Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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Bioadhesion,
Flatworms,
Bioadhesives,
Platyhelminthes
Synthetische Klebstoffe finden breite Verwendung in unserem Leben, unter anderem in der Medizin und Industrie. Diese Kleber beinhalten jedoch toxische und karzinogene Komponenten. Im Gegensatz dazu sind biologische Klebstoffe von Tieren und Pflanzen nicht toxisch, gewebekompatibel, und funktionieren unter feuchten oder nassen Bedingungen. Jedoch ist über die natürlichen Klebemechanismen nur sehr wenig bekannt. Es ist das Ziel deren Funktionsweise aufzuklären und biomimetische Kleber für medizinische und industrielle Anwendungen zu entwickeln. Plattwürmer besitzen ein Zwei-Drüsen Klebesytem mit dem sich die Tiere an jeder beliebegen Oberfläche im Meer- und Süßwasser festhalten und wieder loslassen können. Dieses Klebesystem besteht aus mehreren hundert Klebeorganen. Jedes dieser Klebeorgane besteht aus drei Zellen: eine Klebedrüse, einer Loslassdrüse und einer Stützzelle, genannt Ankerzelle. Im vorliegenden Projekt wurden 20 verschiedene Plattwurmarten ausgewählt die im Meer, im Süßwasser und im brackischen Bereichen vorkommen. Darüber hinaus wurde bei der Auswahl der Arten darauf geachtet Vertreter zu verweden, die unterschiedlichten Habitaten leben: in ruhigen Gewässern, in exponierten Stränden mit Wellen, in Ebbe- und Flutregionen, im Sand, auf Pflanzen, unter Steinen, oder sogar auf Pfeilschwanzkrebsen. Auch eine Spezies einer parasitischen Plattwurmart ist vertreten, die sich mit einem klebrigen Sekret auf der Haut von Fischen festhalten kann. Schließlich war auch die Verfügbarkeit der Tiere ein Kriterium und die Möglichkeit Kulturen im Labor verfügbar zu haben. In unserer Hypothese gehen wir davon aus, daß Plattwürmer entsprechene Anpassungen evolviert haben, um das Ankleben in den unterschiedlichsten Lebensbereichen zu gewähleisten. Diese Annahme wird durch die Beobachtung unterstützt, daß es von zwei Klebeproteinen die wir beim Plattwurm Macrostomum lignano identifiziert haben, keine Verwandten Proteine in 61 anderen Vertretern der Plattwürmer gibt. In den letzten Jahren haben wir eine Kollektion von Methoden für die Identifikation von Klebeproteinen bei Plattwürmern und Polypen im Labor etabliert. Das vorliegende Projekt vereint eine eine besonders geeignete Auswahl von Plattwurmarten, eine etabliertes Set von Methoden und - zusammen mit Kooperationspartnern - fundiertes Wissen zu Biologie der Plattwürmer. Die erwarteten Ergebnisses sind eine Liste von Klebeproteinen, die als Ausgangsmoleküle für die Entwickling Plattwurm-basierter biomimmetischer Klebstoffe dienen kann.
Viele freilebende Platyhelminthen (Plattwürmer) können sich sehr schnell an jedes natürliche Substrat anheften und wieder ablösen. Diese Fähigkeit macht sie zu geeigneten Kandidaten für die Untersuchung der temporären Bioadhäsion. Wir haben zwei riesige Adhäsionsproteine identifiziert, die bei dem marinen Plattwurm Macrostomum lignano die Anheftung vermitteln. Auf der Grundlage eines umfangreichen Datensatzes waren wir in der Lage, ein neuartiges Modell der temporären Adhäsion von Plattwürmern vorzuschlagen. Der natürliche Lebensraum von M. lignano ist die Lagune von Venedig, Italien, und die Tiere leben an Stränden mit niedriger Energie zwischen Sandkörnern. Wir stellten die Hypothese auf, dass Plattwurmarten aus anderen Lebensräumen angepasste Klebeproteine besitzen. Daher war es das Ziel dieses Projekts, Adhäsionsproteine verschiedener Plattwürmer aus unterschiedlichen Lebensräumen zu identifizieren, darunter Süßwasser, Brackwasser und dem Meer. Es ist bemerkenswert, dass wir in den identifizierten Regionen der Adhäsionsproteine keine wesentlichen Variationen gefunden haben. Zur weiteren Charakterisierung der Adhäsionsbiologie von Plattwürmern untersuchten wir die Morphologie der Adhäsionsorgane, sequenzierten alle Gene (Transkriptome) mehrerer Arten, analysierten die Expression der Adhäsionsproteine (In-situ-Hybridisierung) und schalteten die Produktion der Proteine aus (RNA-Interferenz), um ihre Beteiligung am Adhäsionsprozess zu untersuchen. Aufgrund der Größe der Adhäsionsproteine war es eine Herausforderung, ihre vollständige Aminosäuresequenz zu identifizieren. Aus diesem Grund haben wir die Oxford Nanopore Long-Read-Sequenzierung im Labor etabliert. Mit dieser Technologie war es möglich, die Sequenz der Klebeprotein zu beschreiben. Handelsübliche Klebstoffe sind oft giftig und krebserregend, können Allergien auslösen und Umweltprobleme verursachen. Außerdem sind synthetische Klebstoffe unter nassen Bedingungen nur begrenzt leistungsfähig, insbesondere bei medizinischen Anwendungen. Im Gegensatz dazu sind biologische Klebstoffe biokompatibel, biologisch abbaubar, ungiftig und in der Lage, auf einer Vielzahl von Oberflächen zu haften, auch unter Wasser. Besonders hervorzuheben ist, dass die Klebstoffe der Plattwürmer reversibel sind: Sie können sich sehr schnell und freiwillig von allen natürlichen Oberflächen ablösen. Daher können biologische reversible Klebstoffe den Bedarf an neuartigen Klebstoffen sowohl in der Industrie als auch in der Biomedizin decken. Die Ergebnisse dieses Projekts können dazu beitragen, neue Sequenzen von Klebeproteinen für die Herstellung synthetischer Klebstoffe für medizinische oder industrielle Anwendungen zu finden.
