Vergleichende Glykomik ausgewählter Nematoden
Comparative Glycomics of Selected Nematodes
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (70%); Gesundheitswissenschaften (10%); Physik, Astronomie (20%)
Keywords
-
Nematode,
N-Glycan,
Parasite,
Oesophagostomum
Nematoden, nicht-segmentierte Rundwürmer, haben sich im Laufe der Millionen Jahre dauernden Evolution an verschiedene ökologische Nischen angepasst. Viele Mitglieder dieser Organismen sind Parasiten - entweder von Menschen, Wirbellosen, Wirbeltieren oder Pflanzen während einige Nematoden einen frei lebenden Lebensstil aufweisen. Die parasitären Lebensformen haben sich innerhalb der Nematodenfamilie mehrmals unabhängig voneinander entwickelt und sind jetzt in vier der fünf Untergruppen anzutreffen. Oesophagostomum dentatum, der Knötchenwurm des Schweins, ein parasitärer Vertreter der Strongylida, einer Untergruppe des Nematoden Stammbaums, mit wesentlichen Säugetierparasiten und unmittelbaren Verwandten von Caenorhabditis elegans soll im Zentrum dieser Studie stehen. Die Oberfläche von Oesophagostomum dentatum, die großteils aus Glykoproteinen besteht, ist an das Immunsystem des Wirtes angepasst und verhindert die Ausbildung einer Immunität seitens des Wirtes. Besonders seine N-Glykan Epitope, Verzierungen der Proteinoberflächen, werden in Hinsicht auf ihre unterschiedliche Präsentation während der Entwicklung des Parasiten analysiert. Die spezifischen Epitope des invasiven dritten (L3) und des parasitären vierten (L4) Larvenstadiums, deren exkretorischen und sekretorischen Produkte als auch die geschlechtsspezifischen Ausprägungen der Darm bewohnenden adulten Würmer werden im Detail mit Hilfe von immunologischen, chromatographischen und massenspektrometrischen Verfahren untersucht. Im Vergleich von Oesophagostomum dentatum mit seinen frei lebenden nahen Verwandten wie dem Modellorganismus Caenorhabditis elegans, Caenorhabditis briggsae, Caenorhabditis remanei, Caenorhabditis japonica und Pristionchus pacificus sollen Epitope, die den parasitären Lebensstil unterstützen, definiert werden. Diese Studie soll dazu beitragen, die immunogenen und immunmodulierenden Glykane, der Nematoden besser zu verstehen.
Nematoden, nicht-segmentierte Rundwürmer, haben sich im Laufe der Millionen Jahre dauernden Evolution an verschiedene ökologische Nischen angepasst. Viele Mitglieder dieser Organismen sind Parasiten - entweder von Menschen, Wirbellosen, Wirbeltieren oder Pflanzen während einige Nematoden einen frei lebenden Lebensstil aufweisen. Die parasitären Lebensformen haben sich innerhalb der Nematodenfamilie mehrmals unabhängig voneinander entwickelt und sind jetzt in vier der fünf Untergruppen anzutreffen. Oesophagostomum dentatum, der Knötchenwurm des Schweins, ein parasitärer Vertreter der Strongylida, einer Untergruppe des Nematoden Stammbaums, mit wesentlichen Säugetierparasiten und unmittelbaren Verwandten von Caenorhabditis elegans stand im Zentrum dieser Studie. Die Oberfläche von Oesophagostomum dentatum, die großteils aus Glykoproteinen besteht, ist an das Immunsystem des Wirtes angepasst und verhindert die Ausbildung einer Immunität seitens des Wirtes. Besonders seine N-Glykan Epitope, Verzierungen der Proteinoberflächen, wurden in Hinsicht auf ihre unterschiedliche Präsentation während der Entwicklung des Parasiten analysiert. Die spezifischen Epitope des invasiven dritten (L3) und des parasitären vierten (L4) Larvenstadiums als auch die geschlechtsspezifischen Ausprägungen der Darm bewohnenden adulten Würmer wurden im Detail mit Hilfe von chromatographischen und massenspektrometrischen Verfahren untersucht. Im Vergleich von Oesophagostomum dentatum mit seinen frei lebenden nahen Verwandten wie den Modellorganismen Caenorhabditis elegans und Pristionchus pacificus als auch den parasitären Trichuris suis wurden verschiedene Glykanepitope definiert. Diese Studie trägt bei, die immunogenen und immunmodulierenden Glykane, der Nematoden besser zu verstehen.
