipiden und Membranproteinen gibt. Von besonderem Interesse ist die Organisation von Lipiden und Proteinen in funktionellen Plattformem, sogenannte "Rafts", mit spezifischen Aufgaben für Transport und Signalübertragung. Sphingomyelin und Cholesterin sind laut gegenwärtiger Meinung die Lipidhauptbestandteile der Rafts. Ein grundlegendes physikalisch-chemisches Verständnis der Eigenschaften von "Membran-Rafts" ist daher eine unverzichtbare Voraussetzung für wegweisende medzinische und pharmazeutische Entwicklungen. Biophysikalische Studien an komplexen Mischungen von "Raftlipiden" können einen wesentlichen Beitrag zu diesem Wissen liefern. In diesen Lipidmischungen kommt es zu einer Phasenseparation in "fluid-geordnete" (L o ) und "fluid-ungeordnete" (L a) Domänen. Lo -Phasen entsprechen in vielen Eigenschaften natürlichen Membran- Rafts, inklusive des erhöhten Cholesteringehalts, sowie der bevorzugten Insertierung von Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-verankerten Proteinen in diese Lipidumgebung. Jedoch stellt die kürzlich entdeckte Seggregation von raft-assoziierten Transmembranproteinen (TMP) aus Lo -Phasen die Anwendbarkeit dieser Modelle für Membran-Rafts in Frage. Ziel des Projektes ist daher, lipid-basierte Modelle herzuleiten, welche die Partitioninerung von TMP wieder zulassen und somit optimierte und experimentell streng kontrollierbare Modellsysteme für Membran-Rafts darstellen. Zu diesem Zweck sollen unter der Verwendung einer Vielzahl von biophysikalischen Methoden diejenigen strukturellen und elastischen Parameter von Lo und La Phasen hergeleitet werden, welche die Partitionierung von TMP bestimmen. Insbesondere sind dies die Packungsdichte (Fläche pro Lipid), Membrandicke, spontane Krümmung, Gaussscher Kurvaturmodulus und Biegefestigkeit. Mit Hilfe dieser Parameter werden wir die bevorzugte Insertierung von Modelproteinen in bestimmte Lipidumgebungen berechnen. Die Ergebnissen werden zeigen, warum TMP nicht in gegenwärtige Raft-Modelle partitionieren und wie wir ihre physiko-chemischen Eigenschaften verändern müssen, damit TMP wieder in diese Lipiddomänen insertieren. Schließlich werden wir die optimierten Lo -Phasen testen, indem wir die Partitionierung eines etablierten TMP-Modellpeptides in diese Domänen messen, und mit dem Insertiationsverhalten in raft-ähnlichen Strukturen in Plasmamembran-Präparationen vergleichen. Das Projekt beinhaltet eine Kooperation mit hochrangigen Experten aus den Bereichen der Biophysik und Zellbiologie. Der Brückenschlag zwischen den beiden Disziplinen wird für eine Vielzahl von zukünftigen Projekten als Basis dienen.

