Molecular Bioanalytics
Molecular Bioanalytics: From molecular recognition to membrane transport (MoBA)
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Das interdisziplinäre Doktoratskolleg (DK) wird von den Instituten für Biophysik, Analytische Chemie, Angewandte Physik, Organische Chemie und Theoretische Physik der Johannes-Kepler-Universität (JKU), dem Johan Radon Institut für Numerische und Angewandte Mathematik der Österreichischen Akademie der Wissenschaften und der Upper Austrian Research GmbH getragen. Seine Forschungstätigkeit ist auf die miteinander verknüpften Prozesse der Molekülerkennung und des molekularen Membrantransports gerichtet. Während der erstgenannte Teil komplementär zum GENAU-Netzwerk an der JKU "Ultrasensitive Proteomik and Genomik" ist, fußt der zweite Teil auf einer langjährigen Forschungstradition an der Universität. Die wissenschaftliche Arbeit des DK zielt darauf ab, ein molekulares Bild dessen zu erarbeiten, wie Moleküle an der Membranoberfläche erkannt und wie sie durch Membranproteine geschleust werden. Die Erforschung der, an Erkennungs- und Transportprozessens beteiligten Carrier (Natrium-Glukose-Transporter), Kernporen, sowie von Wasser- und Ionenkanälen (AQP und TRP-kanäle) profitiert von der Entwicklung neuer bioanalytischer Methoden (dünne piezoelektrische Filmwandler, Zellmikroarrays, molekular geprägte Polymere, Vielparameter- Hochdurchsatzmikroskopie). Gut etablierte analytische Techniken mit einer, die gesamte Skale von Einzelmolekülen bis zu Molekülensembles abdeckenden, Auflösung liefern eine solide Basis für das Molekular- Bioanalytische Programm. Letzteres ist Teil des interdisziplinären Netzwerkes "Biosystemanalyse an der JKU. Es zielt darauf ab, österreichischen und internationalen Promotionsstudenten hervorragende Studienmöglichkeiten im Grenzgebiet zwischen Physik, Medizin Biologie und Chemie einzuräumen. Sein Studienplan setzt sich aus Vorlesungen in Einzelmolekültechniken, Bioanalyse molekularer Ensembles und molekularbiologischen Techniken zusammen, die durch Praktika komplettiert werden. Zusätzlich haben die Studenten die Möglichkeit, Kurse über Präsentationstechniken, in Rhetorik und Wissensvermittlung zu besuchen. Die Programmrichtlinien beinhalten die Teilnahme am jährlichen "Einzelmolekül-Workshop" in Linz und eine jährliche Sommerschule, an der neben den Studenten der gesamte Lehrkörper teilnimmt. Die Förderung des DK wird es den Doktoranden darüber hinaus ermöglichen, nationale und internationale Kongresse zu besuchen und ein Semester in einem Labor eines ausländischen Kooperationspartners zu arbeiten. Kombiniert mit exzellenter Forschung auf dem Gebiet der Lebenswissenschaften bietet das Programm wissenschaftliche und technologische Einblicke auf dem Gebiet der Biophysik, der Angewandten Physik, der Bioorganischen Chemie, der Struktur- und Molekularbiologie, der mathematischen Modellierung und numerischen Umsetzung. Sie verleihen dem Doktoranden die nötige Flexibilität für ein kontinuierliches professionelles Wachstum.
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Konsortiumsmitglied (01.03.2006 - 31.12.2010)
- CBL GmbH
- Universität Linz
- Österreichische Akademie der Wissenschaften
- Alois Sonnleitner, CBL GmbH , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Gerhard J. Schütz, Technische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Christoph Romanin, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Johannes David Pedarnig, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Johannes Heitz, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Norbert Müller, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Peter Hinterdorfer, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Peter Pohl, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Sapar Saparov, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Urbaan M. Titulaer, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Wolfgang Buchberger, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Heinz Engl, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Gottfried Otting, ANU - Australian National University - Australien
- Klaus Albert, Eberhard-Karls-Universität Tübingen - Deutschland
- Michael Schaefer, Freie Universität Berlin - Deutschland
- Walter Rosenthal, Helmholtz-Gemeinschaft Deutscher Forschungszentren - Deutschland
- Claus Hultschig, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
- Klaus Fendler, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
- Rolf Kinne, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
- Helmut Grubmüller, Max-Planck-Institut für Biophysikalische Chemie - Deutschland
- Dietmar Knopp, Technische Universität München - Deutschland
- Boris Mizaikoff, Universität Ulm - Deutschland
- Natalia Prevarskaya, Université de Lille - Frankreich
- Ziv Reich, Weizmann Institute of Science - Israel
- Vincenzo Capasso, University of Milan - Italien
- Ivano Bertini, Università degli Studi di Firenze - Italien
- Matthias A. Hediger, University of Bern - Schweiz
