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Bioadhesion von Plattwürmern

Bioadhesion of Flatworms

Peter Ladurner (ORCID: 0000-0002-0323-9266)
  • Grant-DOI 10.55776/P30347
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2017
  • Projektende 28.02.2023
  • Bewilligungssumme 389.458 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Bioadhesion, Flatworms, Bioadhesives, Platyhelminthes

Abstract Endbericht

Synthetische Klebstoffe finden breite Verwendung in unserem Leben, unter anderem in der Medizin und Industrie. Diese Kleber beinhalten jedoch toxische und karzinogene Komponenten. Im Gegensatz dazu sind biologische Klebstoffe von Tieren und Pflanzen nicht toxisch, gewebekompatibel, und funktionieren unter feuchten oder nassen Bedingungen. Jedoch ist über die natürlichen Klebemechanismen nur sehr wenig bekannt. Es ist das Ziel deren Funktionsweise aufzuklären und biomimetische Kleber für medizinische und industrielle Anwendungen zu entwickeln. Plattwürmer besitzen ein Zwei-Drüsen Klebesytem mit dem sich die Tiere an jeder beliebegen Oberfläche im Meer- und Süßwasser festhalten und wieder loslassen können. Dieses Klebesystem besteht aus mehreren hundert Klebeorganen. Jedes dieser Klebeorgane besteht aus drei Zellen: eine Klebedrüse, einer Loslassdrüse und einer Stützzelle, genannt Ankerzelle. Im vorliegenden Projekt wurden 20 verschiedene Plattwurmarten ausgewählt die im Meer, im Süßwasser und im brackischen Bereichen vorkommen. Darüber hinaus wurde bei der Auswahl der Arten darauf geachtet Vertreter zu verweden, die unterschiedlichten Habitaten leben: in ruhigen Gewässern, in exponierten Stränden mit Wellen, in Ebbe- und Flutregionen, im Sand, auf Pflanzen, unter Steinen, oder sogar auf Pfeilschwanzkrebsen. Auch eine Spezies einer parasitischen Plattwurmart ist vertreten, die sich mit einem klebrigen Sekret auf der Haut von Fischen festhalten kann. Schließlich war auch die Verfügbarkeit der Tiere ein Kriterium und die Möglichkeit Kulturen im Labor verfügbar zu haben. In unserer Hypothese gehen wir davon aus, daß Plattwürmer entsprechene Anpassungen evolviert haben, um das Ankleben in den unterschiedlichsten Lebensbereichen zu gewähleisten. Diese Annahme wird durch die Beobachtung unterstützt, daß es von zwei Klebeproteinen die wir beim Plattwurm Macrostomum lignano identifiziert haben, keine Verwandten Proteine in 61 anderen Vertretern der Plattwürmer gibt. In den letzten Jahren haben wir eine Kollektion von Methoden für die Identifikation von Klebeproteinen bei Plattwürmern und Polypen im Labor etabliert. Das vorliegende Projekt vereint eine eine besonders geeignete Auswahl von Plattwurmarten, eine etabliertes Set von Methoden und - zusammen mit Kooperationspartnern - fundiertes Wissen zu Biologie der Plattwürmer. Die erwarteten Ergebnisses sind eine Liste von Klebeproteinen, die als Ausgangsmoleküle für die Entwickling Plattwurm-basierter biomimmetischer Klebstoffe dienen kann.

