Glykosylierung von Caenorhabditis elegans III
Glycosylation of Caenorhabditis elegans III
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (90%); Chemie (10%)
Keywords
-
Fucosyltransferase,
Nematode,
Mass spectrometry,
Glycan analysis,
Glycomutants,
Azidofucose
Der Model Organismus Caenorhabditis elegans wird zwar auf genetischer Ebene intensiv studiert jedoch seine Glykosylierungsmuster, Schlüsselmodifikationen an der Zelloberfläche, sind noch immer kaum untersucht. Neueste Ergebnisse dieses und anderer Labors deuten darauf hin, daß kovalent an Nematodenproteine gebundene Kohlenhydrate gemeinsame Strukturen wie in Säugetieren aufweisen, daneben jedoch bis dato neuartige Strukturen existieren. Speziell das Vorkommen von Asparagin gebundenen Glykanstrukturen mit bis zu vier fukosylierten Resten substituiert mit zwei O-Methylgruppen alsauch das Vorkommen von Phosphorylcholin als Modifikation ist faszinierend. O-Methylgruppen wurden bereits auf O-Glykanen der Nematoden gefunden, auch Phosphorylcholin modifizierte Glykolipide sind bekannt. Einige dieser Merkmale teilt Caenorhabditis elegans zumindest teiweise mit parasitären Nematoden und ist daher ein nützliches Model um neue Strategien in der Untersuchung dieser Oligosaccaridstrukturen mit Hinblick auf Bekämpfungsmaßnahmen gegen die parasitären Nematoden zu entwickeln. Zielsetzung der vorgeschlagenen Studie ist das Wissen über die Biosynthese und Struktur der N- Glykanen weiter zu vertiefen. Durch Verwendung von Doppelmutanten zur Glykananalyse, der Untersuchung einer bisher unbekannten Fukosyltransferaseaktivität und unter zu Hilfenahme einer chemischen Sonde für Fukosylierung werden eine Reihe biochemischer und analytischer Werkzeuge angewandt um die molekulare Basis für die mehrfache Fukosylierung zu entschlüssen. Ziel dieser Studie ist es Enzyme zu identifizieren, die nematodenspezifische Glykanstrukturen synthetisieren und dadurch die Wirt-Parasit Wechselwirkung wesentlich beeinflussen.
Der Model Organismus Caenorhabditis elegans wird zwar auf genetischer Ebene intensiv studiert jedoch seine Glykosylierungsmuster, Schlüsselmodifikationen an der Zelloberfläche, sind noch immer kaum untersucht. Neueste Ergebnisse dieses und anderer Labors deuten darauf hin, dass kovalent an Nematodenproteine gebundene Kohlenhydrate gemeinsame Strukturen wie in Säugetieren aufweisen, daneben jedoch bis dato neuartige Strukturen existieren. Speziell das Vorkommen von Asparagin gebundenen Glykanstrukturen mit bis zu vier fukosylierten Resten substituiert mit zwei O-Methylgruppen als auch das Vorkommen von Phosphorylcholin als Modifikation ist faszinierend. O-Methylgruppen wurden bereits auf O-Glykanen der Nematoden gefunden, auch Phosphorylcholin modifizierte Glykolipide sind bekannt. Einige dieser Merkmale teilt Caenorhabditis elegans zumindest teilweise mit parasitären Nematoden und ist daher ein nützliches Model um neue Strategien in der Untersuchung dieser Oligosaccaridstrukturen mit Hinblick auf Bekämpfungsmaßnahmen gegen die parasitären Nematoden zu entwickeln. Zielsetzung der Studie war das Wissen über die Biosynthese und Struktur der N-Glykanen weiter zu vertiefen. Durch Verwendung von Doppelmutanten und die Entdeckung einer bisher unbekannten Fukosyltransferaseaktivität wurden eine Reihe biochemischer und analytischer Werkzeuge angewandt um die molekulare Basis für die mehrfache Fukosylierung zu entschlüsseln. Weiters wurden andere unübliche Glykosylierungen entdeckt mit Parallelen zu Glykanstrukturen von Insekten. Es bleibt ein zukünftiges Ziel Enzyme zu identifizieren, die nematodenspezifische Glykanstrukturen synthetisieren und dadurch die Wirt-Parasit Wechselwirkung wesentlich beeinflussen.
