Phylogenetik & Biogeographie von Nicotiana Sekt. Suaveolente
Phylogenetics & Biogeography of Nicotiana sect.Suaveolentes
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Nicotiana,
Phylogenetics,
Evolution,
Biogeography,
RADseq.,
Suaveolentes
Die Gattung Nicotiana zählt zur Pflanzenfamilie der Solanaceae (Nachtschattengewächse) die von hoher wirtschaftlicher Bedeutung ist. Die Familie der Nachtschattengewächse umfasst einige sehr wichtige Nutzpflanzen (z.B. Kartoffel Solanum tuberosum, Tomaten Solanum lycopersicum, Melanzani Solanum melongena, Paprika und Chilis Capsicum spp., Tabak Nicotiana spp.) sowie Zierpflanzen (z.B. Petunia spp.). In diesem Projekt wird die Sektion Suaveolentes der Gattung Nicotiana untersucht. Der Großteil der Arten dieser Sektion ist in Australien endemisch. Die Sektion Suaveolentes ist wahrscheinlich das Ergebnis von natürlicher Allopolyploidie; die Hybridisation zwischen zwei nicht sehr nahe miteinander verwandten Arten gefolgt von einer Verdoppelung des gesamten Genoms. Mit der Evolution neuer Arten der Gattung Nicotiana Sektion Suaveolentes und der Reduktion der Chromosomenzahl, besetzten diese das trockene Innere von Zentral- und Südaustralien, wo sie heute am vielfältigsten sind. Gegenwärtig existieren jedoch zwei grundlegend unterschiedliche Erklärungen für die aktuelle Verteilung von Nicotiana Sektion Suaveolentes in Australien. Nach Meinung australischer Forscher ist der Vorfahre von Nicotiana Sektion Suaveolentes, wie fast alle anderen australischen Pflanzengruppen, etwa 20 Millionen Jahre alt und war früher auf dem ganzen Kontinent verbreitet, lange bevor die Aridifizierung vor sieben Millionen Jahren begann. In diesem Szenario sind die gegenwärtigen Verteilungsmuster der modernen Arten auf die Vikarianz über 20 Millionen Jahre zurückzuführen. Im Gegensatz dazu, neuere Forschungen, basierend auf Analysen der molekulare Uhr und wenigen Arten der Sektion Suaveolentes, ergaben, dass das Alter der Sektion nur sechs Millionen Jahre beträgt. Die Ausbreitung in die Eremäische Zone begann erst vor zwei Millionen Jahren. Um diese zwei verschiedenen Meinungen über die Verteilung der Sektion in der Eraemäischen Zone zu testen, erstreben wir, einen gut aufgelösten phylogenetischen Baum für die 45 Arten der Sektion Suaveolentes mit Nicotiana africana als Außengruppe zu erstellen. Wir beabsichtigen die Verwendung einer DNA-Sequenziertechnik mit hohem Durchsatz. Diese Methode wird uns zehntausende variable Stellen liefern, von denen erwartet wird, dass sie großes Potential für eine Artabgrenzung sowie zur Klärung phylogenetischer Fragestellungen haben. Um die evolutionären Details und Prozesse dieser Gruppe besser zu verstehen, wird eine Analyse auf Populationsniveau, basierend auf derselben Methode, durchgeführt. Diese Informationen werden verwendet, um die historische Demografie dieser Gruppe einschließlich Datierung zu untersuchen, was Hinweise auf die Verbreitung der Sektion Suaveolentes, sowie auf Variationen der Populationsgrößen und des Genflusses geben wird. Gut aufgelöste phylogenetische Verwandtschaftsbeziehungen werden auch das biogeographische Muster und die Veränderungen der Chromosomenzahlen und Genomgrößen in der Sektion Suaveolentes klären.
