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Regulation des RGG-vermittelten Kernimports

Regulation of RGG-mediated Nuclear Import

Tobias Madl (ORCID: 0000-0002-9725-5231)
  • Grant-DOI 10.55776/I3792
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2018
  • Projektende 28.02.2022
  • Bewilligungssumme 203.214 €

DACH: Österreich - Deutschland - Schweiz

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    NMR spectroscopy, Nuclear Import, CIRP, FUS, Transportin-1, Small-angle scattering

Abstract Endbericht

Arginin- und Glycin-reiche Motive wurden vor einigen Jahrzehnten als Schlüsselmotive in RNA-bindenden Proteinen erkannt, und als RG/RGG-Motive bezeichnet. Mehr als 1000 Proteine beinhalten diese unstrukturierten RG/RGG-Motive, und diese Proteine spielen eine essentielle Rolle in einer Vielzahl von physiologischen Prozessen, wie Transkription, prä-mRNA-Spleißen, Reparatur von DNA-Schäden, und mRNA-Translation. Kürzlich haben wir gezeigt, dass das RG/RGG-Motiv des Proteins Fused-in-Sarkoma (FUS) am Transportin-1 - vermittelten Kernimport beteiligt ist und dass Transportin-1 sowohl das bekannte Prolin-Tyrosin- Kernlokalisierungssignal (PY-NLS) als auch das RG/RGG-Motiv von FUS gleichzeitig binden kann. Arginin Methylierung des RG/RGG Motivs, in Kombination mit in ALS-Patienten (Amyotrophe Lateralsklerose) gefundenen Mutationen, verringert die Affinität von FUS für Transportin-1 und damit die Effizienz der Kernimport. Die daraus resultierenden zytosolischen Einschlüsse sind wohl das Markenzeichen der FUS-assoziierten Krankheit ALS. Trotz dieser Erkenntnisse bleiben die molekularen Details des geregelten Kerntransports von RG/RGG-Proteinen weitgehend unbekannt. In diesem Projekt wollen wir die molekularen Details des (fehl-)geregelten Kernimports der großen Klasse von RG/RGG-Proteinen durch das Studium der Interaktion und Funktion der Komplexe von FUS und CIRP (cold- inducible RNA-binding protein) mit dem Kernimportrezeptor Transportin-1 in vitro und in zellbasierten Assays untersuchen. Fehlregulation von RG/RGG-Kernimport ist ein gemeinsames Merkmal schwerer Krankheiten wie Krebs und Neurodegeneration. Daher ist detailliertes Verständnis der zugrundeliegenden molekularen Mechanismen der Schlüssel wird für die Entwicklung alternativer Strategien für die Behandlung von Krankheiten. Dieses Projekt zielt auf die Verallgemeinerung unserer jüngsten Erkenntnisse auf die gesamte Klasse der RG/RGG-haltigen Proteinen. Dies wird die Basis für die Entdeckung neuer, krankheitsassoziierter Ziele für die Behandlung einer Vielzahl von Erkrankungen mit unterschiedlichen Phänotypen, jedoch gleichen molekularen Krankheitsmechanismen (d.h. Fehlregulation des RG/RGG-vermittelten Kernimport), legen.

Arginin- und Glycin-reiche Motive wurden vor einigen Jahrzehnten als Schlüsselmotive in RNA-bindenden Proteinen erkannt, und als RG/RGG-Motive bezeichnet. Mehr als 1000 Proteine beinhalten diese unstrukturierten RG/RGG-Motive, und diese Proteine spielen eine essentielle Rolle in einer Vielzahl von physiologischen Prozessen, wie Transkription, prä-mRNA-Spleißen, Reparatur von DNA-Schäden, und mRNA-Translation. Kürzlich haben wir gezeigt, dass das RG/RGG-Motiv des Proteins Fused-in-Sarkoma (FUS) am Transportin-1 - vermittelten Kernimport beteiligt ist und dass Transportin-1 sowohl das bekannte Prolin-Tyrosin-Kernlokalisierungssignal (PY-NLS) als auch das RG/RGG-Motiv von FUS gleichzeitig binden kann. Arginin Methylierung des RG/RGG Motivs, in Kombination mit in ALS-Patienten (Amyotrophe Lateralsklerose) gefundenen Mutationen, verringert die Affinität von FUS für Transportin-1 und damit die Effizienz der Kernimport. Die daraus resultierenden zytosolischen Einschlüsse sind wohl das Markenzeichen der FUS-assoziierten Krankheit ALS. Trotz dieser Erkenntnisse bleiben die molekularen Details des geregelten Kerntransports von RG/RGG-Proteinen weitgehend unbekannt. In diesem Projekt haben wir die molekularen Details des (fehl-)geregelten Kernimports der großen Klasse von RG/RGG-Proteinen durch das Studium der Interaktion und Funktion der Komplexe von FUS und CIRP (cold-inducible RNA-binding protein) mit dem Kernimportrezeptor Transportin-1 in vitro und in zellbasierten Assays untersucht. Fehlregulation von RG/RGG-Kernimport ist ein gemeinsames Merkmal schwerer Krankheiten wie Krebs und Neurodegeneration. Daher ist detailliertes Verständnis der zugrundeliegenden molekularen Mechanismen der Schlüssel wird für die Entwicklung alternativer Strategien für die Behandlung von Krankheiten. Dieses Projekt ist ein wichtiger Beitrag für die Verallgemeinerung auf die gesamte Klasse der RG/RGG-haltigen Proteinen. Dies legt die Basis für die Entdeckung neuer, krankheitsassoziierter Ziele für die Behandlung einer Vielzahl von Erkrankungen mit unterschiedlichen Phänotypen, jedoch gleichen molekularen Krankheitsmechanismen (d.h. Fehlregulation des RG/RGG-vermittelten Kernimport).