- Anja Joachim, Veterinärmedizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 846 Zitationen
- 28 Publikationen
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2019
Titel Anionic and zwitterionic moieties as widespread glycan modifications in non-vertebrates DOI 10.1007/s10719-019-09874-2 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycoconjugate Journal Seiten 27-40 Link Publikation -
2019
Titel Comparisons of N-glycans across invertebrate phyla DOI 10.1017/s0031182019000398 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Parasitology Seiten 1733-1742 Link Publikation -
2018
Titel Glycomics Studies on Nematodes Elucidate Conserved Functional Epitopes and Biosynthetic Pathways DOI 10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.673.17 Typ Journal Article Autor Yan S Journal The FASEB Journal Seiten 673.17-673.17 -
2020
Titel Biochemical Characterization of Oyster and Clam Galectins: Selective Recognition of Carbohydrate Ligands on Host Hemocytes and Perkinsus Parasites DOI 10.3389/fchem.2020.00098 Typ Journal Article Autor Vasta G Journal Frontiers in Chemistry Seiten 98 Link Publikation -
2018
Titel Ablation of N-acetylglucosaminyltransferases in Caenorhabditis induces expression of unusual intersected and bisected N-glycans DOI 10.1016/j.bbagen.2018.07.002 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 2191-2203 Link Publikation -
2015
Titel Comparisons of Caenorhabditis Fucosyltransferase Mutants Reveal a Multiplicity of Isomeric N-Glycan Structures DOI 10.1021/acs.jproteome.5b00746 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Journal of Proteome Research Seiten 5291-5305 Link Publikation -
2015
Titel Sweet secrets of a therapeutic worm: mass-spectrometric N-glycomic analysis of Trichuris suis DOI 10.1007/s00216-015-9154-8 Typ Journal Article Autor Wilson I Journal Analytical and Bioanalytical Chemistry Seiten 461-471 Link Publikation -
2015
Titel Comparison of RP-HPLC modes to analyse the N-glycome of the free-living nematode Pristionchus pacificus DOI 10.1002/elps.201400528 Typ Journal Article Autor Yan S Journal ELECTROPHORESIS Seiten 1314-1329 Link Publikation -
2015
Titel Two types of galactosylated fucose motifs are present on N-glycans of Haemonchus contortus DOI 10.1093/glycob/cwv015 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycobiology Seiten 585-590 Link Publikation -
2016
Titel Structure and biosynthesis of complex N-glycan cores and antennae in nematodes DOI 10.1096/fasebj.30.1_supplement.843.4 Typ Journal Article Autor Wilson I Journal The FASEB Journal Link Publikation -
2016
Titel Gender and developmental specific N-glycomes of the porcine parasite Oesophagostomum dentatum DOI 10.1016/j.bbagen.2016.10.011 Typ Journal Article Autor Jiménez-Castells C Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 418-430 Link Publikation -
2016
Titel Analysis of zwitterionic and anionic N-linked glycans from invertebrates and protists by mass spectrometry DOI 10.1007/s10719-016-9650-x Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycoconjugate Journal Seiten 273-283 Link Publikation -
2017
Titel Core Richness of N-Glycans of Caenorhabditis elegans: A Case Study on Chemical and Enzymatic Release DOI 10.1021/acs.analchem.7b03898 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Analytical Chemistry Seiten 928-935 Link Publikation -
2015
