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Introns und funktionelle Innovation in Drosophila

An intron based screen for functional innovation

Christian Schlötterer (ORCID: 0000-0003-4710-6526)
  • Grant-DOI 10.55776/P19832
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2007
  • Projektende 31.12.2011
  • Bewilligungssumme 280.828 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Drosophila melanogaster, Comparative genomics, Selektion, Intron

Abstract Endbericht

Lange wurde angenommen, dass Introns neutral evolvieren. Neuere Erkenntnisse zeigen jedoch, dass sowohl die Intronlänge, as auch die Intronsequenz zwischen Arten sehr stark konserviert sein können. Diese teilweise sehr starke Konservierung wurde darauf zurückgeführt, dass Introns wichtige Funktionen innehaben können. Das vorgelegte Projekt basiert auf der funktionellen Konservierung von Introns. Das Ziel ist es aus den funktionell konservierten Introns diejenigen zu identifizieren, die zu einem Zeitpunkt eine funktionelle Veränderung erfahren haben. Mittels populationsgenetischer und funktioneller Analysen werden die identifizierten Kandidaten validiert.

Lange wurde angenommen, dass Introns neutral evolvieren. Neuere Erkenntnisse zeigen jedoch, dass sowohl die Intronlänge, as auch die Intronsequenz zwischen Arten sehr stark konserviert sein können. Diese teilweise sehr starke Konservierung wurde darauf zurückgeführt, dass Introns wichtige Funktionen innehaben können. Das vorgelegte Projekt basiert auf der funktionellen Konservierung von Introns. Das Ziel ist es aus den funktionell konservierten Introns diejenigen zu identifizieren, die zu einem Zeitpunkt eine funktionelle Veränderung erfahren haben. Mittels populationsgenetischer und funktioneller Analysen werden die identifizierten Kandidaten validiert.

Forschungsstätte(n)
  • Veterinärmedizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Bettina Harr, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland

Research Output

  • 636 Zitationen
  • 6 Publikationen
Publikationen
  • 2010
    Titel The Next Generation of Molecular Markers From Massively Parallel Sequencing of Pooled DNA Samples
    DOI 10.1534/genetics.110.114397
    Typ Journal Article
    Autor Futschik A
    Journal Genetics
    Seiten 207-218
    Link Publikation
  • 2010
    Titel DNA double-strand break repair and the evolution of intron density
    DOI 10.1016/j.tig.2010.10.004
    Typ Journal Article
    Autor Farlow A
    Journal Trends in Genetics
    Seiten 1-6
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Nonsense-Mediated Decay Enables Intron Gain in Drosophila
    DOI 10.1371/journal.pgen.1000819
    Typ Journal Article
    Autor Farlow A
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Expression profiling of Drosophila mitochondrial genes via deep mRNA sequencing
    DOI 10.1093/nar/gkp856
    Typ Journal Article
    Autor Torres T
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 7509-7518
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Detecting Selective Sweeps from Pooled Next-Generation Sequencing Samples
    DOI 10.1093/molbev/mss090
    Typ Journal Article
    Autor Boitard S
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 2177-2186
    Link Publikation
  • 2011
    Titel The Genomic Signature of Splicing-Coupled Selection Differs between Long and Short Introns
    DOI 10.1093/molbev/msr201
    Typ Journal Article
    Autor Farlow A
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 21-24
    Link Publikation

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