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Glykosylierung von Caenorhabditis elegans III

Glycosylation of Caenorhabditis elegans III

Iain B. Wilson (ORCID: 0000-0001-8996-1518)
  • Grant-DOI 10.55776/P23922
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2012
  • Projektende 31.12.2016
  • Bewilligungssumme 333.890 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (90%); Chemie (10%)

Keywords

    Fucosyltransferase, Nematode, Mass spectrometry, Glycan analysis, Glycomutants, Azidofucose

Abstract Endbericht

Der Model Organismus Caenorhabditis elegans wird zwar auf genetischer Ebene intensiv studiert jedoch seine Glykosylierungsmuster, Schlüsselmodifikationen an der Zelloberfläche, sind noch immer kaum untersucht. Neueste Ergebnisse dieses und anderer Labors deuten darauf hin, daß kovalent an Nematodenproteine gebundene Kohlenhydrate gemeinsame Strukturen wie in Säugetieren aufweisen, daneben jedoch bis dato neuartige Strukturen existieren. Speziell das Vorkommen von Asparagin gebundenen Glykanstrukturen mit bis zu vier fukosylierten Resten substituiert mit zwei O-Methylgruppen alsauch das Vorkommen von Phosphorylcholin als Modifikation ist faszinierend. O-Methylgruppen wurden bereits auf O-Glykanen der Nematoden gefunden, auch Phosphorylcholin modifizierte Glykolipide sind bekannt. Einige dieser Merkmale teilt Caenorhabditis elegans zumindest teiweise mit parasitären Nematoden und ist daher ein nützliches Model um neue Strategien in der Untersuchung dieser Oligosaccaridstrukturen mit Hinblick auf Bekämpfungsmaßnahmen gegen die parasitären Nematoden zu entwickeln. Zielsetzung der vorgeschlagenen Studie ist das Wissen über die Biosynthese und Struktur der N- Glykanen weiter zu vertiefen. Durch Verwendung von Doppelmutanten zur Glykananalyse, der Untersuchung einer bisher unbekannten Fukosyltransferaseaktivität und unter zu Hilfenahme einer chemischen Sonde für Fukosylierung werden eine Reihe biochemischer und analytischer Werkzeuge angewandt um die molekulare Basis für die mehrfache Fukosylierung zu entschlüssen. Ziel dieser Studie ist es Enzyme zu identifizieren, die nematodenspezifische Glykanstrukturen synthetisieren und dadurch die Wirt-Parasit Wechselwirkung wesentlich beeinflussen.

Der Model Organismus Caenorhabditis elegans wird zwar auf genetischer Ebene intensiv studiert jedoch seine Glykosylierungsmuster, Schlüsselmodifikationen an der Zelloberfläche, sind noch immer kaum untersucht. Neueste Ergebnisse dieses und anderer Labors deuten darauf hin, dass kovalent an Nematodenproteine gebundene Kohlenhydrate gemeinsame Strukturen wie in Säugetieren aufweisen, daneben jedoch bis dato neuartige Strukturen existieren. Speziell das Vorkommen von Asparagin gebundenen Glykanstrukturen mit bis zu vier fukosylierten Resten substituiert mit zwei O-Methylgruppen als auch das Vorkommen von Phosphorylcholin als Modifikation ist faszinierend. O-Methylgruppen wurden bereits auf O-Glykanen der Nematoden gefunden, auch Phosphorylcholin modifizierte Glykolipide sind bekannt. Einige dieser Merkmale teilt Caenorhabditis elegans zumindest teilweise mit parasitären Nematoden und ist daher ein nützliches Model um neue Strategien in der Untersuchung dieser Oligosaccaridstrukturen mit Hinblick auf Bekämpfungsmaßnahmen gegen die parasitären Nematoden zu entwickeln. Zielsetzung der Studie war das Wissen über die Biosynthese und Struktur der N-Glykanen weiter zu vertiefen. Durch Verwendung von Doppelmutanten und die Entdeckung einer bisher unbekannten Fukosyltransferaseaktivität wurden eine Reihe biochemischer und analytischer Werkzeuge angewandt um die molekulare Basis für die mehrfache Fukosylierung zu entschlüsseln. Weiters wurden andere unübliche Glykosylierungen entdeckt mit Parallelen zu Glykanstrukturen von Insekten. Es bleibt ein zukünftiges Ziel Enzyme zu identifizieren, die nematodenspezifische Glykanstrukturen synthetisieren und dadurch die Wirt-Parasit Wechselwirkung wesentlich beeinflussen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 80%
  • Universität Wien - 20%
Nationale Projektbeteiligte
  • Verena Jantsch-Plunger, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Markus Künzler, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich - Schweiz
  • Niels-Christian Reichardt, CICbiomaGUNE - Spanien

