Fukosylierung und Defukosylierung in A. thaliana
Fucosylation and defucosylation in A. thaliana
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Arabidopsis thaliana,
Rhamnogalacturonan,
Fucosyltransferase,
Xyloglucan,
Fucosidase,
Arabinogalactan Protein
Thema 1, a1,2-Fucosyltransferasen: Es sollen die cDNAs für die Xyloglucan a1,2-Fucosyltransferase Homologe aus A. thaliana kloniert und exprimiert werden. Die rekombinanten Proteine werden auf ihre enzymatische Aktivität getestet. Potentielle Promotor Sequenzen der 10 Mitglieder der Xyloglucan Fucosyltransferase Familie sollen kloniert und zur Bestimmung ihrer zeitlichen und räumlichen Expressionsmuster verwendet werden. Die Wirkung biotischer und abiotischer Stressfaktoren und von Hormonen auf die Expressionsmuster der potentiellen Fucosyltransferasen wird untersucht werden. Die Untersuchung des Phenotyps von Mutanten soll mit besonderer Berücksichtigung der Entwicklungsphase und des Gewebes erfolgen, in dem die Promotorstudien im Wildtyp Genexpression gezeigt haben. Für diese Stadien und Organe sollen biochemische und elektronenmikroskopische Analysen der Zellwandkomponenten durchgeführt werden. Thema 2, a1,2-Fucosidase: Diese Fukosidase wurde kürzlich in unserer Gruppe identifiziert und ihre Aktivität auf Xyloglucane gezeigt. Die Aktivitätsbestimmung soll auf Arabinogalactane und Rhamnogalacturonane ausgedehnt werden. Die Genexpression soll durch Promotorstudien, die Enzymverteilung durch Western Blot und die subzelluläre Lokalisierung durch Elektronenmikroskopie mithilfe dafür erzeugter Antikörper untersucht werden. Ausgehend von den hierbei erhaltenen Ergebnissen sollen die Xyloglucan-Strukturen in den relevanten Geweben und Entwicklungsstadi im Wildtyp und in Mutanten untersucht werden. Die Wirkung von Phytohormonen und des Nonasaccharids XXFG auf Mutanten und Wildtyp wird untersucht werden. Die a1,2-Fucosidase soll unter der Kontrolle des 35S Promotors via Agrobacterium Transformation überexprimiert werden. Die Wirkung auf Xyloglucan-Strukturen soll mittels Massenspektroskopie nach Verdau mit Endo-(1,4)-ß-D-Glucanase analysiert werden. Der Phänotyp der überexprimierenden Mutante soll während des Wachstums unter Normalbedingungen sowie unter Hormonstreß beobachtet werden. Thema 3, a1,3/4-Fucosidase: Der A. thaliana a1,3/4-Fucosidase Promotor wird mithilfe eines Fusionskonstruktes untersucht um eine allfällige Übereinstimmung mit dem Expressionsmuster von N-Glycanen mit Lewis a Determinanten zu erkennen. Western Blot und Immunlokalisierung sollen in verschiedenen A. thaliana Geweben durchgeführt werden. Dazu wird ein polyklonaler Antikörper mittels in E. coli exprimierter, rekombinanter a1,3/4- Fucosidase erzeugt. Das N-glycan Profil einer Mutante soll mit dem des Wildtyps verglichen werden.
