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Molecular Bioanalytics

Molecular Bioanalytics: From molecular recognition to membrane transport (MoBA)

Peter Pohl (ORCID: 0000-0002-1792-2314)
  • Grant-DOI 10.55776/W1201
  • Förderprogramm Doktoratskollegs
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2006
  • Projektende 31.12.2010
  • Bewilligungssumme 1.526.962 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Abstract

Das interdisziplinäre Doktoratskolleg (DK) wird von den Instituten für Biophysik, Analytische Chemie, Angewandte Physik, Organische Chemie und Theoretische Physik der Johannes-Kepler-Universität (JKU), dem Johan Radon Institut für Numerische und Angewandte Mathematik der Österreichischen Akademie der Wissenschaften und der Upper Austrian Research GmbH getragen. Seine Forschungstätigkeit ist auf die miteinander verknüpften Prozesse der Molekülerkennung und des molekularen Membrantransports gerichtet. Während der erstgenannte Teil komplementär zum GENAU-Netzwerk an der JKU "Ultrasensitive Proteomik and Genomik" ist, fußt der zweite Teil auf einer langjährigen Forschungstradition an der Universität. Die wissenschaftliche Arbeit des DK zielt darauf ab, ein molekulares Bild dessen zu erarbeiten, wie Moleküle an der Membranoberfläche erkannt und wie sie durch Membranproteine geschleust werden. Die Erforschung der, an Erkennungs- und Transportprozessens beteiligten Carrier (Natrium-Glukose-Transporter), Kernporen, sowie von Wasser- und Ionenkanälen (AQP und TRP-kanäle) profitiert von der Entwicklung neuer bioanalytischer Methoden (dünne piezoelektrische Filmwandler, Zellmikroarrays, molekular geprägte Polymere, Vielparameter- Hochdurchsatzmikroskopie). Gut etablierte analytische Techniken mit einer, die gesamte Skale von Einzelmolekülen bis zu Molekülensembles abdeckenden, Auflösung liefern eine solide Basis für das Molekular- Bioanalytische Programm. Letzteres ist Teil des interdisziplinären Netzwerkes "Biosystemanalyse an der JKU. Es zielt darauf ab, österreichischen und internationalen Promotionsstudenten hervorragende Studienmöglichkeiten im Grenzgebiet zwischen Physik, Medizin Biologie und Chemie einzuräumen. Sein Studienplan setzt sich aus Vorlesungen in Einzelmolekültechniken, Bioanalyse molekularer Ensembles und molekularbiologischen Techniken zusammen, die durch Praktika komplettiert werden. Zusätzlich haben die Studenten die Möglichkeit, Kurse über Präsentationstechniken, in Rhetorik und Wissensvermittlung zu besuchen. Die Programmrichtlinien beinhalten die Teilnahme am jährlichen "Einzelmolekül-Workshop" in Linz und eine jährliche Sommerschule, an der neben den Studenten der gesamte Lehrkörper teilnimmt. Die Förderung des DK wird es den Doktoranden darüber hinaus ermöglichen, nationale und internationale Kongresse zu besuchen und ein Semester in einem Labor eines ausländischen Kooperationspartners zu arbeiten. Kombiniert mit exzellenter Forschung auf dem Gebiet der Lebenswissenschaften bietet das Programm wissenschaftliche und technologische Einblicke auf dem Gebiet der Biophysik, der Angewandten Physik, der Bioorganischen Chemie, der Struktur- und Molekularbiologie, der mathematischen Modellierung und numerischen Umsetzung. Sie verleihen dem Doktoranden die nötige Flexibilität für ein kontinuierliches professionelles Wachstum.

