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Bioorthogonales Targeting von RNA

Bioorthogonal Stapling of RNA

Hannes Mikula (ORCID: 0000-0002-9218-9722)
  • Grant-DOI 10.55776/ZK29
  • Förderprogramm Zukunftskollegs
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2019
  • Projektende 30.06.2024
  • Bewilligungssumme 1.439.344 €
  • Projekt-Website
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Chemie (50%)

Keywords

    Antisense Oligonucleotides, Bioorthogonal Chemistry, RNA targeting, Biomolecular Interactions, RNA silencing, RNA-based transcriptional regulation

Abstract

Fortschritte im Bereich der RNA-Forschung brachten dieses Biomolekül in the Fokus mehrerer wissenschaftlicher Disziplinen. Aufgrund der biologischen Funktionen von RNA, dem enormen Potential zur Regulierung biologischer Prozesse, sowie der Assoziation zu verschiedensten Krankheiten, wurde RNA ein wichtiges Target für die Entwicklung von diagnostischen und therapeutischen Verfahren. Mehrere Strategien zur Manipulation und Detektion von RNA wurden entwickelt. Jedoch sind gezielte Anwendungen bis dato noch stark limitiert. Im Rahmen dieses Projektes sollen programmierbare chemische Verbindungen hergestellt werden, die eine selektive Bindung an RNA ermöghen, gefolgt von einer bioorthogonalen Ligation, einer Reaktion, die in lebenden Organismen gezielt ablaufen kann, die dazu führt, dass die chemische Verbindung auf der RNA fix verankert wird. Auf diese Weise wird nicht nur die Bindung an RNA verbessert, sondern auch neue Strategien zur Entwicklung von Antibiotika ermöglicht. In Kombination mit neuartigen bioorthogonalen Reaktionen kann zudem die Abspaltung einer aktiven Verbindung ausgelöst werden. Mithilfe einer solchen Strategie können bestimmte RNA-Sequenzen gezielt angegriffen und somit neue Therapiemöglichkeiten in der Präzisionsmedizin entwickelt werden.

Konsortium
  • Hannes Mikula, Technische Universität Wien
    Koordinator:in (01.07.2019 - 30.06.2024)
  • Brigitte Holzer, Technische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.07.2019 - 30.06.2024)
  • Marion Goldeck, Medizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.07.2019 - 30.06.2024)
Forschungsstätte(n)
  • Technische Universität Wien
Internationale Projektbeteiligte
  • Marc Robillard, Radboud University Nijmegen - Niederlande
  • Jonathan Carlson, Harvard Medical School - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Ralph Weissleder, Massachusetts General Hospital - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Evgeny Nudler, New York University School of Medicine - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Kendall N. Houk, University of California at Los Angeles - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 72 Zitationen
  • 4 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 4 Datasets & Models
  • 1 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 3 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2022
    Titel How RNA editing keeps an I on physiology
    DOI 10.1152/ajpcell.00191.2022
    Typ Journal Article
    Autor Goldeck M
    Journal American Journal of Physiology-Cell Physiology
  • 2022
    Titel Oxidative Desymmetrization Enables the Concise Synthesis of a trans-Cyclooctene Linker for Bioorthogonal Bond Cleavage
    DOI 10.1002/chem.202203069
    Typ Journal Article
    Autor Kuba W
    Journal Chemistry – A European Journal
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Readily Accessible Strained Difunctionalized trans-Cyclooctenes with Fast Click and Release Capabilities
    DOI 10.26434/chemrxiv-2022-klj4d
    Typ Preprint
    Autor Maartense L
  • 2020
    Titel A Cleavable C2-Symmetric trans-Cyclooctene Enables Fast and Complete Bioorthogonal Disassembly of Molecular Probes
    DOI 10.1021/jacs.0c07922
    Typ Journal Article
    Autor Wilkovitsch M
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 19132-19141
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 2020
    Titel Cleavable Bioorthogonal Linkers
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
Datasets & Models
  • 2024 Link
    Titel Fluorescence microscopy data
    DOI 10.48436/mdh8d-77d32
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2023 Link
    Titel CCDC 2108333: Experimental Crystal Structure Determination
    DOI 10.5517/ccdc.csd.cc28rwrp
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2023 Link
    Titel CCDC 2108332: Experimental Crystal Structure Determination
    DOI 10.5517/ccdc.csd.cc28rwqn
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel NMR Data - C2TCO
    DOI 10.48436/skjex-t7w55
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 0
    Titel European Researchers' Night
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2023
    Titel Elisabeth Lutz Award
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad National (any country)
Weitere Förderungen
  • 2022
    Titel Click-activatable circular oligonucleotides for bioorthogonal translation
    Typ Research grant (including intramural programme)
    DOI 10.47379/ls21067
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber Vienna Science and Technology Fund
  • 2021
    Titel Bioorthogonal Cascade-Targeting
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2021
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2023
    Titel bioTARGET
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2023
    Geldgeber European Research Council (ERC)

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