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Angeregte Zustände und Dynamik von funktionellen Re(I) Komplexen in Metalloproteinen

Excited states and dynamics of functional Re(I) complexes embedded in metalloproteins

Leticia Gonzalez (ORCID: 0000-0001-5112-794X)
  • Grant-DOI 10.55776/I2883
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2016
  • Projektende 31.08.2019
  • Bewilligungssumme 209.506 €
  • Projekt-Website

Bilaterale Ausschreibung: Frankreich

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (100%)

Keywords

    Ab Initio Quantum Chemisty, Ab Initio Molecular Dynamics, Quantum Dynamics, Molecular Mechanics, Metalloproteins, Transition Metal Complexes

Abstract Endbericht

Dieses Projekt untersucht die angeregten Zustände und die lichtinduzierte Dynamik von Metalloproteinen eingebetteten Rhenium(I)-Komplexen. Abhängig von der biologischen Umgebung und von den Liganden mit welchen das Rhenium(I) Zentrum funktionalisiert ist, können diese Metallkomplexe verschiedene Funktionalitäten zeigen: Sie können isomerisieren, einen Elektronentransfer auslösen oder einfach Licht ausstrahlen. Bisher wurden Experimente mit ultraschnellen Laserpulsen an solchen Systemen durchgeführt; allerdings fehlt immer noch ein Verständnis über den genauen Mechanismus dieser lichtinduzierten Prozesse. Das Projekt zielt deshalb auf eine Aufklärung und ein Verständnis der Umgebungseinflüsse auf die Photochemie und Photophysik dieser Komplexfamilie ab. Das so gewonnene Verständnis ist fundamental wichtig zur Verbesserung des Designs neuer Materialien, eingesetzt in der künstlichen Photosynthese sowie in anderen Gebieten der Materialwissenschaften sowie der Molekularbiologie. Um dieses Ziel zu erreichen werden neue theoretische Werkzeuge und multiskalen Berechnungsverfahren entwickelt. Dazu wird die verschiedene Expertise von drei Arbeitsgruppen kombiniert: (1) Berechnung von elektronisch angeregten Zuständen (Straßburg), (2) die Simulation von dynamischen Prozessen mittels Quantenmechanik (Straßburg) bzw. klassischer Mechanik (Wien), und (3) die Beschreibung biologischer Umgebungen (Nancy). Durch den Verständnisgewinn anhand spezifischer Systeme mit experimentellem Interesse wird das Konsortium eine neue Methodologie entwickeln, welche allgemein auf dem Gebiet der Photonik anwendbar sein werden. Die anvisierten Ziele können dabei nicht durch eine einzelne Arbeitsgruppe erreicht werden. Deshalb wurde das vorliegende Konsortium geschaffen, um komplementäres Wissen und Fähigkeiten zu kombinierten und dadurch synergetisch Fortschritte auf dem Gebiet der Methodenentwicklung zu erzielen.