Research Output

  • 545 Zitationen
  • 24 Publikationen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2024
    Titel Recognition of Highly Branched N-Glycans of the Porcine Whipworm by the Immune System.
    DOI 10.1016/j.mcpro.2024.100711
    Typ Journal Article
    Autor Eckmair B
    Journal Molecular & cellular proteomics : MCP
    Seiten 100711
  • 2023
    Titel Increasing Complexity of the N-Glycome During Caenorhabditis Development.
    DOI 10.1016/j.mcpro.2023.100505
    Typ Journal Article
    Autor Wilson Ibh
    Journal Molecular & cellular proteomics : MCP
    Seiten 100505
  • 2019
    Titel Anionic and zwitterionic moieties as widespread glycan modifications in non-vertebrates
    DOI 10.1007/s10719-019-09874-2
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Glycoconjugate Journal
    Seiten 27-40
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Comparisons of N-glycans across invertebrate phyla
    DOI 10.1017/s0031182019000398
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Parasitology
    Seiten 1733-1742
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Glycomics Studies on Nematodes Elucidate Conserved Functional Epitopes and Biosynthetic Pathways
    DOI 10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.673.17
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal The FASEB Journal
    Seiten 673.17-673.17
  • 2014
    Titel Comparative Glycobiology
    DOI 10.1007/978-4-431-54836-2_153-1
    Typ Book Chapter
    Autor Paschinger K
    Verlag Springer Nature
    Seiten 1-10
  • 2016
    Titel Structure and biosynthesis of complex N-glycan cores and antennae in nematodes
    DOI 10.1096/fasebj.30.1_supplement.843.4
    Typ Journal Article
    Autor Wilson I
    Journal The FASEB Journal
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Analysis of zwitterionic and anionic N-linked glycans from invertebrates and protists by mass spectrometry
    DOI 10.1007/s10719-016-9650-x
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Glycoconjugate Journal
    Seiten 273-283
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Protein-Specific Analysis of Invertebrate Glycoproteins
    DOI 10.1007/978-1-4939-8814-3_24
    Typ Book Chapter
    Autor Hykollari A
    Verlag Springer Nature
    Seiten 421-435
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Ablation of N-acetylglucosaminyltransferases in Caenorhabditis induces expression of unusual intersected and bisected N-glycans
    DOI 10.1016/j.bbagen.2018.07.002
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects
    Seiten 2191-2203
    Link Publikation
  • 2017
    Titel The expanding glycouniverse: diverse glycan modifications in lower eukaryotes
    DOI 10.1096/fasebj.31.1_supplement.784.5
    Typ Journal Article
    Autor Wilson I
    Journal The FASEB Journal
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Core Richness of N-Glycans of Caenorhabditis elegans: A Case Study on Chemical and Enzymatic Release
    DOI 10.1021/acs.analchem.7b03898
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 928-935
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Synthesis of a ß-d-Psicofuranosyl Sulfone and Inhibitory-Activity Evaluation Against N-Acetylglucosaminyltransferase I
    DOI 10.1002/ejoc.201701102
    Typ Journal Article
    Autor Bella M
    Journal European Journal of Organic Chemistry
    Seiten 6179-6191
  • 2017
    Titel The underestimated N-glycomes of lepidopteran species
    DOI 10.1016/j.bbagen.2017.01.009
    Typ Journal Article
    Autor Stanton R
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects
    Seiten 699-714
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Bisecting Galactose as a Feature of N-Glycans of Wild-type and Mutant Caenorhabditis elegans * [S]
    DOI 10.1074/mcp.m115.049817
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Molecular & Cellular Proteomics
    Seiten 2111-2125
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Two types of galactosylated fucose motifs are present on N-glycans of Haemonchus contortus
    DOI 10.1093/glycob/cwv015
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Glycobiology
    Seiten 585-590
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Analysis of Invertebrate and Protist N-Glycans
    DOI 10.1007/978-1-4939-6493-2_13
    Typ Book Chapter
    Autor Hykollari A
    Verlag Springer Nature
    Seiten 167-184
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Comparisons of Caenorhabditis Fucosyltransferase Mutants Reveal a Multiplicity of Isomeric N-Glycan Structures
    DOI 10.1021/acs.jproteome.5b00746
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 5291-5305
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Comparison of RP-HPLC modes to analyse the N-glycome of the free-living nematode Pristionchus pacificus
    DOI 10.1002/elps.201400528
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal ELECTROPHORESIS
    Seiten 1314-1329
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Sweet secrets of a therapeutic worm: mass-spectrometric N-glycomic analysis of Trichuris suis
    DOI 10.1007/s00216-015-9154-8
    Typ Journal Article
    Autor Wilson I
    Journal Analytical and Bioanalytical Chemistry
    Seiten 461-471
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Complicated N-linked glycans in simple organisms
    DOI 10.1515/hsz-2012-0150
    Typ Journal Article
    Autor Schiller B
    Journal Biological chemistry
    Seiten 661-673
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Comparative Glycobiology
    DOI 10.1007/978-4-431-54841-6_153
    Typ Book Chapter
    Autor Paschinger K
    Verlag Springer Nature
    Seiten 795-805
  • 2014
    Titel Enzymatic properties and subtle differences in the substrate specificity of phylogenetically distinct invertebrate N-glycan processing hexosaminidases
    DOI 10.1093/glycob/cwu132
    Typ Journal Article
    Autor Dragosits M
    Journal Glycobiology
    Seiten 448-464
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Array-assisted Characterization of a Fucosyltransferase Required for the Biosynthesis of Complex Core Modifications of Nematode N-Glycans*
    DOI 10.1074/jbc.m113.479147
    Typ Journal Article
    Autor Yan ?? S
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 21015-21028
    Link Publikation
Weitere Förderungen
  • 2016
    Titel Einzelprojekte
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2016
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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