Biomolecular Structures and Interactions
Biomolecular Structures and Interactions
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Structural Biology,
Molecular Interactions,
Protein Structure,
Molecular Modeling,
Biophysics
Das Leben auf der Ebene biologischer Moleküle ist ein faszinierendes Zusammenspiel definierter 3D Strukturen und dynamischer Bewegungen, und fordern die heutigen Forscher heraus. Diese intrinsische Komplexität bietet einzigartige Möglichkeiten, die wir in unserem Ausbildungsprogramm ansprechen möchten. Die Strukturbiologie spielt eine zentrale Rolle in der biomedizinischen Forschung. Sie hat geholfen, grundlegende makromolekulare Strukturen zu entschlüsseln, die (patho)physiologischen Prozessen zugrunde liegen. Die letzten Jahre haben zu einem Paradigmenwechsel auf diesem Gebiet geführt, weg von der Definition biologischer Funktionen nur aus statischen Strukturen, hin zur Notwendigkeit, die Molekulardynamik für ein umfassendes Verständnis der zugrundeliegenden Mechanismen einzubeziehen. In BioMolStruct stellen wir eine einzigartige Gruppe von Forscher :innen aus drei Universitäten in Graz zusammen. Unser Programm adressiert die wachsende Nachfrage nach Wissenschaftler:innen in der integrativen Strukturbiologie mit einem soliden experimentellen und theoretischen Hintergrund in Molekularbiologie, Biophysik und Strukturbiologie. Das Programm ermöglicht eine Fachausbildung mit fundierten Kenntnissen in der integrativen Strukturbiologie dynamischer Biomoleküle und einem breiten methodischen Portfolio, um diese zu adressieren. Um die große Herausforderung zu bewältigen, komplementäre strukturbiologisc he Techniken in einem integrativen Ansatz in einem Trainingsprogramm zu kombinieren, bietet BioMolStruct kompetitive Projekte an, welche Grundlagenforschung abdecken, die in (patho)physiologische Kontexte eingebettet sind. Alle drei teilnehmenden Universitäten unterstützen BioMolStruct, von hochmoderner Forschungsinfrastruktur bis zur Integration in die regulären Aktivitäten der Institution en. Darüber hinaus stellen alle Universitäten zusätzliche Eigenmittel für den laufenden Betrieb, die institutionelle Verankerung des Programms sowie eine erhebliche direkte finanzielle Unterstützung bereit. Die jungen Forscher:innen von BioMolStruct werden Biomoleküle und biomolekulare Komplexe untersuchen, die eine wesentliche Rolle bei der Signalübertragung und dem Stoff wechsel von Zellen spielen, wobei der Schwerpunkt auf Proteinen, Proteinkomplexen und Lipid / Protein- Wechselwirkungen liegt, die mit Alterung, Krebs, neurodegenerativen, metabolischen und kardiovaskulären Erkrankungen verbunden sind sowie genetische n Störungen. Unser Forschungsprogramm zielt darauf ab, die Struktur, Konformationsdynamik und detaillierte Funktion dieser Systeme und ihre Modulation durch Wirkstoffe zu verstehen. Unser internationales Programm ist attraktiv für Studierende der biomedizinischen Wissenschaften, die eine intellektuell anspruchsvolle Doktorand:innenausbildung anstreben, um eine Karriere in der Wissenschaft oder Industriezu verfolgen. Wir werden unsereBioMolStruct- Nachwuchsforscher:innen darauf vorbereiten, zukünftige Herausforderungen in den Bereichen der biomedizinischen Forschung mit fundiertem Wissen und innovativen Ansätzen zu meistern.