Viele freilebende Platyhelminthen (Plattwürmer) können sich sehr schnell an jedes natürliche Substrat anheften und wieder ablösen. Diese Fähigkeit macht sie zu geeigneten Kandidaten für die Untersuchung der temporären Bioadhäsion. Wir haben zwei riesige Adhäsionsproteine identifiziert, die bei dem marinen Plattwurm Macrostomum lignano die Anheftung vermitteln. Auf der Grundlage eines umfangreichen Datensatzes waren wir in der Lage, ein neuartiges Modell der temporären Adhäsion von Plattwürmern vorzuschlagen. Der natürliche Lebensraum von M. lignano ist die Lagune von Venedig, Italien, und die Tiere leben an Stränden mit niedriger Energie zwischen Sandkörnern. Wir stellten die Hypothese auf, dass Plattwurmarten aus anderen Lebensräumen angepasste Klebeproteine besitzen. Daher war es das Ziel dieses Projekts, Adhäsionsproteine verschiedener Plattwürmer aus unterschiedlichen Lebensräumen zu identifizieren, darunter Süßwasser, Brackwasser und dem Meer. Es ist bemerkenswert, dass wir in den identifizierten Regionen der Adhäsionsproteine keine wesentlichen Variationen gefunden haben. Zur weiteren Charakterisierung der Adhäsionsbiologie von Plattwürmern untersuchten wir die Morphologie der Adhäsionsorgane, sequenzierten alle Gene (Transkriptome) mehrerer Arten, analysierten die Expression der Adhäsionsproteine (In-situ-Hybridisierung) und schalteten die Produktion der Proteine aus (RNA-Interferenz), um ihre Beteiligung am Adhäsionsprozess zu untersuchen. Aufgrund der Größe der Adhäsionsproteine war es eine Herausforderung, ihre vollständige Aminosäuresequenz zu identifizieren. Aus diesem Grund haben wir die Oxford Nanopore Long-Read-Sequenzierung im Labor etabliert. Mit dieser Technologie war es möglich, die Sequenz der Klebeprotein zu beschreiben. Handelsübliche Klebstoffe sind oft giftig und krebserregend, können Allergien auslösen und Umweltprobleme verursachen. Außerdem sind synthetische Klebstoffe unter nassen Bedingungen nur begrenzt leistungsfähig, insbesondere bei medizinischen Anwendungen. Im Gegensatz dazu sind biologische Klebstoffe biokompatibel, biologisch abbaubar, ungiftig und in der Lage, auf einer Vielzahl von Oberflächen zu haften, auch unter Wasser. Besonders hervorzuheben ist, dass die Klebstoffe der Plattwürmer reversibel sind: Sie können sich sehr schnell und freiwillig von allen natürlichen Oberflächen ablösen. Daher können biologische reversible Klebstoffe den Bedarf an neuartigen Klebstoffen sowohl in der Industrie als auch in der Biomedizin decken. Die Ergebnisse dieses Projekts können dazu beitragen, neue Sequenzen von Klebeproteinen für die Herstellung synthetischer Klebstoffe für medizinische oder industrielle Anwendungen zu finden.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Stanislav N. Gorb, Christian Albrechts Universität Kiel - Deutschland
  • Julian Smith Iii, Winthrop University - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 402 Zitationen
  • 28 Publikationen
  • 1 Policies
  • 2 Methoden & Materialien
  • 29 Datasets & Models
  • 11 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 3 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2017
    Titel Organ specific gene expression in the regenerating tail of Macrostomum lignano
    DOI 10.1016/j.ydbio.2017.07.021
    Typ Journal Article
    Autor Lengerer B
    Journal Developmental Biology
    Seiten 448-460
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Integrative Transcriptome and Proteome Analysis of the Tube Foot and Adhesive Secretions of the Sea Urchin Paracentrotus lividus
    DOI 10.3390/ijms21030946
    Typ Journal Article
    Autor Pjeta R
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 946
    Link Publikation
  • 2020
    Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.1186/s12864-020-06862-x
    Typ Journal Article
    Autor Brand J
    Journal BMC Genomics
    Seiten 462
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Supplementary Figures, Tables, and Materials and Methods from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.6084/m9.figshare.8960894
    Typ Other
    Autor Pjeta R
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Supplementary Figures, Tables, and Materials and Methods from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.6084/m9.figshare.8960894.v1
    Typ Other
    Autor Pjeta R
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Sticking Together an Updated Model for Temporary Adhesion
    DOI 10.3390/md20060359
    Typ Journal Article
    Autor Bertemes P
    Journal Marine Drugs
    Seiten 359
    Link Publikation
  • 2022
    Titel New Hydra genomes reveal conserved principles of hydrozoan transcriptional regulation
    DOI 10.1101/2022.06.21.496857
    Typ Preprint
    Autor Cazet J
    Seiten 2022.06.21.496857
    Link Publikation
  • 2019
    Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.5281/zenodo.3547572
    Typ Other
    Autor Bertemes P
    Link Publikation
  • 2019
    Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.5281/zenodo.3547573
    Typ Other
    Autor Bertemes P
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.3929/ethz-b-000364113
    Typ Other
    Autor Pjeta
    Link Publikation
  • 2021
    Titel (Un)expected Similarity of the Temporary Adhesive Systems of Marine, Brackish, and Freshwater Flatworms
    DOI 10.3390/ijms222212228
    Typ Journal Article
    Autor Bertemes P
