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Chromosome dynamics

Chromosome dynamics

Franz Klein (ORCID: 0000-0001-7204-1432)
  • Grant-DOI 10.55776/F34
  • Förderprogramm Spezialforschungsbereiche
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2008
  • Projektende 30.06.2019
  • Bewilligungssumme 11.006.179 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Mass spectrometry, Quantifications, Protein modification, Phospho-peptides, Protein complexes, Affinity Chromatography

Abstract

Wie erlangen Chromosomen, in denen unsere Erbanlagen gespeichert sind, gleichzeitig ihre erstaunliche Stabilität und Flexibilität? Das Geheimnis liegt in ihrer Struktur und ihren Interaktionen mit Zellkernfaktoren, die die Zugänglichkeit verschiedener chromosomaler Bereiche kontrollieren und biegsame Achsen formen. Chromosomale Domänen wie zum Beispiel Kinetochore, Schlaufen und Achsenregionen oder Rekombinations-hotspots haben spezialisierte Aufgaben, und nur detaillierte biochemische und zellbiologische Untersuchungen können unser Verständnis für die korrekte Chromosomenaufgeteilung vertiefen. Um unser Forschungsfeld voranzubringen werden wir neueste Technologien anwenden. Noch kennen wir zu wenige der beteilten Faktoren und wissen nicht, wie sie mit Chromosomen interagieren. Ja, wir kennen nicht einmal die exakte molekulare Faltung der Chromosomen in der Zelle und können nur wenige chromosomale Vorgänge in vitro nachvollziehen. Unser Projektantrag zielt darauf ab, 1) Protein-Protein Wechselwirkungen systematisch mittels Dual-tag Immunreinigung, gefolgt von Massenspektroskopie zu untesuchen. Wir werden auch Proteine mit nachgewiesener Rolle in der Meiose, sowie Kandidaten, die aus unserer eigenen Arbeit hervorgehen untersuchen. 2) Weiters wollen wir Protein-DNA Interaktionen untersuchen. Chromatin, das spezifisch an unsere Protein-Komplexe bindet, gibt nach Hybridisierung auf Mikrochips Aufschluß über den Aufenthalt des Proteins in der lebenden Zelle. Die CCC Technik, aber auch Fluoreszenzmarker, die in die Chromosomen eingebracht werden, erlauben die Rekonstruktion der genauen Chromosomenstruktur in vivo. Unsere Untersuchungen führen wir an Modellorganismen durch, die Pilze, Würmer, Pflanzen und sogar Wimperntierchen umfassen und somit ein außergewöhnlich breites evolutionäres Spektrum darstellen. Alle Teilprojekte kreisen um das Thema der Chromosomendynamik. Die Regulation der Kinetochor-Mikrotubuli Interaktion und die Biochemie der Schwesterchromatidenkohäsion, die für die Chromosomenaufteilung von zentraler Bedeutung sind werden in Mitose und Meiose studiert. Chromosomenpaarung und Rekombination sind für die korrekte Aufteilung der Chromosomen in der ersten meiotischen Teilung wichtig. Im Wurm C. elegans werden wir eine Mutante die altersabhängige Chromosomenverteilungsdefekte zeigt untersuchen. In Pflanzen und Würmern wollen wir die chromosomalen Regionen identifizieren, an denen präferentiell Rekombination stattfindet. Die Untersuchung künstlicher Mini-chromosomen in der Hefe wird die Minimalanforderungen erfolgreicher genetischer Rekombination definieren, während das Wimperntierchen Tetrahymena uns zeigen soll, welche Charakteristika der Meiose konserviert sind. Unsere Untersuchungen sind auch eingebunden in das Bestreben die molekularen Mechanismen verschiedener genetischer Defekte beim Menschen zu verstehen. So ist die Fehlverteilung von Chromosomen der Hauptgrund für Fehlgeburten und Down`s Syndrom. Außerdem haben die meisten Krebszellen eine veränderte Chromosomenzahl. All dies zeigt, daß wir mehr über die Chromosomenaufteilung wissen müssen, wenn wir die Ursachen dieser "molekularen Unfälle" verstehen wollen.