Titel The fucomic potential of mosquitoes: Fucosylated N-glycan epitopes and their cognate fucosyltransferases DOI 10.1016/j.ibmb.2015.11.001 Typ Journal Article Autor Kurz S Journal Insect Biochemistry and Molecular Biology Seiten 52-63 Link Publikation -
2015
Titel Bisecting Galactose as a Feature of N-Glycans of Wild-type and Mutant Caenorhabditis elegans * [S] DOI 10.1074/mcp.m115.049817 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 2111-2125 Link Publikation -
2015
Titel Targeted release and fractionation reveal glucuronylated and sulphated N- and O-glycans in larvae of dipteran insects DOI 10.1016/j.jprot.2015.05.030 Typ Journal Article Autor Kurz S Journal Journal of Proteomics Seiten 172-188 Link Publikation -
2014
Titel N-glycomic profiling of a glucosidase II mutant of Dictyostelium discoideum by ‘‘off-line’’ liquid chromatography and mass spectrometry DOI 10.1002/elps.201300612 Typ Journal Article Autor Hykollari A Journal ELECTROPHORESIS Seiten 2116-2129 Link Publikation -
2014
Titel Comparative Glycobiology DOI 10.1007/978-4-431-54836-2_153-1 Typ Book Chapter Autor Paschinger K Verlag Springer Nature Seiten 1-10 -
2011
Titel Glycomarkers in parasitic infections and allergy DOI 10.1042/bst0390360 Typ Journal Article Autor Hoffmann-Sommergruber K Journal Biochemical Society Transactions Seiten 360-364 -
2011
Titel The N-glycans of Trichomonas vaginalis contain variable core and antennal modifications DOI 10.1093/glycob/cwr149 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycobiology Seiten 300-313 Link Publikation -
2013
Titel Hemocytes and Plasma of the Eastern Oyster (Crassostrea virginica) Display a Diverse Repertoire of Sulfated and Blood Group A-modified N-Glycans* DOI 10.1074/jbc.m113.478933 Typ Journal Article Autor Kurz S Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 24410-24428 Link Publikation -
2014
Titel Comparative Glycobiology DOI 10.1007/978-4-431-54841-6_153 Typ Book Chapter Autor Paschinger K Verlag Springer Nature Seiten 795-805 -
2013
Titel Array-assisted Characterization of a Fucosyltransferase Required for the Biosynthesis of Complex Core Modifications of Nematode N-Glycans* DOI 10.1074/jbc.m113.479147 Typ Journal Article Autor Yan ?? S Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 21015-21028 Link Publikation -
2013
Titel Mass Spectrometric Analysis of Neutral and Anionic N-Glycans from a Dictyostelium discoideum Model for Human Congenital Disorder of Glycosylation CDG IL DOI 10.1021/pr300806b Typ Journal Article Autor Hykollari A Journal Journal of Proteome Research Seiten 1173-1187 Link Publikation -
2012
Titel Mass spectrometric analysis of the immunodominant glycan epitope of Echinococcus granulosus antigen Ag5 DOI 10.1016/j.ijpara.2012.01.002 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal International Journal for Parasitology Seiten 279-285 Link Publikation -
2012
Titel Galactosylated Fucose Epitopes in Nematodes INCREASED EXPRESSION IN A CAENORHABDITIS MUTANT ASSOCIATED WITH ALTERED LECTIN SENSITIVITY AND OCCURRENCE IN PARASITIC SPECIES* DOI 10.1074/jbc.m112.353128 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 28276-28290 Link Publikation -
2012
Titel Complicated N-linked glycans in simple organisms DOI 10.1515/hsz-2012-0150 Typ Journal Article Autor Schiller B Journal Biological chemistry Seiten 661-673 Link Publikation -
2011
Titel Presence of galactosylated core fucose on N-glycans in the planaria Dugesia japonica DOI 10.1002/jms.1925 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Journal of Mass Spectrometry Seiten 561-567 Link Publikation