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B12 Derivate als potentielle Antivitamine

B12 derivatives as potential antivitamins

Maren Podewitz (ORCID: 0000-0001-7256-1219)
  • Grant-DOI 10.55776/M2005
  • Förderprogramm Lise Meitner
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.05.2017
  • Projektende 30.04.2021
  • Bewilligungssumme 161.220 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (100%)

Keywords

    B12 derivatives, Antimetabolites, Quantum Chemistry, Bioinorganic Complexes, QM/MM

Abstract Endbericht

Als metallorganische Verbindungen sind B12 Derivate, sogenannte Cobalamine, essentiell für den Menschen und andere Organismen. Physiologisch aktive B 12 Spezies sind an der Bildung roter Blutkörperchen und der Synthese und Regulierung von DNA beteiligt. Wird Vitamin B12 nicht oder nur unzureichend im Körper aufgenommen, kann dies zu lebensgefährlichen Krankheiten wie perniziöser Anämie führen. Wäre man in der Lage den B12 Stoffwechsel auf molekularer Ebene zu verstehen, so könnten daraus Therapien für diese und andere durch B12 Mangel verursachte Krankheiten entwickelt werden. Obwohl die Kristallstrukturen der bekanntesten B12 Derivate wie Vitamin B12 und Koenzym B12 bereits vor über 50 Jahren entdeckt wurden, sind ihre Rollen im B12 Metabolismus noch nicht vollständig aufgeklärt. Ein möglicher Ansatz ihre Funktionsweisen besser zu verstehen ist eine gezielte Deaktivierung einzelner Schlüsselreaktionsschritte im B 12 Stoffwechsel, z. B. durch Modifikation des Vitamins B12. Zwei modifizierte B12 Cobalamine wurden kürzlich publiziert. Sie gehören zu einer neuartigen Klasse von B12 Derivaten, die von dem Protein homocystinuria type C (CblC) nicht in eine physiologisch aktive Form umgewandelt werden können. Sie sind also in der Lage den B12 Stoffwechsel zu blockieren und wirken als Vitamin B12 Gegenspieler oder B12 Antivitamine. Die molekularen Eigenschaften und die Wechselwirkung dieser beiden Cobalamine mit dem Protein CblC sind bisher jedoch kaum verstanden und sollen in dieser Studie erforscht werden. Ziel dieses Forschungsvorhabens ist es, die Funktionsweise der beiden vorgeschlagenen Antivitamine mit Hilfe quantenchemischer und molekularmechanischer Studien zu verstehen und verbesserte Antivitamine vorzuschlagen, die den B12 Stoffwechsel noch effizienter blockieren. Computergestützte Untersuchungen ermöglichen räumlich- und zeitlich aufgelöste Studien und damit Zugang zu experimentell nicht zugänglichen Informationen. Untersucht werden molekulare Eigenschaften der Cobalamine wie Bindungsenergien und Molekülgeometrien sowie deren Änderung bei Bindung an das Protein CblC. Mit Hilfe dieser Studien können Faktoren identifiziert werden seien es intrinsische Eigenschaften der Antivitamine oder Wechsel-wirkungen mit dem Protein die zu einer Inhibierung des B12 Mechanismus beitragen. Weiter beabsichtigen wir die Wirkungsweise der Antivitamine durch Modifikation der Substrate weiter zu optimieren und verbesserte Antivitamine vorzuschlagen. Forschungsergebnisse dieser Studien tragen zu einem umfassenderen Verständnis der Funktionsweise der Cobalamine im Metabolismus bei und helfen ihre Rolle bei verschiedenen neurologischen Krankheiten zu verstehen.