Thema 1, a1,2-Fucosyltransferasen: Es sollen die cDNAs für die Xyloglucan a1,2-Fucosyltransferase Homologe aus A. thaliana kloniert und exprimiert werden. Die rekombinanten Proteine werden auf ihre enzymatische Aktivität getestet. Potentielle Promotor Sequenzen der 10 Mitglieder der Xyloglucan Fucosyltransferase Familie sollen kloniert und zur Bestimmung ihrer zeitlichen und räumlichen Expressionsmuster verwendet werden. Die Wirkung biotischer und abiotischer Stressfaktoren und von Hormonen auf die Expressionsmuster der potentiellen Fucosyltransferasen wird untersucht werden. Die Untersuchung des Phenotyps von Mutanten soll mit besonderer Berücksichtigung der Entwicklungsphase und des Gewebes erfolgen, in dem die Promotorstudien im Wildtyp Genexpression gezeigt haben. Für diese Stadien und Organe sollen biochemische und elektronenmikroskopische Analysen der Zellwandkomponenten durchgeführt werden. Thema 2, a1,2-Fucosidase: Diese Fukosidase wurde kürzlich in unserer Gruppe identifiziert und ihre Aktivität auf Xyloglucane gezeigt. Die Aktivitätsbestimmung soll auf Arabinogalactane und Rhamnogalacturonane ausgedehnt werden. Die Genexpression soll durch Promotorstudien, die Enzymverteilung durch Western Blot und die subzelluläre Lokalisierung durch Elektronenmikroskopie mithilfe dafür erzeugter Antikörper untersucht werden. Ausgehend von den hierbei erhaltenen Ergebnissen sollen die Xyloglucan-Strukturen in den relevanten Geweben und Entwicklungsstadi im Wildtyp und in Mutanten untersucht werden. Die Wirkung von Phytohormonen und des Nonasaccharids XXFG auf Mutanten und Wildtyp wird untersucht werden. Die a1,2-Fucosidase soll unter der Kontrolle des 35S Promotors via Agrobacterium Transformation überexprimiert werden. Die Wirkung auf Xyloglucan-Strukturen soll mittels Massenspektroskopie nach Verdau mit Endo-(1,4)-ß-D-Glucanase analysiert werden. Der Phänotyp der überexprimierenden Mutante soll während des Wachstums unter Normalbedingungen sowie unter Hormonstreß beobachtet werden. Thema 3, a1,3/4-Fucosidase: Der A. thaliana a1,3/4-Fucosidase Promotor wird mithilfe eines Fusionskonstruktes untersucht um eine allfällige Übereinstimmung mit dem Expressionsmuster von N-Glycanen mit Lewis a Determinanten zu erkennen. Western Blot und Immunlokalisierung sollen in verschiedenen A. thaliana Geweben durchgeführt werden. Dazu wird ein polyklonaler Antikörper mittels in E. coli exprimierter, rekombinanter a1,3/4- Fucosidase erzeugt. Das N-glycan Profil einer Mutante soll mit dem des Wildtyps verglichen werden.
- Guy Costa, Université de Limoges - Frankreich
Research Output
- 279 Zitationen
- 5 Publikationen
-
2020
Titel Surface Analysis of Biodegradable Mg-Alloys after Immersion in Simulated Body Fluid DOI 10.3390/ma13071740 Typ Journal Article Autor Petrovic D Journal Materials Seiten 1740 Link Publikation -
2013
Titel Rhamnogalacturonan II structure shows variation in the side chains monosaccharide composition and methylation status within and across different plant species DOI 10.1111/tpj.12271 Typ Journal Article Autor Pabst M Journal The Plant Journal Seiten 61-72 Link Publikation -
2008
Titel Identification of an Arabidopsis gene encoding a GH95 alpha1,2-fucosidase active on xyloglucan oligo- and polysaccharides DOI 10.1016/j.phytochem.2008.03.024 Typ Journal Article Autor Léonard R Journal Phytochemistry Seiten 1983-1988 -
2011
Titel The two endo-ß-N-acetylglucosaminidase genes from Arabidopsis thaliana encode cytoplasmic enzymes controlling free N-glycan levels DOI 10.1007/s11103-011-9808-7 Typ Journal Article Autor Fischl R Journal Plant Molecular Biology Seiten 275 -
2010
Titel Nucleotide and Nucleotide Sugar Analysis by Liquid Chromatography-Electrospray Ionization-Mass Spectrometry on Surface-Conditioned Porous Graphitic Carbon DOI 10.1021/ac101975k Typ Journal Article Autor Pabst M Journal Analytical Chemistry Seiten 9782-9788 Link Publikation