Vollantrag zu Chromosomen Dynamik
Vollantrag zu Chromosome Dynamics
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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Chromosomes,
Mitosis,
DNA Repair,
Kinetochores,
Centrosomes,
Meiosis
Die genetische Information, der Bauplan aller Lebewesen, wird von DNA kodiert. In höheren Eukaryonten befindet sich die DNA im Zellkern und liegt in Form mehrerer linearer Einheiten, den Chromosomen, vor. Nur intakte Chromosomen gewährleisten, dass die genetische Information erhalten bleibt und an die nächste Generation weitergegeben werden kann. Wird die DNA nicht vor Schäden bewahrt, werden Alterungsprozesse nicht ausgeglichen oder werden Chromosomen in den Zellteilungen nicht richtig aufgeteilt, dann führt das zu einem Verlust von Vitalität. Somit ist das Verständnis der molekularen Grundlagen wie Chromosomen ihre Integrität und somit ihre Funktionalität bewahren von essentieller Bedeutung für Gesundheit und Fertilität beim Menschen aber auch für die industrielle Produktion, die Lebensmittelherstellung und die Pflanzenzüchtung. Der "Vienna Biocenter Campus" beherbergt einen erfolgreichen "Research Cluster", bestehend aus Forschungsgruppen die ihre Arbeit auf die Biologie der Chromosomen fokussieren. Ein Doktoratskolleg zu diesem Thema fehlte jedoch bislang. Dieser Projektantrag beschreibt ein Doktoratskolleg im Feld der Chromosomenbiologie, um genau diesem Bedarf gerecht zu werden. Die einzelnen Forscher die zu dem Doktoratskolleg beitragen, werden sicherstellen, dass die beteiligten Studenten mit unterschiedlichen Modellorganismen, experimentellen Ansätzen, Denkweisen und Blickwinkeln vertraut gemacht werden. Nur ein Gemeinschaftsprojekt, so wie dieses Doktoratskolleg, kann diesen breiten Ansatz vermitteln. Die Forschungsthemen beinhalten DNA Reparatur, Chromosomen- Bewegung und Verteilung, Funktionsweise der Telomere, mitotische and meiotische Zellteilungen und den Zellzyklus. Im Rahmen des Doktoratskollegs werden die Lehraktivitäten der einzelnen beteiligten Forscher koordiniert und beträchtlich ausgeweitet. Das Doktoratskolleg bietet die Möglichkeit Plattformen für die Lehre, für spezielle Seminare und Tagungen aufzubauen, um Wissen zu vermitteln, Ideen und Erfahrungen auszutauschen und um Techniken zu diskutieren. Als einzigartige Erweiterung des Doktoratsprogramms werden spezielle "Workshops" für die Studierenden angeboten. Sie unterscheiden sich von der restlichen Lehre, und bieten Themen die für die Forschung und den Forschenden wichtig sind, jedoch nicht unbedingt das engere Thema betreffen. Das allgemeine Ausbildungsziel ist das Heranziehen junger, enthusiastischer und auch kritisch denkender Wissenschafter mit einem tiefgreifenden Wissen um die Biologie der Chromosomen. Das soll durch die sorgsam geplante Verbindung aus Seminaren, Vorträgen, "Workshops" und der eigentlichen Forschungsarbeit erreicht werden und die jungen Wissenschafter erfolgreich inner- und außerhalb der akademischen Welt bestehen lassen.