- Universität Innsbruck - 100%
- Stanislav N. Gorb, Christian Albrechts Universität Kiel - Deutschland
- Julian Smith Iii, Winthrop University - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 464 Zitationen
- 28 Publikationen
- 1 Policies
- 2 Methoden & Materialien
- 29 Datasets & Models
- 11 Disseminationen
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 3 Weitere Förderungen
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2019
Titel Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.1098/rstb.2019.0194 Typ Journal Article Autor Pjeta R Journal Philosophical Transactions of the Royal Society B Seiten 20190194 Link Publikation -
2023
Titel A chromosome-scale epigenetic map of the Hydra genome reveals conserved regulators of cell state DOI 10.1101/gr.277040.122 Typ Journal Article Autor Cazet J Journal Genome Research Seiten 283-298 Link Publikation -
2020
Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.3929/ethz-b-000426889 Typ Other Autor Brand Link Publikation -
2020
Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.5451/unibas-ep87060 Typ Other Autor Brand Link Publikation -
2020
Titel The free-living flatworm Macrostomum lignano DOI 10.5451/unibas-ep87062 Typ Other Autor Egger Link Publikation -
2020
Titel Additional file 13 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618194 Typ Other Autor Brand J Link Publikation -
2020
Titel Additional file 13 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618194.v1 Typ Other Autor Brand J Link Publikation -
2020
Titel Additional file 17 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618206 Typ Other Autor Brand J Link Publikation -
2020
Titel Additional file 17 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618206.v1 Typ Other Autor Brand J Link Publikation -
2020
Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.1186/s12864-020-06862-x Typ Journal Article Autor Brand J Journal BMC Genomics Seiten 462 Link Publikation -
2022
Titel Sticking Together an Updated Model for Temporary Adhesion DOI 10.3390/md20060359 Typ Journal Article Autor Bertemes P Journal Marine Drugs Seiten 359 Link Publikation -
2021
Titel Omics-based molecular analyses of adhesion by aquatic invertebrates DOI 10.1111/brv.12691 Typ Journal Article Autor Davey P Journal Biological Reviews Seiten 1051-1075 Link Publikation -
2018
Titel Papillae revisited and the nature of the adhesive secreting collocytes DOI 10.1016/j.ydbio.2018.11.012 Typ Journal Article Autor Zeng F Journal Developmental Biology Seiten 183-198 Link Publikation -
2018
Titel The structural and chemical basis of temporary adhesion in the sea star Asterina gibbosa DOI 10.3762/bjnano.9.196 Typ Journal Article Autor Lengerer B Journal Beilstein Journal of Nanotechnology Seiten 2071-2086 Link Publikation -
2018
Titel Properties of temporary adhesion systems of marine and freshwater organisms DOI 10.1242/jeb.182717 Typ Journal Article Autor Lengerer B Journal Journal of Experimental Biology -
2020
Titel The free-living flatworm Macrostomum lignano DOI 10.1186/s13227-020-00150-1 Typ Journal Article Autor Wudarski J Journal EvoDevo Seiten 5 Link Publikation -
2020
Titel Integrative Transcriptome and Proteome Analysis of the Tube Foot and Adhesive Secretions of the Sea Urchin Paracentrotus lividus DOI 10.3390/ijms21030946 Typ Journal Article Autor Pjeta R Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 946 Link Publikation -
2022
Titel New Hydra genomes reveal conserved principles of hydrozoan transcriptional regulation DOI 10.1101/2022.06.21.496857 Typ Preprint Autor Cazet J Seiten 2022.06.21.496857 Link Publikation -
2021
Titel (Un)expected Similarity of the Temporary Adhesive Systems of Marine, Brackish, and Freshwater Flatworms DOI 10.3390/ijms222212228 Typ Journal Article Autor Bertemes P Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 12228 Link Publikation -
2020
Titel Acoel Single-Cell Transcriptomics: Cell Type Analysis of a Deep Branching Bilaterian DOI 10.1093/molbev/msaa333 Typ Journal Article Autor Duruz J Journal Molecular Biology and Evolution Seiten 1888-1904 Link Publikation -
2019
Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.5281/zenodo.3547573 Typ Other Autor Bertemes P Link Publikation -
2019
Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.5281/zenodo.3547572 Typ Other Autor Bertemes P Link Publikation -
2019
Titel Supplementary Figures, Tables, and Materials and Methods from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.6084/m9.figshare.8960894.v1 Typ Other Autor Pjeta R Link Publikation -
2019
Titel Supplementary Figures, Tables, and Materials and Methods from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.6084/m9.figshare.8960894 Typ Other Autor Pjeta R Link Publikation -
2019
Titel Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.3929/ethz-b-000364113 Typ Other Autor Pjeta Link Publikation -
2019
Titel A mechanism for temporary bioadhesion DOI 10.1073/pnas.1814230116 Typ Journal Article Autor Wunderer J Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 4297-4306 Link Publikation -
2017
Titel Efficient transgenesis and annotated genome sequence of the regenerative flatworm model Macrostomum lignano DOI 10.1038/s41467-017-02214-8 Typ Journal Article Autor Wudarski J Journal Nature Communications Seiten 2120 Link Publikation -
2017
Titel Organ specific gene expression in the regenerating tail of Macrostomum lignano DOI 10.1016/j.ydbio.2017.07.021 Typ Journal Article Autor Lengerer B Journal Developmental Biology Seiten 448-460 Link Publikation
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2023
