Interdisziplinäre gekoppelte Physik Bildgebung
Interdisciplinary Coupled Physic Imaging
Wissenschaftsdisziplinen
Mathematik (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)
Keywords
-
Couple Physics Imaging,
Optical Coherence Tomography,
Mathematical Modeling,
Photoacoustic Imaging
Dieses Projekt ist ein Nachfolgeprojekt des auslaufenden nationalen Forschungsnetzwerkes (NFN) Photoakustische Bildgebung in der Biologie und Medizin, (http://www.csc.univie.ac.at/pai/), welches im März 2014 enden wird. Dieses neue Projekt ist wiederum interdisziplinär aufgestellt, behandelt aber nun den erweiterten Themenbereich der gekoppelten Physik Bildgebung (CPI). Wiederum sind ForscherInnen aus den Bereichen Angewandte Mathematik, Biologie und der Medizinischen Physik am Projekt beteiligt. Diese Forschungsgruppen haben bereits am NFN erfolgreich zusammengearbeitet. Durch die Zusammensetzung der Forschungsgruppen können wir fundamentale Forschungsfragen des CPI, die sich zum Beispiel durch die Kombination von OCT, Photoakustik und der Elastographie ergeben, erfolgreich untersuchen. Es ist eine Tatsache, dass den meisten CPI-Experimenten ein sehr einfaches mathematisches Modell zugrunde gelegt wird. Diese vereinfachten Modellannahmen beschränken die Auflösung und den Kontrast der Bildgebung. Im Projekt zeigen wir, dass sich komplizierte mathematische Modelle experimentell und computertechnisch realisieren lassen, und sich dadurch die Imaging Qualität verbessern und die Aufnahmezeit verringern lässt. Außerdem werden wir bisher unzugängliche Parameter rekonstruieren. Wir zeigen, dass mathematische Modellbildung oft kontraintuitive Aussagen zu ingenieurmäßigen Ansätzen liefert, wie man etwa bei der mathematischen Modellbildung von fokussierenden Detektoren sieht.
Diese interdisziplinäre Projekt zwischen dem Computational Science Centers der Universität Wien und dem Zentrum für Medizinische Physik und Biomedizinischem Engineering der Medizinischen Universität Wien beschäftigt sich mit den Möglichkeiten von Optischer Koherenz Tomographie (OCT) und Photoakustischer Tomographie (PAT) für die Analyse von mikroskopischen Daten.Schwerpunkt der Forschungen lag auf der quantitativen Analyse und dem kombinierten Einsatz der beiden Modalitäten.Schon zu Beginn des Projektes stand uns ein multi-modales Meßinstrument, welches OCT und PAT parallel durchführen kann, zur Verfügung. Zu Beginn des Projektes war es sogar international exklusiv in Wien verfügbar, was uns einen enormen wissenschaftlichen Vorteil für theoretisch mathematische und medizinische Forschungen verschaffte. Inzwischen konnte die Meßanordnung soweit transportabel gemacht werden, dass multi-modale medizinische Untersuchungen an Patienten (zum Beispiel an der Haut) durchgeführt werden können.Im Laufe des Projektes wurde eine Anzahl von Möglichkeiten entwickelt um quantitative Werte von physikalischen Parametern (wie etwa Schallgeschwindigkeit oder Kompressibilität) des zu untersuchenden Gewebes mit diesen beiden Modalitäten zu visualisieren. Mit den Modalitäten im Einzelbetrieb können diese physikalischen Parameter nicht visualisiert werden, und sie sind damit einer medizinischen Diagnose nicht zugänglich. Unter allen entwickelten quantitativen Ansätzen hat sich die multi-modale quantitive Elastographie als vielversprechend für medizinische Anwendungen herausgestellt. Dabei wird basierend auf einer Analyse der visualisierten induzierten Verschiebungen (berechnet mit Hilfe des optischen Flusses) im zu analysierenden Medium eine quantitative Analyse der physikalischen Parameter des Gewebes, wie etwa der Steifigkeit, mit Methoden der Inversen Probleme durchgeführt. Zu diesem Zweck sind unbedingt Aufnahmen mehrerer sich komplementierende Modalitäten notwendig und die Auswertung der Daten erfordert diffizile Methoden des Computer Visions und der numerischen Inversen Probleme. Erste praktische Versuche mit elastischen und visko-elastischen Testmaterialen (zb. mit Agarose und Silikon) für quantitative multi-modale Elastographie haben sich als sehr vielversprechend erwiesen.