Konsortium
  • Daniel Wolfram Gerlich, IMBA – Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH
    Konsortiumsmitglied (01.01.2013 - 30.06.2019)
  • Franz Klein, Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.04.2008 - 30.06.2019)
  • Gustav Ammerer, Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.04.2008 - 31.12.2012)
  • Jan-Michael Peters, Institut für Molekulare Pathologie - IMP
    Konsortiumsmitglied (01.04.2008 - 30.06.2019)
  • Juraj Gregan, Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.04.2008 - 31.12.2012)
  • Kikue Tachibana, IMBA – Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH
    Konsortiumsmitglied (01.01.2016 - 30.06.2019)
  • Peter Schlögelhofer, Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.04.2008 - 30.06.2019)
  • Stefan Westermann, Institut für Molekulare Pathologie - IMP
    Konsortiumsmitglied (01.04.2008 - 31.12.2015)
  • Verena Jantsch-Plunger, Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.01.2013 - 30.06.2019)
Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien
Nationale Projektbeteiligte
  • Karl Mechtler, Institut für Molekulare Pathologie - IMP , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Maria Novatchkova, Institut für Molekulare Pathologie - IMP , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Markus Hartl, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Kris Gevaert, Ghent University - Belgien
  • Jan Ellenberg, European Molecular Biology Laboratory Heidelberg - Deutschland
  • Veit Schubert, Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung - Deutschland
  • Andrea Pichler, Max Planck Institute - Deutschland
  • Anthony A. Hyman, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
  • Gregor Eichele, Max-Planck-Institut für Biophysikalische Chemie - Deutschland
  • Holger Stark, Technische Universität Berlin - Deutschland
  • Rolf Jessberger, Technische Universität Dresden - Deutschland
  • Thomas Müller-Reichert, Technische Universität Dresden - Deutschland
  • Arp Schnittger, Universität Hamburg - Deutschland
  • Holger Puchta, Universität Karlsruhe - Deutschland
  • Christine Mezard, INRA - Centre de recherche de Versailles-Grignon - Frankreich
  • Mathilde Grelon, INRA - Centre de recherche de Versailles-Grignon - Frankreich
  • Alain Nicolas, Institut Curie - Frankreich
  • Valerie Borde, Institut Curie - Frankreich
  • Charles I. White, Universite Blaise-Pascal Clermont-Ferrand II - Frankreich
  • Yosef Gruenbaum, The Hebrew University of Jerusalem - Israel
  • Mitinori Saitou, Kyoto University Graduate School of Medicine - Japan
  • Hitoshi Kurumizaka, Waseda University - Japan
  • Monique Claire Zetka, McGill University - Kanada
  • Albert J.R. Heck, Utrecht University - Niederlande
  • Keun Il Kim, Seoul National University - Republik Korea
  • Katsuhiko Shirahige, Karolinska Institute - Schweden
  • Camilla Björkegren, Karolinska Institutet - Schweden
  • Matthias Peter, ETH Hönggerberg - Schweiz
  • Ruedi Aebersold, ETH Zürich - Schweiz
  • David Shore, University of Geneva - Schweiz
  • Eduard Sabido, Centre for Genomic Regulation - Spanien
  • Francesc Posas, Universitat Pompeu Fabra - Spanien
  • Lumir Krejci, Masarykova Univerzita - Tschechien
  • G Valentin Boerner, Cleveland State University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Paula Cohen, Cornell University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Peter Fraser, Florida State University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Gerald R. Smith, Fred Hutchinson Cancer Research Center - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Iain Cheeseman, MIT - Massachusetts Institute of Technology - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Michael Lichten, National Cancer Institute - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Andreas Hochwagen, New York University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Eva Nogales, University of California Berkeley - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Kevan M. Shokat, University of California at San Francisco - Vereinigte Staaten von Amerika
  • T. Tzfira, University of Michigan - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Gregory P. Copenhaver, University of North Carolina at Chapel Hill - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Rita Cha, Medical Research Council - Vereinigtes Königreich
  • Christopher Franklin, The University of Birmingham - Vereinigtes Königreich
  • Eugenio Sanchez-Moran, The University of Birmingham - Vereinigtes Königreich
  • Kim Ashley Nasmyth, The University of Oxford - Vereinigtes Königreich
  • Kim Nasmyth, The University of Oxford - Vereinigtes Königreich
  • Lothar Schermelleh, The University of Oxford - Vereinigtes Königreich
  • Ian Robert Henderson, University of Cambridge - Vereinigtes Königreich
  • Stephen Kearsey, University of Oxford - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 12301 Zitationen
  • 109 Publikationen
Publikationen
  • 2017
    Titel Meiosis.
