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Phylogenetik & Biogeographie von Nicotiana Sekt. Suaveolente

Phylogenetics & Biogeography of Nicotiana sect.Suaveolentes

Mary Rosabelle Samuel (ORCID: 0000-0003-0197-4854)
  • Grant-DOI 10.55776/P33028
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2020
  • Projektende 30.06.2024
  • Bewilligungssumme 336.118 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Nicotiana, Phylogenetics, Evolution, Biogeography, RADseq., Suaveolentes

Abstract Endbericht

Die Gattung Nicotiana zählt zur Pflanzenfamilie der Solanaceae (Nachtschattengewächse) die von hoher wirtschaftlicher Bedeutung ist. Die Familie der Nachtschattengewächse umfasst einige sehr wichtige Nutzpflanzen (z.B. Kartoffel Solanum tuberosum, Tomaten Solanum lycopersicum, Melanzani Solanum melongena, Paprika und Chilis Capsicum spp., Tabak Nicotiana spp.) sowie Zierpflanzen (z.B. Petunia spp.). In diesem Projekt wird die Sektion Suaveolentes der Gattung Nicotiana untersucht. Der Großteil der Arten dieser Sektion ist in Australien endemisch. Die Sektion Suaveolentes ist wahrscheinlich das Ergebnis von natürlicher Allopolyploidie; die Hybridisation zwischen zwei nicht sehr nahe miteinander verwandten Arten gefolgt von einer Verdoppelung des gesamten Genoms. Mit der Evolution neuer Arten der Gattung Nicotiana Sektion Suaveolentes und der Reduktion der Chromosomenzahl, besetzten diese das trockene Innere von Zentral- und Südaustralien, wo sie heute am vielfältigsten sind. Gegenwärtig existieren jedoch zwei grundlegend unterschiedliche Erklärungen für die aktuelle Verteilung von Nicotiana Sektion Suaveolentes in Australien. Nach Meinung australischer Forscher ist der Vorfahre von Nicotiana Sektion Suaveolentes, wie fast alle anderen australischen Pflanzengruppen, etwa 20 Millionen Jahre alt und war früher auf dem ganzen Kontinent verbreitet, lange bevor die Aridifizierung vor sieben Millionen Jahren begann. In diesem Szenario sind die gegenwärtigen Verteilungsmuster der modernen Arten auf die Vikarianz über 20 Millionen Jahre zurückzuführen. Im Gegensatz dazu, neuere Forschungen, basierend auf Analysen der molekulare Uhr und wenigen Arten der Sektion Suaveolentes, ergaben, dass das Alter der Sektion nur sechs Millionen Jahre beträgt. Die Ausbreitung in die Eremäische Zone begann erst vor zwei Millionen Jahren. Um diese zwei verschiedenen Meinungen über die Verteilung der Sektion in der Eraemäischen Zone zu testen, erstreben wir, einen gut aufgelösten phylogenetischen Baum für die 45 Arten der Sektion Suaveolentes mit Nicotiana africana als Außengruppe zu erstellen. Wir beabsichtigen die Verwendung einer DNA-Sequenziertechnik mit hohem Durchsatz. Diese Methode wird uns zehntausende variable Stellen liefern, von denen erwartet wird, dass sie großes Potential für eine Artabgrenzung sowie zur Klärung phylogenetischer Fragestellungen haben. Um die evolutionären Details und Prozesse dieser Gruppe besser zu verstehen, wird eine Analyse auf Populationsniveau, basierend auf derselben Methode, durchgeführt. Diese Informationen werden verwendet, um die historische Demografie dieser Gruppe einschließlich Datierung zu untersuchen, was Hinweise auf die Verbreitung der Sektion Suaveolentes, sowie auf Variationen der Populationsgrößen und des Genflusses geben wird. Gut aufgelöste phylogenetische Verwandtschaftsbeziehungen werden auch das biogeographische Muster und die Veränderungen der Chromosomenzahlen und Genomgrößen in der Sektion Suaveolentes klären.