- Wolfgang Drexler, Medizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Otmar Scherzer, Österreichische Akademie der Wissenschaften , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Maitine Bergounioux, Université d´Orléans - Frankreich
- Habib Ammari, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich - Schweiz
- John C. Schotland, Yale University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Paul Beard, University College London - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 471 Zitationen
- 50 Publikationen
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2016
Titel Singular Values of the Attenuated Photoacoustic Imaging Operator DOI 10.48550/arxiv.1611.05807 Typ Preprint Autor Elbau P -
2016
Titel Articulated dual modality photoacoustic and optical coherence tomography probe for preclinical and clinical imaging (Conference Presentation) DOI 10.1117/12.2212577 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Liu M Seiten 970817-970817-1 -
2016
Titel Inverse Problems of Combined Photoacoustic and Optical Coherence Tomography DOI 10.48550/arxiv.1601.03320 Typ Preprint Autor Elbau P -
2016
Titel 6. A variational method for quantitative photoacoustic tomography with piecewise constant coefficients DOI 10.1515/9783110430394-006 Typ Book Chapter Autor Beretta E Verlag De Gruyter Seiten 202-224 Link Publikation -
2016
Titel Photoacoustic tomography with spatially varying compressibility and density DOI 10.1515/jiip-2015-0113 Typ Journal Article Autor Belhachmi Z Journal Journal of Inverse and Ill-posed Problems Seiten 119-133 Link Publikation -
2016
Titel Combined multi-modal photoacoustic tomography, optical coherence tomography (OCT) and OCT angiography system with an articulated probe for in vivo human skin structure and vasculature imaging. DOI 10.1364/boe.7.003390 Typ Journal Article Autor Liu M Journal Biomedical optics express Seiten 3390-3402 Link Publikation -
2017
Titel Reconstruction formulas for Photoacoustic Imaging in Attenuating Media DOI 10.48550/arxiv.1705.07466 Typ Preprint Autor Scherzer O -
2017
Titel The inverse scattering problem for orthotropic media in polarization-sensitive optical coherence tomography DOI 10.1007/s13137-017-0102-y Typ Journal Article Autor Elbau P Journal GEM - International Journal on Geomathematics Seiten 145-165 Link Publikation -
2017
Titel Quantitative reconstructions in multi-modal photoacoustic and optical coherence tomography imaging DOI 10.48550/arxiv.1709.00207 Typ Preprint Autor Elbau P -
2017
Titel The inverse scattering problem for orthotropic media in Polarization-sensitive Optical Coherence Tomography DOI 10.48550/arxiv.1705.08373 Typ Preprint Autor Elbau P -
2016
Titel Phase-stable swept source OCT angiography in human skin using an akinetic source DOI 10.1364/boe.7.003032 Typ Journal Article Autor Chen Z Journal Biomedical Optics Express Seiten 3032-3048 Link Publikation -
2016
Titel A direct method for photoacoustic tomography with inhomogeneous sound speed DOI 10.1088/0266-5611/32/4/045005 Typ Journal Article Autor Belhachmi Z Journal Inverse Problems Seiten 045005 Link Publikation -
2016
Titel On the X-ray transform of planar symmetric 2-tensors DOI 10.1016/j.jmaa.2016.04.018 Typ Journal Article Autor Sadiq K Journal Journal of Mathematical Analysis and Applications Seiten 31-49 Link Publikation -
2016
Titel Nonequispaced grid sampling in photoacoustics with a nonuniform fast Fourier transform DOI 10.1117/1.jbo.21.1.015005 Typ Journal Article Autor Schmid J Journal Journal of Biomedical Optics Seiten 015005-015005 Link Publikation -
