Evolution der Sekundärstoffwechselsynthese in Flechten
Evolution of secondary metabolite synthesis in lichens
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Evolution,
Lichens,
Melanin,
Anthraquinone,
Paralogy,
Polyketide Synthase
Flechtenpilze erinnern an winzige chemische Laboratorien, die eine große Bandbreite von mehr als 800 Inhaltsstoffen produzieren können. Sie repräsentieren daher ideale Modellorganismen um die Evolution der Sekundärstoffchemie zu untersuchen. In diesem Projekt werden wir uns auf die Diversität und Evolution von Polyketidsynthasegenen konzentrieren, die in wichtigen Sekundärstoffwechselwegen involviert sind. Durch einen Vergleich mit organismischen Phylogenien, die auf der Analyse ribosomaler Gene beruhen, werden wir Muster von Homologie und Paralogie dieser Gene feststellen. Eine Genbank wird verwendet um die Vielfalt der Polyketidsynthasegene in einem ausgewählten Flechtenpilz zu untersuchen und weitere Gene zu entdecken, die für die Produktion von Anthrachinonen verantwortlich sind. In anderen Flechten wird die Phylogenie einzelner Gene rekonstruiert, die an der Produktion von Melanin und Anthrachinon beteiligt sind. Co-phylogenetische Studien mit mehreren Genen werden genutzt, u die Evolution von Biosynthesewegen zu untersuchen.
Flechtenpilze erinnern an winzige chemische Laboratorien, die eine große Bandbreite von mehr als 800 Inhaltsstoffen produzieren können. Sie repräsentieren daher ideale Modellorganismen um die Evolution der Sekundärstoffchemie zu untersuchen. In diesem Projekt werden wir uns auf die Diversität und Evolution von Polyketidsynthasegenen konzentrieren, die in wichtigen Sekundärstoffwechselwegen involviert sind. Durch einen Vergleich mit organismischen Phylogenien, die auf der Analyse ribosomaler Gene beruhen, werden wir Muster von Homologie und Paralogie dieser Gene feststellen. Eine Genbank wird verwendet um die Vielfalt der Polyketidsynthasegene in einem ausgewählten Flechtenpilz zu untersuchen und weitere Gene zu entdecken, die für die Produktion von Anthrachinonen verantwortlich sind. In anderen Flechten wird die Phylogenie einzelner Gene rekonstruiert, die an der Produktion von Melanin und Anthrachinon beteiligt sind. Co-phylogenetische Studien mit mehreren Genen werden genutzt, u die Evolution von Biosynthesewegen zu untersuchen.
- Universität Graz - 100%
- Sandra Scherrer, University of Zurich - Schweiz
Research Output
- 44 Zitationen
- 2 Publikationen
-
2008
Titel A transcribed polyketide synthase gene from Xanthoria elegans DOI 10.1016/j.mycres.2008.08.007 Typ Journal Article Autor Brunauer G Journal Mycological Research Seiten 82-92 -
2007
Titel Purifying selection is a prevailing motif in the evolution of ketoacyl synthase domains of polyketide synthases from lichenized fungi DOI 10.1016/j.mycres.2007.08.020 Typ Journal Article Autor Muggia L Journal Mycological Research Seiten 277-288