Zellmembranen sind komplexe dynamische Verbundstoffe aus Lipiden, Proteinen und Kohlenhydraten (Zucker) mit einer Vielzahl von physiologischen Aufgaben (z.B. Schützen/Abtrennen des Zellinneren für diverse biochemische Reaktionen, oder Schaffung einer Kommunikationsplattform zwischen Zellen). Der strukturelle hierarchische Aufbau der Membranen spielt hierbei eine besondere Rolle. Eine der Hypothesen zur Membranstruktur geht davon aus, dass kurzlebige, mikroskopisch kleine Domänen (Rafts) für Zellkommunikation oder Materialtransport durch die Membranen verantwortlich sind. Allerdings ist es aufgrund der Komplexität des Systems bislang nicht gelungen, diese Strukturen in lebenden Zellen direkt nachzuweisen. Künstliche Membranen aus Lipidmischungen sind hingegen dafür bekannt, unter bestimmten Voraussetzungen solche Domänen auszubilden. Ziel des Projektes war es, diese Domänen in künstlichen Membranen genauer zu analysieren, um ein besseres Verständnis ihrer physikalischen Eigenschaften zu erlangen. Diese Eigenschaften sind wiederum wichtig um das Verhalten von Membranproteinen zu verstehen, die zwischen den beiden Domänen aussuchen können, um ihre Funktionen (z.B. Signalübertragung) erfüllen zu können. Zu diesem Zweck wurden Röntgen- und Neutronenstreumethoden entwickelt, die es erstmals erlaubten koexistierende Domänen in situ, d.h. simultan zu untersuchen. Die erhaltenen Einblicke auf der Subnanometer Längenskala brachten einige interessante Ergebnisse zum Vorschein. Zum Beispiel fanden wir, dass die festeren Domänen beim Aufheizen dünner werden, wohingegen die weicheren sich zusehends verdicken, bis beide Domänen schließlich zu einer homogenen Membran verschmelzen. Das Temperaturverhalten lässt sich durch einen Austausch der Lipide (durch Diffusion) verstehen. Interessanterweise richten sich diese Domänen in mehrschaligen Vesikeln zueinander aus, sodass immer gleichartige Domänen übereinander zu liegen kommen, was umso bemerkenswerter ist, da die Membranen durch eine Wasserschicht voneinander getrennt sind. Unsere Messungen zeigten, dass dies durch ein Wechselspiel der anziehenden und abstoßenden Kräfte bewerkstelligt wird. Insbesondere waren die fluktuationsgetriebenen Kräfte zwischen weichen und festen Domänen stark unterschiedlich. Die erhaltenen physikalischen Parameter der Domänen erlaubten uns schließlich den bevorzugten Aufenthalt von Transmembranproteinen mit verschiedenen Formen zu berechnen. Proteine mit einer konvexen Form etwa tauchen bevorzugt in weiche Domänen ein, und konkave Proteine in festere. Proteine mit einer asymmetrischen Form hingegen bevorzugen auch eine asymmetrisch zusammengesetzte Lipidmembran. Dies könnte eine wichtige Rolle bei der für physiologische Funktionen so wichtigen Asymmetrie von Zellmembranen spielen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Kai Simons, Max-Planck-Institut für - Deutschland
  • Daniel Harries, The Hebrew University of Jerusalem - Israel
  • Siewert-Jan Marrink, University of Groningen - Niederlande
  • Norbert Kucerka, Joint Institute for Nuclear Research - Russland
  • Zoran Arsov, Jozef Stefan Institute - Slowenien
  • George Khelashvili, Cornell University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Gerald W. Feigenson, Cornell University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Frederick A. Heberle, Oak Ridge National Laboratory - Vereinigte Staaten von Amerika
  • John Katsaras, Oak Ridge National Laboratory - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Ilya Levental, University of Virginia - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 838 Zitationen
  • 46 Publikationen
Publikationen
  • 2014
    Titel Characterization of Phosphatidylcholine/Tween-80 Model Membranes for the NMR Study of Membrane Interactions
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2804
    Typ Journal Article
    Autor Gravel A
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Monolayer Spontaneous Curvature of Raft-Forming Membrane Lipids
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2802
    Typ Journal Article
    Autor Kollmitzer B
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Lipid Order Investigations Combined with Generalized Polarization Provide Deeper Insights into Plasma Membrane Architecture of Live Cells
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2851
    Typ Journal Article
    Autor Kress A
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Protein Partitioning in Liquid-Ordered (LO) / Liquid-Disordered (LD) Domains Depends on Lipid Composition and Protein Shape
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2853
    Typ Journal Article
    Autor Kollmitzer B
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel The Effect of Ectoins on the Structural Organization of the Tear Fluid Monolayer
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2850
    Typ Journal Article
    Autor Galla H
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Kinetic Study of Photo-Induced Lipid Oxidation in Giant Unilamellar Vesicles
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2805
    Typ Journal Article
    Autor Sankhagowit S
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Chelating Agent Induction of Multiphase Coexistence in Lipid Multilayers
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.500
    Typ Journal Article
    Autor Weisman M
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Crystal Structures of the Ryanodine Receptor SPRY2 Domain
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1868
    Typ Journal Article
    Autor Lau K
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Cell Cycle Position Determines Critical Temperatures in Plasma Membrane Vesicles
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.505
    Typ Journal Article
    Autor Gray E
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel On scattered waves and lipid domains: detecting membrane rafts with X-rays and neutrons
    DOI 10.1039/c5sm01807b
    Typ Journal Article
    Autor Marquardt D
    Journal Soft Matter
    Seiten 9055-9072
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Medium Matters: Order through Fluctuations?
