Struktur und Elastizität von Fluid-Geordneten / Fluid-Ungeordneten Domänen
Structure and Elasticity of Liquid Ordered / Liquid Disordered Domains
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (75%); Chemie (25%)
Keywords
-
Membrane Biophysics,
Membrane Raft Model,
Phase Coexistence,
Lipid-Domains
Biologische Membranen steuern eine Vielzahl von Vorgängen auf der zellulären Ebene, wie z.B. Materialtransport, Signalübertragung und zahlreiche chemische Reaktionen. Das zentrale Element dieser Membranen ist eine etwa 4 nm dünne Schicht aus Phospholipiden und Proteinen, wobei es zahlreiche Hinweise für eine gegenseitige Beeinflussung von Lipiden und Membranproteinen gibt. Von besonderem Interesse ist die Organisation von Lipiden und Proteinen in funktionellen Plattformem, sogenannte "Rafts", mit spezifischen Aufgaben für Transport und Signalübertragung. Sphingomyelin und Cholesterin sind laut gegenwärtiger Meinung die Lipidhauptbestandteile der Rafts. Ein grundlegendes physikalisch-chemisches Verständnis der Eigenschaften von "Membran-Rafts" ist daher eine unverzichtbare Voraussetzung für wegweisende medzinische und pharmazeutische Entwicklungen. Biophysikalische Studien an komplexen Mischungen von "Raftlipiden" können einen wesentlichen Beitrag zu diesem Wissen liefern. In diesen Lipidmischungen kommt es zu einer Phasenseparation in "fluid-geordnete" (L o ) und "fluid-ungeordnete" (L a) Domänen. Lo -Phasen entsprechen in vielen Eigenschaften natürlichen Membran- Rafts, inklusive des erhöhten Cholesteringehalts, sowie der bevorzugten Insertierung von Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-verankerten Proteinen in diese Lipidumgebung. Jedoch stellt die kürzlich entdeckte Seggregation von raft-assoziierten Transmembranproteinen (TMP) aus Lo -Phasen die Anwendbarkeit dieser Modelle für Membran-Rafts in Frage. Ziel des Projektes ist daher, lipid-basierte Modelle herzuleiten, welche die Partitioninerung von TMP wieder zulassen und somit optimierte und experimentell streng kontrollierbare Modellsysteme für Membran-Rafts darstellen. Zu diesem Zweck sollen unter der Verwendung einer Vielzahl von biophysikalischen Methoden diejenigen strukturellen und elastischen Parameter von Lo und La Phasen hergeleitet werden, welche die Partitionierung von TMP bestimmen. Insbesondere sind dies die Packungsdichte (Fläche pro Lipid), Membrandicke, spontane Krümmung, Gaussscher Kurvaturmodulus und Biegefestigkeit. Mit Hilfe dieser Parameter werden wir die bevorzugte Insertierung von Modelproteinen in bestimmte Lipidumgebungen berechnen. Die Ergebnissen werden zeigen, warum TMP nicht in gegenwärtige Raft-Modelle partitionieren und wie wir ihre physiko-chemischen Eigenschaften verändern müssen, damit TMP wieder in diese Lipiddomänen insertieren. Schließlich werden wir die optimierten Lo -Phasen testen, indem wir die Partitionierung eines etablierten TMP-Modellpeptides in diese Domänen messen, und mit dem Insertiationsverhalten in raft-ähnlichen Strukturen in Plasmamembran-Präparationen vergleichen. Das Projekt beinhaltet eine Kooperation mit hochrangigen Experten aus den Bereichen der Biophysik und Zellbiologie. Der Brückenschlag zwischen den beiden Disziplinen wird für eine Vielzahl von zukünftigen Projekten als Basis dienen.