    DOI 10.1895/wormbook.1.178.1
    Typ Journal Article
    Autor Hillers K
    Journal WormBook : the online review of C. elegans biology
    Seiten 1-43
    Link Publikation
  • 2017
    Titel DNA Cross-Bridging Shapes a Single Nucleus from a Set of Mitotic Chromosomes
    DOI 10.1016/j.cell.2017.07.038
    Typ Journal Article
    Autor Samwer M
    Journal Cell
    Link Publikation
  • 2020
    Titel "The nuclear envelope, a meiotic jack-of-all-trades"
    DOI 10.1016/j.ceb.2019.12.010
    Typ Journal Article
    Autor Zetka M
    Journal Current Opinion in Cell Biology
    Seiten 34-42
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Transient and Partial Nuclear Lamina Disruption Promotes Chromosome Movement in Early Meiotic Prophase
    DOI 10.1016/j.devcel.2018.03.018
    Typ Journal Article
    Autor Link J
    Journal Developmental Cell
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Novel interconnections of HOG signaling revealed by combined use of two proteomic software packages
    DOI 10.1186/s12964-019-0381-z
    Typ Journal Article
    Autor Janschitz M
    Journal Cell Communication and Signaling
    Seiten 66
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Estimation of the Required Lipoprotein(a)-Lowering Therapeutic Effect Size for Reduction in Coronary Heart Disease Outcomes
    DOI 10.1001/jamacardio.2019.1041
    Typ Journal Article
    Autor Lamina C
    Journal JAMA Cardiology
    Seiten 575-579
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Arabidopsis thaliana FANCD2 Promotes Meiotic Crossover Formation
    DOI 10.1105/tpc.17.00745
    Typ Journal Article
    Autor Kurzbauer M
    Journal The Plant Cell
    Seiten 415-428
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Deep and Precise Quantification of the Mouse Synaptosomal Proteome Reveals Substantial Remodeling during Postnatal Maturation
    DOI 10.1021/pr500456t
    Typ Journal Article
    Autor Moczulska K
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 4310-4324
  • 2014
    Titel Cohesin’s ATPase Activity Couples Cohesin Loading onto DNA with Smc3 Acetylation
    DOI 10.1016/j.cub.2014.08.011
    Typ Journal Article
    Autor Ladurner R
    Journal Current Biology
    Seiten 2228-2237
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Regulation of Gene Expression through a Transcriptional Repressor that Senses Acyl-Chain Length in Membrane Phospholipids
    DOI 10.1016/j.devcel.2014.04.025
    Typ Journal Article
    Autor Hofbauer H
    Journal Developmental Cell
    Seiten 729-739
    Link Publikation
  • 2014
    Titel MS Amanda, a Universal Identification Algorithm Optimized for High Accuracy Tandem Mass Spectra
    DOI 10.1021/pr500202e
    Typ Journal Article
    Autor Dorfer V
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 3679-3684
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Chiasmatic and achiasmatic inverted meiosis of plants with holocentric chromosomes
    DOI 10.1038/ncomms6070
    Typ Journal Article
    Autor Cabral G
    Journal Nature Communications
    Seiten 5070
    Link Publikation
  • 2014
    Titel A cooperative mechanism drives budding yeast kinetochore assembly downstream of CENP-A
    DOI 10.1083/jcb.201403081
    Typ Journal Article
    Autor Hornung P
    Journal Journal of Cell Biology
    Seiten 509-524
    Link Publikation
  • 2014
    Titel “Uno, nessuno e centomila”: the different faces of the budding yeast kinetochore
    DOI 10.1007/s00412-014-0472-y
    Typ Journal Article
    Autor Malvezzi F
    Journal Chromosoma
    Seiten 447-457
  • 2017
    Titel Leaves from banana (Musa nana) and maize (Zea mays) have no phyto-prophylactic effects on the susceptibility of grass carp (Ctenopharyngodon idella) to Aeromonas hydrophila infection
    DOI 10.1186/s12917-017-1255-5
    Typ Journal Article
    Autor Mayrhofer R
    Journal BMC Veterinary Research
    Seiten 329
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Systematic Phosphorylation Analysis of Human Mitotic Protein Complexes
    DOI 10.1126/scisignal.2001993
    Typ Journal Article
    Autor Hegemann B
    Journal Science Signaling
    Link Publikation
  • 2011
    Titel RAD21L is a novel kleisin subunit of the cohesin complex
    DOI 10.4161/cc.10.12.15691
    Typ Journal Article
    Autor Polakova S
    Journal Cell Cycle
    Seiten 1893-1893
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Ultra-High-Pressure RPLC Hyphenated to an LTQ-Orbitrap Velos Reveals a Linear Relation between Peak Capacity and Number of Identified Peptides
    DOI 10.1021/ac103243t
    Typ Journal Article
    Autor Ko¨Cher T
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 2699-2704
  • 2011
    Titel Quantitative Phospho-proteomics to Investigate the Polo-like Kinase 1-Dependent Phospho-proteome*
    DOI 10.1074/mcp.m111.008540
    Typ Journal Article
