3D Spektroskopiebildgebung mit ultrakurzem Akquisitionsdelay
Ultra-short acquisition delay 3D Spectroscopic Imaging
Wissenschaftsdisziplinen
Klinische Medizin (50%); Medizintechnik (50%)
Keywords
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Ultra-High Magnetic Field,
Magnetic Resonance Spectroscopy,
Brain
Protonen Magnetresonanz-Spektroskopiebildgebung (MRSI) erlaubt die nicht-invasive Darstellung von lokalen Veränderungen in der Neurochemie des Gehirns, welche vielen Hirnerkrankungen zugrunde liegt. Unser Ziel ist es eine verbesserte MRSI Methode für die Ganzhirn-Darstellung einer umfassenden Zahl an chemischen Substanzen zu entwickeln. Herkömmliche MRSI Methoden teilen mehrere methodische Limitationen, welche folgende inkludieren: (a) niedrige räumliche Auflösung; (b) eingeschränkte Hirnabdeckung; (c) Fehleranfälligkeit; (d) Probleem mit der Lokalisierungsgenauigkeit; (e) Quantifizierung eingeschränkt auf wenige neurochemische Substanzen. Um dieMRSIinein wirkungsvolles klinisches/neurowissenschaftliches Bildgebungswerkzeug zu verwandeln, müssen diese Limitationen überwunden werden. Eine robuste Ganzhirn-MRSI muss eine akkurate Darstellung eines umfassenden neurochemischen Profils mit hoher räumlicher Auflösung liefern. Eine derartige MR Bildgebungsmethode wäre ein wertvolles Werkzeug sowohl für klinische aus auch neurowissenscahftliche Untersuchungen verschiedenster Erkrankungen wie etwa Multiple Sclerose, Tumore, oder neurogenerative Erkrankungen. Wir vermuten, dass: (a) Methoden, die die Datenerfassung beschleunigen so kombiniert werden können, dass sie hochaufgelöste Ganzhirn-MRSI innerhalb klinisch sinnvoller Messzeiten erlaubt; (b) Echtzeit Fehlerkorrektur wird eine robuste MRSI Aufnahme mit reproduzierbaren Resultaten für klinische/neurowissenschaftliche Anwendungen erlauben; (c) die bildhafte Darstellung einer größeren Zahl an neurochemischen Substanzen wird das Verständnis für komplexeneurochemische Veränderungen verbessern, welcheden wichtigsten Hirnerkrankungen zugrunde liegen. Bisher hat nur eine einzige Forschungsgruppe eine MRSI-Methodik für Ganzhirn- Abdeckung etabliert, jedoch lediglich für niedrige Feldstärken und unter der Verwendung von Methoden, die wenig sensitiv sind für die meisten chemischen Substanzen. Es existiert bisher aufgrund technischer Limitationen keine Implementierung für höhere Feldstärken. Basierend auf unserer bisherigen Methodenentwicklung, werden wir eine Ganzhirn- MRSI Technik entwickeln, welche: (a) auch bei Ultrahochfeld verwendet warden kann; (b) die bildhafte Darstellung mehrerer chemischer Substanzen erlaubt; (c) wesentlich sensitiver sein wird als bisherige Methoden; (d) höhere räumliche Auflösungen erlauben wird; und (e) robuster sein wird als bisherige Methoden. Die erfolgreiche Abschliessung des Projekts wird deshalb die Entwicklung einer neuen inherent multi-parametrischen Neurobildgebungstechnik ermöglichen, welche ein potentes Werkzeug für sowohl klinische als auch neurowissenschafltiche Untersuchungen sein wird.
In diesem Projekt haben wir ein Bildgebungsverfahren für das gesamte Gehirn entwickelt, das in der Lage ist, die Konzentrationen mehrerer biochemischer Substanzen im menschlichen Gehirn in klinisch attraktiven Messzeiten abzubilden. Dies hat ein hohes Potenzial für eine Reihe klinischer Anwendungen, da lokale oder weitreichende Veränderungen in der Biochemie des Gehirns allgegenwärtig und bei vielen schweren Hirnerkrankungen wichtig sind. Die erfassten Rohdaten sind jedoch enorm und folglich sind die Verarbeitungszeiten, um diese Rohdaten in Konzentrationskarten umzuwandeln, immer noch sehr lang, was derzeit die Verwendung dieser Techniken für den routinemäßigen Gebrauch einschränkt. Dennoch haben wir erste klinische Untersuchungen in einer Kohorte von Patienten mit Hirntumoren und Multipler Sklerose mit vielversprechenden Ergebnissen durchgeführt. In Folgestudien werden wir uns auf eine bessere Integration dieser neuen neurochemischen Bildgebungsverfahren auf den Magnetresonanztomographen und eine verbesserte Robustheit konzentrieren, um eine benutzerfreundliche Anwendung in einer klinischen Umgebung zu ermöglichen.