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Michael Sattler, Technische Universität München - Deutschland

Research Output

  • 1607 Zitationen
  • 122 Publikationen
  • 1 Policies
  • 1 Methoden & Materialien
  • 7 Datasets & Models
  • 3 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2024
    Titel PROVIT-CLOCK: A Potential Influence of Probiotics and Vitamin B7 Add-On Treatment and Metabolites on Clock Gene Expression in Major Depression.
    DOI 10.1159/000538781
    Typ Journal Article
    Autor Birkl-Toeglhofer Am
    Journal Neuropsychobiology
    Seiten 135-151
  • 2024
    Titel Effects of dietary interventions and intermittent fasting on HDL function in obese individuals with T2DM: a randomized controlled trial.
    DOI 10.1186/s12933-024-02426-5
    Typ Journal Article
    Autor Obermayer A
    Journal Cardiovascular diabetology
    Seiten 339
  • 2024
    Titel MetSCORE: a molecular metric to evaluate the risk of metabolic syndrome based on serum NMR metabolomics.
    DOI 10.1186/s12933-024-02363-3
    Typ Journal Article
    Autor Conde R
    Journal Cardiovascular diabetology
    Seiten 272
  • 2024
    Titel Millifluidic magnetophoresis-based chip for age-specific fractionation: evaluating the impact of age on metabolomics and gene expression in yeast.
    DOI 10.1039/d4lc00185k
    Typ Journal Article
    Autor Eigenfeld M
    Journal Lab on a chip
    Seiten 2987-2998
  • 2024
    Titel Skeletal muscle p53-depletion uncovers a mechanism of fuel usage suppression that enables efficient energy conservation.
    DOI 10.1002/jcsm.13529
    Typ Journal Article
    Autor Garcia Carrizo F
    Journal Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
    Seiten 1772-1784
  • 2025
    Titel The disordered p53 transactivation domain is the target of FOXO4 and the senolytic compound FOXO4-DRI.
    DOI 10.1038/s41467-025-60844-9
    Typ Journal Article
    Autor Bourgeois B
    Journal Nature communications
    Seiten 5672
  • 2024
    Titel IGF2BP1 phosphorylation in the disordered linkers regulates ribonucleoprotein condensate formation and RNA metabolism.
    DOI 10.1038/s41467-024-53400-4
    Typ Journal Article
    Autor Anisimova As
    Journal Nature communications
    Seiten 9054
  • 2024
    Titel Hexokinase 1 forms rings that regulate mitochondrial fission during energy stress.
    DOI 10.1016/j.molcel.2024.06.009
    Typ Journal Article
    Autor Gottschalk B
    Journal Molecular cell
  • 2024
    Titel Loss of lysosomal acid lipase results in mitochondrial dysfunction and fiber switch in skeletal muscles of mice.
    DOI 10.1016/j.molmet.2023.101869
    Typ Journal Article
    Autor Akhmetshina A
    Journal Molecular metabolism
    Seiten 101869
  • 2024
    Titel Serum Levels of Adiponectin Are Strongly Associated with Lipoprotein Subclasses in Healthy Volunteers but Not in Patients with Metabolic Syndrome.
    DOI 10.3390/ijms25095050
    Typ Journal Article
    Autor Habisch H
    Journal International journal of molecular sciences
  • 2024
    Titel Sirtuin 3 drives sex-specific responses to age-related changes in mouse embryonic fibroblasts.