Mit Unterstützung durch Experten (Taxonomie und Feldforschung der Gattung Nicotiana), welche das benötigte Material aus Australien zu Verfügung stellten, konnte durch dieses Projekt ein wichtiger Beitrag für die Öffentlichkeit geleistet werden. Im Quarantäne-Gewächshaus der Kew Royal Botanic Gardens wurden Pflanzen mittels des gesammelten Saatguts gezogen und vermehrt. Die Setzlinge wurden sorgfältigst untersucht, teilweise neue Arten beschrieben und deren morphologischen Merkmale durch das Erstellen von Zeichnungen festgehalten. Die Laborarbeit wurde von qualifiziertem Personal der Abteilung für Systematik und Evolutionsbotanik durchgeführt, die Auswertung und Analyse der generierten Daten durch einen am Projekt beteiligten Postdoc. Die Beiträge der im Projekt Involvierten ermöglichte die Veröffentlichung der Ergebnisse des Projekts, welche Raum für zukünftige Arbeit innerhalb der Gattung Nicotiana und anderen Pflanzengruppen schaffen.
- Universität Wien - 100%
- Mark W. Chase, Royal Botanic Gardens - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 44 Zitationen
- 8 Publikationen
- 2 Künstlerischer Output
- 3 Methoden & Materialien
- 2 Datasets & Models
- 2 Disseminationen
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2024
Titel Taxonomy of the Nicotiana megalosiphon species complex (Solanaceae; Nicotiana section Suaveolentes): analyses of RADseq data identifies a new cryptic species DOI 10.1071/sb24021 Typ Journal Article Autor Chase M Journal Australian Systematic Botany -
2024
Titel Recent speciation and adaptation to aridity in the ecologically diverse Pilbara region of Australia enabled the native tobaccos (Nicotiana; Solanaceae) to colonize all Australian deserts. DOI 10.1111/mec.17498 Typ Journal Article Autor Cauz-Santos La Journal Molecular ecology -
2021
Titel Phylogenomics of Nicotiana section Suaveolentes (Solanaceae), with a focus on N. Benthamiana Typ Other Autor Aljaž Jakob -
2022
Titel Genomic insights into recent species divergence in Nicotiana benthamiana and natural variation in Rdr1 gene controlling viral susceptibility DOI 10.1111/tpj.15801 Typ Journal Article Autor Cauz-Santos L Journal The Plant Journal Seiten 7-18 Link Publikation -
2023
Titel Nine new species of Australian Nicotiana (Solanaceae) DOI 10.1071/sb23001 Typ Journal Article Autor Chase M Journal Australian Systematic Botany -
2022
Titel Taxonomy of the Australian Nicotiana benthamiana complex (Nicotiana section Suaveolentes; Solanaceae): five species, four newly described, with distinct ranges and morphologies DOI 10.1071/sb22009 Typ Journal Article Autor Chase M Journal Australian Systematic Botany Seiten 345-363 Link Publikation -
2022
Titel Down, then up: non-parallel genome size changes and a descending chromosome series in a recent radiation of the Australian allotetraploid plant species, Nicotiana section Suaveolentes (Solanaceae) DOI 10.1093/aob/mcac006 Typ Journal Article Autor Chase M Journal Annals of Botany Seiten 123-142 Link Publikation -
2022
Titel Variation of the Rdr1 gene insertion in wild populations of Nicotiana benthamiana (Solanaceae) and insights into recent species divergence DOI 10.1101/2022.02.01.478068 Typ Preprint Autor Cauz-Santos L Seiten 2022.02.01.478068 Link Publikation
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2023
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Titel Nine new species of Australian Nicotiana (Solanaceae) Typ Artwork Link Link -
2022
Link
Titel Taxonomy of the Australian Nicotiana benthamiana complex (Nicotiana section Suaveolentes; Solanaceae): five species, four newly described, with distinct ranges and morphologies Typ Artwork Link Link
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2024
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Titel Biogeography and Ancestral range estimation Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link -
2023
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Titel Chromosome counts and genome size measurements Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Restriction Site Associated DNA sequencing (RADseq.) Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link
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2024
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Titel Attending the International Congress of the Brazilian Genetic Society Typ A talk or presentation Link Link -
2023
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Titel Conference and Seminars attended by the PI, collaborator, Postdoc and the student involved in this project Typ Participation in an activity, workshop or similar Link Link
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2024
Titel invited talk at the International Congress of the Brazilian Genetics society Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International