Introns und funktionelle Innovation in Drosophila
An intron based screen for functional innovation
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Drosophila melanogaster,
Comparative genomics,
Selektion,
Intron
Lange wurde angenommen, dass Introns neutral evolvieren. Neuere Erkenntnisse zeigen jedoch, dass sowohl die Intronlänge, as auch die Intronsequenz zwischen Arten sehr stark konserviert sein können. Diese teilweise sehr starke Konservierung wurde darauf zurückgeführt, dass Introns wichtige Funktionen innehaben können. Das vorgelegte Projekt basiert auf der funktionellen Konservierung von Introns. Das Ziel ist es aus den funktionell konservierten Introns diejenigen zu identifizieren, die zu einem Zeitpunkt eine funktionelle Veränderung erfahren haben. Mittels populationsgenetischer und funktioneller Analysen werden die identifizierten Kandidaten validiert.
Lange wurde angenommen, dass Introns neutral evolvieren. Neuere Erkenntnisse zeigen jedoch, dass sowohl die Intronlänge, as auch die Intronsequenz zwischen Arten sehr stark konserviert sein können. Diese teilweise sehr starke Konservierung wurde darauf zurückgeführt, dass Introns wichtige Funktionen innehaben können. Das vorgelegte Projekt basiert auf der funktionellen Konservierung von Introns. Das Ziel ist es aus den funktionell konservierten Introns diejenigen zu identifizieren, die zu einem Zeitpunkt eine funktionelle Veränderung erfahren haben. Mittels populationsgenetischer und funktioneller Analysen werden die identifizierten Kandidaten validiert.
- Bettina Harr, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
Research Output
- 636 Zitationen
- 6 Publikationen
-
2010
Titel The Next Generation of Molecular Markers From Massively Parallel Sequencing of Pooled DNA Samples DOI 10.1534/genetics.110.114397 Typ Journal Article Autor Futschik A Journal Genetics Seiten 207-218 Link Publikation -
2010
Titel DNA double-strand break repair and the evolution of intron density DOI 10.1016/j.tig.2010.10.004 Typ Journal Article Autor Farlow A Journal Trends in Genetics Seiten 1-6 Link Publikation -
2010
Titel Nonsense-Mediated Decay Enables Intron Gain in Drosophila DOI 10.1371/journal.pgen.1000819 Typ Journal Article Autor Farlow A Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2009
Titel Expression profiling of Drosophila mitochondrial genes via deep mRNA sequencing DOI 10.1093/nar/gkp856 Typ Journal Article Autor Torres T Journal Nucleic Acids Research Seiten 7509-7518 Link Publikation -
2012
Titel Detecting Selective Sweeps from Pooled Next-Generation Sequencing Samples DOI 10.1093/molbev/mss090 Typ Journal Article Autor Boitard S Journal Molecular Biology and Evolution Seiten 2177-2186 Link Publikation -
2011
Titel The Genomic Signature of Splicing-Coupled Selection Differs between Long and Short Introns DOI 10.1093/molbev/msr201 Typ Journal Article Autor Farlow A Journal Molecular Biology and Evolution Seiten 21-24 Link Publikation