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
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Konsortiumsmitglied (01.03.2012 - 31.08.2021)
- IMBA – Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH
- Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology
- Universität Wien
- Ortrun Mittelsten Scheid, Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Daniel Wolfram Gerlich, IMBA – Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Andrea Pichler, Max Planck Institute - Deutschland
- Thomas Müller-Reichert, Technische Universität Dresden - Deutschland
- Arp Schnittger, Universität Hamburg - Deutschland
- Mathilde Grelon, INRA - Centre de recherche de Versailles-Grignon - Frankreich
- Julien Dumont, Institut Jaques Monod - Frankreich
- Aline V. Probst, Université Clermont Auvergne - Frankreich
- Avraham A. Levy, Weizmann Institute of Science - Israel
- Amy Shaub-Maddox, Université de Montréal - Kanada
- Camilla Sjoegren, Karolinska Institutet - Schweden
- Matthias Peter, ETH Hönggerberg - Schweiz
- Francesc Posas, Universitat Pompeu Fabra - Spanien
- Michael Lichten, National Cancer Institute - Vereinigte Staaten von Amerika
- Dorothy E. Shippen, Texas A&M University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Christopher Franklin, The University of Birmingham - Vereinigtes Königreich
- Kim Nasmyth, The University of Oxford - Vereinigtes Königreich
- Stephen Kearsey, University of Oxford - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 4759 Zitationen
- 72 Publikationen
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2020
Titel Conformation of sister chromatids in the replicated human genome DOI 10.1038/s41586-020-2744-4 Typ Journal Article Autor Mitter M Journal Nature Seiten 139-144 Link Publikation -
2021
Titel Polyploidy-associated paramutation in Arabidopsis is determined by small RNAs, temperature, and allele structure DOI 10.1371/journal.pgen.1009444 Typ Journal Article Autor Bente H Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2021
Titel A CENH3 mutation promotes meiotic exit and restores fertility in SMG7-deficient Arabidopsis DOI 10.1101/2021.04.08.439068 Typ Preprint Autor Capitao C Seiten 2021.04.08.439068 Link Publikation -
2019
Titel Differential Requirements for Centrioles in Mitotic Centrosome Growth and Maintenance DOI 10.1016/j.devcel.2019.06.004 Typ Journal Article Autor Cabral G Journal Developmental Cell Link Publikation -
2019
Titel Identification of proteins associated with splicing factors Ntr1, Ntr2, Brr2 and Gpl1 in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe DOI 10.1080/15384101.2019.1632126 Typ Journal Article Autor Cipakova I Journal Cell Cycle Seiten 1532-1536 Link Publikation -
2019
Titel Meiotic DNA Repair in the Nucleolus Employs a Non-homologous End Joining Mechanism DOI 10.1105/tpc.19.00367 Typ Journal Article Autor Sims J Journal The Plant Cell Link Publikation -
2019
Titel H2A Variants in Arabidopsis: Versatile Regulators of Genome Activity DOI 10.1016/j.xplc.2019.100015 Typ Journal Article Autor Lei B Journal Plant Communications Seiten 100015 Link Publikation -
2021
Titel Crosstalk between H2A variant-specific modifications impacts vital cell functions DOI 10.1371/journal.pgen.1009601 Typ Journal Article Autor Schmücker A Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2021
Titel DNA topoisomerase 3 is required for efficient germ cell quality control DOI 10.1083/jcb.202012057 Typ Journal Article Autor Dello Stritto M Journal Journal of Cell Biology Link Publikation -
2021
Titel The evolution of imprinting in plants: beyond the seed DOI 10.1007/s00497-021-00410-7 Typ Journal Article Autor Montgomery S Journal Plant Reproduction Seiten 373-383 Link Publikation -
2021
Titel A chromatin phase transition protects mitotic chromosomes against microtubule perforation DOI 10.1101/2021.07.05.450834 Typ Preprint Autor Schneider M Seiten 2021.07.05.450834 Link Publikation -
2021
Titel In Diverse Conditions Intrinsic Chromatin Condensates Have Liquid-like Material Properties DOI 10.1101/2021.11.22.469620 Typ Preprint Autor Gibson B Seiten 2021.11.22.469620 Link Publikation -
2021
Titel A CENH3 mutation promotes meiotic exit and restores fertility in SMG7-deficient Arabidopsis DOI 10.1371/journal.pgen.1009779 Typ Journal Article Autor Capitao C Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2022