2016
Titel Comprehensive vascular imaging using optical coherence tomography-based angiography and photoacoustic tomography DOI 10.1117/1.jbo.21.9.096011 Typ Journal Article Autor Zabihian B Journal Journal of Biomedical Optics Seiten 096011-096011 Link Publikation -
2016
Titel Inverse problems of combined photoacoustic and optical coherence tomography DOI 10.1002/mma.3915 Typ Journal Article Autor Elbau P Journal Mathematical Methods in the Applied Sciences Seiten 505-522 Link Publikation -
2016
Titel Inverse Boundary Value Problem For The Helmholtz Equation: Quantitative Conditional Lipschitz Stability Estimates DOI 10.1137/15m1043856 Typ Journal Article Autor Beretta E Journal SIAM Journal on Mathematical Analysis Seiten 3962-3983 Link Publikation -
2016
Titel Convergence rates for regularization functionals with polyconvex integrands DOI 10.48550/arxiv.1612.06724 Typ Preprint Autor Kirisits C -
2016
Titel Optimal Convergence Rates Results for Linear Inverse Problems in Hilbert Spaces DOI 10.1080/01630563.2016.1144070 Typ Journal Article Autor Albani V Journal Numerical Functional Analysis and Optimization Seiten 521-540 Link Publikation -
2015
Titel Computational Realization of a Non-Equidistant Grid Sampling in Photoacoustics with a Non-Uniform FFT DOI 10.48550/arxiv.1501.02946 Typ Preprint Autor Schmid J -
2015
Titel Non-Equispaced Grid Sampling in Photoacoustics with a Non-Uniform FFT DOI 10.48550/arxiv.1510.01078 Typ Preprint Autor Schmid J -
2015
Titel A Direct Method for Photoacoustic Tomography with Inhomogeneous Sound Speed DOI 10.48550/arxiv.1507.01741 Typ Preprint Autor Belhachmi Z -
2015
Titel Inverse boundary value problem for the Helmholtz equation: quantitative conditional Lipschitz stability estimates DOI 10.48550/arxiv.1510.02366 Typ Preprint Autor Beretta E -
2015
Titel Photoacoustic Tomography With Spatially Varying Compressibility and Density DOI 10.48550/arxiv.1512.07411 Typ Preprint Autor Belhachmi Z -
2015
Titel Texture generation in compressional photoacoustic elastography DOI 10.1117/12.2079672 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Schmid J -
2017
Titel Combined multimodal photoacoustic tomography, optical coherence tomography (OCT) and OCT based angiography system for in vivo imaging of multiple skin disorders in human(Conference Presentation) DOI 10.1117/12.2253002 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Liu M -
2017
Titel Nonlinear Flows for Displacement Correction and Applications in Tomography DOI 10.1007/978-3-319-58771-4_23 Typ Book Chapter Autor Dong G Verlag Springer Nature Seiten 283-294 -
2017
Titel Singular values of the attenuated photoacoustic imaging operator DOI 10.1016/j.jde.2017.06.018 Typ Journal Article Autor Elbau P Journal Journal of Differential Equations Seiten 5330-5376 Link Publikation -
2017
Titel Convergence rates for regularization functionals with polyconvex integrands DOI 10.1088/1361-6420/aa7a1e Typ Journal Article Autor Kirisits C Journal Inverse Problems Seiten 085008 Link Publikation -
2017
Titel The inverse scattering problem for orthotropic media in polarization-sensitive optical coherence tomography. Typ Journal Article Autor Elbau P -
2017
Titel Surface pH changes suggest a role for H+/OH- channels in salinity response of Chara australis DOI 10.1007/s00709-017-1191-z Typ Journal Article Autor Absolonova M Journal Protoplasma Seiten 851-862 Link Publikation -
2017
Titel Non-invasive multimodal optical coherence and photoacoustic tomography for human skin imaging DOI 10.1038/s41598-017-18331-9 Typ Journal Article Autor Chen Z Journal Scientific Reports Seiten 17975 Link Publikation -