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 12228
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Acoel Single-Cell Transcriptomics: Cell Type Analysis of a Deep Branching Bilaterian
    DOI 10.1093/molbev/msaa333
    Typ Journal Article
    Autor Duruz J
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 1888-1904
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Additional file 13 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618194
    Typ Other
    Autor Brand J
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Additional file 13 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618194.v1
    Typ Other
    Autor Brand J
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Additional file 17 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618206
    Typ Other
    Autor Brand J
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Additional file 17 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618206.v1
    Typ Other
    Autor Brand J
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Properties of temporary adhesion systems of marine and freshwater organisms
    DOI 10.1242/jeb.182717
    Typ Journal Article
    Autor Lengerer B
    Journal Journal of Experimental Biology
  • 2018
    Titel Papillae revisited and the nature of the adhesive secreting collocytes
    DOI 10.1016/j.ydbio.2018.11.012
    Typ Journal Article
    Autor Zeng F
    Journal Developmental Biology
    Seiten 183-198
    Link Publikation
  • 2023
    Titel A chromosome-scale epigenetic map of the Hydra genome reveals conserved regulators of cell state.
    DOI 10.1101/gr.277040.122
    Typ Journal Article
    Autor Cazet Jf
    Journal Genome research
    Seiten 283-298
  • 2021
    Titel Omics-based molecular analyses of adhesion by aquatic invertebrates
    DOI 10.1111/brv.12691
    Typ Journal Article
    Autor Davey P
    Journal Biological Reviews
    Seiten 1051-1075
    Link Publikation
  • 2020
    Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.5451/unibas-ep87060
    Typ Other
    Autor Brand
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The free-living flatworm Macrostomum lignano
    DOI 10.5451/unibas-ep87062
    Typ Other
    Autor Egger
    Link Publikation
  • 2020
    Titel RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.3929/ethz-b-000426889
    Typ Other
    Autor Brand
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The free-living flatworm Macrostomum lignano
    DOI 10.1186/s13227-020-00150-1
    Typ Journal Article
    Autor Wudarski J
    Journal EvoDevo
    Seiten 5
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Efficient transgenesis and annotated genome sequence of the regenerative flatworm model Macrostomum lignano
    DOI 10.1038/s41467-017-02214-8
    Typ Journal Article
    Autor Wudarski J
    Journal Nature Communications
    Seiten 2120
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.1098/rstb.2019.0194
    Typ Journal Article
    Autor Pjeta R
    Journal Philosophical Transactions of the Royal Society B
    Seiten 20190194
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A mechanism for temporary bioadhesion
    DOI 10.1073/pnas.1814230116
    Typ Journal Article
    Autor Wunderer J
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 4297-4306
    Link Publikation
  • 2018
    Titel The structural and chemical basis of temporary adhesion in the sea star Asterina gibbosa
    DOI 10.3762/bjnano.9.196
    Typ Journal Article
    Autor Lengerer B
    Journal Beilstein Journal of Nanotechnology
    Seiten 2071-2086
    Link Publikation
Policies
  • 2017 Link
    Titel COST Action training school
    Typ Influenced training of practitioners or researchers
    Link Link
Methoden & Materialien
  • 2022 Link
    Titel Oxford Nanopore Sequencing
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 0
    Titel Single-cell RNAseq
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
Datasets & Models
  • 2023 Link
    Titel Hydra oligactis genome
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2022 Link
    Titel Theama mediterranea transcriptome, genome, differential gene expression
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Acoel Single-Cell Transcriptomics: Cell Type Analysis of a Deep Branching Bilaterian
    DOI 10.48350/182462
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Macrostomum poznanienze transcriptome
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel (Un)expected similarity of the temporary adhesive systems of marine, brackish, and freshwater flatworms
    DOI 10.5281/zenodo.5519226
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 19 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618212
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 2 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618218
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 3 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618221
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 4 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618224
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 5 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618227
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 6 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618230
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 7 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618233