Titel Sister chromatid–sensitive Hi-C to map the conformation of replicated genomes DOI 10.1038/s41596-022-00687-6 Typ Journal Article Autor Mitter M Journal Nature Protocols Seiten 1486-1517 -
2022
Titel A hormone-activated mobile RNAi pathway defends plant stem cells from virus infection DOI 10.1101/2022.12.18.520928 Typ Preprint Autor Incarbone M Seiten 2022.12.18.520928 Link Publikation -
2018
Titel BRCA1-BARD1 associate with the synaptonemal complex and pro-crossover factors and influence RAD-51 dynamics during Caenorhabditis elegans meiosis DOI 10.1371/journal.pgen.1007653 Typ Journal Article Autor Janisiw E Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2018
Titel Functional Characterization of SMG7 Paralogs in Arabidopsis thaliana DOI 10.3389/fpls.2018.01602 Typ Journal Article Autor Capitao C Journal Frontiers in Plant Science Seiten 1602 Link Publikation -
2018
Titel Single-nucleus Hi-C of mammalian oocytes and zygotes DOI 10.1016/bs.mcb.2018.03.032 Typ Book Chapter Autor Gassler J Verlag Elsevier Seiten 389-407 -
2018
Titel The BRCA1-BARD1 complex associates with the synaptonemal complex and pro-crossover factors and influences RAD-51 dynamics during Caenorhabditis elegans meiosis DOI 10.1101/280214 Typ Preprint Autor Janisiw E Seiten 280214 Link Publikation -
2018
Titel Genomic insights into chromatin reprogramming to totipotency in embryos DOI 10.1083/jcb.201807044 Typ Journal Article Autor Ladstätter S Journal Journal of Cell Biology Seiten 70-82 Link Publikation -
2018
Titel Initiation of Meiotic Development Is Controlled by Three Post-transcriptional Pathways in Caenorhabditis elegans DOI 10.1534/genetics.118.300985 Typ Journal Article Autor Mohammad A Journal Genetics Seiten 1197-1224 Link Publikation -
2013
Titel The Arabidopsis SWR1 Chromatin-Remodeling Complex Is Important for DNA Repair, Somatic Recombination, and Meiosis DOI 10.1105/tpc.112.104067 Typ Journal Article Autor Rosa M Journal The Plant Cell Seiten 1990-2001 Link Publikation -
2013
Titel Chromosome Segregation: Disarming the Protector DOI 10.1016/j.cub.2013.02.028 Typ Journal Article Autor Sanyal S Journal Current Biology Link Publikation -
2012
Titel Microtubule Organization: A Pericentriolar Material-Like Structure in Yeast Meiosis DOI 10.1016/j.cub.2012.02.036 Typ Journal Article Autor Dammermann A Journal Current Biology Link Publikation -
2016
Titel A Surveillance Mechanism Ensures Repair of DNA Lesions during Zygotic Reprogramming DOI 10.1016/j.cell.2016.11.009 Typ Journal Article Autor Ladstätter S Journal Cell Link Publikation -
2016
Titel A Surveillance System Ensures Crossover Formation in C. elegans DOI 10.1016/j.cub.2016.09.007 Typ Journal Article Autor Machovina T Journal Current Biology Seiten 2873-2884 Link Publikation -
2018
Titel Transient and Partial Nuclear Lamina Disruption Promotes Chromosome Movement in Early Meiotic Prophase DOI 10.1016/j.devcel.2018.03.018 Typ Journal Article Autor Link J Journal Developmental Cell Link Publikation -
2018
Titel Transposons: a blessing curse DOI 10.1016/j.pbi.2018.01.003 Typ Journal Article Autor Dubin M Journal Current Opinion in Plant Biology Seiten 23-29 Link Publikation -
2018
Titel Mutations that prevent methylation of cohesin render sensitivity to DNA damage in S. pombe DOI 10.1242/jcs.214924 Typ Journal Article Autor Sanyal S Journal Journal of Cell Science Link Publikation -
2016
Titel Cdk3, a conjugation-specific cyclin-dependent kinase, is essential for the initiation of meiosis in Tetrahymena thermophila DOI 10.1080/15384101.2016.1207838 Typ Journal Article Autor Yan G Journal Cell Cycle Seiten 2506-2514 Link Publikation -
2021
Titel Caenorhabditis elegans RMI2 functional homolog-2 (RMIF-2) and RMI1 (RMH-1) have both overlapping and distinct meiotic functions within the BTR complex DOI 10.1371/journal.pgen.1009663 Typ Journal Article Autor Velkova M Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2019
Titel Mitotic Chromosome Mechanics: How Cells Segregate Their Genome DOI 10.1016/j.tcb.2019.05.007 Typ Journal Article Autor Batty P Journal Trends in Cell Biology Seiten 717-726 Link Publikation -
2019