Research Output
- 1528 Zitationen
- 46 Publikationen
- 6 Datasets & Models
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2024
Titel A Flow-based Truncated Denoising Diffusion Model for super-resolution Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging DOI 10.1016/j.media.2024.103358 Typ Journal Article Autor Dong S Journal Medical Image Analysis Seiten 103358 Link Publikation -
2019
Titel The influence of spatial resolution on the spectral quality and quantification accuracy of whole-brain MRSI at 1.5T, 3T, 7T, and 9.4T DOI 10.1002/mrm.27746 Typ Journal Article Autor Motyka S Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 551-565 Link Publikation -
2019
Titel 7 T Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging in Multiple Sclerosis DOI 10.1097/rli.0000000000000531 Typ Journal Article Autor Heckova E Journal Investigative Radiology Link Publikation -
2019
Titel Accelerated Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging at 7 Tesla via Concentric Ring Trajectories for Mapping of Brain Metabolites Typ PhD Thesis Autor Lukas Hingerl -
2023
Titel The influence of season on glutamate and GABA levels in the healthy human brain investigated by magnetic resonance spectroscopy imaging DOI 10.1002/hbm.26236 Typ Journal Article Autor Spurny-Dworak B Journal Human Brain Mapping Seiten 2654-2663 Link Publikation -
2023
Titel 1H magnetic resonance spectroscopic imaging of deuterated glucose and of neurotransmitter metabolism at 7 T in the human brain DOI 10.1038/s41551-023-01035-z Typ Journal Article Autor Bednarik P Journal Nature Biomedical Engineering Seiten 1001-1013 Link Publikation -
2018
Titel Super-Resolution 1H Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging utilizing Deep Learning DOI 10.48550/arxiv.1802.07909 Typ Preprint Autor Iqbal Z -
2022
Titel 7T HR FID-MRSI Compared to Amino Acid PET: Glutamine and Glycine as Promising Biomarkers in Brain Tumors DOI 10.3390/cancers14092163 Typ Journal Article Autor Hangel G Journal Cancers Seiten 2163 Link Publikation -
2022
Titel Extensive Brain Pathologic Alterations Detected with 7.0-T MR Spectroscopic Imaging Associated with Disability in Multiple Sclerosis DOI 10.1148/radiol.210614 Typ Journal Article Autor Heckova E Journal Radiology Seiten 141-150 -
2022
Titel The impact of theta-burst stimulation on cortical GABA and glutamate in treatment-resistant depression: A surface-based MRSI analysis approach DOI 10.1101/2022.02.17.22271118 Typ Preprint Autor Spurny-Dworak B Seiten 2022.02.17.22271118 Link Publikation -
2022
Titel The Impact of Theta-Burst Stimulation on Cortical GABA and Glutamate in Treatment-Resistant Depression: A Surface-Based MRSI Analysis Approach DOI 10.3389/fnmol.2022.913274 Typ Journal Article Autor Spurny-Dworak B Journal Frontiers in Molecular Neuroscience Seiten 913274 Link Publikation -
2020
Titel Terminology and concepts for the characterization of in vivo MR spectroscopy methods and MR spectra: Background and experts' consensus recommendations DOI 10.1002/nbm.4347 Typ Journal Article Autor Kreis R Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2020
Titel Spectral editing in 1H magnetic resonance spectroscopy: Experts' consensus recommendations DOI 10.1002/nbm.4411 Typ Journal Article Autor Choi I Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2020
Titel Effect of Ketamine on Limbic GABA and Glutamate: A Human In Vivo Multivoxel Magnetic Resonance Spectroscopy Study DOI 10.3389/fpsyt.2020.549903 Typ Journal Article Autor Silberbauer L Journal Frontiers in Psychiatry Seiten 549903 Link Publikation -
2020
Titel High-resolution metabolic imaging of high-grade gliomas using 7T-CRT-FID-MRSI DOI 10.1016/j.nicl.2020.102433 Typ Journal Article Autor Hangel G Journal NeuroImage: Clinical Seiten 102433 Link Publikation -
2020
Titel Motion correction methods for MRS: experts' consensus recommendations DOI 10.1002/nbm.4364 Typ Journal Article Autor Andronesi O Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2020