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.10.2021 -)
- Medizinische Universität Graz
- Sabine Flicker, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
- Nermina Malanovic, Universität Graz , nationale:r Kooperationspartner:in
- Robert Zimmermann, Universität Graz , nationale:r Kooperationspartner:in
- Sandro Keller, Universität Graz , nationale:r Kooperationspartner:in
- Toma Glasnov, Universität Graz , nationale:r Kooperationspartner:in
- Jeroen D.C. Codee, Universiteit Leiden - Niederlande
- Boudewijn M. T. Burgering, University Medical Center Utrecht - Niederlande
- Robert Vacha, Central European Institute of Technology (CEITEC) - Tschechien
- Anna Peacock, The University of Birmingham - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 377 Zitationen
- 44 Publikationen
- 1 Policies
- 47 Disseminationen
- 10 Wissenschaftliche Auszeichnungen
-
2025
Titel The Acrolein-Lipopolysaccharide Mouse Model for Frequent Exacerbations in Chronic Obstructive Pulmonary Disease. DOI 10.1165/rcmb.2024-0507ma Typ Journal Article Autor Reiter B Journal American journal of respiratory cell and molecular biology Seiten 343-352 -
2025
Titel SAAP-148 Oligomerizes into a Hexamer Forming a Hydrophobic Inner Core DOI 10.1002/cbic.202500112 Typ Journal Article Autor Hodzic A Journal ChemBioChem Link Publikation -
2025
Titel Expanding the cultivable human archaeome: Methanobrevibacter intestini sp. nov. and strain Methanobrevibacter smithii ‘GRAZ-2’ from human faeces DOI 10.1099/ijsem.0.006751 Typ Journal Article Autor Weinberger V Journal International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Seiten 006751 Link Publikation -
2025
Titel Depletion of Small HDL Subclasses Predicts Poor Survival in Liver Cirrhosis DOI 10.3390/antiox14060664 Typ Journal Article Autor Pammer A Journal Antioxidants Seiten 664 Link Publikation -
2025
Titel Structural basis of phosphorylation-independent nuclear import of CIRBP by TNPO3 DOI 10.1038/s41467-025-59802-2 Typ Journal Article Autor Zhou Q Journal Nature Communications Seiten 4456 Link Publikation -
2025
Titel Biodegradable ultrahigh-purity magnesium and its alloy ZX00 promote osteogenesis in the medullary cavity and glycogenolysis in the liver DOI 10.1016/j.actbio.2025.02.007 Typ Journal Article Autor Okutan B Journal Acta Biomaterialia Seiten 599-613 Link Publikation -
2025
Titel Interactive 3D Objects Enhance Scientific Communication of Structural Data DOI 10.1002/cbic.202500036 Typ Journal Article Autor Mokos D Journal ChemBioChem Link Publikation -
2025
Titel Digging out the Molecular Connections between the Catalytic Mechanism of Human Lysosomal a-Mannosidase and Its Pathophysiology DOI 10.1021/acs.jcim.4c02229 Typ Journal Article Autor Di Geronimo B Journal Journal of Chemical Information and Modeling Seiten 2650-2659 Link Publikation -
2025
Titel Presenilin-1 controls glucose metabolism and identity of pancreatic beta cells DOI 10.1101/2025.09.05.674426 Typ Preprint Autor Koshenov Z Seiten 2025.09.05.674426 Link Publikation -
2025
Titel The disordered p53 transactivation domain is the target of FOXO4 and the senolytic compound FOXO4-DRI DOI 10.1038/s41467-025-60844-9 Typ Journal Article Autor Bourgeois B Journal Nature Communications Seiten 5672 Link Publikation -
2025
Titel Inside the membrane: a closer look using elastic scattering techniques and friends DOI 10.1007/s00249-025-01761-z Typ Journal Article Autor Kaltenegger M Journal European Biophysics Journal Seiten 1-13 Link Publikation -
2021
Titel Global analysis of protein arginine methylation DOI 10.1016/j.crmeth.2021.100016 Typ Journal Article Autor Zhang F Journal Cell Reports Methods Seiten 100016 Link Publikation -
2022
Titel An all-at-once 2D CEST by F1-spatial frequency encoding DOI 10.1016/j.jmro.2022.100073 Typ Journal Article Autor Rotzinger M Journal Journal of Magnetic Resonance Open Seiten 100073 Link Publikation -
2021
Titel Phosphorylation Regulates CIRBP Arginine Methylation, Transportin-1 Binding and Liquid-Liquid Phase Separation DOI 10.3389/fmolb.2021.689687 Typ Journal Article Autor Lenard A Journal Frontiers in Molecular Biosciences Seiten 689687 Link Publikation -
2021
Titel Structural Changes in the Cap of Rv0183/mtbMGL Modulate the Shape of the Binding Pocket DOI 10.3390/biom11091299 Typ Journal Article Autor Grininger C Journal Biomolecules Seiten 1299 Link Publikation -
2021
Titel A prostate-specific membrane antigen activated molecular rotor for real-time fluorescence imaging DOI 10.1038/s41467-021-25746-6 Typ Journal Article Autor Zhang J Journal Nature Communications Seiten 5460 Link Publikation -