Das Ziel dieses Projektes war die Modellierung und Simulation licht-empfindlicher Übergangsmetallkomplexe in komplexen biologischen Umgebungen, wie beispielsweise Proteinen. Insbesondere lag der Fokus der Untersuchungen auf der Berechnung von angeregten Zuständen und licht-induzierter Dynamik von Re (I) Komplexen, welche eingebettet in metall-markierten Mutanten eines blauen Kupfer-Proteins experimentelle Anwendung finden. Dieses Re (I)-Protein-System ist deshalb faszinierend, weil es in Abhängigkeit von den angrenzenden Liganden und der Umgebung verschiedene spezifische Funktionen zulässt, beispielsweise das Auslösen von Elektronentransfer, Lumineszenz-Messungen, oder Isomerisierungen. Die Komplexität des Systems erforderte, dass wir in enger Zusammenarbeit mit den Partner-Forschungsgruppen in Straßburg und Nancy neue Berechnungs- und Simulationsansätze entwickelten, welche die Untersuchung von Systemen mit erhöhtem Komplexitäts-Grad auf effiziente und akkurate Weise ermöglichen. Die Zusammenarbeit der drei Gruppen ermöglichte einige Synergien durch die gemeinsame Entwicklung, Erweiterung und Kombination mehrerer sich ergänzender Faktoren: den Molekülmechanik-Techniken der Gruppe aus Nancy, der Quantendynamik-Expertise der Gruppe aus Straßburg und trajektorien-basierte Surface-Hopping-Dynamik unserer Gruppe in Wien. Auf diese Weise war es möglich, zum ersten Mal die Dynamik der angeregten Zustände eines [Re(CO)3(Phen)(Im)]+ Komplexes mit computer-gestützten Methoden zu untersuchen, sowohl in wässriger Lösung als auch in Gegenwart einer Aminosäure des Proteins, und Spindynamik und Ladungs-/Energietransfer zu analysieren. Die Mehrheit der entwickelten Software-Werkzeuge sind allgemein gehalten und können für beliebige Systeme in Gegenwart einer chemischen Umgebung angewendet werden, was neue Forschungsansätze ermöglicht. Dafür ist es wesentlich, dass alle neu entwickelten Methoden in frei verfügbarer Software implementiert wurden, beispielsweise unserem Dynamik-Program SHARC, welches nun in der Lage ist die Dynamik von Übergangsmetallkomplexen in komplexer Umgebung zu simulieren.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Antonio Monari, UMR 7062 : CNRS, Université Paris 7 Denis-Diderot, ÉPHÉ Ve section - Frankreich
  • Chantal Daniel, Université de Strasbourg - Frankreich