    Autor Grosstessner-Hain K
    Journal Molecular & Cellular Proteomics
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Sgo1 is required for co-segregation of sister chromatids during achiasmate meiosis I
    DOI 10.4161/cc.10.6.15032
    Typ Journal Article
    Autor Dudas A
    Journal Cell Cycle
    Seiten 951-955
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Retinoblastoma protein goes green: the role of RBR in Arabidopsis meiosis
    DOI 10.1038/emboj.2011.9
    Typ Journal Article
    Autor Kurzbauer M
    Journal The EMBO Journal
    Seiten 631-633
    Link Publikation
  • 2011
    Titel A blueprint for kinetochores — new insights into the molecular mechanics of cell division
    DOI 10.1038/nrm3133
    Typ Journal Article
    Autor Lampert F
    Journal Nature Reviews Molecular Cell Biology
    Seiten 407-412
  • 2012
    Titel Transgene-mediated cosuppression and RNA interference enhance germ-line apoptosis in Caenorhabditis elegans
    DOI 10.1073/pnas.1107390109
    Typ Journal Article
    Autor Adamo A
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 3440-3445
    Link Publikation
  • 2012
    Titel SIMPATIQCO: A Server-Based Software Suite Which Facilitates Monitoring the Time Course of LC–MS Performance Metrics on Orbitrap Instruments
    DOI 10.1021/pr300163u
    Typ Journal Article
    Autor Pichler P
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 5540-5547
    Link Publikation
  • 2012
    Titel The Recombinases DMC1 and RAD51 Are Functionally and Spatially Separated during Meiosis in Arabidopsis
    DOI 10.1105/tpc.112.098459
    Typ Journal Article
    Autor Kurzbauer M
    Journal The Plant Cell
    Seiten 2058-2070
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Spatiotemporal Regulation of Ipl1/Aurora Activity by Direct Cdk1 Phosphorylation
    DOI 10.1016/j.cub.2012.03.007
    Typ Journal Article
    Autor Zimniak T
    Journal Current Biology
    Seiten 787-793
    Link Publikation
  • 2012
    Titel M-Track: detecting short-lived protein-protein interactions in vivo
    DOI 10.1038/nmeth.2017
    Typ Journal Article
    Autor Zuzuarregui A
    Journal Nature Methods
    Seiten 594-596
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Photo-sensitive hydrogels for three-dimensional laser microfabrication in the presence of whole organisms
    DOI 10.1117/1.jbo.17.10.105008
    Typ Journal Article
    Autor Torgersen J
    Journal Journal of Biomedical Optics
    Seiten 105008-105008
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Validation of regulated protein phosphorylation events in yeast by quantitative mass spectrometry analysis of purified proteins
    DOI 10.1002/pmic.201200185
    Typ Journal Article
    Autor Reiter W
    Journal PROTEOMICS
    Seiten 3030-3043
    Link Publikation
  • 2014
    Titel A Versatile Scaffold Contributes to Damage Survival via Sumoylation and Nuclease Interactions
    DOI 10.1016/j.celrep.2014.08.054
    Typ Journal Article
    Autor Sarangi P
    Journal Cell Reports
    Seiten 143-152
    Link Publikation
  • 2014
    Titel SNW1 enables sister chromatid cohesion by mediating the splicing of sororin and APC2 pre-mRNAs
    DOI 10.15252/embj.201488202
    Typ Journal Article
    Autor Van Der Lelij P
    Journal The EMBO Journal
    Seiten 2643-2658
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Cdk1 Inactivation Terminates Mitotic Checkpoint Surveillance and Stabilizes Kinetochore Attachments in Anaphase
    DOI 10.1016/j.cub.2014.01.034
    Typ Journal Article
    Autor Vázquez-Novelle M
    Journal Current Biology
    Seiten 638-645
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Genotoxic Stress Prevents Ndd1-Dependent Transcriptional Activation of G2/M-Specific Genes in Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1128/mcb.01090-13
    Typ Journal Article
    Autor Yelamanchi S
    Journal Molecular and Cellular Biology
    Seiten 711-724
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Characterization of a DNA exit gate in the human cohesin ring
    DOI 10.1126/science.1256904
    Typ Journal Article
    Autor Huis In 'T Veld P
    Journal Science
    Seiten 968-972
  • 2014
    Titel Jagunal homolog 1 is a critical regulator of neutrophil function in fungal host defense
    DOI 10.1038/ng.3070
    Typ Journal Article
    Autor Wirnsberger G
    Journal Nature Genetics
    Seiten 1028-1033
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Phosphoregulation of the budding yeast EB1 homologue Bim1p by Aurora/Ipl1p
    DOI 10.1083/jcb.200901036
    Typ Journal Article
    Autor Zimniak T
    Journal Journal of Cell Biology
    Seiten 379-391
    Link Publikation
  • 2008
    Titel The cohesin complex and its roles in chromosome biology
    DOI 10.1101/gad.1724308
    Typ Journal Article
    Autor Peters J
    Journal Genes & Development