    DOI 10.1016/j.mad.2024.111996
    Typ Journal Article
    Autor Podgorski Ii
    Journal Mechanisms of ageing and development
    Seiten 111996
  • 2024
    Titel Advanced Oxidation Protein Products Are Strongly Associated with the Serum Levels and Lipid Contents of Lipoprotein Subclasses in Healthy Volunteers and Patients with Metabolic Syndrome.
    DOI 10.3390/antiox13030339
    Typ Journal Article
    Autor Hofmann L
    Journal Antioxidants (Basel, Switzerland)
  • 2024
    Titel Genetically encoded fluorescent sensor to monitor intracellular arginine methylation.
    DOI 10.1016/j.jphotobiol.2024.112867
    Typ Journal Article
    Autor Bischof H
    Journal Journal of photochemistry and photobiology. B, Biology
    Seiten 112867
  • 2024
    Titel Sex-Related Differences in the Associations between Adiponectin and Serum Lipoproteins in Healthy Subjects and Patients with Metabolic Syndrome.
    DOI 10.3390/biomedicines12091972
    Typ Journal Article
    Autor Habisch H
    Journal Biomedicines
  • 2024
    Titel Lanifibranor Reduces Inflammation and Improves Dyslipidemia in Lysosomal Acid Lipase-Deficient Mice.
    DOI 10.1016/j.gastha.2024.05.006
    Typ Journal Article
    Autor Bradić I
    Journal Gastro hep advances
    Seiten 711-723
  • 2024
    Titel Spermidine is essential for fasting-mediated autophagy and longevity.
    DOI 10.1038/s41556-024-01468-x
    Typ Journal Article
    Autor Daskalaki I
    Journal Nature cell biology
    Seiten 1571-1584
  • 2024
    Titel Interindividual differences in aronia juice tolerability linked to gut microbiome and metabolome changes-secondary analysis of a randomized placebo-controlled parallel intervention trial.
    DOI 10.1186/s40168-024-01774-4
    Typ Journal Article
    Autor Lackner S
    Journal Microbiome
    Seiten 49
  • 2024
    Titel Metabolic Reprogramming Is an Initial Step in Pancreatic Carcinogenesis That Can Be Targeted to Inhibit Acinar-to-Ductal Metaplasia
    DOI 10.1158/0008-5472.can-23-2213
    Typ Journal Article
    Autor Chen M
    Journal Cancer Research
  • 2022
    Titel Patterns of Peripheral Blood B-Cell Subtypes Are Associated With Treatment Response in Patients Treated With Immune Checkpoint Inhibitors: A Prospective Longitudinal Pan-Cancer Study
    DOI 10.3389/fimmu.2022.840207
    Typ Journal Article
    Autor Barth D
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 840207
    Link Publikation
  • 2022
    Titel FOXO transcription factors differ in their dynamics and intra/intermolecular interactions
    DOI 10.1016/j.crstbi.2022.04.001
    Typ Journal Article
    Autor Spreitzer E
    Journal Current Research in Structural Biology
    Seiten 118-133
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Acinar-to-ductal metaplasia in the pancreas requires a glycolytic switch and functional mitochondria
    DOI 10.1101/2022.06.27.495427
    Typ Preprint
    Autor Neuß T
    Seiten 2022.06.27.495427
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Alternative nutritional and clinical care practices for NEC prevention drive distinct profiles and functional responses in the preterm gut microbiome
    DOI 10.1101/2022.06.08.22276177
    Typ Preprint
    Autor Neumann C
    Seiten 2022.06.08.22276177
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Hepatic p53 is regulated by transcription factor FOXO1 and acutely controls glycogen homeostasis
    DOI 10.17169/refubium-38763
    Typ Other
    Autor Galhuber M
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The sex-specific metabolic signature of C57BL/6NRj mice during aging
    DOI 10.60692/yeryf-hqa71
    Typ Other
    Autor Doruntina Bresilla
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Fasting reverses drug-resistance in hepatocellular carcinoma through p53-dependent metabolic synergism
    DOI 10.1101/2021.02.10.430545
    Typ Preprint
    Autor Krstic J
    Seiten 2021.02.10.430545
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Lysophosphatidic Acid Induces Aerobic Glycolysis, Lipogenesis, and Increased Amino Acid Uptake in BV-2 Microglia
    DOI 10.3390/ijms22041968
    Typ Journal Article
    Autor Joshi L
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 1968
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Tissue-Specific Landscape of Metabolic Dysregulation during Ageing
    DOI 10.3390/biom11020235
    Typ Journal Article
    Autor Zhang F
    Journal Biomolecules
    Seiten 235
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Metabolic, Phenotypic, and Neuropathological Characterization of the Tg4-42 Mouse Model for Alzheimer’s Disease
    DOI 10.3233/jad-201204
    Typ Journal Article
    Autor Hinteregger B
    Journal Journal of Alzheimer's Disease
    Seiten 1151-1168
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Global Analysis of Protein Arginine Methylation
    DOI 10.2139/ssrn.3762765
