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Molecular Metabolism

Molecular Metabolism

Monika Oberer (ORCID: 0000-0003-2525-9513)
  • Grant-DOI 10.55776/DOC50
  • Förderprogramm doc.funds
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2019
  • Projektende 31.03.2024
  • Bewilligungssumme 1.902.624 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Metabolism, Lipids, Molecular Biology, Nucleic Acids, Aging, Protein Structure-Function

Abstract Endbericht

Das doc.fund-DoktorandInnenprogramm "Molekularer Metabolismus" ist ein internationales und interdisziplinäres Ausbildungsprogramm für Doktoratsstudierende der Molekularen Biowissenschaften an der Universität Graz (UG). Das Trainingsprogramm wird von 10 WissenschafterInnen getragen, dieausgewählte Aspektedes Lipid- und Nukleinsäurestoffwechsels untersuchen. Die untersuchten Fragestellungen haben hohe wissenschaftliche und gesellschaftliche Relevanz, da sie mit metabolische Prozessen der Nährstoffaufnahme bei Stoffwechselerkrankungen (Typ-2-Diabetes, Atherosklerose, Fettsstoffwechselstörungen), Alterungsprozessen und bakteriellen Infektionen assoziiert sind. Die Ergebnisse der Forschungsarbeiten werden einen wichtigen Beitrag zum molekularen Verständnis dieser Erkrankungen und damit zur Entwicklung neuer diagnostischer und therapeutischer Ansätze leisten. Ein besonders hervorstechendes Merkmal unseres DoktorandInnenprogramms ist die Möglichkeit, dass die jungen WissenschafterInnen ihre Forschungsfragen mit einem großen Spektrum verschiedener Modellorganismen behandeln können, die von Bakterien, Hefe, Zellkultur bis zu multizellulären Organismen (Fliege und Maus) reichen. Die doc.fund WissenschafterInnen sind international erfolgreich, enorm produktiv und stellen eine ideale Mischung aus ForscherInnen in jungen, mittleren und fortgeschrittenen Karrierestufen dar. Die oberste Priorität des Ausbildungsprogramms fundiert in der Exzellenz der ausgeübtenForschung. Darüber hinaus bietet das Doktoratsprogrammein Rotationsschema der Studierenden in die verschiedenen Labore, welches starke Netzwerke zwischen den Studierenden und den Fakultätsmitgliedern etablieren soll. Zusätzlich werden Weiterbildungsangebote im Rahmen von interdisziplinären Workshops, Seminaren, einem Journal-Club sowie einer Vortragsreihe zu Konzepten metabolischer und regulatorischer Ereignisse in verschiedenen Modellorganismen angeboten. Das Doktoratsprogramm bietet auch Kurse zu übertragbaren Qualifikationen an, welche die persönliche Karrierechancen der Graduierten verbessern (z.B.: Präsentationstechnik, Projektmanagement, wissenschaftliches Englisch). Ein weiteres wichtiges Element des Ausbildungsgrogrammes ist die internationale Sichtbarkeit. DoktorandInnen veröffentlichen ihre Daten in hochrangigen Fachjournalen und können einen Teil ihrer Forschungsaktivitäten in Partnerlabors im Ausland durchführen. Die Teilnahme an internationalen Kursen, Workshops und Konferenzen wird maßgeblich unterstützt. Das Programm zielt darauf ab, unseren AbsolventInnen die beste Ausbildung zu bieten, damit sie zu führenden ExpertInnen in unserer wissensbasierten Gesellschaft werden können.