    DOI 10.1016/j.bpj.2015.05.008
    Typ Journal Article
    Autor Parikh A
    Journal Biophysical Journal
    Seiten 2751-2753
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Multiple Closed States of the Ryanodine Receptor Determined by CRYOEM
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1867
    Typ Journal Article
    Autor Castro-Hartmann P
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Membrane Domain Interactions by Monte Carlo Type Analysis of Osmotic Stress Data
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.502
    Typ Journal Article
    Autor Kollmitzer B
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Structural Studies of IP3R by Cryoem
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1866
    Typ Journal Article
    Autor Jiang Q
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Influence of Domain Size on Structure and Elastic Fluctuations in Complex Lipid Mixtures
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1871
    Typ Journal Article
    Autor Heftberger P
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Hydrocarbon Thickness Dictates Cholesterol's Location, Orientation and Motion in a Phospholipid Bilayer
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.501
    Typ Journal Article
    Autor Marquardt D
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel How do Cholesterol and Saturated Sphingolipids Affect Acyl Chain Order in the Fluid Phase of Binary POPC Bilayers - a Study with 1-oleoyl-2-propionyl-DPH-sn-glycero-3-phosphocholine
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.503
    Typ Journal Article
    Autor Engberg O
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Terrestrial adaptation of green algae Klebsormidium and Zygnema (Charophyta) involves diversity in photosynthetic traits but not in CO2 acquisition
    DOI 10.1007/s00425-017-2741-5
    Typ Journal Article
    Autor Pierangelini M
    Journal Planta
    Seiten 971-986
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Complex biomembrane mimetics on the sub-nanometer scale
    DOI 10.1007/s12551-017-0275-5
    Typ Journal Article
    Autor Heberle F
    Journal Biophysical Reviews
    Seiten 353-373
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Interaction of HIV-1 Gag Protein's Ma Membrane Binding Domain with Membrane Mimics Probed by Low- and Wide-Angle X-Ray Scattering
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1870
    Typ Journal Article
    Autor O’Neil L
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Structure and interactions of raft-like domains.
    Typ Journal Article
    Autor Kollmitzer B
    Journal European Biophysics Journal with Biophysics Letters
  • 2015
    Titel Bending Rigidities and Interdomain Forces in Membranes with Coexisting Lipid Domains
    DOI 10.1016/j.bpj.2015.05.003
    Typ Journal Article
    Autor Kollmitzer B
    Journal Biophysical Journal
    Seiten 2833-2842
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Quantitative Comparison against Experiments Reveals Imperfections in Force Fields' Descriptions of POPC-Cholesterol Interactions.
    DOI 10.1021/acs.jctc.3c00648
    Typ Journal Article
    Autor Heftberger P
    Journal Journal of chemical theory and computation
    Seiten 6342-6352
  • 2023
    Titel Quantitative Comparison Against Experiments Reveals Imperfections in Force Fields' Descriptions of Phospholipid-Cholesterol Interactions
    DOI 10.26434/chemrxiv-2023-kz2lk
    Typ Preprint
    Autor Heftberger P
  • 2023
    Titel Quantitative Comparison against Experiments Reveals Imperfections in Force Fields' Descriptions of POPC-Cholesterol Interactions
    DOI 10.17169/refubium-41844
    Typ Other
    Autor Heftberger P
    Link Publikation
  • 2015
    Titel In Situ Determination of Structure and Fluctuations of Coexisting Fluid Membrane Domains
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.3488
    Typ Journal Article
    Autor Heftberger P
    Journal Biophysical Journal
    Seiten 854-862
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Bending rigidities and interdomain forces in membranes with coexisting lipid domains
    DOI 10.48550/arxiv.1502.07472
    Typ Preprint
    Autor Kollmitzer B
  • 2015
    Titel Phase Coexistence in Lipid Membranes Induced by Buffering Agents and Charged Lipid Headgroups
    DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1872
    Typ Journal Article
    Autor Johnson M
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Integrins and Urokinase Receptors Show Distinct Mechanisms of Protein Sequestration in Raft-Mimicking Lipid Mixtures: Influence of Bilayer Asymmetry, Ligand Binding, and Cholesterol Content
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2801
    Typ Journal Article
    Autor Ge Y
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Temperature Dependence of Lo/Ld Domain Thickness and Elasticity by Global Saxs Data Analysis
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2863
    Typ Journal Article
    Autor Heftberger P
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Spin Labels Detect the Coexistence of Two Lipid Domains Along the Anomalous Gel-Fluid Transition of Anionic Dmpg Bilayers
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2852
    Typ Journal Article
    Autor Pellegrina D
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Protein partitioning in liquid-ordered (Lo)/liquid-disordered (Ld) domains.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Kollmitzer B
    Konferenz Springer (Hg.): 9th European Biophysics Congress, 13-17 July 2013, Lisbon, Portugal. 2013.