    Typ Preprint
    Autor Zhang F
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Global analysis of protein arginine methylation
    DOI 10.1101/2021.01.25.428036
    Typ Preprint
    Autor Zhang F
    Seiten 2021.01.25.428036
    Link Publikation
  • 2021
    Titel ATP regulates RNA-driven cold inducible RNA binding protein phase separation
    DOI 10.1002/pro.4123
    Typ Journal Article
    Autor Zhou Q
    Journal Protein Science
    Seiten 1438-1453
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Potassium ions promote hexokinase-II dependent glycolysis
    DOI 10.1016/j.isci.2021.102346
    Typ Journal Article
    Autor Bischof H
    Journal iScience
    Seiten 102346
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Growing Human Hepatocellular Tumors Undergo a Global Metabolic Reprogramming
    DOI 10.3390/cancers13081980
    Typ Journal Article
    Autor Zhang F
    Journal Cancers
    Seiten 1980
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Dietary spermidine improves cognitive function
    DOI 10.1016/j.celrep.2021.108985
    Typ Journal Article
    Autor Schroeder S
    Journal Cell Reports
    Seiten 108985
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Reduced olfactory performance is associated with changed microbial diversity, oralization, and accumulation of dead biomaterial in the nasal olfactory area.
    DOI 10.1128/spectrum.01549-23
    Typ Journal Article
    Autor Fischmeister Fps
    Journal Microbiology spectrum
  • 2023
    Titel Targeting epigenetic features in clear cell sarcomas based on patient-derived cell lines.
    DOI 10.1186/s12967-022-03843-4
    Typ Journal Article
    Autor Anders I
    Journal Journal of translational medicine
    Seiten 54
  • 2022
    Titel Lipoprotein Subclasses Independently Contribute to Subclinical Variance of Microvascular and Macrovascular Health
    DOI 10.5451/unibas-ep93888
    Typ Other
    Autor Habisch
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The sex-specific metabolic signature of C57BL/6NRj mice during aging
    DOI 10.60692/9x7pr-z5m82
    Typ Other
    Autor Doruntina Bresilla
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Brain Regions Show Different Metabolic and Protein Arginine Methylation Phenotypes in Frontotemporal Dementias and Alzheimer's Disease
    DOI 10.2139/ssrn.4195324
    Typ Journal Article
    Autor Rakhimbekova A
    Journal SSRN Electronic Journal
  • 2022
    Titel The sex-specific metabolic signature of C57BL/6NRj mice during aging
    DOI 10.3929/ethz-b-000586504
    Typ Other
    Autor Bresilla
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Brain regions show different metabolic and protein arginine methylation phenotypes in frontotemporal dementias and Alzheimer’s disease
    DOI 10.1016/j.pneurobio.2022.102400
    Typ Journal Article
    Autor Zhang F
    Journal Progress in Neurobiology
    Seiten 102400
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Residual Humidity in Paraffin Embedded Tissue Reduces Nucleic Acid Stability
    DOI 10.20944/preprints202212.0457.v1
    Typ Preprint
    Autor Abuja P
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Efficacy and Safety of Intermittent Fasting in People With Insulin-Treated Type 2 Diabetes (INTERFAST-2)—A Randomized Controlled Trial
    DOI 10.2337/dc22-1622
    Typ Journal Article
    Autor Obermayer A
    Journal Diabetes Care
    Seiten 463-468
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Reduced olfactory performance is associated with changed microbial diversity, oralization and accumulation of dead biomaterial in the nasal olfactory area
    DOI 10.21203/rs.3.rs-2251236/v1
    Typ Preprint
    Autor Kumpitsch C
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Targeting epigenetic features in clear cell sarcomas based on patient-derived cell lines
    DOI 10.21203/rs.3.rs-2190208/v1
    Typ Preprint
    Autor Karner C
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The sex-specific metabolic signature of C57BL/6NRj mice during aging
    DOI 10.1038/s41598-022-25396-8
    Typ Journal Article
    Autor Bresilla D
    Journal Scientific Reports
    Seiten 21050
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The PROVIT Study—Effects of Multispecies Probiotic Add-on Treatment on Metabolomics in Major Depressive Disorder—A Randomized, Placebo-Controlled Trial
    DOI 10.3390/metabo12080770
    Typ Journal Article
    Autor Kreuzer K
    Journal Metabolites
    Seiten 770
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase Knockout Modulates Metabolic Changes in Aging Mice
    DOI 10.20944/preprints202208.0159.v1
    Typ Preprint
    Autor Zhou Q
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Hepatic p53 is regulated by transcription factor FOXO1 and acutely controls glycogen homeostasis
    DOI 10.1016/j.jbc.2022.102287
    Typ Journal Article