Das PhD-Programm "Molekularer Metabolismus" (MOBILES) an der Universität Graz ist eine herausragende internationale Ausbildungsmöglichkeit für Doktorand:innen, die die Anstrengungen führender WissenschaftlerInnen des Instituts für Biomolekulare Wissenschaften, des Instituts für Chemie und des Instituts für Pharmazeutische Wissenschaften bündelt. Das Ziel des Programms ist es, außergewöhnliche junge Forschende in der Bedeutung des Stoffwechsels für Gesundheit und Krankheit zu schulen und das Wissen durch unsere Forschung tiefgreifend zu erweitern. Die Bedeutung der metabolischen Gesundheit nimmt zu, da demografische Veränderungen hin zu einer längeren Lebenserwartung und ein entsprechender Anstieg stoffwechselbedingter Erkrankungen neue medizinische Herausforderungen darstellen. Die Exzellenz der Forschungsprojekte bestimmte die Qualität des MOBILES PhD-Programmes und die darunterliegenden Dissertationen konzentrierten sich auf die metabolischen Aspekte in der Nährstoffversorgung, das Altern und bakterielle Infektionen, Proteinstrukturen und -interaktionen sowie posttranslationale Modifikationen mit besonderem Augenmerk auf Lipid- und Nukleinsäurestoffwechsel. Um eine hochwertige Ausbildung zu gewährleisten, wurde das Konsortium gemäß Indikatoren für eine ausgezeichnete Forschungsausbildung ausgewählt, einschließlich i) Exzellenz in der Forschung; ii) Engagement in der Betreuung von Doktorand:innen; iii) Führungsfunktionen in laufender drittmittel-finanzierter Forschung; und iv) aktive Teilnahme in die Forschungsgemeinschaft. Doktorand:innen wurden über einen mehrstufigen Auswahlprozess für das Programm zugelassen und die erfolgreichen Kandidat:innen erhielten eine umfassende Ausbildung, die sich durch exzellente Forschungsmöglichkeiten, Mentor:innentätigkeit, interdisziplinäre Zusammenarbeit und internationales Networking auszeichnete. Zusätzlich zu den Forschungsprojekten beinhaltete die Ausbildung auch Training in unterschiedlichen Labors, obligatorische Kurse, Seminare, Forschungsaufenthalte im Ausland sowie die Entwicklung von Soft Skills. Trotz der unerwarteten Rückschläge wie Laborschließungen und ausgesetzte Aktivitäten, die durch die COVID-19-Pandemie verursacht wurden, hat das Programm seine Forschungsziele beibehalten. Die detaillierten Erfolge der Forschungsbemühungen unserer Doktorand:innen spiegeln sich bereits in mehr als 50 von Expert:innen begutachteten Veröffentlichungen wider, und sind der Beginn einer kontinuierlich wachsenden Publikationsliste wider. Diese dient als Maß für die wissenschaftliche Leistung des Programms und den akademischen Fortschritt unserer Teilnehmer:innen. Die ersten Alumni der PhD-Ausbildung wechselten zu Postdoktoranden-Positionen an Universitäten, in die Industrie oder gründeten sogar Start-up-Unternehmen. Das eigentliche doc.fund MOBILES Programm lief von 2019 bis 2024 und wurde vom Österreichischen Wissenschaftsfonds FWF (doc.fund Projekt DOC50) finanziert. Das Programm wurde in Doktoratsinitiativen der Universität Graz integriert, einschließlich Doktoratsschulen für Naturwissenschaften, der universitätsweiten "Doctoral Academy Graz", sowie der Exzellenzinitiative "BioHealth - Biowissenschaften in Stoffwechsel und Altern". Wir haben uns proaktiv auf die Zeit nach der FWF-Förderung vorbereitet, indem wir neue etablierte und junge Forschende unter Beibehaltung unsere strengen Auswahlkriterien aufgenommen haben. Die 25 aktuellen Doktorand:innen werden durch Mittel der Projektleiter:innen finanziert, während die Universität Graz Bildungsressourcen wie Vorlesungen und Seminare bereitstellt. Das PhD-Programm "Molekularer Metabolismus" ist bereit, mit einem umfangreichen Angebot an Ausbildungsaktivitäten voranzuschreiten und sieht sich weiter dem Ziel verpflichtet, die nächste Generation junger ForscherInnen bestmögliche Ausbildungsmöglichkeiten zu bieten.