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 8 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618236
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Paracentrotus lividus transcriptome
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 16 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618203
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 11 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618188
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 14 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618197
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2020 Link
    Titel Additional file 15 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618200
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2020 Link
    Titel Additional file 1 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618215
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2020 Link
    Titel Additional file 10 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618185
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2020 Link
    Titel Additional file 18 of RNA-Seq of three free-living flatworm species suggests rapid evolution of reproduction-related genes
    DOI 10.6084/m9.figshare.12618209
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2019 Link
    Titel transcriptome and proteome data of Macrostomum lignano adhesion
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2019 Link
    Titel Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.3929/ethz-b-000364113
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2019 Link
    Titel Supplementary data S1 on gene selection for expression screening and differential RNA-seq from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.6084/m9.figshare.8960891.v1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2019 Link
    Titel Supplementary data S1 on gene selection for expression screening and differential RNA-seq from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.6084/m9.figshare.8960891
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2019 Link
    Titel Datasheets on Mass Spectrometry from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.6084/m9.figshare.8960897.v1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2019 Link
    Titel Datasheets on Mass Spectrometry from Temporary adhesion of the proseriate flatworm Minona ileanae
    DOI 10.6084/m9.figshare.8960897
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2018 Link
    Titel Organ specific gene expression in the regenerating tail of Macrostomum lignano
    DOI 10.3929/ethz-b-000226173
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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  • 2018 Link
    Titel A targeted in situ hybridization screen identifies putative seminal fluid proteins in a simultaneously hermaphroditic flatworm
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.4117889
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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Disseminationen
  • 2019 Link
    Titel Der Standard: Newspaper Article
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
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  • 2019 Link
    Titel Univeristy main Webpage report
    Typ Engagement focused website, blog or social media channel
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  • 2018 Link
    Titel Lange Nacht der Forschung
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
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  • 2019 Link
    Titel Die Presse: Newspaper Article
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
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  • 2019 Link
    Titel Newpaper Article: in "Der Schweiter Bauer"
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
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  • 2019 Link
    Titel Kronenzeitung: Zeitschriften Artikel
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
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  • 2019 Link
    Titel Laborjournal: Journal article
    Typ A magazine, newsletter or online publication
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  • 2018
    Titel Day care group visits
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2019 Link
    Titel Television appearance
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
    Link Link
  • 2019 Link
    Titel FWF scilog: video of the Funding agency on our research
    Typ Engagement focused website, blog or social media channel
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  • 2019 Link
    Titel "Life Radio" Interview
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
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Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel Best Poster Award
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2019
    Titel AFR - PhD Grant for Philp Bertemes
    Typ Fellowship
    Förderbeginn 2019
    Geldgeber Fonds National de la Recherche (FNR)
  • 2022
    Titel Tiroler Wissenschaft Fond
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber Land Tirol
  • 2018
    Titel Glue characterization in centipedes
    Typ Other
    Förderbeginn 2018
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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