    Autor Oster M
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 102287
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The LEF-1 high-mobility group box adopts residual structure in its DNA-free form
    DOI 10.1016/j.jmro.2022.100074
    Typ Journal Article
    Autor Alderson T
    Journal Journal of Magnetic Resonance Open
    Seiten 100074
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Phosphatidylethanolamine N-Methyltransferase Knockout Modulates Metabolic Changes in Aging Mice
    DOI 10.3390/biom12091270
    Typ Journal Article
    Autor Zhou Q
    Journal Biomolecules
    Seiten 1270
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Lipoprotein Subclasses Independently Contribute to Subclinical Variance of Microvascular and Macrovascular Health
    DOI 10.3390/molecules27154760
    Typ Journal Article
    Autor Streese L
    Journal Molecules
    Seiten 4760
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Oral Intake of L-Ornithine-L-Aspartate Is Associated with Distinct Microbiome and Metabolome Changes in Cirrhosis
    DOI 10.3390/nu14040748
    Typ Journal Article
    Autor Horvath A
    Journal Nutrients
    Seiten 748
    Link Publikation
  • 2022
    Titel EGCG Promotes FUS Condensate Formation in a Methylation-Dependent Manner
    DOI 10.3390/cells11040592
    Typ Journal Article
    Autor Lenard A
    Journal Cells
    Seiten 592
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Fasting improves therapeutic response in hepatocellular carcinoma through p53-dependent metabolic synergism
    DOI 10.1126/sciadv.abh2635
    Typ Journal Article
    Autor Krstic J
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Lipoprotein Subclasses Independently Contribute to Subclinical Variance of Microvascular and Macrovascular Health
    DOI 10.20944/preprints202206.0299.v1
    Typ Preprint
    Autor Streese L
    Link Publikation
  • 2022
    Titel p53 Regulates a miRNA-Fructose Transporter Axis in Brown Adipose Tissue Under Fasting
    DOI 10.3389/fgene.2022.913030
    Typ Journal Article
    Autor Reinisch I
    Journal Frontiers in Genetics
    Seiten 913030
    Link Publikation
  • 2019
    Titel NMR characterization of solvent accessibility and transient structure in intrinsically disordered proteins
    DOI 10.1007/s10858-019-00248-2
    Typ Journal Article
    Autor Hartlmüller C
    Journal Journal of Biomolecular NMR
    Seiten 305-317
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Purification and Application of Genetically Encoded Potassium Ion Indicators for Quantification of Potassium Ion Concentrations within Biological Samples
    DOI 10.1002/cpch.71
    Typ Journal Article
    Autor Bischof H
    Journal Current Protocols in Chemical Biology
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Nonclassical nuclear localization signals mediate nuclear import of CIRBP
    DOI 10.1073/pnas.1918944117
    Typ Journal Article
    Autor Bourgeois B
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 8503-8514
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Transgene integration causes RARB downregulation in homozygous Tg4–42 mice
    DOI 10.1038/s41598-020-63512-8
    Typ Journal Article
    Autor Hinteregger B
    Journal Scientific Reports
    Seiten 6377
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Human Milk Oligosaccharides Modulate the Risk for Preterm Birth in a Microbiome-Dependent and -Independent Manner
    DOI 10.1128/msystems.00334-20
    Typ Journal Article
    Autor Pausan M
    Journal mSystems
    Link Publikation
  • 2020
    Titel N-acetylaspartate improves cell survival when glucose is limiting
    DOI 10.1101/2020.05.28.114629
    Typ Preprint
    Autor Alkan H
    Seiten 2020.05.28.114629
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Cysteine oxidation triggers amyloid fibril formation of the tumor suppressor p16INK4A
    DOI 10.1016/j.redox.2019.101316
    Typ Journal Article
    Autor Göbl C
    Journal Redox Biology
    Seiten 101316
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A small molecule chaperone rescues the stability and activity of a cancer-associated variant of NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1 in vitro
    DOI 10.1002/1873-3468.13636
    Typ Journal Article
    Autor Strandback E
    Journal FEBS Letters
    Seiten 424-438
    Link Publikation
  • 2019
    Titel The Co-chaperone Cns1 and the Recruiter Protein Hgh1 Link Hsp90 to Translation Elongation via Chaperoning Elongation Factor 2
    DOI 10.1016/j.molcel.2019.02.011
    Typ Journal Article
    Autor Schopf F
    Journal Molecular Cell
    Link Publikation
  • 2019
    Titel pH-Lemon, a Fluorescent Protein-Based pH Reporter for Acidic Compartments
    DOI 10.1021/acssensors.8b01599
    Typ Journal Article
    Autor Burgstaller S
    Journal ACS Sensors
    Seiten 883-891