Konsortium
  • Brigitte Pertschy, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Ellen L. Zechner, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Frank Madeo, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Klaus Zangger, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Monika Oberer, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Robert Zimmermann, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Ronald Philip Kühnlein, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Rudolf Zechner, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Stefan Schild, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
  • Ulrich Stelzl, Universität Graz
    Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
Forschungsstätte(n)
  • Universität Graz
Nationale Projektbeteiligte
  • Irina Cornaciu, Universität Graz , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Jozef Vanden Broeck, Katholieke Universiteit Leuven - Belgien
  • Ulrich Kintscher, Charité - Universitätsmedizin Berlin - Deutschland
  • Miguel Andrade, Institute of Molecular Biology - Deutschland
  • Bernd Timmermann, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
  • Chris Meisinger, Universität Freiburg - Deutschland
  • Julia Fritz-Steuber, Universität Hohenheim - Deutschland
  • Reinhard Wimmer, Aalborg University - Dänemark
  • Kenn Gerdes, University of Copenhagen - Dänemark
  • Jarmo T. Laitinen, University of Eastern Finland - Finnland
  • Jose Marquez, EMBL Grenoble - Frankreich
  • Guido Kroemer, INSERM U1138 - Frankreich
  • Dominique Langin, Université Toulouse III Paul Sabatier - Frankreich
  • Nicolas Leulliot, Université de Paris - Frankreich
  • Roded Sharan, Tel-Aviv University - Israel
  • Isabella C. Felli, Università degli Studi di Firenze - Italien
  • Constantin Urban, Umea University - Schweden
  • Christoph Dehio, Universität Basel - Schweiz
  • Dieter Kressler, Universität Freiburg - Schweiz
  • Patrick Aloy, Institute for Research in Biomedicine - Spanien
  • Dalibor Kodrik, University of South Bohemia - Tschechien
  • Ana Maria Cuervo, Albert Einstein College of Medicine - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Jonathan Brown, Cleveland Clinic Foundation - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Henning Hermjakob, EMBL-EBI, Hinxton - Vereinigtes Königreich
  • Gabriel Waksman, University College London - Vereinigtes Königreich
  • Ingrid Dreveny, University of Nottingham - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 5272 Zitationen
  • 74 Publikationen
  • 2 Policies
  • 10 Disseminationen
  • 25 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 10 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Enrichment of human IgA-coated bacterial vesicles in ulcerative colitis as a driver of inflammation
    DOI 10.1038/s41467-025-59354-5
    Typ Journal Article
    Autor Passegger C
    Journal Nature Communications
  • 2024
    Titel Mutational scanning pinpoints distinct binding sites of key ATGL regulators in lipolysis.
    DOI 10.1038/s41467-024-46937-x
    Typ Journal Article
    Autor Grabner Gf
    Journal Nature communications
    Seiten 2516
  • 2024
    Titel Klebsiella oxytoca inhibits Salmonella infection through multiple microbiota-context-dependent mechanisms.
    DOI 10.1038/s41564-024-01710-0
    Typ Journal Article
    Autor Almási Édh
    Journal Nature microbiology
    Seiten 1792-1811
  • 2024
    Titel Microbiota-derived small molecule genotoxins: host interactions and ecological impact in the gut ecosystem.
    DOI 10.1080/19490976.2024.2430423
    Typ Journal Article
    Autor Kienesberger S
    Journal Gut microbes
    Seiten 2430423
  • 2024
    Titel R-ketorolac ameliorates cancer-associated cachexia and prolongs survival of tumour-bearing mice.
    DOI 10.1002/jcsm.13422
    Typ Journal Article
    Autor Chrysostomou Se
    Journal Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
    Seiten 562-574
  • 2024
    Titel Adipocyte HSL is required for maintaining circulating vitamin A and RBP4 levels during fasting.
    DOI 10.1038/s44319-024-00158-x
    Typ Journal Article
    Autor Steinhoff Js
    Journal EMBO reports
    Seiten 2878-2895
  • 2024
    Titel The molecular architecture of Lactobacillus S-layer: Assembly and attachment to teichoic acids.
    DOI 10.1073/pnas.2401686121
    Typ Journal Article
    Autor Gubensäk N
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 2024
    Titel Structural investigation of Trypanosoma cruzi Akt-like kinase as drug target against Chagas disease.
    DOI 10.1038/s41598-024-59654-8
    Typ Journal Article
    Autor Ortiz-Joya Lj
    Journal Scientific reports
    Seiten 10039
  • 2024
    Titel Unmasking crucial residues in adipose triglyceride lipase for coactivation with comparative gene identification-58.