Konsortium
  • Peter Pohl, Universität Linz
    Konsortiumsmitglied (01.03.2006 - 31.12.2010)
Forschungsstätte(n)
  • CBL GmbH
  • Universität Linz
  • Österreichische Akademie der Wissenschaften
Nationale Projektbeteiligte
  • Alois Sonnleitner, CBL GmbH , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Gerhard J. Schütz, Technische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Christoph Romanin, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Johannes David Pedarnig, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Johannes Heitz, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Norbert Müller, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Peter Hinterdorfer, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Peter Pohl, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Sapar Saparov, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Urbaan M. Titulaer, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Wolfgang Buchberger, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Heinz Engl, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Gottfried Otting, ANU - Australian National University - Australien
  • Klaus Albert, Eberhard-Karls-Universität Tübingen - Deutschland
  • Michael Schaefer, Freie Universität Berlin - Deutschland
  • Walter Rosenthal, Helmholtz-Gemeinschaft Deutscher Forschungszentren - Deutschland
  • Claus Hultschig, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
  • Klaus Fendler, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
  • Rolf Kinne, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
  • Helmut Grubmüller, Max-Planck-Institut für Biophysikalische Chemie - Deutschland
  • Dietmar Knopp, Technische Universität München - Deutschland
  • Boris Mizaikoff, Universität Ulm - Deutschland
  • Natalia Prevarskaya, Université de Lille - Frankreich
  • Ziv Reich, Weizmann Institute of Science - Israel
  • Vincenzo Capasso, University of Milan - Italien
  • Ivano Bertini, Università degli Studi di Firenze - Italien
  • Matthias A. Hediger, University of Bern - Schweiz
  • Vaclav Svorcik, University of Chemistry and Technology Prague - Tschechien
  • Laszlo Vigh, University of Szeged - Ungarn
  • Evan Evans, Boston University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Peter Agre, Duke Medical Center - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Rüdiger H. Ettrich, Larkin University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Nikolai M. Soldatov, National Institutes of Health - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Robert S. Eisenberg, Rush University Medical Center - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Stanley Osher, University of California at Los Angeles - Vereinigte Staaten von Amerika
  • John Cherian Mathai, University of Pittsburgh - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Mark Zeidel, University of Pittsburgh - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Philip M. Williams, Nottingham University - Vereinigtes Königreich
  • Alexander M. Seifalian, University College London - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 1307 Zitationen
  • 18 Publikationen
Publikationen
  • 2018
    Titel New Avenues for Matter-Wave-Enhanced Spectroscopy
    DOI 10.1007/978-3-319-64346-5_2
    Typ Book Chapter
    Autor Rodewald J
    Verlag Springer Nature
    Seiten 21-34
  • 2011
    Titel Monitoring Single-channel Water Permeability in Polarized Cells*
    DOI 10.1074/jbc.m111.291864
    Typ Journal Article
    Autor Erokhova L
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 39926-39932
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Cholesterol's decoupling effect on membrane partitioning and permeability revisited: Is there anything beyond Fick's law of diffusion?
    DOI 10.1016/j.bbamem.2008.05.001
    Typ Journal Article
    Autor Missner A
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes
    Seiten 2154-2156
    Link Publikation
  • 2007
    Titel The first ankyrin-like repeat is the minimum indispensable key structure for functional assembly of homo- and heteromeric TRPC4/TRPC5 channels
    DOI 10.1016/j.ceca.2007.05.015
    Typ Journal Article
    Autor Schindl R
    Journal Cell Calcium
    Seiten 260-269
  • 2013
    Titel Long and Short Lipid Molecules Experience the Same Interleaflet Drag in Lipid Bilayers
    DOI 10.1103/physrevlett.110.268101
    Typ Journal Article
    Autor Horner A
    Journal Physical Review Letters
    Seiten 268101
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Electrostatically Induced Recruitment of Membrane Peptides into Clusters Requires Ligand Binding at Both Interfaces
    DOI 10.1371/journal.pone.0052839
    Typ Journal Article
    Autor Antonenko Y
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Single-Molecule Analysis of the Recognition Forces Underlying Nucleo-Cytoplasmic Transport
    DOI 10.1002/ange.201305359
    Typ Journal Article
    Autor Rangl M
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 10546-10549
    Link Publikation
  • 2016
    Titel New avenues for matter-wave-enhanced spectroscopy
    DOI 10.1007/s00340-016-6573-y
    Typ Journal Article
    Autor Rodewald J
    Journal Applied Physics B
    Seiten 3
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Structure, Regulation and Biophysics of ICRAC, STIM/Orai1
    DOI 10.1007/978-94-007-2888-2_16
    Typ Book Chapter
    Autor Derler I
    Verlag Springer Nature
    Seiten 383-410
  • 2010
    Titel Resting State Orai1 Diffuses as Homotetramer in the Plasma Membrane of Live Mammalian Cells*
    DOI 10.1074/jbc.m110.177881
    Typ Journal Article
    Autor Madl J
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 41135-41142
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Plasticity in Ca2+ selectivity of Orai1/Orai3 heteromeric channel
    DOI 10.1073/pnas.0907714106
    Typ Journal Article
    Autor Schindl R
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 19623-19628
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Recent progress on STIM1 domains controlling Orai activation
    DOI 10.1016/j.ceca.2009.08.003
    Typ Journal Article
    Autor Schindl R
    Journal Cell Calcium
    Seiten 227-232
  • 2009
    Titel No facilitator required for membrane transport of hydrogen sulfide
    DOI 10.1073/pnas.0902952106
    Typ Journal Article
    Autor Mathai J
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 16633-16638
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Mechanistic view on domains mediating STIM1–Orai coupling
    DOI 10.1111/j.1600-065x.2009.00815.x
    Typ Journal Article
    Autor Fahrner M
    Journal Immunological Reviews
    Seiten 99-112
  • 2009
    Titel Stable, Non-Destructive Immobilization of Native Nuclear Membranes to Micro-Structured PDMS for Single-Molecule Force Spectroscopy
    DOI 10.1002/cphc.200900219
    Typ Journal Article
    Autor Rangl M
    Journal ChemPhysChem
    Seiten 1553-1558
    Link Publikation
  • 2009
    Titel 110 Years of the Meyer–Overton Rule: Predicting Membrane Permeability of Gases and Other Small Compounds
    DOI 10.1002/cphc.200900270
    Typ Journal Article
    Autor Missner A
    Journal ChemPhysChem
    Seiten 1405-1414
    Link Publikation
  • 2006
    Titel Fast and Selective Ammonia Transport by Aquaporin-8*
    DOI 10.1074/jbc.m609343200
    Typ Journal Article
    Autor Saparov S
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 5296-5301
    Link Publikation
  • 2006
    Titel Dynamic but not constitutive association of calmodulin with rat TRPV6 channels enables fine tuning of Ca2+-dependent inactivation
    DOI 10.1113/jphysiol.2006.118661
    Typ Journal Article
    Autor Derler I
    Journal The Journal of Physiology
    Seiten 31-44
    Link Publikation

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