- Vaclav Svorcik, University of Chemistry and Technology Prague - Tschechien
- Laszlo Vigh, University of Szeged - Ungarn
- Evan Evans, Boston University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Peter Agre, Duke Medical Center - Vereinigte Staaten von Amerika
- Rüdiger H. Ettrich, Larkin University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Nikolai M. Soldatov, National Institutes of Health - Vereinigte Staaten von Amerika
- Robert S. Eisenberg, Rush University Medical Center - Vereinigte Staaten von Amerika
- Stanley Osher, University of California at Los Angeles - Vereinigte Staaten von Amerika
- John Cherian Mathai, University of Pittsburgh - Vereinigte Staaten von Amerika
- Mark Zeidel, University of Pittsburgh - Vereinigte Staaten von Amerika
- Philip M. Williams, Nottingham University - Vereinigtes Königreich
- Alexander M. Seifalian, University College London - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 1307 Zitationen
- 18 Publikationen
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2018
Titel New Avenues for Matter-Wave-Enhanced Spectroscopy DOI 10.1007/978-3-319-64346-5_2 Typ Book Chapter Autor Rodewald J Verlag Springer Nature Seiten 21-34 -
2011
Titel Monitoring Single-channel Water Permeability in Polarized Cells* DOI 10.1074/jbc.m111.291864 Typ Journal Article Autor Erokhova L Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 39926-39932 Link Publikation -
2008
Titel Cholesterol's decoupling effect on membrane partitioning and permeability revisited: Is there anything beyond Fick's law of diffusion? DOI 10.1016/j.bbamem.2008.05.001 Typ Journal Article Autor Missner A Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes Seiten 2154-2156 Link Publikation -
2007
Titel The first ankyrin-like repeat is the minimum indispensable key structure for functional assembly of homo- and heteromeric TRPC4/TRPC5 channels DOI 10.1016/j.ceca.2007.05.015 Typ Journal Article Autor Schindl R Journal Cell Calcium Seiten 260-269 -
2013
Titel Long and Short Lipid Molecules Experience the Same Interleaflet Drag in Lipid Bilayers DOI 10.1103/physrevlett.110.268101 Typ Journal Article Autor Horner A Journal Physical Review Letters Seiten 268101 Link Publikation -
2012
Titel Electrostatically Induced Recruitment of Membrane Peptides into Clusters Requires Ligand Binding at Both Interfaces DOI 10.1371/journal.pone.0052839 Typ Journal Article Autor Antonenko Y Journal PLoS ONE Link Publikation -
2013
Titel Single-Molecule Analysis of the Recognition Forces Underlying Nucleo-Cytoplasmic Transport DOI 10.1002/ange.201305359 Typ Journal Article Autor Rangl M Journal Angewandte Chemie Seiten 10546-10549 Link Publikation -
2016
Titel New avenues for matter-wave-enhanced spectroscopy DOI 10.1007/s00340-016-6573-y Typ Journal Article Autor Rodewald J Journal Applied Physics B Seiten 3 Link Publikation -
2012
Titel Structure, Regulation and Biophysics of ICRAC, STIM/Orai1 DOI 10.1007/978-94-007-2888-2_16 Typ Book Chapter Autor Derler I Verlag Springer Nature Seiten 383-410 -
2010
Titel Resting State Orai1 Diffuses as Homotetramer in the Plasma Membrane of Live Mammalian Cells* DOI 10.1074/jbc.m110.177881 Typ Journal Article Autor Madl J Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 41135-41142 Link Publikation -
2009
Titel Plasticity in Ca2+ selectivity of Orai1/Orai3 heteromeric channel DOI 10.1073/pnas.0907714106 Typ Journal Article Autor Schindl R Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 19623-19628 Link Publikation -
2009
Titel Recent progress on STIM1 domains controlling Orai activation DOI 10.1016/j.ceca.2009.08.003 Typ Journal Article Autor Schindl R Journal Cell Calcium Seiten 227-232 -
2009
Titel No facilitator required for membrane transport of hydrogen sulfide DOI 10.1073/pnas.0902952106 Typ Journal Article Autor Mathai J Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 16633-16638 Link Publikation -
2009
Titel Mechanistic view on domains mediating STIM1–Orai coupling DOI 10.1111/j.1600-065x.2009.00815.x Typ Journal Article Autor Fahrner M Journal Immunological Reviews Seiten 99-112 -
2009
Titel Stable, Non-Destructive Immobilization of Native Nuclear Membranes to Micro-Structured PDMS for Single-Molecule Force Spectroscopy DOI 10.1002/cphc.200900219 Typ Journal Article Autor Rangl M Journal ChemPhysChem Seiten 1553-1558 Link Publikation -
2009
Titel 110 Years of the Meyer–Overton Rule: Predicting Membrane Permeability of Gases and Other Small Compounds DOI 10.1002/cphc.200900270 Typ Journal Article Autor Missner A Journal ChemPhysChem Seiten 1405-1414 Link Publikation -
2006
Titel Fast and Selective Ammonia Transport by Aquaporin-8* DOI 10.1074/jbc.m609343200 Typ Journal Article Autor Saparov S Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 5296-5301 Link Publikation -
2006
Titel Dynamic but not constitutive association of calmodulin with rat TRPV6 channels enables fine tuning of Ca2+-dependent inactivation DOI 10.1113/jphysiol.2006.118661 Typ Journal Article Autor Derler I Journal The Journal of Physiology Seiten 31-44 Link Publikation