    DOI 10.1016/j.jlr.2023.100491
    Typ Journal Article
    Autor Kulminskaya N
    Journal Journal of lipid research
    Seiten 100491
  • 2024
    Titel Platelets induce endoplasmic reticulum stress in macrophages invitro.
    DOI 10.1016/j.jtha.2024.01.009
    Typ Journal Article
    Autor Derler M
    Journal Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
    Seiten 1475-1488
  • 2024
    Titel NMR-based studies of protein expression, structure determination and protein-ligand interactions
    Typ PhD Thesis
    Autor Stadler, Karina
  • 2024
    Titel Role of bacterial membrane vesicle in intestinal inflammation
    Typ PhD Thesis
    Autor Thapa, Himadri Bahadur
  • 2024
    Titel Deciphering conditional fitness mechanisms of bacterial pathogens
    Typ PhD Thesis
    Autor Palma Neves Pompo, Joao
  • 2024
    Titel Navigating Through an Enzymatic Multiverse: The Significance of Bis(monoacylglycero)phosphate Synthesis Pathways
    Typ PhD Thesis
    Autor Bulfon, Dominik
  • 2024
    Titel Fasting, Autophagy and Caloric Restriction Mimetics in Healthspan
    Typ PhD Thesis
    Autor Müller, Melanie
  • 2024
    Titel SymProFold - Structural prediction of symmetrical biological assemblies
    DOI 10.21203/rs.3.rs-3830312/v1
    Typ Preprint
    Autor Buhlheller C
  • 2024
    Titel The molecular architecture of Lactobacillus S-Layer: Assembly and attachment to teichoic acids
    DOI 10.21203/rs.3.rs-3689109/v1
    Typ Preprint
    Autor Gubensäk N
  • 2024
    Titel PNPLA-mediated lipid hydrolysis and transacylation - At the intersection of catabolism and anabolism.
    DOI 10.1016/j.bbalip.2023.159410
    Typ Journal Article
    Autor Colaço-Gaspar M
    Journal Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
    Seiten 159410
  • 2021
    Titel Structural Changes in the Cap of Rv0183/mtbMGL Modulate the Shape of the Binding Pocket
    DOI 10.3390/biom11091299
    Typ Journal Article
    Autor Grininger C
    Journal Biomolecules
    Seiten 1299
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Biofilms by bacterial human pathogens: Clinical relevance – development, composition and regulation – therapeutical strategies
    DOI 10.15698/mic2021.02.741
    Typ Journal Article
    Autor Schulze A
    Journal Microbial Cell
    Seiten 28
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Dietary spermidine improves cognitive function
    DOI 10.1016/j.celrep.2021.108985
    Typ Journal Article
    Autor Schroeder S
    Journal Cell Reports
    Seiten 108985
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Carboxylesterase 2 proteins are efficient diglyceride and monoglyceride lipases possibly implicated in metabolic disease
    DOI 10.1016/j.jlr.2021.100075
    Typ Journal Article
    Autor Chalhoub G
    Journal Journal of Lipid Research
    Seiten 100075
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Advanced lipodystrophy reverses fatty liver in mice lacking adipocyte hormone-sensitive lipase
    DOI 10.1038/s42003-021-01858-z
    Typ Journal Article
    Autor Pajed L
    Journal Communications Biology
    Seiten 323
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Immunomodulatory Effects of Aronia Juice Polyphenols—Results of a Randomized Placebo-Controlled Human Intervention Study and Cell Culture Experiments
    DOI 10.3390/antiox11071283
    Typ Journal Article
    Autor Lackner S
    Journal Antioxidants
    Seiten 1283
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network
    DOI 10.1530/ey.19.15.15
    Typ Journal Article
    Autor M B
    Journal Yearbook of Paediatric Endocrinology
    Link Publikation
  • 2022
    Titel ABHD5—A Regulator of Lipid Metabolism Essential for Diverse Cellular Functions
    DOI 10.3390/metabo12111015
    Typ Journal Article
    Autor Schratter M
    Journal Metabolites
    Seiten 1015
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Enterotoxin tilimycin from gut-resident Klebsiella promotes mutational evolution and antibiotic resistance in mice
    DOI 10.1038/s41564-022-01260-3
    Typ Journal Article
    Autor Kienesberger S
    Journal Nature Microbiology
    Seiten 1834-1848
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Rbp95 binds to 25S rRNA helix H95 and cooperates with the Npa1 complex during early pre-60S particle maturation
    DOI 10.1093/nar/gkac724
    Typ Journal Article
    Autor Bhutada P
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 10053-10077
