Funktion von CDYL in der Regulation der Chromatin Struktur

In eukaryotischen Zellen stellt Chromatin die Umgebung für alle genomischen Prozesse dar. Dieses strukturell hoch dynamische, polymere Molekül besteht aus DNS und hauptsächlich Histon Proteinen. Chromatin kann weiter in transkriptionell aktives Euchromatin oder transkriptionell inertes Heterochromatin eingeteilt werden. Post- translationale Modifikationen (PTM) von Histonen sind Schlüssel Faktoren in der Regulation der Chromatin Funktion wodurch diese die biochemische Basis für epigentische Phänomene darstellen. Eine Möglichkeit wie PTM die Chromatin Struktur beeinflussen besteht in der Rekrutierung von Modifikations-abhängigen "Effektor"- Proteinen, welche die Modifikation als biologischen Effekt weiterleiten. Die Methylierung von Histone H3 an Lysin 9 wird als ein Kennzeichen für Heterochromatin betrachtet. Ein neuer Faktor von dem erst kürzlich gezeigt wurde, dass er diese Modifikation durch eine Chromodomäne erkennt, ist CDYL wodurch eine mögliche Funktion in der Organisation von Heterochromatin indiziert wird. Von diesem Protein wurde gezeigt dass es transkriptionelle Repressor-Funktion, möglicherweise durch transiente Interaktion mit einem Repressor-Komplex, besitzt. Allerdings ist die Funktion von CDYL in der Chromatin Biologie noch nicht charakterisiert worden. In diesem Projekte werde ich die Funktion von CDYL in der Chromatin Biologie mittels biochemischer, biophysikalischer und zellbiologischer Methoden charakterisieren. Zu diesem Zweck werde ich die sub-zelluläre Lokalisation von CDYL mittels Fluoreszenz-Mikroskopie und die Chromatin bezogene Lokalisierung durch Genom-weite Kartierung bestimmen. Ich werde die thermodynamischen Parameter für die Bindung von CDYL an Chromatin und die Effekte dieser Interaktion in vitro und in vivo sorgfältig analysieren. Weiters werde ich die Konsequenzen der CDYL Bindung für transkriptionelle Regulation in vivo untersuchen. Um ein umfassendes Verständnis von direkten und indirekten CDYL Funktionen in der strukturellen Organisation des Chromatins zu erhalten werde ich CDYL assoziierte Proteine und Komplexe sowie RNAs identifizieren und charakterisieren. Der Einfluss dieser Faktoren auf CDYL Funktionen an Chromatin wird mittels biochemischer und biophysikalischer Methoden bestimmt werden. Ich erwarte, dass die durch die vorgeschlagenen Experimente generierten Daten unser Verständnis um die Rolle von CDYL in Heterochromatin Formierung bedeutend erweitern werden.