In vivo induzierte Gene von Tetracapsuloides bryosalmonae
In vivo induced genes of Tetracapsuloides bryosalmonae
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (40%); Land- und Forstwirtschaft, Fischerei (30%); Veterinärmedizin (30%)
Keywords
-
Proliferative kidney disease,
Tetracapsuloides bryosalmonae,
Myxozoan parasite,
Virulence genes,
In vivo induced genes,
Brown trout
Inhalt des Forschungsprojektes: Tetracapsuloides bryosalmonae ist ein Endoparasit, der die proliferative Nierenerkrankung (PKD) in verschiedenen Arten von Salmoniden in Europa und Nordamerika verursacht. Die wirtschaftlichen Auswirkungen der Krankheit machen sie zu einem wichtigen Faktor für die Aquakultur. PKD steht im Verdacht zu dem Rückgang der Bachforellen- und Lachspopulationen in Europa beizutragen. T. bryosalmonae vervollständigt den Entwicklungszyklus in zwei Wirten, ein wirbelloser Wirt: Bryozoen und ein Wirbeltier: Bachforellen. Die Proliferation der Parasiten induziert eine granulomatöse zelluläre Antwort in den interstitiellen Geweben, die zu einer Schwellung der Niere und der Milz führt. Die Virulenzmechanismen von T. bryosalmonae sind nicht vollständig erforscht und über die Virulenzgene, welche während des Infektionsverlaufs im Fischwirt induziert und exprimiert werden und an der Pathogenität beteiligt sind, ist noch nichts bekannt. Hypothese: Unsere Arbeitshypothese ist, dass die Virulenzgene von T. bryosalmonae während der Entwicklung der Parasiten in den Fischen induziert und in vivo ausgedrückt werden. Diese Gene können zur Virulenz oder Pathogenität für Fische während des Infektionsprozesses beitragen. Wir identifizieren Virulenzgene von T. bryosalmonae, die in vivo exprimiert werden und die Pathogenität für Bachforellen im Verlauf der Infektion verursachen. Methoden: In diesem Projekt werden Bachforellen mit Sporen von T. bryosalmonae infiziert. Serum und Organe der Fische werden zu verschiedenen Zeitpunkten beprobt. EinecDNA- Bibliothek von T. bryosalmonae wird konstruiert und ein Immunoscreening der cDNA- Bibliothek wird unter Verwendung von adsorbierten Fischseren durchgeführt. Positive Klone werden durch quantitative Echtzeit -PCR in den infizierten Organen identifiziert und validiert. Zusätzlichwirdeine RNA-Sequenzierung von T.bryosalmonaezur Sequenzhomologieanalyse generiert. Neuer und einzigartiger Aspekt des Projekts: Das Projekt stellt die erste Untersuchung von Virulenzgenen und Antigenen von T. bryosalmonae, welche in vivo im Zuge der Entwicklung der Parasiten exprimiert werden, dar. Die Ergebnisse werden Einblicke in den Mechanismus der proliferativen Nierenerkrankung der Salmoniden geben. Die neuen Gene und Antigene können für Therapie- und Impfstoffanwendungen in Betracht gezogen werden. Darüber hinaus liefern Transkriptomprofile von T. bryosalmonae grundlegende biologische Informationen und helfen uns, die Krankheitsmechanismen dieser wichtigen Fischparasiten zu verstehen.