  • 2013
    Titel Monolayer spontaneous curvature of raft-forming membrane lipids
    DOI 10.1039/c3sm51829a
    Typ Journal Article
    Autor Kollmitzer B
    Journal Soft Matter
    Seiten 10877-10884
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Hybrid and Nonhybrid Lipids Exert Common Effects on Membrane Raft Size and Morphology
    DOI 10.1021/ja407624c
    Typ Journal Article
    Autor Heberle F
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 14932-14935
  • 2014
    Titel Hybrid and Nonhybrid Lipids Exert Common Effects on Membrane Raft Size and Morphology
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2803
    Typ Journal Article
    Autor Doktorova M
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Solubilization of Giant Vesicles Composed of Erythrocyte Lipid Extracts and of Ternary Lipid Mixtures by Triton X-100
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2806
    Typ Journal Article
    Autor Casadei B
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Perturbation of Plasma Membrane Physical Properties by Endogenous and Exogenous Mediators Affects Cell Function
    DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2854
    Typ Journal Article
    Autor Levental K
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Advancing high resolution structural analysis of lipid membranes using a genetic algorithm.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Heftberger B
    Konferenz Springer (Hg.): 9th European Biophysics Congress, 13-17 July 2013, Lisbon, Portugal. 2013
  • 2013
    Titel Global small-angle X-ray scattering data analysis for multilamellar vesicles: the evolution of the scattering density profile model
    DOI 10.1107/s1600576713029798
    Typ Journal Article
    Autor Heftberger P
    Journal Journal of Applied Crystallography
    Seiten 173-180
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Chapter Four Coupling Membrane Elasticity and Structure to Protein Function
    DOI 10.1016/b978-0-12-411515-6.00004-7
    Typ Book Chapter
    Autor Pabst G
    Verlag Elsevier
    Seiten 81-109
  • 2013
    Titel Calculating the Bending Modulus for Multicomponent Lipid Membranes in Different Thermodynamic Phases
    DOI 10.1021/ct400492e
    Typ Journal Article
    Autor Khelashvili G
    Journal Journal of Chemical Theory and Computation
    Seiten 3866-3871
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Global SAXS data analysis for multilamellar vesicles: Evolution of the scattering density profile (SDP) model
    DOI 10.48550/arxiv.1309.5237
    Typ Preprint
    Autor Heftberger P
  • 2013
    Titel Monolayer Spontaneous Curvature of Raft-Forming Membrane Lipids
    DOI 10.48550/arxiv.1307.0367
    Typ Preprint
    Autor Kollmitzer B
  • 2016
    Titel Membrane Domains on the Sub-Nanometer Scale
    DOI 10.1016/j.bpj.2015.11.071
    Typ Journal Article
    Autor Pabst G
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Lateral pressure-mediated protein partitioning into liquid-ordered/liquid-disordered domains
    DOI 10.1039/c6sm00042h
    Typ Journal Article
    Autor Frewein M
    Journal Soft Matter
    Seiten 3189-3195
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Atomistic resolution structure and dynamics of lipid bilayers in simulations and experiments
    DOI 10.1016/j.bbamem.2016.01.019
    Typ Journal Article
    Autor Ollila O
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes
    Seiten 2512-2528
    Link Publikation

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