Kompartimentierung von GPCR-PKA Signalkaskaden
Compartmentalization of GPCR-PKA signalling
Matching Funds - Tirol
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (75%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)
Keywords
-
G protein coupled receptor,
Kinase,
Signaling crosstalk,
Molecular Interactions,
Biosensor,
Cancer
Aktivierte Membranrezeptoren konvertieren und amplifizieren eingehende Signalinformationen durch intrazelluläre Effektorkaskaden, die zeitlich und räumlich durch vielseitige Strukturproteine organisiert werden. Um zytoplasmatische Effektormoleküle zu rekrutieren, verwenden aktivierte G-Protein gekoppelte Rezeptoren (GPCR) Strukturproteine wie z.B. -Arrestin oder A-Kinase (PKA) Ankerproteine (AKAPs). Dadurch können GTPasen, Kinasen und Phosphatasen physisch mit Rezeptoren verlinkt werden, um dann als Molekularschalter die kontrollierte Weiterleitung von Inputsignalen zu gewährleisten. In einer ersten Machbarkeitsstudie analysierten wir die makromolekulare Organisation von zellulär-kompartimentierten und phosphorylierten PKA Komplexen. Neben bekannten AKAP- Interaktionen konnten wir eine binäre Protein:Proteininteraktion (PPI) zwischen PKA und dem GPCR GPR161 identifizieren. In detaillierten biochemischen Analysen bestätigten wir, dass GPR161, den man hauptsächlich im primären Ziliumkompartiment vorfindet, eine intrinsische AKAP-Funktion aufweist (Bachmann et al, PNAS 2016). In Strukturanalysen werden wir nach einer Erklärung suchen, warum es ausschließlich zu der Isoform-spezifischen Interaktion zwischen GPR161 und dem Typ-I PKA Holoenzym kommt. Zusätzlich zu den Funktionsstudien von Zelllinien, Zebrafischembryonen und deren primäre Zilien starten wir PPI-Reporteranalysen. Unser Ziel ist es die mechanistischen Details, inwieweit GPR161-kompartimentierte PKA Komplexe zusätzliche Rezeptorkaskaden funktionell mitintegriert, zu identifizieren. Zu Beginn steht die Beteiligung der antagonistisch wirkenden Hedgehog-Signalkaskade im Mittelpunkt. Wir nehmen an, dass GPR161 Phosphorylierung und PKA Interaktion wesentliche Faktoren für die präzise Hh-vermittelten Signalweiterleitung in primären Zilien sind. Aufgrund unserer Entdeckung glauben wir, dass zusätzlich zellspezische PKA-Signalosomedie Signaltransmission von GPCR/Kinasekaskaden regulieren und organisieren. Wir haben eine zwei-gleisige Strategie entworfen und kombinieren Affinitäts-Aufreinigungen aus Krebszellen mit Bioinformatikanalysen, um die Details der Organisation von makromolekularen PKA Komplexen zu verstehen. Eine Auswahl potentieller PKA- Interaktoren und Substrate wird in biochemischen und funktionellen Studien auf ihre Funktion hin untersucht, welche relevant sein könnten für GPCR, cAMP- und PKA beteiligte Erkrankungen.
