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Interdisziplinäre gekoppelte Physik Bildgebung

Interdisciplinary Coupled Physic Imaging

Otmar Scherzer (ORCID: 0000-0001-9378-7452)
  • Grant-DOI 10.55776/P26687
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2014
  • Projektende 31.03.2018
  • Bewilligungssumme 402.239 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Mathematik (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)

Keywords

    Couple Physics Imaging, Optical Coherence Tomography, Mathematical Modeling, Photoacoustic Imaging

Abstract Endbericht

Dieses Projekt ist ein Nachfolgeprojekt des auslaufenden nationalen Forschungsnetzwerkes (NFN) Photoakustische Bildgebung in der Biologie und Medizin, (http://www.csc.univie.ac.at/pai/), welches im März 2014 enden wird. Dieses neue Projekt ist wiederum interdisziplinär aufgestellt, behandelt aber nun den erweiterten Themenbereich der gekoppelten Physik Bildgebung (CPI). Wiederum sind ForscherInnen aus den Bereichen Angewandte Mathematik, Biologie und der Medizinischen Physik am Projekt beteiligt. Diese Forschungsgruppen haben bereits am NFN erfolgreich zusammengearbeitet. Durch die Zusammensetzung der Forschungsgruppen können wir fundamentale Forschungsfragen des CPI, die sich zum Beispiel durch die Kombination von OCT, Photoakustik und der Elastographie ergeben, erfolgreich untersuchen. Es ist eine Tatsache, dass den meisten CPI-Experimenten ein sehr einfaches mathematisches Modell zugrunde gelegt wird. Diese vereinfachten Modellannahmen beschränken die Auflösung und den Kontrast der Bildgebung. Im Projekt zeigen wir, dass sich komplizierte mathematische Modelle experimentell und computertechnisch realisieren lassen, und sich dadurch die Imaging Qualität verbessern und die Aufnahmezeit verringern lässt. Außerdem werden wir bisher unzugängliche Parameter rekonstruieren. Wir zeigen, dass mathematische Modellbildung oft kontraintuitive Aussagen zu ingenieurmäßigen Ansätzen liefert, wie man etwa bei der mathematischen Modellbildung von fokussierenden Detektoren sieht.

Diese interdisziplinäre Projekt zwischen dem Computational Science Centers der Universität Wien und dem Zentrum für Medizinische Physik und Biomedizinischem Engineering der Medizinischen Universität Wien beschäftigt sich mit den Möglichkeiten von Optischer Koherenz Tomographie (OCT) und Photoakustischer Tomographie (PAT) für die Analyse von mikroskopischen Daten.Schwerpunkt der Forschungen lag auf der quantitativen Analyse und dem kombinierten Einsatz der beiden Modalitäten.Schon zu Beginn des Projektes stand uns ein multi-modales Meßinstrument, welches OCT und PAT parallel durchführen kann, zur Verfügung. Zu Beginn des Projektes war es sogar international exklusiv in Wien verfügbar, was uns einen enormen wissenschaftlichen Vorteil für theoretisch mathematische und medizinische Forschungen verschaffte. Inzwischen konnte die Meßanordnung soweit transportabel gemacht werden, dass multi-modale medizinische Untersuchungen an Patienten (zum Beispiel an der Haut) durchgeführt werden können.Im Laufe des Projektes wurde eine Anzahl von Möglichkeiten entwickelt um quantitative Werte von physikalischen Parametern (wie etwa Schallgeschwindigkeit oder Kompressibilität) des zu untersuchenden Gewebes mit diesen beiden Modalitäten zu visualisieren. Mit den Modalitäten im Einzelbetrieb können diese physikalischen Parameter nicht visualisiert werden, und sie sind damit einer medizinischen Diagnose nicht zugänglich. Unter allen entwickelten quantitativen Ansätzen hat sich die multi-modale quantitive Elastographie als vielversprechend für medizinische Anwendungen herausgestellt. Dabei wird basierend auf einer Analyse der visualisierten induzierten Verschiebungen (berechnet mit Hilfe des optischen Flusses) im zu analysierenden Medium eine quantitative Analyse der physikalischen Parameter des Gewebes, wie etwa der Steifigkeit, mit Methoden der Inversen Probleme durchgeführt. Zu diesem Zweck sind unbedingt Aufnahmen mehrerer sich komplementierende Modalitäten notwendig und die Auswertung der Daten erfordert diffizile Methoden des Computer Visions und der numerischen Inversen Probleme. Erste praktische Versuche mit elastischen und visko-elastischen Testmaterialen (zb. mit Agarose und Silikon) für quantitative multi-modale Elastographie haben sich als sehr vielversprechend erwiesen.