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Residues of the minimal sequence of G0S2 collectively contribute to ATGL inhibition while C-and N-terminal extensions promote binding to ATGL
    DOI 10.1016/j.bbalip.2021.159105
    Typ Journal Article
    Autor Riegler-Berket L
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids
    Seiten 159105
    Link Publikation
  • 2021
    Titel An Intranasal Vaccine Based on Outer Membrane Vesicles Against SARS-CoV-2
    DOI 10.3389/fmicb.2021.752739
    Typ Journal Article
    Autor Thapa H
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 752739
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The ups and downs of caloric restriction and fasting: from molecular effects to clinical application
    DOI 10.15252/emmm.202114418
    Typ Journal Article
    Autor Hofer S
    Journal EMBO Molecular Medicine
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The Crystal Structure of Mouse Ces2c, a Potential Ortholog of Human CES2, Shows Structural Similarities in Substrate Regulation and Product Release to Human CES1
    DOI 10.3390/ijms232113101
    Typ Journal Article
    Autor Eisner H
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 13101
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Structure of the Reductase Domain of a Fungal Carboxylic Acid Reductase and Its Substrate Scope in Thioester and Aldehyde Reduction
    DOI 10.1021/acscatal.2c04426
    Typ Journal Article
    Autor Daniel B
    Journal ACS Catalysis
    Seiten 15668-15674
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The FERM F3 subdomain governs tumor suppressor protein NF2 conformation and function
    Typ PhD Thesis
    Autor Mösslacher, Christina
  • 2022
    Titel Deep mutational perturbation profiling reveals contact sites of protein-protein interactions between the key players in intracellular
    Typ PhD Thesis
    Autor Kohlmayr, Johanna
  • 2021
    Titel Variation in Accessory Genes Within the Klebsiella oxytoca Species Complex Delineates Monophyletic Members and Simplifies Coherent Genotyping
    DOI 10.3389/fmicb.2021.692453
    Typ Journal Article
    Autor Cosic A
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 692453
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Phosphorylation activity and specificity of the oncogenic tyrosine kinase fusion protein BCR/ABL
    Typ PhD Thesis
    Autor Smolnig, Martin
  • 2021
    Titel Exploring absent protein function in yeast: assaying post translational modification and human genetic variation
    DOI 10.15698/mic2021.08.756
    Typ Journal Article
    Autor Moesslacher C
    Journal Microbial Cell
    Seiten 164
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Accurate prediction of protein structures and interactions using a three-track neural network
    DOI 10.1126/science.abj8754
    Typ Journal Article
    Autor Baek M
    Journal Science
    Seiten 871-876
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Outer Membrane Vesicles of Vibrio cholerae Protect and Deliver Active Cholera Toxin to Host Cells via Porin-Dependent Uptake
    DOI 10.1128/mbio.00534-21
    Typ Journal Article
    Autor Zingl F
    Journal mBio
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Accurate prediction of protein structures and interactions using a 3-track network
    DOI 10.1101/2021.06.14.448402
    Typ Preprint
    Autor Baek M
    Seiten 2021.06.14.448402
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Outer membrane vesicles as versatile tools for therapeutic approaches
    DOI 10.1093/femsml/uqab006
    Typ Journal Article
    Autor Zingl F
    Journal microLife
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Improved diagnosis of antibiotic-associated haemorrhagic colitis (AAHC) in faecal specimens by a new qualitative real-time PCR assay detecting relevant toxin genes of Klebsiella oxytoca sensu lato
    DOI 10.1016/j.cmi.2021.09.017
    Typ Journal Article
    Autor Leitner E
    Journal Clinical Microbiology and Infection
    Seiten 690-694
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Optimized expression and purification of adipose triglyceride lipase improved hydrolytic and transacylation activities in vitro
    DOI 10.1016/j.jbc.2021.101206
    Typ Journal Article
    Autor Kulminskaya N
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 101206
    Link Publikation
  • 2020
    Titel TetR Regulated in vivo Repression Technology to Identify Conditional Gene Silencing in Genetically Engineerable Bacteria Using Vibrio cholerae Murine Infections as Model System.