    Seiten 3089-3114
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Cohesin mediates transcriptional insulation by CCCTC-binding factor
    DOI 10.1038/nature06634
    Typ Journal Article
    Autor Wendt K
    Journal Nature
    Seiten 796-801
  • 2008
    Titel Sister chromatids caught in the cohesin trap
    DOI 10.1038/nsmb0908-899
    Typ Journal Article
    Autor Cipak L
    Journal Nature Structural & Molecular Biology
    Seiten 899-900
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Solving the shugoshin puzzle
    DOI 10.1016/j.tig.2008.02.001
    Typ Journal Article
    Autor Gregan J
    Journal Trends in Genetics
    Seiten 205-207
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Sister Chromatid Cohesion
    DOI 10.1101/cshperspect.a011130
    Typ Journal Article
    Autor Peters J
    Journal Cold Spring Harbor Perspectives in Biology
    Link Publikation
  • 2012
    Titel CENP-T proteins are conserved centromere receptors of the Ndc80 complex
    DOI 10.1038/ncb2493
    Typ Journal Article
    Autor Schleiffer A
    Journal Nature Cell Biology
    Seiten 604-613
  • 2012
    Titel Galactosylated Fucose Epitopes in Nematodes INCREASED EXPRESSION IN A CAENORHABDITIS MUTANT ASSOCIATED WITH ALTERED LECTIN SENSITIVITY AND OCCURRENCE IN PARASITIC SPECIES*
    DOI 10.1074/jbc.m112.353128
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 28276-28290
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Molecular requirements for the formation of a kinetochore–microtubule interface by Dam1 and Ndc80 complexes
    DOI 10.1083/jcb.201210091
    Typ Journal Article
    Autor Lampert F
    Journal Journal of Cell Biology
    Seiten 21-30
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Analysis of protein mixtures from whole-cell extracts by single-run nanoLC-MS/MS using ultralong gradients
    DOI 10.1038/nprot.2012.036
    Typ Journal Article
    Autor Köcher T
    Journal Nature Protocols
    Seiten 882-890
  • 2015
    Titel Transcription dynamically patterns the meiotic chromosome-axis interface
    DOI 10.7554/elife.07424
    Typ Journal Article
    Autor Sun X
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2012
    Titel ATP analog-sensitive Pat1 protein kinase for synchronous fission yeast meiosis at physiological temperature
    DOI 10.4161/cc.20052
    Typ Journal Article
    Autor Cipak L
    Journal Cell Cycle
    Seiten 1626-1633
    Link Publikation
  • 2012
    Titel APC15 mediates CDC20 autoubiquitylation by APC/CMCC and disassembly of the mitotic checkpoint complex
    DOI 10.1038/nsmb.2412
    Typ Journal Article
    Autor Uzunova K
    Journal Nature Structural & Molecular Biology
    Seiten 1116-1123
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Generation of a set of conditional analog-sensitive alleles of essential protein kinases in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe
    DOI 10.4161/cc.10.20.17792
    Typ Journal Article
    Autor Cipak L
    Journal Cell Cycle
    Seiten 3527-3532
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Universal and Confident Phosphorylation Site Localization Using phosphoRS
    DOI 10.1021/pr200611n
    Typ Journal Article
    Autor Taus T
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 5354-5362
  • 2011
    Titel Spo11-Accessory Proteins Link Double-Strand Break Sites to the Chromosome Axis in Early Meiotic Recombination
    DOI 10.1016/j.cell.2011.07.003
    Typ Journal Article
    Autor Panizza S
    Journal Cell
    Seiten 372-383
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Cohesin acetyltransferase Esco2 is a cell viability factor and is required for cohesion in pericentric heterochromatin
    DOI 10.1038/emboj.2011.381
    Typ Journal Article
    Autor Whelan G
    Journal The EMBO Journal
    Seiten 71-82
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Have a break: determinants of meiotic DNA double strand break (DSB) formation and processing in plants
    DOI 10.1093/jxb/erq421
    Typ Journal Article
    Autor Edlinger B
    Journal Journal of Experimental Botany
    Seiten 1545-1563
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Synthesis and Characterization of Two Homologous Series of Diastereomeric 2-Alkoxyphenylcarbamates
    DOI 10.1248/cpb.59.978
    Typ Journal Article
    Autor Gregan F
    Journal Chemical and Pharmaceutical Bulletin
    Seiten 978
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Non-catalytic motor domains enable processive movement and functional diversification of the kinesin-14 Kar3
    DOI 10.7554/elife.04489
    Typ Journal Article
    Autor Mieck C
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Nuclear Envelope Retention of LINC Complexes Is Promoted by SUN-1 Oligomerization in the Caenorhabditis elegans Germ Line
    DOI 10.1534/genetics.116.188094
    Typ Journal Article