Titel Contribution of macromolecules to brain 1H MR spectra: Experts' consensus recommendations DOI 10.1002/nbm.4393 Typ Journal Article Autor Cudalbu C Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2020
Titel Editorial for “Whole-Slab 3D MR Spectroscopic Imaging of the Human Brain With Spiral-Out-In Sampling at 7T” DOI 10.1002/jmri.27443 Typ Journal Article Autor Lee D Journal Journal of Magnetic Resonance Imaging Seiten 1251-1252 -
2020
Titel Whole-Slab 3D MR Spectroscopic Imaging of the Human Brain With Spiral-Out-In Sampling at 7T DOI 10.1002/jmri.27437 Typ Journal Article Autor Esmaeili M Journal Journal of Magnetic Resonance Imaging Seiten 1237-1250 Link Publikation -
2022
Titel Flow-based Visual Quality Enhancer for Super-resolution Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging DOI 10.48550/arxiv.2207.10181 Typ Preprint Autor Dong S -
2022
Titel Flow-Based Visual Quality Enhancer for Super-Resolution Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging DOI 10.1007/978-3-031-18576-2_1 Typ Book Chapter Autor Dong S Verlag Springer Nature Seiten 3-13 -
2022
Titel Lesion-Specific Metabolic Alterations in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis Via 7 T Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging DOI 10.1097/rli.0000000000000913 Typ Journal Article Autor Lipka A Journal Investigative Radiology Seiten 156-165 Link Publikation -
2019
Titel Ultra-high eld MR spectroscopic imaging for clinical applications in neurodegenerative disorders Typ PhD Thesis Autor Eva Heckova -
2019
Titel Effects of different macromolecular models on reproducibility of FID-MRSI at 7T DOI 10.1002/mrm.27922 Typ Journal Article Autor Heckova E Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 12-21 Link Publikation -
2019
Titel Clinical High-Resolution 3D-MR Spectroscopic Imaging of the Human Brain at 7 T. DOI 10.1097/rli.0000000000000626 Typ Journal Article Autor Hingerl L Journal Investigative radiology Seiten 239-248 -
2019
Titel Super-Resolution 1H Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging Utilizing Deep Learning DOI 10.3389/fonc.2019.01010 Typ Journal Article Autor Iqbal Z Journal Frontiers in Oncology Seiten 1010 Link Publikation -
2019
Titel Intra-session and inter-subject variability of 3D-FID-MRSI using single-echo volumetric EPI navigators at 3T DOI 10.1002/mrm.28076 Typ Journal Article Autor Moser P Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 1920-1929 Link Publikation -
2019
Titel Non-Cartesian GRAPPA and coil combination using interleaved calibration data – application to concentric-ring MRSI of the human brain at 7T DOI 10.1002/mrm.27822 Typ Journal Article Autor Moser P Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 1587-1603 Link Publikation -
2021
Titel Inter-subject stability and regional concentration estimates of 3D-FID-MRSI in the human brain at 7 T DOI 10.1002/nbm.4596 Typ Journal Article Autor Hangel G Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2021
Titel k-Space-based coil combination via geometric deep learning for reconstruction of non-Cartesian MRSI data DOI 10.1002/mrm.28876 Typ Journal Article Autor Motyka S Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 2353-2367 -
2021
Titel Effects of SSRI treatment on GABA and glutamate levels in an associative relearning paradigm DOI 10.1016/j.neuroimage.2021.117913 Typ Journal Article Autor Spurny B Journal NeuroImage Seiten 117913 Link Publikation -
2018
Titel Whole-slice mapping of GABA and GABA+ at 7T via adiabatic MEGA-editing, real-time instability correction, and concentric circle readout DOI 10.1016/j.neuroimage.2018.09.039 Typ Journal Article Autor Moser P Journal NeuroImage Seiten 475-489 Link Publikation -
2024
Titel Terminology and concepts for the characterization of in vivo MR spectroscopy methods and MR spectra: Background and experts' consensus recommendations. DOI 10.7892/boris.146096 Typ Journal Article Autor Boer Link Publikation -
2024
Titel Minimum Reporting Standards for in vivo Magnetic Resonance Spectroscopy (MRSinMRS): Experts' consensus recommendations DOI 10.48350/152082 Typ Journal Article Autor Andronesi Link Publikation -
