Hochauflösende Genomanalyse im Brustkrebs

Brustkrebs repräsentiert eine Reihe von Tumoren mit unterschiedlichem Verhalten und klinischen Ausgang. Genomische Instabilität, insbesondere chromosomale Instabilität, wie numerische Veränderungen und strukturelle Rearrangements (Genamplifikationen, Deletionen und Translokationen), ist essentiell und limitierend für Tumorprogression. Defekte in der Zellzykluskontrolle spielen eine zentrale Rolle in chromosomaler Destabilisierung und genomischer Instabilität. Das Ziel dieses Projektes ist es, genetische Veränderungen und Zellzyklusabnormalitäten mit biologischem Verhalten von Brustkrebstumoren zu korrelieren. Die Arbeitsgruppe von A. Zetterberg verfügt über eine einzigartige Kombination von Techniken (ROMA und QM-FISH) und über eine Tumorbank mit Tumorproben, die nach Kriterien wie klinische Stadium, Morphologie, DNA-Index, Proliferationsrate, Therapietyp und Metastasenbildung klassifiziert wurden. Diese Voraussetzungen ermöglichen es, klar definierte Tumorproben zu analysieren. Folgende Punkte sollen im Rahmen meines Auslandsauftenthaltes bearbeitet werden: 1. Globale genomweite Suche nach Änderungen der Genkopiennummern mit der Kombination von zwei neu entwickelten Techniken für hochauflösende Genomanalysen: a) ROMA (oligonucleotide microarray analysis) und b) QM-FISH (quantitiativen Multigen-Fluoreszenz in situ Hybridisierung) angewendet. 2. Charakterisierung von Burstkrebstumoren mit Genamplifikation durch ROMA und QM-FISH und Screening nach komplexen 17q Rearrangements dieser Tumore, speziell in Hinsicht auf Her-2/neu . 2. Korrelation der genetischen Veränderungen mit dem Niveau der Zyklin E Expression durch eine Technik die in A. Zetterbergs Labor entwickelt wurde.