Zellmembranen sind komplexe dynamische Verbundstoffe aus Lipiden, Proteinen und Kohlenhydraten (Zucker) mit einer Vielzahl von physiologischen Aufgaben (z.B. Schützen/Abtrennen des Zellinneren für diverse biochemische Reaktionen, oder Schaffung einer Kommunikationsplattform zwischen Zellen). Der strukturelle hierarchische Aufbau der Membranen spielt hierbei eine besondere Rolle. Eine der Hypothesen zur Membranstruktur geht davon aus, dass kurzlebige, mikroskopisch kleine Domänen (Rafts) für Zellkommunikation oder Materialtransport durch die Membranen verantwortlich sind. Allerdings ist es aufgrund der Komplexität des Systems bislang nicht gelungen, diese Strukturen in lebenden Zellen direkt nachzuweisen. Künstliche Membranen aus Lipidmischungen sind hingegen dafür bekannt, unter bestimmten Voraussetzungen solche Domänen auszubilden. Ziel des Projektes war es, diese Domänen in künstlichen Membranen genauer zu analysieren, um ein besseres Verständnis ihrer physikalischen Eigenschaften zu erlangen. Diese Eigenschaften sind wiederum wichtig um das Verhalten von Membranproteinen zu verstehen, die zwischen den beiden Domänen aussuchen können, um ihre Funktionen (z.B. Signalübertragung) erfüllen zu können. Zu diesem Zweck wurden Röntgen- und Neutronenstreumethoden entwickelt, die es erstmals erlaubten koexistierende Domänen in situ, d.h. simultan zu untersuchen. Die erhaltenen Einblicke auf der Subnanometer Längenskala brachten einige interessante Ergebnisse zum Vorschein. Zum Beispiel fanden wir, dass die festeren Domänen beim Aufheizen dünner werden, wohingegen die weicheren sich zusehends verdicken, bis beide Domänen schließlich zu einer homogenen Membran verschmelzen. Das Temperaturverhalten lässt sich durch einen Austausch der Lipide (durch Diffusion) verstehen. Interessanterweise richten sich diese Domänen in mehrschaligen Vesikeln zueinander aus, sodass immer gleichartige Domänen übereinander zu liegen kommen, was umso bemerkenswerter ist, da die Membranen durch eine Wasserschicht voneinander getrennt sind. Unsere Messungen zeigten, dass dies durch ein Wechselspiel der anziehenden und abstoßenden Kräfte bewerkstelligt wird. Insbesondere waren die fluktuationsgetriebenen Kräfte zwischen weichen und festen Domänen stark unterschiedlich. Die erhaltenen physikalischen Parameter der Domänen erlaubten uns schließlich den bevorzugten Aufenthalt von Transmembranproteinen mit verschiedenen Formen zu berechnen. Proteine mit einer konvexen Form etwa tauchen bevorzugt in weiche Domänen ein, und konkave Proteine in festere. Proteine mit einer asymmetrischen Form hingegen bevorzugen auch eine asymmetrisch zusammengesetzte Lipidmembran. Dies könnte eine wichtige Rolle bei der für physiologische Funktionen so wichtigen Asymmetrie von Zellmembranen spielen.
- Universität Graz - 100%
- Kai Simons, Max-Planck-Institut für - Deutschland
- Daniel Harries, The Hebrew University of Jerusalem - Israel
- Siewert-Jan Marrink, University of Groningen - Niederlande
- Norbert Kucerka, Joint Institute for Nuclear Research - Russland
- Zoran Arsov, Jozef Stefan Institute - Slowenien
- George Khelashvili, Cornell University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Gerald W. Feigenson, Cornell University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Frederick A. Heberle, Oak Ridge National Laboratory - Vereinigte Staaten von Amerika
- John Katsaras, Oak Ridge National Laboratory - Vereinigte Staaten von Amerika
- Ilya Levental, University of Virginia - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 858 Zitationen
- 46 Publikationen
-
2023
Titel Quantitative Comparison against Experiments Reveals Imperfections in Force Fields’ Descriptions of POPC–Cholesterol Interactions DOI 10.1021/acs.jctc.3c00648 Typ Journal Article Autor Javanainen M Journal Journal of Chemical Theory and Computation Seiten 6342-6352 Link Publikation -
2023
Titel Quantitative Comparison Against Experiments Reveals Imperfections in Force Fields' Descriptions of Phospholipid-Cholesterol Interactions DOI 10.26434/chemrxiv-2023-kz2lk Typ Preprint Autor Javanainen M Link Publikation -
2023
Titel Quantitative Comparison against Experiments Reveals Imperfections in Force Fields' Descriptions of POPC-Cholesterol Interactions DOI 10.17169/refubium-41844 Typ Other Autor Heftberger P Link Publikation -
2017
Titel Terrestrial adaptation of green algae Klebsormidium and Zygnema (Charophyta) involves diversity in photosynthetic traits but not in CO2 acquisition DOI 10.1007/s00425-017-2741-5 Typ Journal Article Autor Pierangelini M Journal Planta Seiten 971-986 Link Publikation -
2017
Titel Complex biomembrane mimetics on the sub-nanometer scale DOI 10.1007/s12551-017-0275-5 Typ Journal Article Autor Heberle F Journal Biophysical Reviews Seiten 353-373 Link Publikation -