Titel Probing the 3D architecture of the plant nucleus with microscopy approaches: challenges and solutions DOI 10.1080/19491034.2019.1644592 Typ Journal Article Autor Dumur T Journal Nucleus Seiten 181-212 Link Publikation -
2019
Titel Organization of Chromatin by Intrinsic and Regulated Phase Separation DOI 10.1016/j.cell.2019.08.037 Typ Journal Article Autor Gibson B Journal Cell Link Publikation -
2020
Titel Versatile in vitro assay to recognize Cas9-induced mutations DOI 10.1002/pld3.269 Typ Journal Article Autor Bente H Journal Plant Direct Link Publikation -
2020
Titel Chromosome clustering by Ki-67 excludes cytoplasm during nuclear assembly DOI 10.1038/s41586-020-2672-3 Typ Journal Article Autor Cuylen-Haering S Journal Nature Seiten 285-290 Link Publikation -
2020
Titel Sister-chromatid-sensitive Hi-C reveals the conformation of replicated human chromosomes DOI 10.1101/2020.03.10.978148 Typ Preprint Autor Mitter M Seiten 2020.03.10.978148 Link Publikation -
2022
Titel Transposons repressed by H3K27me3 were co-opted as cis-regulatory elements of H3K27me3 controlled protein coding genes during evolution of plants DOI 10.1101/2022.10.24.513474 Typ Preprint Autor Hisanaga T Seiten 2022.10.24.513474 Link Publikation -
2022
Titel A mitotic chromatin phase transition prevents perforation by microtubules DOI 10.1038/s41586-022-05027-y Typ Journal Article Autor Schneider M Journal Nature Seiten 183-190 Link Publikation -
2022
Titel Polycomb-mediated repression of paternal chromosomes maintains haploid dosage in diploid embryos of Marchantia DOI 10.7554/elife.79258 Typ Journal Article Autor Montgomery S Journal eLife Link Publikation -
2022
Titel Diversification of chromatin organization in eukaryotes DOI 10.1016/j.ceb.2021.12.002 Typ Journal Article Autor Jamge B Journal Current Opinion in Cell Biology Seiten 1-6 -
2022
Titel Polycomb-mediated repression of paternal chromosomes maintains haploid dosage in diploid embryos of Marchantia DOI 10.1101/2022.02.04.477531 Typ Preprint Autor Montgomery S Seiten 2022.02.04.477531 Link Publikation -
2017
Titel Promoter interactions direct chromatin folding in embryonic stem cells DOI 10.1038/nsmb.3421 Typ Journal Article Autor Sanyal S Journal Nature Structural & Molecular Biology Seiten 494-495 -
2017
Titel A novel non-canonical PIP-box mediates PARG interaction with PCNA DOI 10.1093/nar/gkx604 Typ Journal Article Autor Kaufmann T Journal Nucleic Acids Research Seiten 9741-9759 Link Publikation -
2017
Titel PARP inhibition causes premature loss of cohesion in cancer cells DOI 10.18632/oncotarget.21879 Typ Journal Article Autor Kukolj E Journal Oncotarget Seiten 103931-103951 Link Publikation -
2021
Titel The genetic and epigenetic landscape of the Arabidopsis centromeres DOI 10.1126/science.abi7489 Typ Journal Article Autor Naish M Journal Science Link Publikation -
2021
Titel It Is Just a Matter of Time: Balancing Homologous Recombination and Non-homologous End Joining at the rDNA Locus During Meiosis DOI 10.3389/fpls.2021.773052 Typ Journal Article Autor Sims J Journal Frontiers in Plant Science Seiten 773052 Link Publikation -
2021
Titel Crosstalk between H2A variant-specific modifications impacts vital cell functions DOI 10.1101/2021.01.14.426637 Typ Preprint Autor Schmücker A Seiten 2021.01.14.426637 Link Publikation -
2021
Titel From Microscopy to Nanoscopy: Defining an Arabidopsis thaliana Meiotic Atlas at the Nanometer Scale DOI 10.3389/fpls.2021.672914 Typ Journal Article Autor Sims J Journal Frontiers in Plant Science Seiten 672914 Link Publikation -
2021
Titel Under siege: virus control in plant meristems and progeny DOI 10.1093/plcell/koab140 Typ Journal Article Autor Bradamante G Journal The Plant Cell Seiten 2523-2537 Link Publikation -
2017
Titel E2fl1 is a meiosis-specific transcription factor in the protist Tetrahymena thermophila DOI 10.1080/15384101.2016.1259779 Typ Journal Article Autor Zhang J Journal Cell Cycle Seiten 123-135 Link Publikation -
2017
Titel Epigenetic contribution to diversification DOI 10.1073/pnas.1702748114 Typ Journal Article Autor Bente H Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 3558-3560 Link Publikation -
2017
Titel Single-nucleus Hi-C reveals unique chromatin reorganization at oocyte-to-zygote transition DOI 10.1038/nature21711 Typ Journal Article Autor Flyamer I Journal Nature Seiten 110-114 Link Publikation -