Forschungsstätte(n)
  • Österreichische Akademie der Wissenschaften - 25%
  • Medizinische Universität Wien - 36%
  • Universität Wien - 39%
Nationale Projektbeteiligte
  • Wolfgang Drexler, Medizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Otmar Scherzer, Österreichische Akademie der Wissenschaften , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Maitine Bergounioux, Université d´Orléans - Frankreich
  • Habib Ammari, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich - Schweiz
  • John C. Schotland, Yale University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Paul Beard, University College London - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 471 Zitationen
  • 50 Publikationen
Publikationen
  • 2016
    Titel Singular Values of the Attenuated Photoacoustic Imaging Operator
    DOI 10.48550/arxiv.1611.05807
    Typ Preprint
    Autor Elbau P
  • 2016
    Titel Articulated dual modality photoacoustic and optical coherence tomography probe for preclinical and clinical imaging (Conference Presentation)
    DOI 10.1117/12.2212577
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Liu M
    Seiten 970817-970817-1
  • 2016
    Titel Inverse Problems of Combined Photoacoustic and Optical Coherence Tomography
    DOI 10.48550/arxiv.1601.03320
    Typ Preprint
    Autor Elbau P
  • 2016
    Titel 6. A variational method for quantitative photoacoustic tomography with piecewise constant coefficients
    DOI 10.1515/9783110430394-006
    Typ Book Chapter
    Autor Beretta E
    Verlag De Gruyter
    Seiten 202-224
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Photoacoustic tomography with spatially varying compressibility and density
    DOI 10.1515/jiip-2015-0113
    Typ Journal Article
    Autor Belhachmi Z
    Journal Journal of Inverse and Ill-posed Problems
    Seiten 119-133
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Combined multi-modal photoacoustic tomography, optical coherence tomography (OCT) and OCT angiography system with an articulated probe for in vivo human skin structure and vasculature imaging.
    DOI 10.1364/boe.7.003390
    Typ Journal Article
    Autor Liu M
    Journal Biomedical optics express
    Seiten 3390-3402
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Reconstruction formulas for Photoacoustic Imaging in Attenuating Media
    DOI 10.48550/arxiv.1705.07466
    Typ Preprint
    Autor Scherzer O
  • 2017
    Titel The inverse scattering problem for orthotropic media in polarization-sensitive optical coherence tomography
    DOI 10.1007/s13137-017-0102-y
    Typ Journal Article
    Autor Elbau P
    Journal GEM - International Journal on Geomathematics
    Seiten 145-165
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Quantitative reconstructions in multi-modal photoacoustic and optical coherence tomography imaging
    DOI 10.48550/arxiv.1709.00207
    Typ Preprint
    Autor Elbau P
  • 2017
    Titel The inverse scattering problem for orthotropic media in Polarization-sensitive Optical Coherence Tomography
    DOI 10.48550/arxiv.1705.08373
    Typ Preprint
    Autor Elbau P
  • 2016
    Titel Phase-stable swept source OCT angiography in human skin using an akinetic source
    DOI 10.1364/boe.7.003032
    Typ Journal Article
    Autor Chen Z
    Journal Biomedical Optics Express
    Seiten 3032-3048
    Link Publikation
  • 2016
    Titel A direct method for photoacoustic tomography with inhomogeneous sound speed
    DOI 10.1088/0266-5611/32/4/045005
    Typ Journal Article
    Autor Belhachmi Z
    Journal Inverse Problems
    Seiten 045005
    Link Publikation
  • 2016
    Titel On the X-ray transform of planar symmetric 2-tensors
    DOI 10.1016/j.jmaa.2016.04.018
    Typ Journal Article
    Autor Sadiq K
    Journal Journal of Mathematical Analysis and Applications
    Seiten 31-49
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Nonequispaced grid sampling in photoacoustics with a nonuniform fast Fourier transform
    DOI 10.1117/1.jbo.21.1.015005
    Typ Journal Article
    Autor Schmid J
    Journal Journal of Biomedical Optics