Mit Unterstützung durch Experten (Taxonomie und Feldforschung der Gattung Nicotiana), welche das benötigte Material aus Australien zu Verfügung stellten, konnte durch dieses Projekt ein wichtiger Beitrag für die Öffentlichkeit geleistet werden. Im Quarantäne-Gewächshaus der Kew Royal Botanic Gardens wurden Pflanzen mittels des gesammelten Saatguts gezogen und vermehrt. Die Setzlinge wurden sorgfältigst untersucht, teilweise neue Arten beschrieben und deren morphologischen Merkmale durch das Erstellen von Zeichnungen festgehalten. Die Laborarbeit wurde von qualifiziertem Personal der Abteilung für Systematik und Evolutionsbotanik durchgeführt, die Auswertung und Analyse der generierten Daten durch einen am Projekt beteiligten Postdoc. Die Beiträge der im Projekt Involvierten ermöglichte die Veröffentlichung der Ergebnisse des Projekts, welche Raum für zukünftige Arbeit innerhalb der Gattung Nicotiana und anderen Pflanzengruppen schaffen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Mark W. Chase, Royal Botanic Gardens - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 55 Zitationen
  • 9 Publikationen
  • 2 Künstlerischer Output
  • 3 Methoden & Materialien
  • 2 Datasets & Models
  • 2 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Origin and biogeographical history of Palaeotropical Piper (Piperaceae): multiple long-distance dispersals from South America initiated during the Middle Eocene climatic optimum
    DOI 10.1093/botlinnean/boaf014
    Typ Journal Article
    Autor Metschina D
    Journal Botanical Journal of the Linnean Society
    Seiten 189-204
  • 2024
    Titel Recent speciation and adaptation to aridity in the ecologically diverse Pilbara region of Australia enabled the native tobaccos (Nicotiana; Solanaceae) to colonize all Australian deserts
    DOI 10.1111/mec.17498
    Typ Journal Article
    Autor Cauz-Santos L
    Journal Molecular Ecology
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Taxonomy of the Nicotiana megalosiphon species complex (Solanaceae; Nicotiana section Suaveolentes): analyses of RADseq data identifies a new cryptic species
    DOI 10.1071/sb24021
    Typ Journal Article
    Autor Chase M
    Journal Australian Systematic Botany
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Taxonomy of the Australian Nicotiana benthamiana complex (Nicotiana section Suaveolentes; Solanaceae): five species, four newly described, with distinct ranges and morphologies
    DOI 10.1071/sb22009
    Typ Journal Article
    Autor Chase M
    Journal Australian Systematic Botany
    Seiten 345-363
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Down, then up: non-parallel genome size changes and a descending chromosome series in a recent radiation of the Australian allotetraploid plant species, Nicotiana section Suaveolentes (Solanaceae)
    DOI 10.1093/aob/mcac006
    Typ Journal Article
    Autor Chase M
    Journal Annals of Botany
    Seiten 123-142
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Variation of the Rdr1 gene insertion in wild populations of Nicotiana benthamiana (Solanaceae) and insights into recent species divergence
    DOI 10.1101/2022.02.01.478068
    Typ Preprint
    Autor Cauz-Santos L
    Seiten 2022.02.01.478068
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Genomic insights into recent species divergence in Nicotiana benthamiana and natural variation in Rdr1 gene controlling viral susceptibility
    DOI 10.1111/tpj.15801
    Typ Journal Article
    Autor Cauz-Santos L
    Journal The Plant Journal
    Seiten 7-18
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Phylogenomics of Nicotiana section Suaveolentes (Solanaceae), with a focus on N. Benthamiana
    Typ Other
    Autor Aljaž Jakob
  • 2023
    Titel Nine new species of Australian Nicotiana (Solanaceae)
    DOI 10.1071/sb23001
    Typ Journal Article
    Autor Chase M
    Journal Australian Systematic Botany
    Seiten 167-205
    Link Publikation
Künstlerischer Output
  • 2023 Link
    Titel Nine new species of Australian Nicotiana (Solanaceae)
    Typ Artwork
    Link Link
  • 2022 Link
    Titel Taxonomy of the Australian Nicotiana benthamiana complex (Nicotiana section Suaveolentes; Solanaceae): five species, four newly described, with distinct ranges and morphologies
    Typ Artwork
    Link Link
Methoden & Materialien
  • 2023 Link
    Titel Chromosome counts and genome size measurements
    Typ Improvements to research infrastructure
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2022 Link
    Titel Restriction Site Associated DNA sequencing (RADseq.)
    Typ Improvements to research infrastructure
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel Biogeography and Ancestral range estimation
    Typ Improvements to research infrastructure
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Datasets & Models
  • 2021 Link
    Titel RADseq data Nicotiana section Suaveolentes
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Sampling material of Nicotiana section Suaveolentes
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 2024 Link
    Titel Attending the International Congress of the Brazilian Genetic Society
    Typ A talk or presentation
    Link Link
  • 2023 Link
    Titel Conference and Seminars attended by the PI, collaborator, Postdoc and the student involved in this project
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2024
    Titel invited talk at the International Congress of the Brazilian Genetics society
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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