Selektionskartierung in Rindern
Hitchhiking mapping in cattle
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (20%); Tierzucht, Tierproduktion (80%)
Keywords
-
Selection,
Hitchhiking Mapping,
SNPs,
Cattle,
Milk Production Traits,
Rare Breeds
In den vergangenen Jahren wurden ökonomisch wichtige Leistungsmerkmale in Rindern sehr stark selektiert. Die genetische Basis dieser Merkmale ist komplex und noch weitgehend unverstanden. Die momentan verwendeten Methoden zur Identifizierung dieser QTL beruhen überwiegend auf Kopplungsanalyse. In diesem Projekt schlagen wir einen alternativen Ansatz vor, wie QTL für Leistungsmerkmale in Rindern identifiziert werden können, "hitchhiking mapping". Diese Technik kommt aus der Evolutionsbiologie und sie benutzt die Signatur von Selektion in Polymorphismenmustern der Rinderpopulationen. Es werden "high-density SNP arrays" verwendet werden um die genomweite Variabilität zu messen. Die Assoziation der identifizierten Kandidatenregionen mit Leistungsmerkmalen erfolgt mittels eines Assoziationstests. Letztendlich wird besonderes Gewicht auf die Auslotung der genetischen Variabilität und des ökonomischen Potentials in den Kandidatenregionen gefährdeter österreichischer Rinderrassen gelegt.
- Hans-Rudolf Fries, Technische Universität München - Deutschland
- Thomas Meitinger, Technische Universität München - Deutschland
Research Output
- 539 Zitationen
- 6 Publikationen
-
2012
Titel Combining evidence of selection with association analysis increases power to detect regions influencing complex traits in dairy cattle DOI 10.1186/1471-2164-13-48 Typ Journal Article Autor Schwarzenbacher H Journal BMC Genomics Seiten 48 Link Publikation -
2011
Titel The Genomic Signature of Splicing-Coupled Selection Differs between Long and Short Introns DOI 10.1093/molbev/msr201 Typ Journal Article Autor Farlow A Journal Molecular Biology and Evolution Seiten 21-24 Link Publikation -
2010
Titel A genome scan for quantitative trait loci affecting milk somatic cell score in Israeli and Italian Holstein cows by means of selective DNA pooling with single- and multiple-marker mapping DOI 10.3168/jds.2010-3254 Typ Journal Article Autor Tal-Stein R Journal Journal of Dairy Science Seiten 4913-4927 Link Publikation -
2010
Titel Nonsense-Mediated Decay Enables Intron Gain in Drosophila DOI 10.1371/journal.pgen.1000819 Typ Journal Article Autor Farlow A Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2009
Titel Expression profiling of Drosophila mitochondrial genes via deep mRNA sequencing DOI 10.1093/nar/gkp856 Typ Journal Article Autor Torres T Journal Nucleic Acids Research Seiten 7509-7518 Link Publikation -
2010
Titel The Next Generation of Molecular Markers From Massively Parallel Sequencing of Pooled DNA Samples DOI 10.1534/genetics.110.114397 Typ Journal Article Autor Futschik A Journal Genetics Seiten 207-218 Link Publikation