B12 Derivate als potentielle Antivitamine Als metallorganische Verbindungen sind B12 Derivate, sogenannte Cobalamine, essentiell für den Menschen und andere Organismen. Physiologisch aktive B12 Spezies sind an der Bildung roter Blutkörperchen und der Synthese und Regulierung von DNA beteiligt. Wird Vitamin B12 nicht oder nur unzureichend im Körper aufgenommen, kann dies zu lebensgefährlichen Krankheiten wie perniziöser Anämie führen. Versteht man den B12 Stoffwechsel auf molekularer Ebene, so können Therapien für diese und andere durch B12 Mangel verursachte Krankheiten entwickelt werden. Obwohl die Kristallstrukturen von Vitamin B12 und Koenzym B12 bereits vor über 50 Jahren entdeckt wurden, sind ihre Rollen im B12 Metabolismus noch nicht vollständig aufgeklärt. Ein Ansatz ihre Funktionsweisen besser zu verstehen ist eine gezielte Deaktivierung einzelner Reaktionsschritte im B12 Stoffwechsel. Dafür wurde das Konzept der Antivitamine entwickelt. B12 Antivitamine sind strukturell ähnlich zu Vitamin B12 und Coenzym B12. Sie werden vom Organismus erkannt und an der gleichen Stelle gebunden, können jedoch nicht in eine physiologisch aktive Form umgewandelt werden. Folglich verhindern sie weitere B12 Absorption. B12 Erzeugen lassen sie sich beispielsweise durch Modifizierung des Liganden an der Oberseite des Corrinrings. Im Fokus dieses Projekts stand die Untersuchung der chemisch bisher wenig verstandenen B12 Antivitamine und deren Wechselwirkung mit dem verarbeitenden Enzym auf atomistischer Ebene. Umfassende quantenmechanische Studien zielten darauf ab, die Bindungsdissoziationsenergien zweier B12 Derivate zu bestimmen. Entgegen unserer Hypothese stellte sich jedoch heraus, dass die Bindungsstärke nicht oder nicht der alleinige Grund war, warum diese Komplexe sich wie B12 Gegenspieler verhielten. Zeitgleich wurde jedoch die Struktur der Hydrogenobyrsäure - einem quasi "leerem" Corrinliganden ohne Metallzentrum - berichtet, die den Einbau verschiedener Metalle ermöglichte und den Weg für eine neue Art der B12 Antivitamine ebnete. Folglich erforschten wir die chemische Nature dieses Liganden und den Einfluss anderer Metalle auf die potentielle Funktionsweise als B12 Antivitamine. Während dieser Arbeit wurde klar, dass explizite Wechselwirkungen Lösungsmittelmolekülen bei den Berechnungen mitberücksichtigt werden müssen, um ein robustes Modell zu erhalten. Daher entwickelten wir ein Konzept, um Mikrosolvatation mit einem quantenchemischen Modell zu beschreiben. Dabei werden die Lösungsmittelmoleküle automatisch, basierend auf berechneten physikalischen Eigenschaften platziert. So ist es möglich komplexe Lösungsmitteleffekte von bioanorganischen Verbindungen effizient zu beschreiben.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Christian Ochsenfeld, Ludwig Maximilians-Universität München - Deutschland