    Seiten 015005-015005
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Comprehensive vascular imaging using optical coherence tomography-based angiography and photoacoustic tomography
    DOI 10.1117/1.jbo.21.9.096011
    Typ Journal Article
    Autor Zabihian B
    Journal Journal of Biomedical Optics
    Seiten 096011-096011
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Inverse problems of combined photoacoustic and optical coherence tomography
    DOI 10.1002/mma.3915
    Typ Journal Article
    Autor Elbau P
    Journal Mathematical Methods in the Applied Sciences
    Seiten 505-522
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Inverse Boundary Value Problem For The Helmholtz Equation: Quantitative Conditional Lipschitz Stability Estimates
    DOI 10.1137/15m1043856
    Typ Journal Article
    Autor Beretta E
    Journal SIAM Journal on Mathematical Analysis
    Seiten 3962-3983
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Convergence rates for regularization functionals with polyconvex integrands
    DOI 10.48550/arxiv.1612.06724
    Typ Preprint
    Autor Kirisits C
  • 2016
    Titel Optimal Convergence Rates Results for Linear Inverse Problems in Hilbert Spaces
    DOI 10.1080/01630563.2016.1144070
    Typ Journal Article
    Autor Albani V
    Journal Numerical Functional Analysis and Optimization
    Seiten 521-540
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Computational Realization of a Non-Equidistant Grid Sampling in Photoacoustics with a Non-Uniform FFT
    DOI 10.48550/arxiv.1501.02946
    Typ Preprint
    Autor Schmid J
  • 2015
    Titel Non-Equispaced Grid Sampling in Photoacoustics with a Non-Uniform FFT
    DOI 10.48550/arxiv.1510.01078
    Typ Preprint
    Autor Schmid J
  • 2015
    Titel A Direct Method for Photoacoustic Tomography with Inhomogeneous Sound Speed
    DOI 10.48550/arxiv.1507.01741
    Typ Preprint
    Autor Belhachmi Z
  • 2015
    Titel Inverse boundary value problem for the Helmholtz equation: quantitative conditional Lipschitz stability estimates
    DOI 10.48550/arxiv.1510.02366
    Typ Preprint
    Autor Beretta E
  • 2015
    Titel Photoacoustic Tomography With Spatially Varying Compressibility and Density
    DOI 10.48550/arxiv.1512.07411
    Typ Preprint
    Autor Belhachmi Z
  • 2015
    Titel Texture generation in compressional photoacoustic elastography
    DOI 10.1117/12.2079672
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Schmid J
  • 2017
    Titel Combined multimodal photoacoustic tomography, optical coherence tomography (OCT) and OCT based angiography system for in vivo imaging of multiple skin disorders in human(Conference Presentation)
    DOI 10.1117/12.2253002
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Liu M
  • 2017
    Titel Nonlinear Flows for Displacement Correction and Applications in Tomography
    DOI 10.1007/978-3-319-58771-4_23
    Typ Book Chapter
    Autor Dong G
    Verlag Springer Nature
    Seiten 283-294
  • 2017
    Titel Singular values of the attenuated photoacoustic imaging operator
    DOI 10.1016/j.jde.2017.06.018
    Typ Journal Article
    Autor Elbau P
    Journal Journal of Differential Equations
    Seiten 5330-5376
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Convergence rates for regularization functionals with polyconvex integrands
    DOI 10.1088/1361-6420/aa7a1e
    Typ Journal Article
    Autor Kirisits C
    Journal Inverse Problems
    Seiten 085008
    Link Publikation
  • 2017
    Titel The inverse scattering problem for orthotropic media in polarization-sensitive optical coherence tomography.
    Typ Journal Article
    Autor Elbau P
  • 2017
    Titel Surface pH changes suggest a role for H+/OH- channels in salinity response of Chara australis
    DOI 10.1007/s00709-017-1191-z
    Typ Journal Article
    Autor Absolonova M
    Journal Protoplasma
    Seiten 851-862
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Non-invasive multimodal optical coherence and photoacoustic tomography for human skin imaging
    DOI 10.1038/s41598-017-18331-9
    Typ Journal Article