    DOI 10.21769/bioprotoc.3774
    Typ Journal Article
    Autor Zingl F
    Journal Bio-protocol
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Metabolic regulation of the lysosomal cofactor bis(monoacylglycero)phosphate in mice
    DOI 10.1194/jlr.ra119000516
    Typ Journal Article
    Autor Grabner G
    Journal Journal of Lipid Research
    Seiten 995-1003
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Distinct roles of adipose triglyceride lipase and hormone-sensitive lipase in the catabolism of triacylglycerol estolides
    DOI 10.1073/pnas.2020999118
    Typ Journal Article
    Autor Brejchova K
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Lipidome remodeling in aging normal and genetically obese Drosophila males
    DOI 10.1016/j.ibmb.2020.103498
    Typ Journal Article
    Autor Hofbauer H
    Journal Insect Biochemistry and Molecular Biology
    Seiten 103498
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Vibrio cholerae's ToxRS bile sensing system.
    DOI 10.7554/elife.88721
    Typ Journal Article
    Autor Gubensäk N
    Journal eLife
  • 2023
    Titel The Two Faces of Bacterial Membrane Vesicles: Pathophysiological Roles and Therapeutic Opportunities.
    DOI 10.3390/antibiotics12061045
    Typ Journal Article
    Autor Ebenberger Sp
    Journal Antibiotics (Basel, Switzerland)
  • 2023
    Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function.
    DOI 10.26508/lsa.202302043
    Typ Journal Article
    Autor Auernig E
    Journal Life science alliance
  • 2023
    Titel Integrating structure prediction and experimental approaches to elucidate the assembly of Surface Layer Proteins in Lactobacilli
    Typ PhD Thesis
    Autor Sagmeistern, Theo
  • 2022
    Titel Staphylococcus aureus extracellular adherence protein (Eap) reduces immune cell phenotype in developing but not in established atherosclerotic lesions
    DOI 10.1016/j.bbadis.2022.166616
    Typ Journal Article
    Autor Salzmann M
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease
    Seiten 166616
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM-F3 domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function
    DOI 10.1101/2022.12.11.519953
    Typ Preprint
    Autor Moesslacher C
    Seiten 2022.12.11.519953
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Solution of the protein structure prediction problem at last: crucial innovations and next frontiers.
    DOI 10.12703/r-01-0000020
    Typ Journal Article
    Autor Agard D
    Journal Faculty reviews
    Seiten 38
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Structural Changes in the Cap of Rv0183/mtbMGL Modulate the Shape of the Binding Pocket
    DOI 10.3204/pubdb-2021-04410
    Typ Other
    Autor Grininger C
    Link Publikation
  • 2023
    Titel De Novo Linear Phosphorylation Site Motifs for BCR-ABL Kinase Revealed by Phospho-Proteomics in Yeast.
    DOI 10.1021/acs.jproteome.2c00795
    Typ Journal Article
    Autor Fasching S
    Journal Journal of proteome research
    Seiten 1790-1799
  • 2023
    Titel Microbiota-derived genotoxin tilimycin generates colonic stem cell mutations.
    DOI 10.1016/j.celrep.2023.112199
    Typ Journal Article
    Autor Kitsera M
    Journal Cell reports
    Seiten 112199
  • 2023
    Titel Cooperative lipolytic control of neuronal triacylglycerol by spastic paraplegia-associated enzyme DDHD2 and ATGL.
    DOI 10.1016/j.jlr.2023.100457
    Typ Journal Article
    Autor Grabner Gf
    Journal Journal of lipid research
    Seiten 100457
  • 2023
    Titel Structural Investigation of Trypanosoma Cruzi Akt-Like Kinase as Drug Target Against Chagas Disease
    DOI 10.2139/ssrn.4622699
    Typ Preprint
    Autor Ortiz-Joya L
  • 2023
    Titel Corrigendum: Variation in accessory genes within the Klebsiella oxytoca species complex delineates monophyletic members and simplifies coherent genotyping.