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Increased Aggregation Tendency of Alpha-Synuclein in a Fully Disordered Protein Complex
    DOI 10.1016/j.jmb.2019.04.031
    Typ Journal Article
    Autor Merle D
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 2581-2598
  • 2019
    Titel Serum Concentrations of Citrate, Tyrosine, 2- and 3- Hydroxybutyrate are Associated with Increased 3-Month Mortality in Acute Heart Failure Patients
    DOI 10.1038/s41598-019-42937-w
    Typ Journal Article
    Autor Stryeck S
    Journal Scientific Reports
    Seiten 6743
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Human Milk Oligosaccharides modulate the risk for preterm birth in a microbiome dependent and independent manner
    DOI 10.1101/683714
    Typ Preprint
    Autor Pausan M
    Seiten 683714
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Acetyl-CoA carboxylase 1–dependent lipogenesis promotes autophagy downstream of AMPK
    DOI 10.1074/jbc.ra118.007020
    Typ Journal Article
    Autor Gross A
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 12020-12039
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Endothelial lipase increases antioxidative capacity of high-density lipoprotein
    DOI 10.1016/j.bbalip.2019.06.011
    Typ Journal Article
    Autor Schilcher I
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids
    Seiten 1363-1374
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Associations between Endothelial Lipase, High-Density Lipoprotein, and Endothelial Function Differ in Healthy Volunteers and Metabolic Syndrome Patients.
    DOI 10.3390/ijms24032073
    Typ Journal Article
    Autor Klobučar I
    Journal International journal of molecular sciences
  • 2023
    Titel Residual Humidity in Paraffin-Embedded Tissue Reduces Nucleic Acid Stability.
    DOI 10.3390/ijms24098010
    Typ Journal Article
    Autor Abuja Pm
    Journal International journal of molecular sciences
  • 2023
    Titel Associations between Endothelial Lipase and Apolipoprotein B-Containing Lipoproteins Differ in Healthy Volunteers and Metabolic Syndrome Patients.
    DOI 10.3390/ijms241310681
    Typ Journal Article
    Autor Klobučar I
    Journal International journal of molecular sciences
  • 2023
    Titel Clinical NEC prevention practices drive different microbiome profiles and functional responses in the preterm intestine.
    DOI 10.1038/s41467-023-36825-1
    Typ Journal Article
    Autor Mahnert A
    Journal Nature communications
    Seiten 1349
  • 2020
    Titel Probing Surfaces in Dynamic Protein Interactions
    DOI 10.1016/j.jmb.2020.02.032
    Typ Journal Article
    Autor Spreitzer E
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 2949-2972
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Metabolic reprogramming of donor T cells enhances graft-versus-leukemia effects in mice and humans
    DOI 10.1126/scitranslmed.abb8969
    Typ Journal Article
    Autor Uhl F
    Journal Science Translational Medicine
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Regulation of Nuclear Import and Phase Separation
    Typ PhD Thesis
    Autor Usuler, Sinem
  • 2021
    Titel Wide-Range, Rapid, and Specific Identification of Pathogenic Bacteria by Surface-Enhanced Raman Spectroscopy
    DOI 10.1021/acssensors.1c00641
    Typ Journal Article
    Autor Liu S
    Journal ACS Sensors
    Seiten 2911-2919
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Metabolic profiling links cardiovascular risk and vascular end organ damage
    DOI 10.1016/j.atherosclerosis.2021.07.005
    Typ Journal Article
    Autor Streese L
    Journal Atherosclerosis
    Seiten 45-53
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Multiple regulatory intrinsically disordered motifs control FOXO4 transcription factor binding and function
    DOI 10.1016/j.celrep.2021.109446
    Typ Journal Article
    Autor Bourgeois B
    Journal Cell Reports
    Seiten 109446
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Global analysis of protein arginine methylation
    DOI 10.1016/j.crmeth.2021.100016
    Typ Journal Article
    Autor Zhang F
    Journal Cell Reports Methods
    Seiten 100016
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Branched-Chain Amino Acids Can Predict Mortality in ICU Sepsis Patients
    DOI 10.3390/nu13093106
    Typ Journal Article
    Autor Reisinger A
    Journal Nutrients
    Seiten 3106
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Intracellular drug binding affinities by NMR
    DOI 10.1107/s2059798321010135
    Typ Journal Article
    Autor Madl T
    Journal Acta Crystallographica Section D
    Seiten 1216-1217
    Link Publikation
  • 2021
    Titel p53 Transactivation Domain Mediates Binding and Phase Separation With poly-PR/GR
    DOI 10.20944/preprints202109.0265.v1
    Typ Preprint
    Autor Usluer S
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.1186/s40168-021-01130-w