2022
Titel Small Things Matter: The 11.6-kDa TraB Protein is Crucial for Antibiotic Resistance Transfer Among Enterococci DOI 10.3389/fmolb.2022.867136 Typ Journal Article Autor Berger T Journal Frontiers in Molecular Biosciences Seiten 867136 Link Publikation -
2022
Titel The interaction of the Lactobacilli surface layer proteins with the lipotheichoic acids from the cell wall DOI 10.1107/s2053273322096085 Typ Journal Article Autor Gubensäk N Journal Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances -
2022
Titel Brain regions show different metabolic and protein arginine methylation phenotypes in frontotemporal dementias and Alzheimer’s disease DOI 10.1016/j.pneurobio.2022.102400 Typ Journal Article Autor Zhang F Journal Progress in Neurobiology Seiten 102400 Link Publikation -
2022
Titel Triglyceride-Rich Lipoproteins, Remnants, and Atherosclerotic Cardiovascular Disease Risk DOI 10.1007/s12170-022-00702-1 Typ Journal Article Autor Bharadiya V Journal Current Cardiovascular Risk Reports Seiten 131-144 -
2022
Titel The Crystal Structure of Mouse Ces2c, a Potential Ortholog of Human CES2, Shows Structural Similarities in Substrate Regulation and Product Release to Human CES1 DOI 10.3390/ijms232113101 Typ Journal Article Autor Eisner H Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 13101 Link Publikation -
2024
Titel Stability Increase of Phenolic Acid Decarboxylase by a Combination of Protein and Solvent Engineering Unlocks Applications at Elevated Temperatures DOI 10.1021/acssuschemeng.3c06513 Typ Journal Article Autor Myrtollari K Journal ACS Sustainable Chemistry & Engineering Seiten 3575-3584 Link Publikation -
2024
Titel Identifying Exchangeable Protons in a 1D NMR Spectrum by Spatially Selective Exchange-Editing DOI 10.1002/cphc.202300713 Typ Journal Article Autor Rotzinger M Journal ChemPhysChem Link Publikation -
2024
Titel Click, Compute, Create: A Review of Web-based Tools for Enzyme Engineering DOI 10.1002/cbic.202400092 Typ Journal Article Autor Tripp A Journal ChemBioChem Link Publikation -
2024
Titel Flattening the curve—How to get better results with small deep-mutational-scanning datasets DOI 10.1002/prot.26686 Typ Journal Article Autor Wirnsberger G Journal Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics Seiten 886-902 Link Publikation -
2024
Titel Dynamics-driven allosteric stimulation of diguanylate cyclase activity in a red light-regulated phytochrome DOI 10.1016/j.jbc.2024.107217 Typ Journal Article Autor Tran Q Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 107217 Link Publikation -
2024
Titel Expanding the cultivable human archaeome: Methanobrevibacter intestini sp. nov. and strain Methanobrevibacter smithii “GRAZ-2” from human feces DOI 10.1101/2024.05.15.594450 Typ Preprint Autor Weinberger V Seiten 2024.05.15.594450 Link Publikation -
2024
Titel Genetically encoded fluorescent sensor to monitor intracellular arginine methylation DOI 10.1016/j.jphotobiol.2024.112867 Typ Journal Article Autor Zhang F Journal Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology Seiten 112867 Link Publikation -
2024
Titel Effect of TraN key residues involved in DNA binding on pIP501 transfer rates in Enterococcus faecalis DOI 10.3389/fmolb.2024.1268647 Typ Journal Article Autor Michaelis C Journal Frontiers in Molecular Biosciences Seiten 1268647 Link Publikation -
2024
Titel The molecular architecture of Lactobacillus S-Layer: Assembly and attachment to teichoic acids DOI 10.21203/rs.3.rs-3689109/v1 Typ Preprint Autor Sagmeister T Link Publikation -
2024
Titel Targeting organ-specific mitochondrial dysfunction to improve biological aging DOI 10.1016/j.pharmthera.2024.108710 Typ Journal Article Autor Madreiter-Sokolowski C Journal Pharmacology & Therapeutics Seiten 108710 Link Publikation -
2024
Titel Association of Small HDL Subclasses with Mortality Risk in Chronic Kidney Disease DOI 10.3390/antiox13121511 Typ Journal Article Autor Stadler J Journal Antioxidants Seiten 1511 Link Publikation -
2024
Titel Impaired HDL antioxidant and anti-inflammatory functions are linked to increased mortality in acute heart failure patients DOI 10.1016/j.redox.2024.103341 Typ Journal Article Autor Pammer A Journal Redox Biology Seiten 103341 Link Publikation -
2024
Titel Computational enzyme design by catalytic motif scaffolding DOI 10.1101/2024.08.02.606416 Typ Preprint Autor Braun M Seiten 2024.08.02.606416 Link Publikation -
2023