Research Output

  • 690 Zitationen
  • 38 Publikationen
  • 1 Disseminationen
  • 5 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2023
    Titel Solution, Crystal and in Silico Structures of the Organometallic Vitamin B12-Derivative Acetylcobalamin and of its Novel Rhodium-Analogue Acetylrhodibalamin
    DOI 10.1002/hlca.202200158
    Typ Journal Article
    Autor Wiedemair M
    Journal Helvetica Chimica Acta
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The interplay of VSCF/VCI calculations and matrix-isolation IR spectroscopy – Mid infrared spectrum of CH3CH2F and CD3CD2F
    DOI 10.1016/j.jms.2019.111224
    Typ Journal Article
    Autor Dinu D
    Journal Journal of Molecular Spectroscopy
    Seiten 111224
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Implementation of the Freely Jointed Chain Model to Assess Kinetics and Thermodynamics of Thermosensitive Coil–Globule Transition by Markov States
    DOI 10.1021/acs.jpcb.1c01946
    Typ Journal Article
    Autor Quoika P
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 4898-4909
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Quantum Chemical Microsolvation by Automated Water Placement
    DOI 10.3390/molecules26061793
    Typ Journal Article
    Autor Steiner M
    Journal Molecules
    Seiten 1793
    Link Publikation
  • 2021
    Titel A Blue Zinc Complex of a Dioxobilin-Type Pink Chlorophyll Catabolite Exhibiting Bright Chelation-Enhanced Red Fluorescence
    DOI 10.1002/ejic.202100206
    Typ Journal Article
    Autor Li C
    Journal European Journal of Inorganic Chemistry
    Seiten 1904-1912
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Synthesis of Pyrroles via Consecutive 6p-Electrocyclization/Ring-Contraction of Sulfilimines
    DOI 10.1021/jacs.1c04835
    Typ Journal Article
    Autor Haut F
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 9002-9008
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Rapid Assembly of Tetrasubstituted Furans via Pummerer-Type Rearrangement
    DOI 10.1021/jacs.0c12194
    Typ Journal Article
    Autor Haut F
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 1216-1223
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Decomposing anharmonicity and mode-coupling from matrix effects in the IR spectra of matrix-isolated carbon dioxide and methane
    DOI 10.1039/d0cp02121k
    Typ Journal Article
    Autor Dinu D
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 17932-17947
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Synthesis of Vicinal Quaternary All-Carbon Centers via Acid-catalyzed Cycloisomerization of Neopentylic Epoxides
    DOI 10.1021/acs.orglett.0c02296
    Typ Journal Article
    Autor Schmid M
    Journal Organic Letters
    Seiten 6526-6531
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Replacement of the Cobalt Center of Vitamin B12 by Nickel: Nibalamin and Nibyric Acid Prepared from Metal-Free B12 Ligands Hydrogenobalamin and Hydrogenobyric Acid
    DOI 10.1002/ange.202008407
    Typ Journal Article
    Autor Kieninger C
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 20304-20311
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Replacement of the Cobalt Center of Vitamin B12 by Nickel: Nibalamin and Nibyric Acid Prepared from Metal-Free B12 Ligands Hydrogenobalamin and Hydrogenobyric Acid
    DOI 10.1002/anie.202008407
    Typ Journal Article
    Autor Kieninger C
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 20129-20136
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The intermolecular anthracene-transfer in a regiospecific antipodal C 60 difunctionalization
    DOI 10.1039/d0ob00520g
    Typ Journal Article
    Autor Talmazan R
    Journal Organic & Biomolecular Chemistry
    Seiten 4090-4103
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Ni[B2(SO4)4] and Co[B2(SO4)4]: Unveiling Systematic Trends in Phyllosilicate Analogue Borosulfates
    DOI 10.1002/chem.202002221
    Typ Journal Article
    Autor Pasqualini L
    Journal Chemistry – A European Journal
    Seiten 17405-17415
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Crystal Structure and Properties of a UV-Transparent High-Pressure Polymorph of Mg3TeO6 with Second Harmonic Generation Response
    DOI 10.1002/ejic.201900998
    Typ Journal Article
    Autor Selb E
    Journal European Journal of Inorganic Chemistry
    Seiten 4668-4676
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Cationic Cycloheptatrienyl Cyclopentadienyl Manganese Sandwich Complexes: Tromancenium Explored with High-Power LED Photosynthesis
    DOI 10.1021/acs.organomet.1c00376
    Typ Journal Article
    Autor Basse R
    Journal Organometallics
    Seiten 2736-2749
    Link Publikation
  • 2021
    Titel On the Origin of E-Selectivity in the Ring-Opening Metathesis Polymerization with Molybdenum Imido Alkylidene N-Heterocyclic Carbene Complexes
    DOI 10.1021/acs.organomet.1c00229
    Typ Journal Article
    Autor Podewitz M
    Journal Organometallics
    Seiten 2478-2488
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Encapsulation Enhances the Catalytic Activity of C-N Coupling: Reaction Mechanism of a Cu(I)/Calix[8]arene Supramolecular Catalyst
    DOI 10.1002/cctc.202200662
    Typ Journal Article
    Autor Talmazan R
    Journal ChemCatChem
    Link Publikation
  • 2019
    Titel The Hydrogenobyric Acid Structure Reveals the Corrin Ligand as an Entatic State Module Empowering B12 Cofactors for Catalysis
    DOI 10.1002/anie.201904713
    Typ Journal Article
    Autor Kieninger C
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 10756-10760
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Die Hydrogenobyrsäure-Struktur enthüllt den Corrin-Liganden als entatisches Zustandsmodul zur Steigerung der Katalyseaktivität von B12-Cofaktoren
    DOI 10.1002/ange.201904713
    Typ Journal Article
    Autor Kieninger C
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 10869-10873
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Coil–Globule Transition Thermodynamics of Poly(N-isopropylacrylamide)
    DOI 10.1021/acs.jpcb.9b06125
    Typ Journal Article
