Detektion von RNA Modifikationen an einzelnen Molekülen

Weave: Österreich - Belgien - Deutschland - Luxemburg - Polen - Schweiz - Slowenien - Tschechien

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (34%); Informatik (33%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (33%)

Keywords

RNA-modifications, Epitranscriptomics, Single-Molecule Sequencing, Innate Immunity, Adenosine Deamination, Modification Crosstalk

Abstract

RNA-Moleküle können auf viele verschiedene Arten chemisch modifiziert werden. Diese chemischen Modifikationen steuern wichtige funktionelle Aspekte der RNA, wie Immunogenität, Stabilität, Kodierungsinformationen oder Translatierbarkeit. Heute sind mehr als 150 chemische Modifikationen in RNA bekannt. Doch nur sehr wenige können mit Hochdurchsatzmethoden genau nachgewiesen werden. Die Umwandlung von Adenosin in Inosin ist eine häufig vorkommende Modifikation in RNA. Wir wissen zwar, wo Inosine in der RNA zu finden sind, deren lineare Anordnung entlang einzelner RNA-Moleküle ist jedoch nicht bekannt. Da Inosine erforderlich sind, um eine Immunreaktion gegen RNA zu verhindern, ist die lineare Anordnung von Inosinen in einzelnen Molekülen wahrscheinlich sehr wichtig. In diesem Projekt werden wir modernste Sequenzierungstechnologien einsetzen, um das Vorkommen von Inosinen und anderen RNA- Modifikationen entlang einzelner Moleküle zu entschlüsseln.