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Struktur Gestützte Entwicklung SREBE Hemmender Verbindungen

Structure Based Design of SREBP Inhibitors

Andras Böszörmenyi (ORCID: 0000-0001-9810-7241)
  • Grant-DOI 10.55776/J3872
  • Förderprogramm Erwin Schrödinger
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2016
  • Projektende 31.10.2021
  • Bewilligungssumme 123.449 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Sterol Regulatory Element-Biding Protein, Mediator, NMR, Inhibitor, Cancer, Diabetes

Abstract Endbericht

Synthese und Abbau von Cholesterin und Fetten, werden im menschlichen Körper streng reguliert. Störungen dieses Gleichgewichts führen zu schweren Erkrankungen, inklusive Fettleibigkeit, Diabetes und sogar Krebs. Ich befasse mich in meiner Arbeit mit der Familie der Sterin Regulierendes Element Bindenden Eiweiße (SREBE). Diese Eiweiße sitzen an Schaltern (den Sterin Regulierenden Elementen, SRE), welche die Syntheseraten von Lipiden kontrollieren. Wir wollen, im Rahmen einer internationalen Kooperation zwischen Österreich und den Vereinigten Staaten, Hemmstoffe entwickeln die uns erlauben diese Schalter nach Bedarf auf Aus zu stellen. Auf diese Weise können wir die Synthese von Cholesterin und Fetten bremsen und damit den Cholesterin und Fettgehalt im Körper senken. Krebszellen wachsen schneller als gesunde Zellen und brauchen daher eine besonders hohe Zufuhr Cholesterin und Fetten. Um diese sicherzustellen werden genetische Programme zur erhöhten Fett- und Cholesterin-Synthese hochgefahren. Die SREBEs sitzen an den Schaltern genau dieser genetischen Programme. Das Abschalten dieser Synthese- Programme kann dazu dienen die Expansion von Krebszellen zu unterbinden. Unser Forschungs-Ansatz beruht auf der Idee, die Fähigkeit der SREBEs, ihre Helfer, sogenannte Co-Aktivatoren, zu rekrutieren, zu beschränken. Wir haben drei Hemmstoffe identifiziert, welche die dazu nötige Interaktion unterbinden. Nun arbeiten wir daran die Wirksamkeit dieser Hemmstoffe zu verbessern. Dabei gilt es viele Gesichtspunkte zu beachten. Sie sollen möglichst spezifisch sein, um andere genetische Programme nicht zu beeinflussen. Sie sollen schon in kleiner Konzentration wirksam sein und natürlich müssen die zukünftigen Medikamente auch dorthin gelangen wo sie ihre Wirkung entfalten können. Unsere Methode der Wahl ist die Kernspinresonanzspektroskopie. Mit dieser Methode können wir innerhalb von oder auch zwischen Molekülen Distanzen messen die kürzer als ein Nanometer sind. Diese Information nutzen wir, um die Interaktionen der SREBEs, Co- Aktivatoren und Hemmstoffe zu modellieren. Die Modelle (oder Strukturen) werden dann genutzt um den chemischen Raum um die Hemmstoffe zu untersuchen und ihre Wirksamkeit zu verbessern. Neben den herkömmlich aufgebauten Kleinmolekül-Hemmstoffen arbeiten wir auch an der Entwicklung von biologischen Peptidhemmstoffen. Die Peptide werden mit neuartigen Methoden strukturell modifiziert, um ihre Stabilität und Wirksamkeit zu erhöhen. Wir werden die neue und die herkömmliche Methode kombinierend die Peptide mit unseren Kleinmolekül-Hemmstoffen verzieren. Wir hoffen auf diese Weise optimale SREBE Hemmstoffe zu entwickeln, die auf die Therapie von Fettleibigkeit, Diabetes und Krebs abzielen.

In diesem Projekt haben wir eine Reihe von Molekülen entwickelt, welche die körpereigene Fettsynthese blockieren und uns angeschaut welche therapeutischen Anwendungen für diese Moleküle in Frage kommen. Die Blockade der körpereigenen Fettsynthese hat gerade bei Prozessen, die einen erhöhten Bedarf an Fettsynthese mit sich bringen, zum Beispiel die Vermehrung von metastasierenden Krebsarten oder behüllten Viren, ein hohes potenzial für therapeutische Entwicklung. Wir konnten in diesem Projekt auf zellbiologischer Ebene zeigen, dass die von uns entwickelten Moleküle effektiv die Replikation von aggressiven Krebsarten (e.g. glioblastoma) und behüllten Viren (e.g. SARS-CoV-2) verhindern können.

Forschungsstätte(n)
  • CeMM – Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH - 100%
  • Harvard Medical School - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Anders Näär, Harvard Medical School - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Loren Walensky, Harvard University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Sara Buhrlage, Harvard University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Sirano Dhe-Paganon, Harvard University - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 886 Zitationen
  • 10 Publikationen
Publikationen
  • 2018
    Titel Optimal control theory enables homonuclear decoupling without Bloch–Siegert shifts in NMR spectroscopy
    DOI 10.1038/s41467-018-05400-4
    Typ Journal Article
    Autor Coote P
    Journal Nature Communications
    Seiten 3014
    Link Publikation
  • 2018
    Titel The T Cell Antigen Receptor a Transmembrane Domain Coordinates Triggering through Regulation of Bilayer Immersion and CD3 Subunit Associations
    DOI 10.1016/j.immuni.2018.09.007
    Typ Journal Article
    Autor Brazin K
    Journal Immunity
    Link Publikation
  • 2018
    Titel 15N detection harnesses the slow relaxation property of nitrogen: Delivering enhanced resolution for intrinsically disordered proteins
    DOI 10.1073/pnas.1717560115
    Typ Journal Article
    Autor Chhabra S
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Mixed pyruvate labeling enables backbone resonance assignment of large proteins using a single experiment
    DOI 10.1038/s41467-017-02767-8
    Typ Journal Article
    Autor Robson S
    Journal Nature Communications
    Seiten 356
    Link Publikation
  • 2020
    Titel An open-source drug discovery platform enables ultra-large virtual screens
    DOI 10.1038/s41586-020-2117-z
    Typ Journal Article
    Autor Gorgulla C
    Journal Nature
    Seiten 663-668
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The precious fluorine on the ring: fluorine NMR for biological systems
    DOI 10.1007/s10858-020-00331-z
    Typ Journal Article
    Autor Boeszoermenyi A
    Journal Journal of Biomolecular NMR
    Seiten 365-379
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The fission yeast FLCN/FNIP complex augments TORC1 repression or activation in response to amino acid (AA) availability
    DOI 10.1016/j.isci.2021.103338
    Typ Journal Article
    Autor Calvo I
    Journal iScience
    Seiten 103338
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The Structural Determinants of PH Domain-Mediated Regulation of Akt Revealed by Segmental Labeling
    DOI 10.7554/elife.59151
    Typ Journal Article
    Autor Chu N
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Aromatic 19F-13C TROSY: a background-free approach to probe biomolecular structure, function, and dynamics
    DOI 10.1038/s41592-019-0334-x
    Typ Journal Article
    Autor Boeszoermenyi A
    Journal Nature Methods
    Seiten 333-340
    Link Publikation
  • 2023
    Titel A conformation-locking inhibitor of SLC15A4 with TASL proteostatic anti-inflammatory activity
    DOI 10.1038/s41467-023-42070-3
    Typ Journal Article
    Autor Boeszoermenyi A
    Journal Nature Communications
    Seiten 6626
    Link Publikation

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