    Typ Journal Article
    Autor Kumpitsch C
    Journal Microbiome
    Seiten 193
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Cysteine oxidation triggers amyloid fibril formation of the tumor suppressor p16INK4A
    DOI 10.1101/509109
    Typ Preprint
    Autor Göbl C
    Seiten 509109
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A single alcohol binge impacts on neutrophil function without changes in gut barrier function and gut microbiome composition in healthy volunteers
    DOI 10.1371/journal.pone.0211703
    Typ Journal Article
    Autor Stadlbauer V
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Structure of an RNA aptamer in complex with the fluorophore tetramethylrhodamine
    DOI 10.1093/nar/gkz1113
    Typ Journal Article
    Autor Duchardt-Ferner E
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 949-961
    Link Publikation
  • 2021
    Titel p53 Transactivation Domain Mediates Binding and Phase Separation with Poly-PR/GR
    DOI 10.3390/ijms222111431
    Typ Journal Article
    Autor Usluer S
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 11431
    Link Publikation
  • 2021
    Titel XIAP restrains TNF-driven intestinal inflammation and dysbiosis by promoting innate immune responses of Paneth and dendritic cells
    DOI 10.1126/sciimmunol.abf7235
    Typ Journal Article
    Autor Wahida A
    Journal Science Immunology
  • 2021
    Titel Phosphorylation Regulates CIRBP Arginine Methylation, Transportin-1 Binding and Liquid-Liquid Phase Separation
    DOI 10.3389/fmolb.2021.689687
    Typ Journal Article
    Autor Lenard A
    Journal Frontiers in Molecular Biosciences
    Seiten 689687
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Endothelial Lipase Modulates Paraoxonase 1 Content and Arylesterase Activity of HDL.
    DOI 10.3390/ijms22020719
    Typ Journal Article
    Autor Schilcher I
    Journal International journal of molecular sciences
  • 2021
    Titel Dietary spermidine improves cognitive function
    DOI 10.17169/refubium-31292
    Typ Other
    Autor Hofer S
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Metabolomic Profiles of Mice Tissues Reveals an Interplay Between Aging and Energy Metabolism
    DOI 10.20944/preprints202112.0120.v1
    Typ Preprint
    Autor Zhou Q
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Nuclear Import Receptors Directly Bind to Arginine-Rich Dipeptide Repeat Proteins and Suppress Their Pathological Interactions
    DOI 10.1016/j.celrep.2020.108538
    Typ Journal Article
    Autor Hutten S
    Journal Cell Reports
    Seiten 108538
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Imbalances in the eye lens proteome are linked to cataract formation.
    DOI 10.1038/s41594-020-00543-9
    Typ Journal Article
    Autor Lim Nch
    Journal Nature structural & molecular biology
    Seiten 143-151
  • 2021
    Titel A General Small-Angle X-ray Scattering-Based Screening Protocol for Studying Physical Stability of Protein Formulations
    DOI 10.3390/pharmaceutics14010069
    Typ Journal Article
    Autor Zhang F
    Journal Pharmaceutics
    Seiten 69
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Metabolomic Profiles of Mouse Tissues Reveal an Interplay between Aging and Energy Metabolism
    DOI 10.3390/metabo12010017
    Typ Journal Article
    Autor Zhou Q
    Journal Metabolites
    Seiten 17
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Exploring the Arginine Methylome by Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy.
    DOI 10.3791/63245
    Typ Journal Article
    Autor Habisch H
    Journal Journal of visualized experiments : JoVE
  • 2021
    Titel Additional file 2 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680130
    Typ Other
    Autor Fischmeister F
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 11 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680127
    Typ Other
    Autor Fischmeister F
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 11 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680127.v1
    Typ Other
    Autor Fischmeister F
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 2 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680130.v1
    Typ Other
    Autor Fischmeister F
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 4 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680136
    Typ Other
    Autor Fischmeister F
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 4 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680136.v1
    Typ Other
    Autor Fischmeister F
    Link Publikation
  • 2023
    Titel MetSCORE: A Molecular Metric to Evaluate the Risk of Metabolic Syndrome Based on Serum NMR Metabolomics
    DOI 10.2139/ssrn.4625798
    Typ Preprint
    Autor Conde R
  • 2023
    Titel HDL-Related Parameters and COVID-19 Mortality: The Importance of HDL Function.