Die proliferative Nierenerkrankung (PKD) ist eine parasitäre Malacosporidiose, die sowohl gezüchtete als auch wilde Salmoniden in Europa und Nordamerika deutlich beeinträchtigen, wirtschaftliche Verluste verursachen und Wildfischpopulationen gefährden kann. PKD wird durch den Endoparasiten Tetracapsuloides bryosalmonae verursacht, dessen Entwicklungszyklus abwechselnd in Süßwasserbryozoen und Salmoniden erfolgt. Der Fisch-Parasit entwickelt sich meistens in der Niere, wurde aber auch in anderen Geweben gefunden. Die Proliferation des Parasiten in der Niere verursacht eine Schwellung durch Hyperplasie des interstitiellen Gewebes und eine granulomatöse Zellreaktion. Im Wirtsfisch werden während der Infektion Virulenz-Gene induziert und exprimiert, die für Krankheit und Pathogenität wichtig sind. Ziel des beantragten Projektes war es, T. bryosalmonae-Gene zu identifizieren, die in der Bachforelle Salmo trutta exprimiert werden und an ihrer Erkrankung im Verlauf der Infektion beteiligt sind. Dies wurde durch die Verwendung der In-vivo-induzierten-Antigen-Technologie erreicht, einer Immunscreening-Technik, die Parasiten-Antigene identifiziert, die während einer Infektion in Fischen in vivo exprimiert werden. Die Seren von Bachforellen, die T. bryosalmonae ausgesetzt waren, wurden gesammelt und Anti-T. bryosalmonae-Antikörper wurde in jeder Serumprobe mittels indirektem ELISA bestätigt. Die gepoolten Seren wurden gegen drei Formen von Parasitensäcken und E. coli XL1-Blue-Antigenen adsorbiert, um Antikörper in den Seren zu entfernen, die auf Antigene reagieren, die konstitutiv von T. bryosalmonae in der Körperhöhle von Bryozoen exprimiert werden. Die resultierenden adsorbierten Seren wurden zum Screenen einer T. bryosalmonae-cDNA-Phagenexpressionsbibliothek verwendet. Positive Klone wurden gescreent und sequenziert und ihre Sequenzen auf Homologie zu bekannten Genen analysiert. Quantitative Echtzeit-PCR wurde durchgeführt, um die Transkriptionsniveaus dieser Gene in infizierten Nieren und infizierten Bryozoen zu bestimmen. Zusätzlich wurde eine RNA-Sequenzierung von T. bryosalmonae-infizierten Bryozoen (Fredericella sultana), hinteren Nieren von Bachforellen und Parasitensäcken durchgeführt, um Transkriptomdaten zu generieren. Die Ergebnisse dieses Projekts zeigen, dass 136 in vivo induzierte Gene von T. bryosalmonae wie Calmodulin, das ras-verwandte Protein Rab-35 und das Vesikel-assoziierte Membranprotein 3 induziert und in der Bachforelle während der Parasitenentwicklung exprimiert werden. Diese Gene sind an mehreren Funktionen beteiligt, die für den Parasiten entscheidend sind, wie Signalübertragung, Transport, Bindung von Metallionen und Stoffwechselprozessen. Die identifizierten in vivo induzierten Gene könnten für die Entwicklung von Impfstoffen oder als Arzneimittel-Ansätze zur Behandlung von PKD bei Salmoniden verwendet werden. Die Ergebnisse der RNA-seq-Analyse von infizierten F. sultana und infizierten Nieren von Bachforellen bieten neue Einblicke in die Immunreaktion beider Wirtsorganimen gegen T. bryosalmonae. De-novo-Transkriptomanordnungen von Parasitensäcken und Zooiden von F. sultana werden eine wertvolle Ressource für die Genentdeckung und funktionelle transkriptomische Anwendungen sein.
- Bernd Köller, Friedrich-Loeffler-Institut - Deutschland
- Frank Nilsen, University of Bergen - Norwegen
- Jerri Bartholomew, Oregon State University - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 346 Zitationen
- 26 Publikationen
- 4 Künstlerischer Output
- 7 Datasets & Models
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2022
Titel Identification of in vivo induced antigens of the malacosporean parasite Tetracapsuloides bryosalmonae (Cnidaria) using in vivo induced antigen technology DOI 10.3389/fcimb.2022.1032347 Typ Journal Article Autor Kumar G Journal Frontiers in Cellular and Infection Microbiology Seiten 1032347 Link Publikation -
2023
Titel Aboriginal Tribe’s Knowledge of the Endangered Freshwater Turtle Cuora amboinensis in Car Nicobar, a Remote Oceanic Island in the Bay of Bengal DOI 10.3390/fishes8100517 Typ Journal Article Autor Kiruba-Sankar R Journal Fishes Seiten 517 Link Publikation -
2024
Titel Novel insights into Tetracapsuloides bryosalmonae virulence genes during proliferative kidney disease in trout through RNA-seq technology Typ PhD Thesis Autor Saloni Shivam -
2023
Titel Differentially expressed transcripts of Tetracapsuloides bryosalmonae (Cnidaria) between carrier and dead-end hosts involved in key biological processes: novel insights from a coupled approach of FACS and RNA sequencing DOI 10.1186/s13567-023-01185-7 Typ Journal Article Autor Shivam S Journal Veterinary Research Seiten 51 Link Publikation -
2020
Titel Transcriptome Analysis Elucidates the Key Responses of Bryozoan Fredericella sultana during the Development of Tetracapsuloides bryosalmonae (Myxozoa) DOI 10.3390/ijms21165910 Typ Journal Article Autor Kumar G Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 5910 Link Publikation -
2020
Titel Identification and Expression Profiling of Toll-Like Receptors of Brown Trout (Salmo trutta) during Proliferative Kidney Disease DOI 10.3390/ijms21113755 Typ Journal Article Autor Sudhagar A Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 3755 Link Publikation -
2020
Titel Visualisation of immune responses of trout by using RNA-seq technology during proliferative kidney disease Typ PhD Thesis Autor Arun Sudhagar -
2020
Titel First transcriptome analysis of bryozoan Fredericella sultana, the primary host of myxozoan parasite Tetracapsuloides bryosalmonae DOI 10.7717/peerj.9027 Typ Journal Article Autor Kumar G Journal PeerJ Link Publikation -