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Titel Hydra oligactis genome Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Theama mediterranea transcriptome, genome, differential gene expression Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel (Un)expected similarity of the temporary adhesive systems of marine, brackish, and freshwater flatworms DOI 10.5281/zenodo.5519226 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Acoel Single-Cell Transcriptomics: Cell Type Analysis of a Deep Branching Bilaterian DOI 10.48350/182462 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Macrostomum poznanienze transcriptome Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 8 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618236 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Paracentrotus lividus transcriptome Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 6 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618230 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 7 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618233 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 5 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618227 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 11 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618188 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 1 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618215 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 10 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618185 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 14 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618197 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 4 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618224 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 15 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618200 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 16 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618203 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 18 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618209 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 19 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618212 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 2 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618218 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Additional file 3 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes DOI 10.6084/m9.figshare.12618221 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel transcriptome and proteome data of Macrostomum lignano adhesion Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.3929/ethz-b-000364113 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel Supplementary data S1 on gene selection for expression screening and differential RNA-seq from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.6084/m9.figshare.8960891.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel Supplementary data S1 on gene selection for expression screening and differential RNA-seq from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.6084/m9.figshare.8960891 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel Datasheets on Mass Spectrometry from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.6084/m9.figshare.8960897.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel Datasheets on Mass Spectrometry from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae DOI 10.6084/m9.figshare.8960897 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2018
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Titel A targeted in situ hybridization screen identifies putative seminal fluid proteins in a simultaneously hermaphroditic flatworm DOI 10.6084/m9.figshare.c.4117889 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2018
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Titel Organ specific gene expression in the regenerating tail of Macrostomum lignano DOI 10.3929/ethz-b-000226173 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2019
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Titel "Life Radio" Interview Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2019
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Titel Laborjournal: Journal article Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2018
Titel Day care group visits Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2019
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Titel Newpaper Article: in "Der Schweiter Bauer" Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2019
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Titel Kronenzeitung: Zeitschriften Artikel Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2018
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Titel Lange Nacht der Forschung Typ Participation in an open day or visit at my research institution Link Link -
2019
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Titel Die Presse: Newspaper Article Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2019
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Titel Univeristy main Webpage report Typ Engagement focused website, blog or social media channel Link Link -
2019
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Titel Der Standard: Newspaper Article Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2019
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Titel Television appearance Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2019
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Titel FWF scilog: video of the Funding agency on our research Typ Engagement focused website, blog or social media channel Link Link
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2019
Titel Best Poster Award Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International
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2019
Titel AFR - PhD Grant for Philp Bertemes Typ Fellowship Förderbeginn 2019 -
2018
Titel Glue characterization in centipedes Typ Other Förderbeginn 2018 -
2022
Titel Tiroler Wissenschaft Fond Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2022