    DOI 10.3390/antiox12112009
    Typ Journal Article
    Autor Habisch H
    Journal Antioxidants (Basel, Switzerland)
  • 2023
    Titel Low Valine Serum Levels Predict Increased 1-Year Mortality in Acute Heart Failure Patients.
    DOI 10.3390/biom13091323
    Typ Journal Article
    Autor Klobučar I
    Journal Biomolecules
  • 2023
    Titel Altered gut microbiome, bile acid composition and metabolome in sarcopenia in liver cirrhosis.
    DOI 10.1002/jcsm.13342
    Typ Journal Article
    Autor Aliwa B
    Journal Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
    Seiten 2676-2691
  • 2022
    Titel HDL-apoA-II Is Strongly Associated with 1-Year Mortality in Acute Heart Failure Patients
    DOI 10.3390/biomedicines10071668
    Typ Journal Article
    Autor Klobucar I
    Journal Biomedicines
    Seiten 1668
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Solvent paramagnetic relaxation enhancement as a versatile method for studying structure and dynamics of biomolecular systems
    DOI 10.1016/j.pnmrs.2022.09.001
    Typ Journal Article
    Autor Lenard A
    Journal Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy
    Seiten 113-139
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Cholesterol Content of Very-Low-Density Lipoproteins Is Associated with 1-Year Mortality in Acute Heart Failure Patients
    DOI 10.3390/biom12101542
    Typ Journal Article
    Autor Degoricija V
    Journal Biomolecules
    Seiten 1542
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Entspannte Moleküle: NMR-Ober - flächen daten zur Strukturbestimmung
    DOI 10.1007/s12268-018-0898-5
    Typ Journal Article
    Autor Göbl C
    Journal BIOspektrum
    Seiten 161-163
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Oxidative stress-induced structural changes in the microtubule-associated flavoenzyme Irc15p from Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1002/pro.3517
    Typ Journal Article
    Autor Koch K
    Journal Protein Science
    Seiten 176-190
    Link Publikation
  • 2018
    Titel NMR spectroscopy enables simultaneous quantification of carbohydrates for diagnosis of intestinal and gastric permeability
    DOI 10.1038/s41598-018-33104-8
    Typ Journal Article
    Autor Stryeck S
    Journal Scientific Reports
    Seiten 14650
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Saxagliptin but Not Sitagliptin Inhibits CaMKII and PKC via DPP9 Inhibition in Cardiomyocytes
    DOI 10.3389/fphys.2018.01622
    Typ Journal Article
    Autor Koyani C
    Journal Frontiers in Physiology
    Seiten 1622
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Chapter 10 Small Paramagnetic Co-solute Molecules
    DOI 10.1039/9781788013291-00283
    Typ Book Chapter
    Autor Madl T
    Verlag Royal Society of Chemistry (RSC)
    Seiten 283-309
  • 2020
    Titel Tissue-Specific Landscape of Metabolic Dysregulation during Ageing
    DOI 10.20944/preprints202012.0174.v1
    Typ Preprint
    Autor Zhang F
    Link Publikation
  • 2020
    Titel ß-catenin regulates FOXP2 transcriptional activity via multiple binding sites
    DOI 10.1111/febs.15656
    Typ Journal Article
    Autor Richter G
    Journal The FEBS Journal
    Seiten 3261-3284
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Tin-Doped Near-Infrared Persistent Luminescence Nanoparticles with Considerable Improvement of Biological Window Activation for Deep Tumor Photodynamic Therapy
    DOI 10.1021/acsabm.0c00644
    Typ Journal Article
    Autor Shi J
    Journal ACS Applied Bio Materials
    Seiten 5995-6004
    Link Publikation
Policies
  • 2020
    Titel Training course in biobanking
    Typ Influenced training of practitioners or researchers
Methoden & Materialien
  • 2021 Link
    Titel Quantification of arginine methylation
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Datasets & Models
  • 2021 Link
    Titel Additional file 3 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680133
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 7 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680148
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 6 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680142
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 5 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680139
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 10 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680124
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 9 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680154
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 8 of Reduced B12 uptake and increased gastrointestinal formate are associated with archaeome-mediated breath methane emission in humans
    DOI 10.6084/m9.figshare.16680151
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
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Disseminationen
  • 2022 Link
    Titel TEDx talk
    Typ A talk or presentation
    Link Link
  • 2019
    Titel Tag der offenen Tür
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2022
    Titel Lange Nacht der Forschung
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel Editorial board member Scientific Reports
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2019
    Titel F&E Infrastrukturförderung - Next-generation X-ray platform for integrative structural biology
    Typ Capital/infrastructure (including equipment)
    Förderbeginn 2019
    Geldgeber Austrian Research Promotion Agency

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