Kommunikation zwischen Zellstoffwechsel und DNA-Reparatur
Crosstalk between cellular metabolism and DNA repair
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Metabolism,
DNA repair,
Genome integrity,
DNA damage
Die Aufrechterhaltung genetischer Informationen ist erforderlich um Krankheiten, einschließlich Krebs und seltene Krankheiten, zu unterdrücken. Dazu verfügen Zellen über ein komplexes Signalnetzwerk, das DNA-Schäden erkennt und anschließend repariert. Dieses Netzwerk beruht auf den chemischen Zustand der Zellen oder dem Metabolismus,und daher können Veränderungenim Zellmetabolismus die DNA-Schädigung und -Reparatur beeinflussen. Obwohl es einige Beispiele gibt, die das Wechselspiel zwischen Metabolismus und DNA- Reparatur hervorheben, wurde bis jetzt noch keine systematische Studie durchgeführt. Wir sind davon überzeugt, dass derzeitige Technologien, einschließlich Gen- Editierung (unter Verwendung von CRISPR-Cas9) und chemischer Biologie (mit der Entwicklung von Inhibitor-Stoffen) nun solche systematische Studien ermöglichen. Daher schlagen wir vor, mithilfe dieser Technologien, zusammen mit Markern für DNA-Schäden, zu untersuchen wie sich Stoffwechselprozesse auf DNA-Schäden und -Reparaturen auswirken. Nachdem wir neue Wechselwirkungen identifiziert haben, werden wir als nächstes herausfinden, wie sie auf molekularer Ebene funktionieren. Diese Studie wird zu einem Verständnis darüber führen, wie sich der chemische Zustand der Zellen auf den grundlegenden zellulären Prozess der DNA-Reparatur auswirkt, der letztendlich notwendig ist um genomische Informationen zu schützen. Zusätzlichwerdenwir Einblicke in Krankheiten erhalten, die mit DNA- Reparaturdefekten zusammenhängen, die zu besseren Behandlungen führen könnten.
Die Erhaltung des menschlichen Genoms ist notwendig, um Krankheiten, einschließlich Krebs und seltener Krankheiten, zu unterdrücken. Zu diesem Zweck verfügen die Zellen über ein komplexes Signalisierungsnetz, das Schäden an der DNA, aus der unsere Genome bestehen, erkennt. Dieses Netzwerk ist in der Lage, diese Schäden zu reparieren, und hängt vom chemischen Zustand der Zellen, d. h. vom Stoffwechsel, ab, so dass sich Veränderungen im zellulären Stoffwechsel auf DNA-Schäden und deren Reparatur auswirken können. Es gibt zwar einige Beispiele dafür, wie sich der Stoffwechsel auf die DNA-Reparatur auswirken kann, doch wurde dies bisher nicht systematisch untersucht. Wir schlagen vor, dass die aktuellen Technologien, einschließlich des Gen-Editierens (mit CRISPR-Cas9) und der chemischen Biologie (mit der Entwicklung von Inhibitorverbindungen), nun solche systematischen Untersuchungen ermöglichen. Daher haben wir diese Technologien zusammen mit Markern für DNA-Schäden eingesetzt, um zu untersuchen, wie Stoffwechselprozesse DNA-Schäden und -Reparaturen beeinflussen. Nachdem wir neue Wechselwirkungen identifiziert hatten, haben wir untersucht, wie sie auf molekularer Ebene funktionieren. Unsere Ergebnisse haben unser Verständnis dafür verbessert, wie sich der chemische Zustand der Zellen auf den grundlegenden zellulären Prozess der DNA-Reparatur auswirkt, der letztlich zum Schutz der genomischen Information notwendig ist. Das bedeutet, dass wir besser verstehen, wie Krankheiten entstehen, die mit DNA-Reparaturdefiziten einhergehen, so dass diese Erkenntnisse letztlich zu besseren Behandlungsmöglichkeiten für Krankheiten führen könnten, die mit einer Instabilität des Genoms einhergehen.
- Giulio Gino Maria Superti-Furga, CeMM – Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH , nationale:r Kooperationspartner:in
- Stefan Kubicek, CeMM – Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH , nationale:r Kooperationspartner:in
- Jörg Menche, Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
- Trey G. Ideker, University of California San Diego - Vereinigte Staaten von Amerika
- Stephen P. Jackson, University of Cambridge - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 253 Zitationen
- 10 Publikationen
- 3 Datasets & Models
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2021
Titel Prime Editing Efficiency and Fidelity are Enhanced in the Absence of Mismatch Repair DOI 10.1101/2021.09.30.462548 Typ Preprint Autor Da Silva J Seiten 2021.09.30.462548 Link Publikation -
2022
Titel A metabolic map of the DNA damage response identifies PRDX1 in nuclear ROS scavenging and aspartate synthesis DOI 10.1101/2022.08.01.500855 Typ Preprint Autor Moretton A Seiten 2022.08.01.500855 Link Publikation -
2022
Titel Prime editing efficiency and fidelity are enhanced in the absence of mismatch repair DOI 10.3929/ethz-b-000533332 Typ Other Autor Ferreira Da Silva Link Publikation -
2020
Titel Interplay between Cellular Metabolism and the DNA Damage Response in Cancer DOI 10.3390/cancers12082051 Typ Journal Article Autor Moretton A Journal Cancers Seiten 2051 Link Publikation -
2021
Titel Interplay between cellular metabolism and the DNA damage response DOI 10.3390/iecc2021-09223 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Loizou J Seiten 9223 Link Publikation -
2022
Titel Clickable Cisplatin Derivatives as Versatile Tools to Probe the DNA Damage Response to Chemotherapy DOI 10.3389/fonc.2022.874201 Typ Journal Article Autor Moretton A Journal Frontiers in Oncology Seiten 874201 Link Publikation -
2023
Titel A metabolic map of the DNA damage response identifies PRDX1 in the control of nuclear ROS scavenging and aspartate availability DOI 10.15252/msb.202211267 Typ Journal Article Autor Moretton A Journal Molecular Systems Biology Link Publikation -
2023
Titel Detection of oxaliplatin- and cisplatin-DNA lesions requires different global genome repair mechanisms that affect their clinical efficacy DOI 10.1093/narcan/zcad057 Typ Journal Article Autor Slyskova J Journal NAR Cancer Link Publikation -
2022
Titel Prime editing efficiency and fidelity are enhanced in the absence of mismatch repair DOI 10.1038/s41467-022-28442-1 Typ Journal Article Autor Ferreira Da Silva J Journal Nature Communications Seiten 760 Link Publikation -
2021
Titel Tissue Specific DNA Repair Outcomes Shape the Landscape of Genome Editing DOI 10.3389/fgene.2021.728520 Typ Journal Article Autor Meyenberg M Journal Frontiers in Genetics Seiten 728520 Link Publikation
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2022
Link
Titel Metabolomics data Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
Link
Titel CRISPR screen next generation sequencing data Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
Link
Titel Chromatome-MS data Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2021
Titel Wilhelm Ritter von Mannagetta Prize for Medicine Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country)