Research Output

  • 1959 Zitationen
  • 23 Publikationen
  • 8 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2019
    Titel Strong Influence of Decoherence Corrections and Momentum Rescaling in Surface Hopping Dynamics of Transition Metal Complexes.
    DOI 10.1021/acs.jctc.9b00525
    Typ Journal Article
    Autor Plasser F
    Journal Journal of chemical theory and computation
    Seiten 5031-5045
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Unconventional two-step spin relaxation dynamics of [Re(CO) 3 (im)(phen)] + in aqueous solution
    DOI 10.1039/c9sc03671g
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal Chemical Science
    Seiten 10405-10411
    Link Publikation
  • 2019
    Titel OpenMolcas: From Source Code to Insight.
    DOI 10.1021/acs.jctc.9b00532
    Typ Journal Article
    Autor Fdez Galván I
    Journal Journal of chemical theory and computation
    Seiten 5925-5964
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Machine learning enables long time scale molecular photodynamics simulations
    DOI 10.1039/c9sc01742a
    Typ Journal Article
    Autor Westermayr J
    Journal Chemical Science
    Seiten 8100-8107
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Identification of Important Normal Modes in Nonadiabatic Dynamics Simulations by Coherence, Correlation, and Frequency Analyses
    DOI 10.26434/chemrxiv.9913046.v1
    Typ Preprint
    Autor Mai S
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Strong Influence of Decoherence Corrections and Momentum Rescaling in Surface Hopping Dynamics of Transition Metal Complexes
    DOI 10.26434/chemrxiv.8201621
    Typ Preprint
    Autor Plasser F
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Strong Influence of Decoherence Corrections and Momentum Rescaling in Surface Hopping Dynamics of Transition Metal Complexes
    DOI 10.26434/chemrxiv.8201621.v1
    Typ Preprint
    Autor Plasser F
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Identification of important normal modes in nonadiabatic dynamics simulations by coherence, correlation, and frequency analyses
    DOI 10.1063/1.5129335
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 244115
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Quantitative wave function analysis for excited states of transition metal complexes
    DOI 10.48550/arxiv.1711.10707
    Typ Preprint
    Autor Mai S
  • 2018
    Titel CHAPTER 10 General Trajectory Surface Hopping Method for Ultrafast Nonadiabatic Dynamics
    DOI 10.1039/9781788012669-00348
    Typ Book Chapter
    Autor Mai S
    Verlag Royal Society of Chemistry (RSC)
    Seiten 348-385
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Intersystem Crossing as a Key Component of the Nonadiabatic Relaxation Dynamics of Bithiophene and Terthiophene
    DOI 10.1021/acs.jctc.8b00492
    Typ Journal Article
    Autor Schnappinger T
    Journal Journal of Chemical Theory and Computation
    Seiten 4530-4540
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Machine learning enables long time scale molecular photodynamics simulations
    DOI 10.48550/arxiv.1811.09112
    Typ Preprint
    Autor Westermayr J
  • 2018
    Titel Highly efficient surface hopping dynamics using a linear vibronic coupling model
    DOI 10.1039/c8cp05662e
    Typ Journal Article
    Autor Plasser F
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 57-69
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Novel Molecular-Dynamics-Based Protocols for Phase Space Sampling in Complex Systems
    DOI 10.3389/fchem.2018.00495
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal Frontiers in Chemistry
    Seiten 495
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Simulated and Experimental Time-Resolved Photoelectron Spectra of the Intersystem Crossing Dynamics in 2-Thiouracil
    DOI 10.3390/molecules23112836
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal Molecules
    Seiten 2836
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Quantitative wave function analysis for excited states of transition metal complexes
    DOI 10.1016/j.ccr.2018.01.019
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal Coordination Chemistry Reviews
    Seiten 74-97
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Revealing Ultrafast Population Transfer between Nearly Degenerate Electronic States
    DOI 10.1021/acs.jpclett.9b03462
    Typ Journal Article
    Autor Heim P
    Journal The Journal of Physical Chemistry Letters
    Seiten 1443-1449
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Competing ultrafast photoinduced electron transfer and intersystem crossing of [Re(CO)3(Dmp)(His124)(Trp122)]+ in Pseudomonas aeruginosa azurin: a nonadiabatic dynamics study
    DOI 10.1007/s00214-020-2555-6
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal Theoretical Chemistry Accounts
    Seiten 65
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Interstate vibronic coupling constants between electronic excited states for complex molecules
    DOI 10.1063/1.5022760
    Typ Journal Article
    Autor Fumanal M
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 124119
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Nonadiabatic dynamics: The SHARC approach
    DOI 10.1002/wcms.1370
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Interstate Vibronic Coupling Constants Between Electronic Excited States for Complex Molecules
    DOI 10.48550/arxiv.1803.11360
    Typ Preprint
    Autor Fumanal M
  • 2017
    Titel Detailed Wave Function Analysis for Multireference Methods: Implementation in the Molcas Program Package and Applications to Tetracene
    DOI 10.1021/acs.jctc.7b00718
    Typ Journal Article
    Autor Plasser F
    Journal Journal of Chemical Theory and Computation
    Seiten 5343-5353
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Excited-states of a rhenium carbonyl diimine complex: solvation models, spin–orbit coupling, and vibrational sampling effects
    DOI 10.1039/c7cp05126c
    Typ Journal Article
    Autor Mai S
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 27240-27250
    Link Publikation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel Robert Bunsen Lecture Prize
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Elected Member of the Austrian Academy of Sciences
    Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2019
    Titel Prize for Excellent Research from the Spanish Royal Society in Chemistry (RSEQ)
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Gauß-Professorship from Göttingen Academy of Sicences and Humanities
    Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Doctor Honoris Causa by the University of Lorraine (France)
    Typ Honorary Degree
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Elected Member of the International Academy of Quantum Molecular Sciences (IAQMS)
    Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel ChemPubSoc Europe Fellow (Class 2016/2017)
    Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Fellow of the European Academy of Sciences
    Typ Awarded honorary membership, or a fellowship, of a learned society
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2019
    Titel Scientific & Technological Cooperation Austria, France
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2019
    Geldgeber Austrian Agency for International Cooperation in Education and Research
  • 2018
    Titel Priority Program SPP 2102
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2018

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