- Universität Wien - 20%
- Universität für Bodenkultur Wien - 80%
- Verena Jantsch-Plunger, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 556 Zitationen
- 24 Publikationen
- 1 Weitere Förderungen
-
2019
Titel Anionic and zwitterionic moieties as widespread glycan modifications in non-vertebrates DOI 10.1007/s10719-019-09874-2 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycoconjugate Journal Seiten 27-40 Link Publikation -
2024
Titel Recognition of Highly Branched N-Glycans of the Porcine Whipworm by the Immune System DOI 10.1016/j.mcpro.2024.100711 Typ Journal Article Autor Eckmair B Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 100711 Link Publikation -
2018
Titel Glycomics Studies on Nematodes Elucidate Conserved Functional Epitopes and Biosynthetic Pathways DOI 10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.673.17 Typ Journal Article Autor Yan S Journal The FASEB Journal Seiten 673.17-673.17 -
2018
Titel Protein-Specific Analysis of Invertebrate Glycoproteins DOI 10.1007/978-1-4939-8814-3_24 Typ Book Chapter Autor Hykollari A Verlag Springer Nature Seiten 421-435 Link Publikation -
2018
Titel Ablation of N-acetylglucosaminyltransferases in Caenorhabditis induces expression of unusual intersected and bisected N-glycans DOI 10.1016/j.bbagen.2018.07.002 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 2191-2203 Link Publikation -
2016
Titel Analysis of Invertebrate and Protist N-Glycans DOI 10.1007/978-1-4939-6493-2_13 Typ Book Chapter Autor Hykollari A Verlag Springer Nature Seiten 167-184 Link Publikation -
2016
Titel Analysis of zwitterionic and anionic N-linked glycans from invertebrates and protists by mass spectrometry DOI 10.1007/s10719-016-9650-x Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycoconjugate Journal Seiten 273-283 Link Publikation -
2016
Titel Structure and biosynthesis of complex N-glycan cores and antennae in nematodes DOI 10.1096/fasebj.30.1_supplement.843.4 Typ Journal Article Autor Wilson I Journal The FASEB Journal Link Publikation -
2015
Titel Sweet secrets of a therapeutic worm: mass-spectrometric N-glycomic analysis of Trichuris suis DOI 10.1007/s00216-015-9154-8 Typ Journal Article Autor Wilson I Journal Analytical and Bioanalytical Chemistry Seiten 461-471 Link Publikation -
2015
Titel Comparison of RP-HPLC modes to analyse the N-glycome of the free-living nematode Pristionchus pacificus DOI 10.1002/elps.201400528 Typ Journal Article Autor Yan S Journal ELECTROPHORESIS Seiten 1314-1329 Link Publikation -
2017
Titel The underestimated N-glycomes of lepidopteran species DOI 10.1016/j.bbagen.2017.01.009 Typ Journal Article Autor Stanton R Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 699-714 Link Publikation -
2017
Titel The expanding glycouniverse: diverse glycan modifications in lower eukaryotes DOI 10.1096/fasebj.31.1_supplement.784.5 Typ Journal Article Autor Wilson I Journal The FASEB Journal Link Publikation -
2015
Titel Comparisons of Caenorhabditis Fucosyltransferase Mutants Reveal a Multiplicity of Isomeric N-Glycan Structures DOI 10.1021/acs.jproteome.5b00746 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Journal of Proteome Research Seiten 5291-5305 Link Publikation -
2017
Titel Core Richness of N-Glycans of Caenorhabditis elegans: A Case Study on Chemical and Enzymatic Release DOI 10.1021/acs.analchem.7b03898 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Analytical Chemistry Seiten 928-935 Link Publikation -
2017
Titel Synthesis of a ß-d-Psicofuranosyl Sulfone and Inhibitory-Activity Evaluation Against N-Acetylglucosaminyltransferase I DOI 10.1002/ejoc.201701102 Typ Journal Article Autor Bella M Journal European Journal of Organic Chemistry Seiten 6179-6191 -
2019
Titel Comparisons of N-glycans across invertebrate phyla DOI 10.1017/s0031182019000398 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Parasitology Seiten 1733-1742 Link Publikation -
2012
Titel Complicated N-linked glycans in simple organisms DOI 10.1515/hsz-2012-0150 Typ Journal Article Autor Schiller B Journal Biological chemistry Seiten 661-673 Link Publikation -
2014
Titel Enzymatic properties and subtle differences in the substrate specificity of phylogenetically distinct invertebrate N-glycan processing hexosaminidases DOI 10.1093/glycob/cwu132 Typ Journal Article Autor Dragosits M Journal Glycobiology Seiten 448-464 Link Publikation -
2013
Titel Array-assisted Characterization of a Fucosyltransferase Required for the Biosynthesis of Complex Core Modifications of Nematode N-Glycans* DOI 10.1074/jbc.m113.479147 Typ Journal Article Autor Yan ?? S Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 21015-21028 Link Publikation -
2015
Titel Bisecting Galactose as a Feature of N-Glycans of Wild-type and Mutant Caenorhabditis elegans * [S] DOI 10.1074/mcp.m115.049817 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 2111-2125 Link Publikation -
2015
Titel Two types of galactosylated fucose motifs are present on N-glycans of Haemonchus contortus DOI 10.1093/glycob/cwv015 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycobiology Seiten 585-590 Link Publikation -
2014
Titel Comparative Glycobiology DOI 10.1007/978-4-431-54836-2_153-1 Typ Book Chapter Autor Paschinger K Verlag Springer Nature Seiten 1-10 -
2014
Titel Comparative Glycobiology DOI 10.1007/978-4-431-54841-6_153 Typ Book Chapter Autor Paschinger K Verlag Springer Nature Seiten 795-805 -
2023
Titel Increasing Complexity of the N-Glycome During Caenorhabditis Development. DOI 10.1016/j.mcpro.2023.100505 Typ Journal Article Autor Wilson Ibh Journal Molecular & cellular proteomics : MCP Seiten 100505
-
2016
Titel Einzelprojekte Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2016