    Autor Chen Z
    Journal Scientific Reports
    Seiten 17975
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Quantitative Photoacoustic Imaging in the Acoustic Regime using SPIM
    DOI 10.48550/arxiv.1706.01818
    Typ Preprint
    Autor Beigl A
  • 2017
    Titel Lamé Parameter Estimation from Static Displacement Field Measurements in the Framework of Nonlinear Inverse Problems
    DOI 10.48550/arxiv.1710.10446
    Typ Preprint
    Autor Hubmer S
  • 2017
    Titel A note on convergence of solutions of total variation regularized linear inverse problems
    DOI 10.48550/arxiv.1711.06495
    Typ Preprint
    Autor Iglesias J
  • 2015
    Titel On the $X$-ray transform of planar symmetric 2-tensors
    DOI 10.48550/arxiv.1503.04322
    Typ Preprint
    Autor Sadiq K
  • 2015
    Titel Modelling the Effect of Focusing Detectors in Photoacoustic Sectional Imaging
    DOI 10.1137/120882962
    Typ Journal Article
    Autor Elbau P
    Journal SIAM Journal on Imaging Sciences
    Seiten 1-18
  • 2015
    Titel Texture Generation for Photoacoustic Elastography
    DOI 10.1007/s10851-015-0561-4
    Typ Journal Article
    Autor Glatz T
    Journal Journal of Mathematical Imaging and Vision
    Seiten 369-384
  • 2015
    Titel Tomography, Photoacoustic, and Thermoacoustic
    DOI 10.1007/978-3-540-70529-1_47
    Typ Book Chapter
    Autor Kuchment P
    Verlag Springer Nature
    Seiten 1488-1496
  • 2015
    Titel RADAR Imaging - A Mathematical Perspective.
    Typ Journal Article
    Autor Elbau P
    Journal Schriftenreihe zur Didaktik der Mathematik der Österreichischen Mathematischen Gesellschaft
  • 2017
    Titel Quantitative reconstructions in multi-modal photoacoustic and optical coherence tomography imaging
    DOI 10.1088/1361-6420/aa9ae7
    Typ Journal Article
    Autor Elbau P
    Journal Inverse Problems
    Seiten 014006
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Reconstruction formulas for photoacoustic imaging in attenuating media
    DOI 10.1088/1361-6420/aa9ade
    Typ Journal Article
    Autor Scherzer O
    Journal Inverse Problems
    Seiten 015006
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Complete Cutaneous Vasculature Imaging and Its Clinical Translation Using Multimodal Photoacoustic and Optical Coherence Tomography Angiography
    DOI 10.1364/cleo_at.2017.jth4a.2
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Liu M
  • 2018
    Titel A note on convergence of solutions of total variation regularized linear inverse problems
    DOI 10.1088/1361-6420/aab92a
    Typ Journal Article
    Autor Iglesias J
    Journal Inverse Problems
    Seiten 055011
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Quantitative photoacoustic imaging in the acoustic regime using SPIM
    DOI 10.1088/1361-6420/aab584
    Typ Journal Article
    Autor Beigl A
    Journal Inverse Problems
    Seiten 054003
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Lamé Parameter Estimation from Static Displacement Field Measurements in the Framework of Nonlinear Inverse Problems
    DOI 10.1137/17m1154461
    Typ Journal Article
    Autor Hubmer S
    Journal SIAM Journal on Imaging Sciences
    Seiten 1268-1293
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Automatic skin lesion area determination of basal cell carcinoma using optical coherence tomography angiography and a skeletonization approach: Preliminary results
    DOI 10.1002/jbio.201900131
    Typ Journal Article
    Autor Meiburger K
    Journal Journal of Biophotonics
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Texture Generation for Photoacoustic Elastography
    DOI 10.48550/arxiv.1407.6982
    Typ Preprint
    Autor Glatz T
  • 2015
    Titel A variational method for quantitative photoacoustic tomography with piecewise constant coefficients
    DOI 10.48550/arxiv.1509.04982
    Typ Preprint
    Autor Beretta E
  • 2015
    Titel Taylor Series Methods
    DOI 10.1007/978-3-540-70529-1_153
    Typ Book Chapter
    Autor Barrio R
    Verlag Springer Nature
    Seiten 1465-1470

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