Die Kompartimentierung von Signalmolekülen koordiniert die zelluläre Signalweiterleitung. Das primäre Zilium erfüllt hierbei eine Schlüsselfunktion, indem es für die Signaltransduktion, als räumlich und zeitlich begrenzte Signalplattform fungiert. Für die Integrität der ziliaren Signalübertragung ist es zwingend erforderlich, dass die beteiligten Signalwege durch sogenannte 'Second Messenger Moleküle' sowie durch die An- oder Abwesenheit ihrer Effektor-komplexe reguliert werden. Ziliare G-Protein-gekoppelte Rezeptorkaskaden (GPCR) steuern die Mobilmachung von cAMP, einem evolutionär konserviertem Schlüsselmolekül der Signaltransduktion. Im Zilium-kompartiment dienen für die Signalweiterleitung Proteinkinase A (PKA)-Komplexe als Effektoren von cAMP-Gradienten. In diesem Zusammenhang sind die lokal begrenzten Aktivitäten von sogenannten PKA-Signalosomen, für die basale Hemmung der vielfach pathologisch auftretenden Hedgehog (Hh)-Signalübertragung, unerlässlich. In diesem Projekt haben wir neben Schlüsselaspekten der zugrundeliegenden Signalkreisläufe, die Kompartimentierung von Second Messenger Molekülen und die Beteiligung von Kinase-interagierenden GPCRs analysiert. Zuerst konnten wir zeigen, dass ein makromolekularer und im Zilium lokalisierter Signalkomplex, bestehend aus dem GPCR Gpr161 und der PKA, an der Regulation von Hh-Signalkaskaden beteiligt ist. Dieses Kinase-Signalosom könnte als Angriffspunkt dienen, um fehlgeschalteter Hh-Signalweiterleitung, wie es z.B. wie bei Krankheiten wie Krebs vorkommt, entgegenzuwirken. Zweitens haben wir mit Hilfe von zell-basierten Reporteranalysen und Phospho-Proteom-Messungen neue Wechselwirkung von Kinasen und dem Ubiquitin-Proteasom-System (UPS) identifiziert. Wir konnten zeigen, dass eine cAMP-Erhöhung die Zilien unterschiedlich beeinflusst. PKA-Substrate scheinen in diesem Zusammenhang zur Zilienbildung und dessen Abbau beizutragen. In diesem Fall besteht das entsprechende Signalosom aus einem multimeren Proteinkomplex, der zwei Kinasen und das UPS umfasst. Die kompartimentierten Enzymaktivitäten tragen hierbei zur Ziliogenese bei. Drittens haben wir grundsätzliche Aspekt von Kinase-Regulation auf molekularer Ebene analysiert. Mit Hilfe neu entwickelter Kinase-Biosensoren und etablierten Reportern für die GPCR-Aktivierung haben wir die Gpr161-Signalübertragung und allgemeine Konzepte der zellbasierten Kinase-Regulation charakterisiert. Insgesamt haben wir neue Beispiele dafür entdeckt, wie kompartimentierte Enzymplattformen durch post-translationale Modifikationen und bioaktive Moleküle, wie es Kinasehemmer sind, kontrolliert und verändert werden. Diese molekularen Einblicke in die Mechanismen binärer Kinase-Interaktionen bieten nun neue pharmakologische Ansatzpunkte, um pathologischen Rezeptor- und Effektor-Wegen entgegenzuwirken.
- Universität Innsbruck - 100%
- Roland G. Huber, Bioinformatics Institute - Singapur
- Susan S. Taylor, University of California - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 421 Zitationen
- 26 Publikationen
- 1 Ausgründungen
- 2 Weitere Förderungen
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2024
Titel Phosphorylation of the compartmentalized PKA substrate TAF15 regulates RNA-protein interactions. DOI 10.1007/s00018-024-05204-4 Typ Journal Article Autor Enzler F Journal Cellular and molecular life sciences : CMLS Seiten 162 -
2019
Titel Feedback inhibition of cAMP effector signaling by a chaperone-assisted ubiquitin system DOI 10.1038/s41467-019-10037-y Typ Journal Article Autor Rinaldi L Journal Nature Communications Seiten 2572 Link Publikation -
2019
Titel Zebrafish GPR161 Contributes to Basal Hedgehog Repression in a Tissue-specific Manner DOI 10.1101/616482 Typ Preprint Autor Tschaikner P Seiten 616482 Link Publikation -
2020
Titel Hedgehog and Gpr161: Regulating cAMP Signaling in the Primary Cilium DOI 10.3390/cells9010118 Typ Journal Article Autor Tschaikner P Journal Cells Seiten 118 Link Publikation -
2020
Titel KinCon: Cell-based recording of full-length kinase conformations DOI 10.1002/iub.2241 Typ Journal Article Autor Enzler F Journal IUBMB Life Seiten 1168-1174 Link Publikation -
2023
Titel Disruptor: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein-protein and protein-DNA interactions. DOI 10.1038/s42003-023-05089-2 Typ Journal Article Autor Kugler V Journal Communications biology Seiten 720 -
2018
Titel Phosphorylation of protein kinase A (PKA) regulatory subunit RIa by protein kinase G (PKG) primes PKA for catalytic activity in cells DOI 10.1074/jbc.m117.809988 Typ Journal Article Autor Haushalter K Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 4411-4421 Link Publikation -