    Autor Podewitz M
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 8838-8847
  • 2019
    Titel Alpha-Carbonic Acid Revisited: Carbonic Acid Monomethyl Ester as a Solid and its Conformational Isomerism in the Gas Phase
    DOI 10.1002/chem.201904142
    Typ Journal Article
    Autor Köck E
    Journal Chemistry – A European Journal
    Seiten 285-305
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Toward Elimination of Discrepancies between Theory and Experiment: Anharmonic Rotational–Vibrational Spectrum of Water in Solid Noble Gas Matrices
    DOI 10.1021/acs.jpca.9b07221
    Typ Journal Article
    Autor Dinu D
    Journal The Journal of Physical Chemistry A
    Seiten 8234-8242
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Zinc Substitution of Cobalt in Vitamin B12: Zincobyric acid and Zincobalamin as Luminescent Structural B12-Mimics
    DOI 10.1002/ange.201908428
    Typ Journal Article
    Autor Kieninger C
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 14710-14714
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Zinc Substitution of Cobalt in Vitamin B12: Zincobyric acid and Zincobalamin as Luminescent Structural B12-Mimics
    DOI 10.1002/anie.201908428
    Typ Journal Article
    Autor Kieninger C
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 14568-14572
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Mechanism of Olefin Metathesis with Neutral and Cationic Molybdenum Imido Alkylidene N-Heterocyclic Carbene Complexes
    DOI 10.1021/jacs.9b02092
    Typ Journal Article
    Autor Herz K
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 8264-8276
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Cu[B2(SO4)4] und Cu[B(SO4)2(HSO4)] – zwei silicatanaloge Borosulfate unterschiedlicher Dimensionalität: Vergleich von Stabilität und Azidität
    DOI 10.1002/ange.201803395
    Typ Journal Article
    Autor Bruns J
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 9693-9697
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Phase Diagram of a Stratum Corneum Lipid Mixture
    DOI 10.1021/acs.jpcb.8b07200
    Typ Journal Article
    Autor Podewitz M
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 10505-10521
  • 2018
    Titel Novel Types of Hypermodified Fluorescent Phyllobilins from Breakdown of Chlorophyll in Senescent Leaves of Grapevine (Vitis vinifera)
    DOI 10.1002/chem.201803128
    Typ Journal Article
    Autor Erhart T
    Journal Chemistry – A European Journal
    Seiten 17268-17279
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Pyro-Phyllobilins: Elusive Chlorophyll Catabolites Lacking a Critical Carboxylate Function of the Natural Chlorophylls
    DOI 10.1002/chem.201705331
    Typ Journal Article
    Autor Li C
    Journal Chemistry – A European Journal
    Seiten 2987-2998
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Highly Electrophilic, Catalytically Active and Redox-Responsive Cobaltoceniumyl and Ferrocenyl Triazolylidene Coinage Metal Complexes
    DOI 10.1002/chem.201705051
    Typ Journal Article
    Autor Vanicek S
    Journal Chemistry – A European Journal
    Seiten 3742-3753
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Cobaltocenylidene: A Mesoionic Metalloceno Carbene, Stabilized in a Gold(III) Complex
    DOI 10.1002/chem.201800147
    Typ Journal Article
    Autor Vanicek S
    Journal Chemistry – A European Journal
    Seiten 3165-3169
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Thermosensitive Hydration of Four Acrylamide-Based Polymers in Coil and Globule Conformations
    DOI 10.1021/acs.jpcb.0c07232
    Typ Journal Article
    Autor Quoika P
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 9745-9756
    Link Publikation
  • 2020
    Titel N-Heterocyclic Carbene Gold(I) Complexes: Mechanism of the Ligand Scrambling Reaction and Their Oxidation to Gold(III) in Aqueous Solutions
    DOI 10.1021/acs.inorgchem.0c02298
    Typ Journal Article
    Autor Goetzfried S
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 15312-15323
    Link Publikation
  • 2020
    Titel On the synergy of matrix-isolation infrared spectroscopy and vibrational configuration interaction computations
    DOI 10.1007/s00214-020-02682-0
    Typ Journal Article
    Autor Dinu D
    Journal Theoretical Chemistry Accounts
    Seiten 174
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Cu[B2(SO4)4] and Cu[B(SO4)2(HSO4)]—Two Silicate Analogue Borosulfates Differing in their Dimensionality: A Comparative Study of Stability and Acidity
    DOI 10.1002/anie.201803395
    Typ Journal Article
    Autor Bruns J
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 9548-9552
    Link Publikation
  • 2017
    Titel CaB2S4O16: A Borosulfate Exhibiting a New Structure Type with Phyllosilicate Analogue Topology
    DOI 10.1002/chem.201704228
    Typ Journal Article
    Autor Bruns J
    Journal Chemistry – A European Journal
    Seiten 16773-16781
  • 2017
    Titel High-Pressure Synthesis and Characterization of the Ammonium Yttrium Borate (NH4)YB8O14
    DOI 10.1021/acs.inorgchem.7b02402
    Typ Journal Article
    Autor Schmitt M
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 14291-14299
  • 2017
    Titel Balance between hydration enthalpy and entropy is important for ice binding surfaces in Antifreeze Proteins
    DOI 10.1038/s41598-017-11982-8
    Typ Journal Article
    Autor Schauperl M
    Journal Scientific Reports
    Seiten 11901
    Link Publikation
Disseminationen
  • 2017
    Titel Junge Uni
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2020
    Titel Invited speaker
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2019
    Titel Oral presentation award
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Invited speaker SILCOM
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel DK-CIM Winterschool
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2017
    Titel Polymat 2017
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2021
    Titel Reactivity and Selectivity in Olefin Metathesis
    Typ Other
    Förderbeginn 2021

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