Titel Accelerating Biocatalysis Discovery with Machine Learning: A Paradigm Shift in Enzyme Engineering, Discovery, and Design DOI 10.1021/acscatal.3c03417 Typ Journal Article Autor Markus B Journal ACS Catalysis Seiten 14454-14469 Link Publikation -
2023
Titel Loss of lysosomal acid lipase results in mitochondrial dysfunction and fiber switch in skeletal muscles of mice DOI 10.1016/j.molmet.2023.101869 Typ Journal Article Autor Akhmetshina A Journal Molecular Metabolism Seiten 101869 Link Publikation -
2023
Titel Disordered regions mediate the interaction of p53 and MRE11 DOI 10.1016/j.bbamcr.2023.119654 Typ Journal Article Autor Usluer S Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research Seiten 119654 Link Publikation -
2023
Titel Unmasking crucial residues in adipose triglyceride lipase for coactivation with comparative gene identification-58 DOI 10.1016/j.jlr.2023.100491 Typ Journal Article Autor Kulminskaya N Journal Journal of Lipid Research Seiten 100491 Link Publikation -
2021
Titel Structural Changes in the Cap of Rv0183/mtbMGL Modulate the Shape of the Binding Pocket DOI 10.3204/pubdb-2021-04410 Typ Other Autor Grininger C Link Publikation -
2024
Titel Sirtuin 3 drives sex-specific responses to age-related changes in mouse embryonic fibroblasts DOI 10.1016/j.mad.2024.111996 Typ Journal Article Autor Šimunic E Journal Mechanisms of Ageing and Development Seiten 111996 -
2024
Titel PROVIT-CLOCK: A Potential Influence of Probiotics and Vitamin B7 Add-On Treatment and Metabolites on Clock Gene Expression in Major Depression DOI 10.1159/000538781 Typ Journal Article Autor Kreuzer K Journal Neuropsychobiology Seiten 135-151 Link Publikation -
2024
Titel The molecular architecture of Lactobacillus S-layer: Assembly and attachment to teichoic acids DOI 10.1073/pnas.2401686121 Typ Journal Article Autor Sagmeister T Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2023
Titel Vibrio cholerae’s ToxRS bile sensing system DOI 10.7554/elife.88721 Typ Journal Article Autor Gubensäk N Journal eLife Link Publikation -
2021
Titel A General Small-Angle X-ray Scattering-Based Screening Protocol for Studying Physical Stability of Protein Formulations DOI 10.3390/pharmaceutics14010069 Typ Journal Article Autor Zhang F Journal Pharmaceutics Seiten 69 Link Publikation
-
2024
Titel Training course in biobanking Typ Influenced training of practitioners or researchers
-
2024
Titel 3rd Annual Retreat of BioMolStruct, 10-11th June 2024 Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2022
Titel Summer Rosettacon 2022, Seattle Typ A talk or presentation -
2025
Link
Titel Talk at the FRENCH INFRASTRUCTURE FOR INTEGRATED STRUCTURAL BIOLOGY Typ A talk or presentation Link Link -
2023
Titel SFB International Phytochrome Workshop 2023, Germany, Berlin, Oct 11-12, 2023 Typ A talk or presentation -
2023
Titel Poster: The interaction between p53 and the mRNA export factor THOC4 is regulated by their disordered regions Typ A talk or presentation -
2025
Link
Titel Talk at 46th Danish NMR meeting Typ A talk or presentation Link Link -
2023
Titel Young Scientist Symposium Typ A talk or presentation -
2023
Titel Poster: Mechanistic insights into the filament formation of caspase proteases Typ A talk or presentation -
2025
Link
Titel Talk at the 17. Europäischer Chemielehrer*innenkongress Typ A talk or presentation Link Link -
2023
Titel European Biophysics Societies Association Congress 2023, Sweden, Stockholm, July 31- Aug 04, 2023 Typ A talk or presentation -
2024
Titel Oral Communication & Poster: Disordered regions regulate the interaction between p53 and the mRNA export factor THOC4 Typ A talk or presentation -
2023
Titel Helmholtz Training Workshop on integrative structural Biology, Germany, Berlin, Oct 11-13, 2023 Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2022
Titel 1st Annual Retreat of BioMolStruct, 8-9th June 2022, Seggau, Austria Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2022
Titel Oral Communication: Low Density Lipoprotein (LDL) particle organization determined by cryo-electron microscopy (cryo-EM) Typ A talk or presentation -
2023
Titel 6th Annual Austrian Cryo-EM (ACE) Symposium, November 23-24, 2023 Typ A talk or presentation -
2024
Titel Lange Nacht der Forschung Typ Participation in an open day or visit at my research institution -
2024
Titel ÖGMBT 15th annual meeting, Salzburg, 17-19 September, 2023 Typ A talk or presentation -
2022
Titel Poster: Biophysical characterization of p53 regulation by the mRNA export factor-THOC4 Typ A talk or presentation -
