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Krankheits-assoziierte Varianten in ARID5B

Disease-associated variants at ARID5B

Davide Seruggia (ORCID: 0000-0001-5014-0499)
  • Grant-DOI 10.55776/P36302
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.09.2023
  • Projektende 31.08.2026
  • Bewilligungssumme 398.696 €
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (25%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (75%)

Keywords

    Gene Regulation, Genomics, Cancer Biology, Pediatric Cancer

Abstract

Unser Genom besteht aus Gen-Abschnitten, die die Codes, also die Baupläne für unsere Proteine enthalten, aber auch aus nicht-kodierenden Elementen mit zum Teil noch unerforschten Funktionen. Während Mutationen in den erstgenannten Gen-Abschnitten relativ leicht zu erkennen und zu untersuchen sind, ist es viel schwieriger, die nicht-kodierenden Bereiche zu erforschen. Die Entschlüsselung der Erbinformation großer Patient:innenkohorten hat aber gezeigt, dass Veränderungen in nicht-kodierenden, sogenannten intergenischen Regionen mit Krankheiten in Verbindung gebracht werden. In diesem Projekt konzentrieren wir uns auf intergenische Mutationen des Proteins ARID5B, welche mit einem hohen Risiko für die Entwicklung von Leukämie im Kindesalter assoziiert sind. Unsere Hypothese ist, dass intergenische Mutationen zu einer Verringerung der ARID5B-Konzentration im Blut führen, und dass ein niedriger ARID5B-Spiegel das Blut anfälliger für Leukämie macht. Mittels Gentechnik werden wir die bei Patient:innen beobachteten Mutationen im Labor reproduzieren. Dann werden wir mit biochemischen Methoden untersuchen, wie das Protein ARID5B zur Entwicklung von Leukämie beiträgt. Schließlich werden wir in Mausmodellen ohne das Gen ARID5B beobachten, wie sich das Blut in Abwesenheit dieses Gens entwickelt. Diese Experimente werden es uns ermöglichen, besser zu verstehen, wie sich normales Blut und Leukämie entwickeln und wie Mutationen in nicht-kodierenden Gen-Abschnitten diese Prozesse beeinflussen können.

Forschungsstätte(n)
  • St. Anna Kinderkrebsforschung GmbH - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Luca Pinello, Harvard Medical School - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 2 Publikationen
Publikationen
  • 2025
    Titel Directing stem cell differentiation by chromatin state approximation
    DOI 10.1101/2025.04.24.650451
    Typ Preprint
    Autor Montano-Gutierrez L
    Seiten 2025.04.24.650451
    Link Publikation
  • 2024
    Titel CRISPR-CLEAR: Nucleotide-Resolution Mapping of Regulatory Elements via Allelic Readout of Tiled Base Editing
    DOI 10.1101/2024.09.09.612085
    Typ Preprint
    Autor Becerra B
    Seiten 2024.09.09.612085
    Link Publikation

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