2018
Titel Counterregulation of cAMP-directed kinase activities controls ciliogenesis DOI 10.1038/s41467-018-03643-9 Typ Journal Article Autor Porpora M Journal Nature Communications Seiten 1224 Link Publikation -
2022
Titel Resistor: An algorithm for predicting resistance mutations via Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures DOI 10.1016/j.cels.2022.09.003 Typ Journal Article Autor Guerin N Journal Cell Systems Link Publikation -
2022
Titel Physiological Cell Culture Media Tune Mitochondrial Bioenergetics and Drug Sensitivity in Cancer Cell Models DOI 10.3390/cancers14163917 Typ Journal Article Autor Torres-Quesada O Journal Cancers Seiten 3917 Link Publikation -
2023
Titel Tracking and blocking interdependencies of cellular BRAF-MEK oncokinase activities. DOI 10.1093/pnasnexus/pgad185 Typ Journal Article Autor Fleischmann J Journal PNAS nexus -
2023
Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function. DOI 10.26508/lsa.202302043 Typ Journal Article Autor Auernig E Journal Life science alliance -
2020
Titel SATB2-LEMD2 interaction links nuclear shape plasticity to regulation of cognition-related genes DOI 10.15252/embj.2019103701 Typ Journal Article Autor Feurle P Journal The EMBO Journal Link Publikation -
2020
Titel Mutation-oriented profiling of autoinhibitory kinase conformations predicts RAF inhibitor efficacies DOI 10.1073/pnas.2012150117 Typ Journal Article Autor Mayrhofer J Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 31105-31113 Link Publikation -
2017
Titel Chapter Three Targeting the Architecture of Deregulated Protein Complexes in Cancer DOI 10.1016/bs.apcsb.2017.07.001 Typ Book Chapter Autor Stefan E Verlag Elsevier Seiten 101-132 -
2021
Titel Feedback control of the Gpr161-Gas-PKA axis contributes to basal Hedgehog repression in zebrafish DOI 10.1242/dev.192443 Typ Journal Article Autor Tschaikner P Journal Development Link Publikation -
2022
Titel Tracking mutation and drug-driven alterations of oncokinase conformations DOI 10.1007/s12254-021-00790-6 Typ Journal Article Autor Feichtner A Journal memo - Magazine of European Medical Oncology Seiten 137-142 Link Publikation -
2022
Titel Resistor: an algorithm for predicting resistance mutations using Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures DOI 10.1101/2022.01.18.476733 Typ Preprint Autor Guerin N Seiten 2022.01.18.476733 Link Publikation -
2022
Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM-F3 domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function DOI 10.1101/2022.12.11.519953 Typ Preprint Autor Moesslacher C Seiten 2022.12.11.519953 Link Publikation -
2022
Titel Kinase perturbations redirect mitochondrial function in cancer DOI 10.26124/bec:2022-0013 Typ Journal Article Autor Torres-Quesada O Journal Bioenergetics communications Seiten 17 -
2022
Titel DISRUPTOR: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein interactions DOI 10.1101/2022.11.02.514903 Typ Preprint Autor Kugler V Seiten 2022.11.02.514903 Link Publikation -
2021
Titel The TBC1D31/praja2 complex controls primary ciliogenesis through PKA-directed OFD1 ubiquitylation DOI 10.15252/embj.2020106503 Typ Journal Article Autor Senatore E Journal The EMBO Journal Link Publikation -
2019
Titel RBP2 stabilizes slow Cav1.3 Ca2+ channel inactivation properties of cochlear inner hair cells DOI 10.1007/s00424-019-02338-4 Typ Journal Article Autor Ortner N Journal Pflügers Archiv - European Journal of Physiology Seiten 3-25 Link Publikation -
2019
Titel BRAF inhibitors promote intermediate BRAF(V600E) conformations and binary interactions with activated RAS DOI 10.1126/sciadv.aav8463 Typ Journal Article Autor Röck R Journal Science Advances Link Publikation -
2021
Titel Allosteric Kinase Inhibitors Reshape MEK1 Kinase Activity Conformations in Cells and In Silico DOI 10.3390/biom11040518 Typ Journal Article Autor Fleischmann J Journal Biomolecules Seiten 518 Link Publikation -
2021
Titel mTORC2 controls the activity of PKC and Akt by phosphorylating a conserved TOR interaction motif DOI 10.1126/scisignal.abe4509 Typ Journal Article Autor Baffi T Journal Science Signaling Link Publikation
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2020
Titel cAMP-mediated regulation of proliferative kinase circuits Typ Other Förderbeginn 2020 Geldgeber Austrian Science Fund (FWF) -
2020
Titel cAMP-mediated regulation of proliferative kinase circuits Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2020 Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)