    DOI 10.3389/fmicb.2023.1155851
    Typ Journal Article
    Autor Cosic A
    Journal Frontiers in microbiology
    Seiten 1155851
  • 2023
    Titel NF-B in monocytes and macrophages - an inflammatory master regulator in multitalented immune cells.
    DOI 10.3389/fimmu.2023.1134661
    Typ Journal Article
    Autor Derler M
    Journal Frontiers in immunology
    Seiten 1134661
  • 2023
    Titel Impact of (intestinal) LAL deficiency on lipid metabolism and macrophage infiltration.
    DOI 10.1016/j.molmet.2023.101737
    Typ Journal Article
    Autor Bianco V
    Journal Molecular metabolism
    Seiten 101737
  • 2023
    Titel Characterization of the Inflammatory Response Evoked by Bacterial Membrane Vesicles in Intestinal Cells Reveals an RIPK2-Dependent Activation by Enterotoxigenic Escherichia coli Vesicles.
    DOI 10.1128/spectrum.01115-23
    Typ Journal Article
    Autor Kohl P
    Journal Microbiology spectrum
  • 2023
    Titel Dissecting the Nuclear Import of the Ribosomal Protein Rps2 (uS5).
    DOI 10.3390/biom13071127
    Typ Journal Article
    Autor Favre S
    Journal Biomolecules
  • 2022
    Titel Bacterial Indole as a Multifunctional Regulator of Klebsiella oxytoca Complex Enterotoxicity
    DOI 10.1128/mbio.03752-21
    Typ Journal Article
    Autor Ledala N
    Journal mBio
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Impact of Gene Repression on Biofilm Formation of Vibrio cholerae
    DOI 10.3389/fmicb.2022.912297
    Typ Journal Article
    Autor Pombo J
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 912297
    Link Publikation
  • 2022
    Titel RNA folding and functions of RNA helicases in ribosome biogenesis
    DOI 10.1080/15476286.2022.2079890
    Typ Journal Article
    Autor Mitterer V
    Journal RNA Biology
    Seiten 781-810
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Overexpression of recombinant proteins containing non-canonical amino acids in Vibrio natriegens: p-azido-L-phenylalanine as coupling site for 19F-tags
    DOI 10.1007/s00726-022-03148-2
    Typ Journal Article
    Autor Stadler K
    Journal Amino Acids
    Seiten 1041-1053
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The HSP40 chaperone Ydj1 drives amyloid beta 42 toxicity
    DOI 10.15252/emmm.202113952
    Typ Journal Article
    Autor Ring J
    Journal EMBO Molecular Medicine
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Small-Molecule Inhibitors Targeting Lipolysis in Human Adipocytes
    DOI 10.1021/jacs.1c10836
    Typ Journal Article
    Autor Grabner G
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 6237-6250
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The C-terminal tail of ribosomal protein Rps15 is engaged in cytoplasmic pre-40S maturation
    DOI 10.1080/15476286.2022.2064073
    Typ Journal Article
    Autor Rössler I
    Journal RNA Biology
    Seiten 560-574
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Small Things Matter: The 11.6-kDa TraB Protein is Crucial for Antibiotic Resistance Transfer Among Enterococci
    DOI 10.3389/fmolb.2022.867136
    Typ Journal Article
    Autor Berger T
    Journal Frontiers in Molecular Biosciences
    Seiten 867136
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Vibrio cholerae Released by Protozoa are Hyperinfectious
    DOI 10.1016/j.tim.2019.11.003
    Typ Journal Article
    Autor Mitterer F
    Journal Trends in Microbiology
    Seiten 4-6
Policies
  • 2023
    Titel statistic course - doc.funds course, Computational Bioanalytics
    Typ Influenced training of practitioners or researchers
  • 2021
    Titel Data Vizualizing course
    Typ Influenced training of practitioners or researchers
Disseminationen
  • 2021
    Titel Internships for High School Students
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2022
    Titel School Visit
    Typ A talk or presentation
  • 2021
    Titel Interview
    Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press)
  • 2020
    Titel Image film for schools
    Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press)
  • 2024 Link
    Titel 3MT 2024 Thesis competition
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
    Link Link
  • 2021
    Titel Panel discussion
    Typ A talk or presentation
  • 2024
    Titel Open Day at the University of Graz
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2024
    Titel Open Day at the University of Graz
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2024
    Titel 3MT 2024 Thesis competition
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2024
    Titel Arts and Science
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2024
    Titel Best poster prize at RNA 2024 in Edinburgh
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2024
    Titel Keynote Lecture Theodore Escherich Symposium 2024
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2024
    Titel Best Poster-Award "PNPLA4 is a neutral lipid hydrolase residing in the mitochondrial matrix" (9th Symposium on Lipid and Membrane Biology, Graz, AT, 2024)
