Atom-Mutationen und SI-Markierungen von RNA für NMR

Die im Projekt beschriebene Forschung zielt darauf ab, einen neuartigen Ansatz zu etablieren - die Methode der Atom-Mutagenese und des chemischen Verschiebung Fingerabdrucks - um unsichtbare Zustände von Nukleinsäuren sichtbar zu machen. Die Methode ermöglicht tiefe Einblicke in die Struktur sogenannter angeregter Zustände in RNA, die für die biologische Funktion wichtig sind. Die Forschung nutzt die stabile Isotopenmarkierung von RNA-Bausteinen, die einen Kohlenstoff/Stickstoff-Ersatz in der Nukleobase tragen. Diese Bausteine können innerhalb einer Zielnukleinsäure an der Stelle positioniert werden, an der die Konformationsdynamik auftritt. Dann kann unter Verwendung einer NMR-spektroskopischen Methode - dem Relaxationsdispersionsansatz - die Quelle der Konformationsheterogenität auf ein einzelnes Atom in einer Nukleinsäure lokalisiert werden, und anschließend kann die Funktion dieses Atoms in Prozessen wie Katalyse oder Proteinerkennung verstanden werden.

Die im Projekt beschriebene Forschung zielt darauf ab, einen neuartigen Ansatz zu etablieren - die Methode der Atom-Mutagenese und des chemischen Verschiebung Fingerabdrucks - um unsichtbare Zustände von Nukleinsäuren sichtbar zu machen. Die Methode ermöglicht tiefe Einblicke in die Struktur sogenannter angeregter Zustände in RNA, die für die biologische Funktion wichtig sind. Die Forschung nutzt die stabile Isotopenmarkierung von RNA-Bausteinen, die einen Kohlenstoff/Stickstoff-Ersatz in der Nukleobase tragen. Diese Bausteine können innerhalb einer Zielnukleinsäure an der Stelle positioniert werden, an der die Konformationsdynamik auftritt. Dann kann unter Verwendung einer NMR-spektroskopischen Methode - dem Relaxationsdispersionsansatz - die Quelle der Konformationsheterogenität auf ein einzelnes Atom in einer Nukleinsäure lokalisiert werden, und anschließend kann die Funktion dieses Atoms in Prozessen wie Katalyse oder Proteinerkennung verstanden werden.