2022
Link
Titel TEDx talk Typ A talk or presentation Link Link -
2023
Titel Poster Balandin Denys Typ A talk or presentation -
2023
Titel DocDay 09.01.2023 Graz Technical University Typ A talk or presentation -
2024
Titel Hot Topics in Contemporary Crystallography Typ A talk or presentation -
2023
Titel 2nd Annual Retreat of BioMolStruct 27-28th June 2023, Seggau, Austria Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2025
Link
Titel Talk at Metabolomics 2025 conference Typ A talk or presentation Link Link -
2025
Link
Titel Press release Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2023
Titel Poster: The interaction between p53 and the mRNA export factor THOC4 is regulated by their disordered regions Typ A talk or presentation -
2022
Titel EMBO Workshop, EMBL Heidelberg, September 5-8, 2022 Typ A talk or presentation -
2023
Titel Poster: Molecular mechanism of caspase-9 CARD domain filament formation using cryo-EM and NMR spectroscopy Typ A talk or presentation -
2022
Titel Poster: Role of extracellular matrix components of Lactobacillus fermentum MTCC-5898 in the regulation of epidermal tight-junctions during infection with Staphylococcus aureus ATCC 29213 Typ A talk or presentation -
2023
Titel 29th Nawi Graz DocDay, 5th July 2023, University of Graz, Austria Typ A talk or presentation -
2023
Titel 5th Symposium Frontiers in Integrative Structural Biology and Biophysics Typ A talk or presentation -
2023
Titel Poster: Mechanistic insights into the auto-inhibition and filament formation of Caspase-9 Typ A talk or presentation -
2024
Titel 1st Austrian Crystallography Days ACD' 24 Typ A talk or presentation -
2023
Titel Poster: Structural and functional studies of FOXM1 regulation by β-catenin Typ A talk or presentation -
2023
Titel Adriatic NMR 2023, Croatia, Mali Ston, Jun 1-4, 2023 Typ A talk or presentation -
2022
Titel Poster: β-catenin directly interacts with transactivation domain of FOXM1 Typ A talk or presentation -
2022
Titel Poster: Role of Lactobacillus fermentum MTCC-5898 in augmenting skin health against Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (ATCC-29213) infections Typ A talk or presentation -
2023
Titel Poster Balandin Denys Typ A talk or presentation -
2024
Titel Gordon Research Conference, Photosensory Receptors and Signal Transduction, Mar 3-8, 2024 Typ A talk or presentation -
2022
Titel MMCE 2022, Croatia, Primosten, Jun 1-4, 2022 Typ A talk or presentation -
2023
Titel Annual Meeting of Austrian Society of Allergology and Immunology (ÖGAI) Typ A talk or presentation -
2023
Titel Poster: β-catenin directly interacts with transactivation domain of FOXM1 in vitro Typ A talk or presentation -
2022
Titel Poster: Towards high-resolution structure of apolipoprotein B-100 by cryo-EM Typ A talk or presentation -
2023
Titel Oral Communication: Brain regions show different metabolic and protein arginine methylation phenotypes in frontotemporal dementias and Alzheimer's disease Typ A talk or presentation -
2023
Titel 64th ENC 2023, US, CA, Apr 16-20, 2023 Typ A talk or presentation -
2022
Titel EMBO workshop on "high throughput protein production and crystallization", Aix-Marseille Université, France, July 4-13, 2022 Typ A talk or presentation -
2024
Titel 9th International Graz Symposium on Lipid and Membrane Biology, Graz. 2024 Typ A talk or presentation
-
2025
Titel EMBO Scientific Exchange Grant Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel Fellowship of the Austrian Marshall Plan foundation Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel Short-term travel fellowship from Medical University of Graz Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel Marshall Plan Scholarship Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel EMBO Scientific Exchange Grant Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society Bekanntheitsgrad National (any country) -
2024
Titel DocDays Chemie 2024 Poster "Identifying Exchangeable Protons in a 1D NMR Spectrum by Spatially Selective Exchange-Editing" Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2023
Titel Travel Award from Biophysics Austria Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel WTZ Bilateral project with M. Matovina (Ruđer Bošković Institute, Zagreb) 2023 Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel EMBO Scientific Exchange Grant Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel Arqus Grant fo SiteVisit Vilnius, Litauen Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International