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2024
    Titel Best Short Talk
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2024
    Titel best oral prsentation 30th DocDay Molecular Biology and Biochemistry, Graz
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2024
    Titel Best poster award - 9th SFB Lipid Hydrolysis, Graz
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2023
    Titel Best talk award DocDay Uni and TU Graz
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2023
    Titel Invited Speaker: Host Pathogen Interaction Meeting III, Rio de Janeiro (Brazil)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel International conference: Extracellular vesicles: friends and foes, Weizmann Institute of Science, Rehovot (Israel)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Best poster presentation - 28th RNA Meeting 2023, Singapore
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Forschungspreis des Landes Steiermark 2023
    Typ Research prize
    DOI 10.1038/s41564-022-01260-3.
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2023
    Titel best poster award at RNA 2023 meeting in Singapour
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Invited Speaker: Symposium on Microbial Extracellular vesicles @ Institut Pasteur, Paris
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Invited Speaker: Gordon Research - Conference: Microbial Toxins and Pathogenicity. Waterville Valley (USA)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Travel Award by the International Society on Thrombosis and Haemostasis (ISTH) 2022
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Frontiers in integrative structural biology and biophysics, 2022
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2022
    Titel Best Presentation Award
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2022
    Titel Best poster presentation, Frontiers in integrative structural biology and biophysics
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2022
    Titel Best Talk-Award "Establishment of an activity screening platform for mouse serine hydrolases" (DocDay, Graz, AT, 2022)
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2022
    Titel Best Poster-Award "Characterization of an acyl-CoA independent di- and triglyceride synthase in mammalian cells" (DocDay, Graz, AT, 2022)
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2021
    Titel Best Poster-Award "Bis(monoacylglycero)phosphate Protects from Cationic Amphiphilic Drug - Induced Cytotoxicity" (International Conference on the Bioscience of Lipids, Utrecht, NL, 2021)
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel Best poster presentation, International Conference on Bioscience of Lipids 2021
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel Research Fellowship - "Platelet-mediated mechanisms in ER stress-induced hepatic steatosis" -ÖAW (Österr. Akademie der Wissenschaften)
    Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2021
    Titel Best Short-Talk "BMP Synthesis and the Role of BMP in Drug induced Phospholipidosis" (DocDay, Graz, AT, 2021)
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2021
    Titel Invited Speaker: EMBO Workshop | Bacterial Membrane Vesicles (BMVs)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2019
    Titel SFB Lipid Hydrolysis: Cellular lipid degradation pathways in health and disease
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2019
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2023
    Titel Sucrose-induced cardiac aging and prevention by spermidine
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2023
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2024
    Titel Potentiation of antimycotics with human-tolerable flavonoids
    Typ Research grant (including intramural programme)
    DOI 10.55776/p37278
    Förderbeginn 2024
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2019
    Titel Geroprotection By Synergistic Anti-Aging Interventions
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2019
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2021
    Titel Biomolecular Structures and Interactions
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2021
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2023
    Titel AWS Prototype funding
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2023
    Geldgeber Austria Wirtschaftsservice Gesellschaft mbH Austria Wirtschaftsservice Gesellschaft mbH
  • 2022
    Titel Exit The Ribosome
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2022
    Titel Acyl-CoA-independent acylglycerol synthesis
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)
  • 2022
    Titel R-NMR
    Typ Capital/infrastructure (including equipment)
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber EU project
  • 2019
    Titel Metabolism of the late endosomal/lysosomal lipid bis(monoacylglycerol)phosphate
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2019
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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