    Autor Daryabeigi A
    Journal Genetics
    Seiten 733-748
    Link Publikation
  • 2015
    Titel An in vivo detection system for transient and low-abundant protein interactions and their kinetics in budding yeast
    DOI 10.1002/yea.3063
    Typ Journal Article
    Autor Brezovich A
    Journal Yeast
    Seiten 355-365
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Anion-Exchange Chromatography of Phosphopeptides: Weak Anion Exchange versus Strong Anion Exchange and Anion-Exchange Chromatography versus Electrostatic Repulsion–Hydrophilic Interaction Chromatography
    DOI 10.1021/ac504420c
    Typ Journal Article
    Autor Alpert A
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 4704-4711
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Casein Kinase 1 and Phosphorylation of Cohesin Subunit Rec11 (SA3) Promote Meiotic Recombination through Linear Element Formation
    DOI 10.1371/journal.pgen.1005225
    Typ Journal Article
    Autor Phadnis N
    Journal PLOS Genetics
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Quantitative Phosphoproteomics of the Ataxia Telangiectasia-Mutated (ATM) and Ataxia Telangiectasia-Mutated and Rad3-related (ATR) Dependent DNA Damage Response in Arabidopsis thaliana *[S]
    DOI 10.1074/mcp.m114.040352
    Typ Journal Article
    Autor Roitinger E
    Journal Molecular & Cellular Proteomics
    Seiten 556-571
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Chemogenomic and transcriptome analysis identifies mode of action of the chemosensitizing agent CTBT (7-chlorotetrazolo[5,1-c]benzo[1,2,4]triazine)
    DOI 10.1186/1471-2164-11-153
    Typ Journal Article
    Autor Batova M
    Journal BMC Genomics
    Seiten 153
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Casein kinase 1 is required for efficient removal of Rec8 during meiosis I
    DOI 10.4161/cc.9.13.12146
    Typ Journal Article
    Autor Rumpf C
    Journal Cell Cycle
    Seiten 2657-2662
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Molecular Architecture and Connectivity of the Budding Yeast Mtw1 Kinetochore Complex
    DOI 10.1016/j.jmb.2010.11.012
    Typ Journal Article
    Autor Hornung P
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 548-559
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Meiotic Chromosome Homology Search Involves Modifications of the Nuclear Envelope Protein Matefin/SUN-1
    DOI 10.1016/j.cell.2009.10.045
    Typ Journal Article
    Autor Penkner A
    Journal Cell
    Seiten 920-933
    Link Publikation
  • 2009
    Titel How cohesin and CTCF cooperate in regulating gene expression
    DOI 10.1007/s10577-008-9017-7
    Typ Journal Article
    Autor Wendt K
    Journal Chromosome Research
    Seiten 201-214
  • 2009
    Titel An improved strategy for tandem affinity purification-tagging of Schizosaccharomyces pombe genes
    DOI 10.1002/pmic.200800948
    Typ Journal Article
    Autor Cipak L
    Journal PROTEOMICS
    Seiten 4825-4828
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Analysis of Protein–DNA Interactions During Meiosis by Quantitative Chromatin Immunoprecipitation (qChIP)
    DOI 10.1007/978-1-59745-527-5_17
    Typ Book Chapter
    Autor Mendoza M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 267-283
  • 2009
    Titel Separation of roles of Zip1 in meiosis revealed in heterozygous mutants of Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1007/s00438-009-0477-z
    Typ Journal Article
    Autor Klutstein M
    Journal Molecular Genetics and Genomics
    Seiten 453
  • 2009
    Titel Transferring the Concept of Multinuclearity to Ruthenium Complexes for Improvement of Anticancer Activity
    DOI 10.1021/jm8013234
    Typ Journal Article
    Autor Mendoza-Ferri M
    Journal Journal of Medicinal Chemistry
    Seiten 916-925
    Link Publikation
  • 2009
    Titel A Dam1-based artificial kinetochore is sufficient to promote chromosome segregation in budding yeast
    DOI 10.1038/ncb1924
    Typ Journal Article
    Autor Kiermaier E
    Journal Nature Cell Biology
    Seiten 1109-1115
  • 2009
    Titel A novel ATM-dependent X-ray-inducible gene is essential for both plant meiosis and gametogenesis
    DOI 10.1111/j.1365-313x.2009.03814.x
    Typ Journal Article
    Autor Dean P
    Journal The Plant Journal
    Seiten 791-802
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Cohesin Is Required for Higher-Order Chromatin Conformation at the Imprinted IGF2-H19 Locus
    DOI 10.1371/journal.pgen.1000739
    Typ Journal Article
    Autor Nativio R
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Matefin/SUN-1 Phosphorylation Is Part of a Surveillance Mechanism to Coordinate Chromosome Synapsis and Recombination with Meiotic Progression and Chromosome Movement
    DOI 10.1371/journal.pgen.1003335
    Typ Journal Article
    Autor Woglar A