2019
Titel Femtosecond laser generation of microbumps and nanojets on single and bilayer Cu/Ag thin films DOI 10.1039/c9cp02174d Typ Journal Article Autor Naghilou A Journal Physical Chemistry Chemical Physics Seiten 11846-11860 Link Publikation -
2022
Titel Transcriptomic and proteomic investigation of hostpathogen interaction in fish diseases Typ Postdoctoral Thesis Autor Gokhlesh Kumar -
2022
Titel Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.1186/s12864-022-08685-4 Typ Journal Article Autor Sudhagar A Journal BMC Genomics Seiten 446 Link Publikation -
2021
Titel Development of Fish Parasite Vaccines in the OMICs Era: Progress and Opportunities DOI 10.3390/vaccines9020179 Typ Journal Article Autor Shivam S Journal Vaccines Seiten 179 Link Publikation -
2021
Titel Data of de novo transcriptome assembly of the myxozoan parasite Tetracapsuloides bryosalmonae DOI 10.1016/j.dib.2021.106831 Typ Journal Article Autor Kumar G Journal Data in Brief Seiten 106831 Link Publikation -
2018
Titel Recombinase polymerase amplification assay combined with a lateral flow dipstick for rapid detection of Tetracapsuloides bryosalmonae, the causative agent of proliferative kidney disease in salmonids DOI 10.1186/s13071-018-2825-5 Typ Journal Article Autor Soliman H Journal Parasites & Vectors Seiten 234 Link Publikation -
2019
Titel Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.1186/s13071-019-3823-y Typ Journal Article Autor Sudhagar A Journal Parasites & Vectors Seiten 569 Link Publikation -
2018
Titel Transcriptome Analysis Based on RNA-Seq in Understanding Pathogenic Mechanisms of Diseases and the Immune System of Fish: A Comprehensive Review DOI 10.3390/ijms19010245 Typ Journal Article Autor Sudhagar A Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 245 Link Publikation -
2022
Titel Identification of in vivo induced antigens of the malacosporean parasite Tetracapsuloides bryosalmonae (Cnidaria) using in vivo induced antigen technology DOI 10.60692/ngnb9-6vs56 Typ Other Autor Arun Sudhagar Link Publikation -
2022
Titel Identification of in vivo induced antigens of the malacosporean parasite Tetracapsuloides bryosalmonae (Cnidaria) using in vivo induced antigen technology DOI 10.60692/6jcg4-ary29 Typ Other Autor Arun Sudhagar Link Publikation -
2022
Titel Additional file 6 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088063.v1 Typ Other Autor El-Matbouli M Link Publikation -
2022
Titel Additional file 6 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088063 Typ Other Autor El-Matbouli M Link Publikation -
2022
Titel Additional file 5 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088060.v1 Typ Other Autor El-Matbouli M Link Publikation -
2022
Titel Additional file 5 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088060 Typ Other Autor El-Matbouli M Link Publikation -
2021
Titel Kinetics of Parasite-Specific Antibody and B-Cell-Associated Gene Expression in Brown Trout, Salmo trutta during Proliferative Kidney Disease DOI 10.3390/biology10121244 Typ Journal Article Autor Shivam S Journal Biology Seiten 1244 Link Publikation -
2019
Titel MOESM1 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11299973 Typ Other Autor Ertl R Link Publikation -
2019
Titel MOESM1 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11299973.v1 Typ Other Autor Ertl R Link Publikation -
2019
Titel The Malacosporean Myxozoan Parasite Tetracapsuloides bryosalmonae: A Threat to Wild Salmonids DOI 10.3390/pathogens9010016 Typ Journal Article Autor Sudhagar A Journal Pathogens Seiten 16 Link Publikation
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2019
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Titel MOESM4 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11300000 Typ Film/Video/Animation Link Link -
2019
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Titel MOESM4 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11300000.v1 Typ Film/Video/Animation Link Link -
2019
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Titel MOESM5 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11300003 Typ Film/Video/Animation Link Link -
2019
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Titel MOESM5 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11300003.v1 Typ Film/Video/Animation Link Link
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2022
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Titel Additional file 4 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088057 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Additional file 3 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088054 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Additional file 2 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088051 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Additional file 1 of Genome-wide alternative splicing profile in the posterior kidney of brown trout (Salmo trutta) during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.20088048 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel MOESM2 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11299982 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel MOESM3 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11299991 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel MOESM6 of Transcriptome profiling of posterior kidney of brown trout, Salmo trutta, during proliferative kidney disease DOI 10.6084/m9.figshare.11300015 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link