2016
Titel Dbl2 Regulates Rad51 and DNA Joint Molecule Metabolism to Ensure Proper Meiotic Chromosome Segregation DOI 10.1371/journal.pgen.1006102 Typ Journal Article Autor Polakova S Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2016
Titel SIRT2 regulates nuclear envelope reassembly through ANKLE2 deacetylation DOI 10.1242/jcs.192633 Typ Journal Article Autor Kaufmann T Journal Journal of Cell Science Seiten 4607-4621 Link Publikation -
2016
Titel Chromosome Cohesion Established by Rec8-Cohesin in Fetal Oocytes Is Maintained without Detectable Turnover in Oocytes Arrested for Months in Mice DOI 10.1016/j.cub.2015.12.073 Typ Journal Article Autor Burkhardt S Journal Current Biology Seiten 678-685 Link Publikation -
2016
Titel Separable Roles for a Caenorhabditis elegans RMI1 Homolog in Promoting and Antagonizing Meiotic Crossovers Ensure Faithful Chromosome Inheritance DOI 10.1371/journal.pbio.1002412 Typ Journal Article Autor Jagut M Journal PLOS Biology Link Publikation -
2016
Titel Nuclear Envelope Retention of LINC Complexes Is Promoted by SUN-1 Oligomerization in the Caenorhabditis elegans Germ Line DOI 10.1534/genetics.116.188094 Typ Journal Article Autor Daryabeigi A Journal Genetics Seiten 733-748 Link Publikation -
2016
Titel Cyc17, a meiosis-specific cyclin, is essential for anaphase initiation and chromosome segregation in Tetrahymena thermophila DOI 10.1080/15384101.2016.1188238 Typ Journal Article Autor Yan G Journal Cell Cycle Seiten 1855-1864 Link Publikation -
2015
Titel Chapter 18 Ultrastructural analysis of Caenorhabditis elegans cilia DOI 10.1016/bs.mcb.2015.03.014 Typ Book Chapter Autor Serwas D Verlag Elsevier Seiten 341-367 -
2015
Titel Isotropic incorporation of SPD-5 underlies centrosome assembly in C. elegans DOI 10.1016/j.cub.2015.05.060 Typ Journal Article Autor Laos T Journal Current Biology Link Publikation -
2015
Titel Exo1 and Mre11 execute meiotic DSB end resection in the protist Tetrahymena DOI 10.1016/j.dnarep.2015.08.005 Typ Journal Article Autor Lukaszewicz A Journal DNA Repair Seiten 137-143 Link Publikation -
2015
Titel Stress-induced structural changes in plant chromatin DOI 10.1016/j.pbi.2015.05.011 Typ Journal Article Autor Probst A Journal Current Opinion in Plant Biology Seiten 8-16 Link Publikation -
2015
Titel Transcription dynamically patterns the meiotic chromosome-axis interface DOI 10.7554/elife.07424 Typ Journal Article Autor Sun X Journal eLife Link Publikation -
2012
Titel SAS-6 coiled-coil structure and interaction with SAS-5 suggest a regulatory mechanism in C. elegans centriole assembly DOI 10.1038/emboj.2012.280 Typ Journal Article Autor Qiao R Journal The EMBO Journal Seiten 4334-4347 Link Publikation -
2014
Titel Chiasmatic and achiasmatic inverted meiosis of plants with holocentric chromosomes DOI 10.1038/ncomms6070 Typ Journal Article Autor Cabral G Journal Nature Communications Seiten 5070 Link Publikation -
2013
Titel If the cap fits, wear it: an overview of telomeric structures over evolution DOI 10.1007/s00018-013-1469-z Typ Journal Article Autor Fulcher N Journal Cellular and Molecular Life Sciences Seiten 847-865 Link Publikation -
2013
Titel Crosstalk between casein kinase II and Ste20-related kinase Nak1 DOI 10.4161/cc.24095 Typ Journal Article Autor Cipak L Journal Cell Cycle Seiten 884-888 Link Publikation -
2013
Titel Matefin/SUN-1 Phosphorylation Is Part of a Surveillance Mechanism to Coordinate Chromosome Synapsis and Recombination with Meiotic Progression and Chromosome Movement DOI 10.1371/journal.pgen.1003335 Typ Journal Article Autor Woglar A Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2014
Titel How a Retrotransposon Exploits the Plant's Heat Stress Response for Its Activation DOI 10.1371/journal.pgen.1004115 Typ Journal Article Autor Cavrak V Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2013
Titel Multiple Mechanisms Contribute to Centriole Separation in C. elegans DOI 10.1016/j.cub.2013.06.043 Typ Journal Article Autor Cabral G Journal Current Biology Seiten 1380-1387 Link Publikation -
2013
Titel Smc5/6-Mms21 Prevents and Eliminates Inappropriate Recombination Intermediates in Meiosis DOI 10.1371/journal.pgen.1004067 Typ Journal Article Autor Xaver M Journal PLoS Genetics Link Publikation