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Crosstalk between casein kinase II and Ste20-related kinase Nak1
    DOI 10.4161/cc.24095
    Typ Journal Article
    Autor Cipak L
    Journal Cell Cycle
    Seiten 884-888
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Transcriptome and proteome quantification of a tumor model provides novel insights into post-transcriptional gene regulation
    DOI 10.1186/gb-2013-14-11-r133
    Typ Journal Article
    Autor Jüschke C
    Journal Genome Biology
    Link Publikation
  • 2013
    Titel The Arabidopsis SWR1 Chromatin-Remodeling Complex Is Important for DNA Repair, Somatic Recombination, and Meiosis
    DOI 10.1105/tpc.112.104067
    Typ Journal Article
    Autor Rosa M
    Journal The Plant Cell
    Seiten 1990-2001
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Machine learning in cell biology – teaching computers to recognize phenotypes
    DOI 10.1242/jcs.123604
    Typ Journal Article
    Autor Sommer C
    Journal Journal of Cell Science
    Seiten 5529-5539
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Family matters: structural and functional conservation of centromere-associated proteins from yeast to humans
    DOI 10.1016/j.tcb.2013.01.010
    Typ Journal Article
    Autor Westermann S
    Journal Trends in Cell Biology
    Seiten 260-269
  • 2011
    Titel Improved Precision of iTRAQ and TMT Quantification by an Axial Extraction Field in an Orbitrap HCD Cell
    DOI 10.1021/ac102265w
    Typ Journal Article
    Autor Pichler P
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 1469-1474
    Link Publikation
  • 2011
    Titel CSA and CSB proteins interact with p53 and regulate its Mdm2-dependent ubiquitination
    DOI 10.4161/cc.10.21.17905
    Typ Journal Article
    Autor Latini P
    Journal Cell Cycle
    Seiten 3719-3730
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Merotelic kinetochore attachment: causes and effects
    DOI 10.1016/j.tcb.2011.01.003
    Typ Journal Article
    Autor Gregan J
    Journal Trends in Cell Biology
    Seiten 374-381
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Leptotene/Zygotene Chromosome Movement Via the SUN/KASH Protein Bridge in Caenorhabditis elegans
    DOI 10.1371/journal.pgen.1001219
    Typ Journal Article
    Autor Baudrimont A
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Peptide Labeling with Isobaric Tags Yields Higher Identification Rates Using iTRAQ 4-Plex Compared to TMT 6-Plex and iTRAQ 8-Plex on LTQ Orbitrap
    DOI 10.1021/ac100890k
    Typ Journal Article
    Autor Pichler P
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 6549-6558
    Link Publikation
  • 2010
    Titel The Dam1 complex confers microtubule plus end–tracking activity to the Ndc80 kinetochore complex
    DOI 10.1083/jcb.200912021
    Typ Journal Article
    Autor Lampert F
    Journal Journal of Cell Biology
    Seiten 641-649
    Link Publikation
  • 2010
    Titel QIKS – Quantitative identification of kinase substrates
    DOI 10.1002/pmic.200900749
    Typ Journal Article
    Autor Morandell S
    Journal PROTEOMICS
    Seiten 2015-2025
  • 2010
    Titel Lesson from the Stoichiometry Determination of the Cohesin Complex: A Short Protease Mediated Elution Increases the Recovery from Cross-Linked Antibody-Conjugated Beads
    DOI 10.1021/pr100927x
    Typ Journal Article
    Autor Holzmann J
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 780-789
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Sororin Mediates Sister Chromatid Cohesion by Antagonizing Wapl
    DOI 10.1016/j.cell.2010.10.031
    Typ Journal Article
    Autor Nishiyama T
    Journal Cell
    Seiten 737-749
    Link Publikation
  • 2010
    Titel High-throughput knockout screen in Schizosaccharomyces pombe identifies a novel gene required for efficient homolog disjunction during meiosis I
    DOI 10.4161/cc.9.9.11526
    Typ Journal Article
    Autor Rumpf C
    Journal Cell Cycle
    Seiten 1802-1808
    Link Publikation
  • 2010
    Titel S. pombe genome deletion project: An update
    DOI 10.4161/cc.9.12.11914
    Typ Journal Article
    Autor Spirek M
    Journal Cell Cycle
    Seiten 2399-2402
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Laser microsurgery provides evidence for merotelic kinetochore attachments in fission yeast cells lacking Pcs1 or Clr4
    DOI 10.4161/cc.9.19.13233
    Typ Journal Article
    Autor Rumpf C
    Journal Cell Cycle
    Seiten 3997-4004
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Phenotypic profiling of the human genome by time-lapse microscopy reveals cell division genes
    DOI 10.1038/nature08869
    Typ Journal Article
    Autor Neumann B
    Journal Nature
    Seiten 721-727
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Sufficient Amounts of Functional HOP2/MND1 Complex Promote Interhomolog DNA Repair but Are Dispensable for Intersister DNA Repair during Meiosis in Arabidopsis