2016
Titel Atomistic resolution structure and dynamics of lipid bilayers in simulations and experiments DOI 10.1016/j.bbamem.2016.01.019 Typ Journal Article Autor Ollila O Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes Seiten 2512-2528 Link Publikation -
2016
Titel Membrane Domains on the Sub-Nanometer Scale DOI 10.1016/j.bpj.2015.11.071 Typ Journal Article Autor Pabst G Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Hydrocarbon Thickness Dictates Cholesterol's Location, Orientation and Motion in a Phospholipid Bilayer DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.501 Typ Journal Article Autor Marquardt D Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Multiple Closed States of the Ryanodine Receptor Determined by CRYOEM DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1867 Typ Journal Article Autor Castro-Hartmann P Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Phase Coexistence in Lipid Membranes Induced by Buffering Agents and Charged Lipid Headgroups DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1872 Typ Journal Article Autor Johnson M Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Integrins and Urokinase Receptors Show Distinct Mechanisms of Protein Sequestration in Raft-Mimicking Lipid Mixtures: Influence of Bilayer Asymmetry, Ligand Binding, and Cholesterol Content DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2801 Typ Journal Article Autor Ge Y Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Medium Matters: Order through Fluctuations? DOI 10.1016/j.bpj.2015.05.008 Typ Journal Article Autor Parikh A Journal Biophysical Journal Seiten 2751-2753 Link Publikation -
2015
Titel On scattered waves and lipid domains: detecting membrane rafts with X-rays and neutrons DOI 10.1039/c5sm01807b Typ Journal Article Autor Marquardt D Journal Soft Matter Seiten 9055-9072 Link Publikation -
2015
Titel Membrane Domain Interactions by Monte Carlo Type Analysis of Osmotic Stress Data DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.502 Typ Journal Article Autor Kollmitzer B Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Crystal Structures of the Ryanodine Receptor SPRY2 Domain DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1868 Typ Journal Article Autor Lau K Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Influence of Domain Size on Structure and Elastic Fluctuations in Complex Lipid Mixtures DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1871 Typ Journal Article Autor Heftberger P Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Structural Studies of IP3R by Cryoem DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1866 Typ Journal Article Autor Jiang Q Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Bending Rigidities and Interdomain Forces in Membranes with Coexisting Lipid Domains DOI 10.1016/j.bpj.2015.05.003 Typ Journal Article Autor Kollmitzer B Journal Biophysical Journal Seiten 2833-2842 Link Publikation -
2014
Titel Lipid Order Investigations Combined with Generalized Polarization Provide Deeper Insights into Plasma Membrane Architecture of Live Cells DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2851 Typ Journal Article Autor Kress A Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Solubilization of Giant Vesicles Composed of Erythrocyte Lipid Extracts and of Ternary Lipid Mixtures by Triton X-100 DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2806 Typ Journal Article Autor Casadei B Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2013
Titel Advancing high resolution structural analysis of lipid membranes using a genetic algorithm. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heftberger B Konferenz Springer (Hg.): 9th European Biophysics Congress, 13-17 July 2013, Lisbon, Portugal. 2013 -
2013
Titel Global small-angle X-ray scattering data analysis for multilamellar vesicles: the evolution of the scattering density profile model DOI 10.1107/s1600576713029798 Typ Journal Article Autor Heftberger P Journal Journal of Applied Crystallography Seiten 173-180 Link Publikation -
2013
Titel Protein partitioning in liquid-ordered (Lo)/liquid-disordered (Ld) domains. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Kollmitzer B Konferenz Springer (Hg.): 9th European Biophysics Congress, 13-17 July 2013, Lisbon, Portugal. 2013. -
2014