2022
Titel Improving Magnetic Resonance Spectroscopy Imaging during Acquisitions and Post-processing via Deep Learning Typ PhD Thesis Autor Stanislav Motyka -
2022
Titel Deuterium labeling enables non-invasive 3D proton MR imaging of glucose and neurotransmitter metabolism in the human brain DOI 10.58530/2022/0630 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Bednarik P Link Publikation -
2021
Titel Minimum Reporting Standards for in vivo Magnetic Resonance Spectroscopy (MRSinMRS): Experts' consensus recommendations DOI 10.1002/nbm.4484 Typ Journal Article Autor Lin A Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2023
Titel Metabolic Insights into Iron Deposition in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis via 7 T Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging DOI 10.1016/j.nicl.2023.103524 Typ Journal Article Autor Lipka A Journal NeuroImage: Clinical Seiten 103524 Link Publikation -
2021
Titel Deuterium labeling enables non-invasive 3D proton MR imaging of glucose and neurotransmitter metabolism in the human brain DOI 10.21203/rs.3.rs-1027370/v1 Typ Preprint Autor Bednarik P Link Publikation -
2021
Titel 3D localized lactate detection in muscle tissue using double-quantum filtered 1H MRS with adiabatic refocusing pulses at 7 T DOI 10.1002/mrm.29061 Typ Journal Article Autor Niess F Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 1174-1183 Link Publikation -
2021
Titel Emerging methods and applications of ultra-high field MR spectroscopic imaging in the human brain DOI 10.1016/j.ab.2021.114479 Typ Journal Article Autor Hangel G Journal Analytical Biochemistry Seiten 114479 Link Publikation -
2020
Titel Water and lipid suppression techniques for advanced 1H MRS and MRSI of the human brain: Experts' consensus recommendations DOI 10.1002/nbm.4459 Typ Journal Article Autor Tkác I Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2020
Titel Advanced magnetic resonance spectroscopic neuroimaging: Experts' consensus recommendations DOI 10.1002/nbm.4309 Typ Journal Article Autor Maudsley A Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2020
Titel Accelerated MR spectroscopic imaging—a review of current and emerging techniques DOI 10.1002/nbm.4314 Typ Journal Article Autor Bogner W Journal NMR in Biomedicine Link Publikation -
2019
Titel High-resolution metabolic mapping of gliomas via patch-based super-resolution magnetic resonance spectroscopic imaging at 7T DOI 10.1016/j.neuroimage.2019.02.023 Typ Journal Article Autor Hangel G Journal NeuroImage Seiten 587-595 Link Publikation -
2019
Titel Automated ROI-Based Labeling for Multi-Voxel Magnetic Resonance Spectroscopy Data Using FreeSurfer DOI 10.3389/fnmol.2019.00028 Typ Journal Article Autor Spurny B Journal Frontiers in Molecular Neuroscience Seiten 28 Link Publikation
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2020
Link
Titel Supplementary MRSI Data for "High-Resolution Metabolic Imaging of High-Grade Gliomas using 7T-CRT-FID-MRSI" - NIFTI Format DOI 10.5281/zenodo.3981029 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel Supplementary MRSI Data for "High-Resolution Metabolic Imaging of High-Grade Gliomas using 7T-CRT-FID-MRSI" - MINC Format DOI 10.5281/zenodo.3903460 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel 7T MRSI (HFMRC, MU Vienna) Example Data: Raw Spectra DOI 10.5281/zenodo.3904584 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel 7T MRSI (HFMRC, MU Vienna) Example Data: Raw Spectra DOI 10.5281/zenodo.3904583 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel Supplementary MRSI Data for "High-Resolution Metabolic Imaging of High-Grade Gliomas using 7T-CRT-FID-MRSI" - NIFTI Format FIXED DOI 10.5281/zenodo.3981030 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel Supplementary MRSI Data for "High-Resolution Metabolic Imaging of High-Grade Gliomas using 7T-CRT-FID-MRSI" - NIFTI Format FIXED DOI 10.5281/zenodo.3903459 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link