    DOI 10.1105/tpc.113.118521
    Typ Journal Article
    Autor Uanschou C
    Journal The Plant Cell
    Seiten 4924-4940
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Kinetic framework of spindle assembly checkpoint signalling
    DOI 10.1038/ncb2842
    Typ Journal Article
    Autor Dick A
    Journal Nature Cell Biology
    Seiten 1370-1377
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Esperanto for histones: CENP-A, not CenH3, is the centromeric histone H3 variant
    DOI 10.1007/s10577-013-9347-y
    Typ Journal Article
    Autor Earnshaw W
    Journal Chromosome Research
    Seiten 101-106
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Wapl is an essential regulator of chromatin structure and chromosome segregation
    DOI 10.1038/nature12471
    Typ Journal Article
    Autor Tedeschi A
    Journal Nature
    Seiten 564-568
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Studying the fragmentation behavior of peptides with arginine phosphorylation and its influence on phospho-site localization
    DOI 10.1002/pmic.201200240
    Typ Journal Article
    Autor Schmidt A
    Journal PROTEOMICS
    Seiten 945-954
  • 2013
    Titel Budding Yeast ATM/ATR Control Meiotic Double-Strand Break (DSB) Levels by Down-Regulating Rec114, an Essential Component of the DSB-machinery
    DOI 10.1371/journal.pgen.1003545
    Typ Journal Article
    Autor Carballo J
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Unambiguous Phosphosite Localization using Electron-Transfer/Higher-Energy Collision Dissociation (EThcD)
    DOI 10.1021/pr301130k
    Typ Journal Article
    Autor Frese C
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 1520-1525
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Combinatorial Regulation of Meiotic Holliday Junction Resolution in C. elegans by HIM-6 (BLM) Helicase, SLX-4, and the SLX-1, MUS-81 and XPF-1 Nucleases
    DOI 10.1371/journal.pgen.1003591
    Typ Journal Article
    Autor Agostinho A
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Optimized Nonlinear Gradients for Reversed-Phase Liquid Chromatography in Shotgun Proteomics
    DOI 10.1021/ac401145q
    Typ Journal Article
    Autor Moruz L
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 7777-7785
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Yeast Protein Phosphatase 2A-Cdc55 Regulates the Transcriptional Response to Hyperosmolarity Stress by Regulating Msn2 and Msn4 Chromatin Recruitment
    DOI 10.1128/mcb.00834-12
    Typ Journal Article
    Autor Reiter W
    Journal Molecular and Cellular Biology
    Seiten 1057-1072
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Quantitative Phosphoproteomics Reveals the Role of Protein Arginine Phosphorylation in the Bacterial Stress Response*
    DOI 10.1074/mcp.m113.032292
    Typ Journal Article
    Autor Schmidt A
    Journal Molecular & Cellular Proteomics
    Seiten 537-550
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Aurora B and Cdk1 mediate Wapl activation and release of acetylated cohesin from chromosomes by phosphorylating Sororin
    DOI 10.1073/pnas.1305020110
    Typ Journal Article
    Autor Nishiyama T
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 13404-13409
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Smc5/6-Mms21 Prevents and Eliminates Inappropriate Recombination Intermediates in Meiosis
    DOI 10.1371/journal.pgen.1004067
    Typ Journal Article
    Autor Xaver M
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Ubc9 Sumoylation Controls SUMO Chain Formation and Meiotic Synapsis in Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1016/j.molcel.2013.03.027
    Typ Journal Article
    Autor Klug H
    Journal Molecular Cell
    Seiten 625-636
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Chromosome movement in meiosis I prophase of Caenorhabditis elegans
    DOI 10.1007/s00412-013-0436-7
    Typ Journal Article
    Autor Woglar A
    Journal Chromosoma
    Seiten 15-24
    Link Publikation
  • 2013
    Titel A structural basis for kinetochore recruitment of the Ndc80 complex via two distinct centromere receptors
    DOI 10.1038/emboj.2012.356
    Typ Journal Article
    Autor Malvezzi F
    Journal The EMBO Journal
    Seiten 409-423
    Link Publikation
  • 2007
    Titel A novel plant gene essential for meiosis is related to the human CtIP and the yeast COM1/SAE2 gene
    DOI 10.1038/sj.emboj.7601913
    Typ Journal Article
    Autor Uanschou C
    Journal The EMBO Journal
    Seiten 5061-5070
    Link Publikation
  • 2007
    Titel Novel Roles for Selected Genes in Meiotic DNA Processing
    DOI 10.1371/journal.pgen.0030222
    Typ Journal Article
    Autor Jordan P
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation

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