2017
Titel Quantitative Photoacoustic Imaging in the Acoustic Regime using SPIM DOI 10.48550/arxiv.1706.01818 Typ Preprint Autor Beigl A -
2017
Titel Lamé Parameter Estimation from Static Displacement Field Measurements in the Framework of Nonlinear Inverse Problems DOI 10.48550/arxiv.1710.10446 Typ Preprint Autor Hubmer S -
2017
Titel A note on convergence of solutions of total variation regularized linear inverse problems DOI 10.48550/arxiv.1711.06495 Typ Preprint Autor Iglesias J -
2015
Titel On the $X$-ray transform of planar symmetric 2-tensors DOI 10.48550/arxiv.1503.04322 Typ Preprint Autor Sadiq K -
2015
Titel Modelling the Effect of Focusing Detectors in Photoacoustic Sectional Imaging DOI 10.1137/120882962 Typ Journal Article Autor Elbau P Journal SIAM Journal on Imaging Sciences Seiten 1-18 -
2015
Titel Texture Generation for Photoacoustic Elastography DOI 10.1007/s10851-015-0561-4 Typ Journal Article Autor Glatz T Journal Journal of Mathematical Imaging and Vision Seiten 369-384 -
2015
Titel Tomography, Photoacoustic, and Thermoacoustic DOI 10.1007/978-3-540-70529-1_47 Typ Book Chapter Autor Kuchment P Verlag Springer Nature Seiten 1488-1496 -
2015
Titel RADAR Imaging - A Mathematical Perspective. Typ Journal Article Autor Elbau P Journal Schriftenreihe zur Didaktik der Mathematik der Österreichischen Mathematischen Gesellschaft -
2017
Titel Quantitative reconstructions in multi-modal photoacoustic and optical coherence tomography imaging DOI 10.1088/1361-6420/aa9ae7 Typ Journal Article Autor Elbau P Journal Inverse Problems Seiten 014006 Link Publikation -
2017
Titel Reconstruction formulas for photoacoustic imaging in attenuating media DOI 10.1088/1361-6420/aa9ade Typ Journal Article Autor Scherzer O Journal Inverse Problems Seiten 015006 Link Publikation -
2017
Titel Complete Cutaneous Vasculature Imaging and Its Clinical Translation Using Multimodal Photoacoustic and Optical Coherence Tomography Angiography DOI 10.1364/cleo_at.2017.jth4a.2 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Liu M -
2018
Titel A note on convergence of solutions of total variation regularized linear inverse problems DOI 10.1088/1361-6420/aab92a Typ Journal Article Autor Iglesias J Journal Inverse Problems Seiten 055011 Link Publikation -
2018
Titel Quantitative photoacoustic imaging in the acoustic regime using SPIM DOI 10.1088/1361-6420/aab584 Typ Journal Article Autor Beigl A Journal Inverse Problems Seiten 054003 Link Publikation -
2018
Titel Lamé Parameter Estimation from Static Displacement Field Measurements in the Framework of Nonlinear Inverse Problems DOI 10.1137/17m1154461 Typ Journal Article Autor Hubmer S Journal SIAM Journal on Imaging Sciences Seiten 1268-1293 Link Publikation -
2019
Titel Automatic skin lesion area determination of basal cell carcinoma using optical coherence tomography angiography and a skeletonization approach: Preliminary results DOI 10.1002/jbio.201900131 Typ Journal Article Autor Meiburger K Journal Journal of Biophotonics Link Publikation -
2014
Titel Texture Generation for Photoacoustic Elastography DOI 10.48550/arxiv.1407.6982 Typ Preprint Autor Glatz T -
2015
Titel A variational method for quantitative photoacoustic tomography with piecewise constant coefficients DOI 10.48550/arxiv.1509.04982 Typ Preprint Autor Beretta E -
2015
Titel Taylor Series Methods DOI 10.1007/978-3-540-70529-1_153 Typ Book Chapter Autor Barrio R Verlag Springer Nature Seiten 1465-1470