Titel Protein Partitioning in Liquid-Ordered (LO) / Liquid-Disordered (LD) Domains Depends on Lipid Composition and Protein Shape DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2853 Typ Journal Article Autor Kollmitzer B Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Monolayer Spontaneous Curvature of Raft-Forming Membrane Lipids DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2802 Typ Journal Article Autor Kollmitzer B Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Characterization of Phosphatidylcholine/Tween-80 Model Membranes for the NMR Study of Membrane Interactions DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2804 Typ Journal Article Autor Gravel A Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Spin Labels Detect the Coexistence of Two Lipid Domains Along the Anomalous Gel-Fluid Transition of Anionic Dmpg Bilayers DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2852 Typ Journal Article Autor Pellegrina D Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2013
Titel Monolayer spontaneous curvature of raft-forming membrane lipids DOI 10.1039/c3sm51829a Typ Journal Article Autor Kollmitzer B Journal Soft Matter Seiten 10877-10884 Link Publikation -
2013
Titel Calculating the Bending Modulus for Multicomponent Lipid Membranes in Different Thermodynamic Phases DOI 10.1021/ct400492e Typ Journal Article Autor Khelashvili G Journal Journal of Chemical Theory and Computation Seiten 3866-3871 Link Publikation -
2013
Titel Hybrid and Nonhybrid Lipids Exert Common Effects on Membrane Raft Size and Morphology DOI 10.1021/ja407624c Typ Journal Article Autor Heberle F Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 14932-14935 -
2013
Titel Chapter Four Coupling Membrane Elasticity and Structure to Protein Function DOI 10.1016/b978-0-12-411515-6.00004-7 Typ Book Chapter Autor Pabst G Verlag Elsevier Seiten 81-109 -
2013
Titel Monolayer Spontaneous Curvature of Raft-Forming Membrane Lipids DOI 10.48550/arxiv.1307.0367 Typ Preprint Autor Kollmitzer B -
2013
Titel Global SAXS data analysis for multilamellar vesicles: Evolution of the scattering density profile (SDP) model DOI 10.48550/arxiv.1309.5237 Typ Preprint Autor Heftberger P -
2016
Titel Lateral pressure-mediated protein partitioning into liquid-ordered/liquid-disordered domains DOI 10.1039/c6sm00042h Typ Journal Article Autor Frewein M Journal Soft Matter Seiten 3189-3195 Link Publikation -
2015
Titel Bending rigidities and interdomain forces in membranes with coexisting lipid domains DOI 10.48550/arxiv.1502.07472 Typ Preprint Autor Kollmitzer B -
2015
Titel Chelating Agent Induction of Multiphase Coexistence in Lipid Multilayers DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.500 Typ Journal Article Autor Weisman M Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel How do Cholesterol and Saturated Sphingolipids Affect Acyl Chain Order in the Fluid Phase of Binary POPC Bilayers - a Study with 1-oleoyl-2-propionyl-DPH-sn-glycero-3-phosphocholine DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.503 Typ Journal Article Autor Engberg O Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Cell Cycle Position Determines Critical Temperatures in Plasma Membrane Vesicles DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.505 Typ Journal Article Autor Gray E Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel In Situ Determination of Structure and Fluctuations of Coexisting Fluid Membrane Domains DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.3488 Typ Journal Article Autor Heftberger P Journal Biophysical Journal Seiten 854-862 Link Publikation -
2015
Titel Interaction of HIV-1 Gag Protein's Ma Membrane Binding Domain with Membrane Mimics Probed by Low- and Wide-Angle X-Ray Scattering DOI 10.1016/j.bpj.2014.11.1870 Typ Journal Article Autor O’Neil L Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2015
Titel Structure and interactions of raft-like domains. Typ Journal Article Autor Kollmitzer B Journal European Biophysics Journal with Biophysics Letters -
2014
Titel Hybrid and Nonhybrid Lipids Exert Common Effects on Membrane Raft Size and Morphology DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2803 Typ Journal Article Autor Doktorova M Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Kinetic Study of Photo-Induced Lipid Oxidation in Giant Unilamellar Vesicles DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2805 Typ Journal Article Autor Sankhagowit S Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Perturbation of Plasma Membrane Physical Properties by Endogenous and Exogenous Mediators Affects Cell Function DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2854 Typ Journal Article Autor Levental K Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel Temperature Dependence of Lo/Ld Domain Thickness and Elasticity by Global Saxs Data Analysis DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2863 Typ Journal Article Autor Heftberger P Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2014
Titel The Effect of Ectoins on the Structural Organization of the Tear Fluid Monolayer DOI 10.1016/j.bpj.2013.11.2850 Typ Journal Article Autor Galla H Journal Biophysical Journal Link Publikation