Partielle Differentialgleichungen für die Nanotechnologie
PDE models for nanotechnology
Wissenschaftsdisziplinen
Mathematik (100%)
Keywords
-
Partial differential equations,
Mathematical modeling,
Simulation,
Nanotechnology
Das Thema dieses Projekts ist mathematische Modellierung und Simulation mit Hilfe deterministischer partieller Differentialgleichungen (PDEs) und stochastischer partieller Differentialgleichungen für Mehrskalenprobleme mit konkreten Anwendungen in der Nanotechnologie und für Metamaterialien. Mehrskalenprobleme ergeben sich in den Anwendungen auf natürliche Art und Weise auf Grund der verschiedenen Längenskalen, das heißt, es gibt eine Feinstruktur im Nanometerbereich, während die makroskopische Längenskala der gesamten Strukturen um mehrere Größenordnungen größer ist. Die mathematische Methode zum Lösen von Mehrskalenproblemen ist Homogenisierung. Dieses Projekt vereint mathematische Analysis, Homogenisierung, stochastische Aspekte und die Entwicklung von verbesserten numerischen Methoden. Es gibt eine Reihe von aktuellen und konkreten Anwendungen wie Nanodraht-Sensoren, nanostrukturierte Metamaterialien, zufällig strukturierte Materialien und Graphen und Silizen. Stochastische partielle Differentialgleichungen ermöglichen es, über die Berechnung von Durchschnitten hinauszugehen und folglich Unsicherheiten, Fluktuationen und Rauschen zu quantifizieren. Mathematische Modellierung bedeutet, dass wir die Existenz und Eindeutigkeit der Lösungen der Modellgleichungen beweisen und neue Homogenisierungsprobleme lösen. Die wichtigsten Modellgleichungen sind nichtlineare Poisson-Gleichungen, elliptische Eigenprobleme, die Boltzmann-Transport-Gleichung, die Dirac- Gleichung und Systeme davon. Die betrachteten Gleichungen haben stochastische Koeffizienten und Terme. Beispielsweise sind in zufällig strukturierten Materialien Koeffizienten wie die Permittivität und Permeabilität, die die Materialeigenschaften bestimmen, stochastisch und ergeben nach Homogenisierung nichtlineare Effekte. In Nanodraht-Sensoren sind die Brownsche Molekularbewegung von Biomolekülen, Gasreaktionen und das Einfangen von Ladungen an der Oberfläche Zufallsprozesse, die in den Gleichungen zu stochastischen Termen mit verschiedenen Wahrscheinlichkeitsverteilungen in Grenzschichten werden und auf neue Homogenisierungsprobleme führen. Ein wichtige Besonderheit ist, dass wir realistische stochastische Prozesse verwenden und über Normalverteilungen als Standardannahme hinausgehen. Weiters hat das Projekt eine starke numerische Komponente, da die Entwicklung von numerischen Algorithmen für Mehrskalenprobleme von stochastischen PDE noch am Anfang ist. Die Entwicklung von numerischen Algorithmen für diese Modelle steht vor der Herausforderung, dass die Diskretisierung der stochastischen Terme Dutzende oder hunderte Dimensionen zu 2D oder 3D Gleichungen hinzufügt; dies wird auch oft der Fluch der Dimensionen genannt. Daher gibt es einen klaren Bedarf an verbesserten Methoden für die Quantifizierung von Unsicherheiten und wir entwickeln numerische Algorithmen basierend auf Resultaten aus der Theorie der stochastischen Homogenisierung. Die Modellgleichungen stammen aus Anwendungen in Wissenschaft und Technik wie zum Beispiel Fluktuationen und Rauschen in Nanodraht-Sensoren, die Selektivität von Nanodraht-Gassensoren, das Design von zufällig strukturierten Materialien und von Metamaterialien und Ladungstransport in Graphen und Silizen. Für alle diese Anwendungen werden neue Simulationen entwickelt um quantitatives Verständnis bereitzustellen und Design auf Basis der Physik der Probleme zu ermöglichen. Die Schönheit der Mathematik besteht darin, dass unsere Resultate sehr abstrakt und daher für viele verschiedene Anwendungen relevant sind. Die numerische Methoden, die entwickelt werden, machen es möglich zu berechnen, was vorher nicht berechenbar war.
Technologischer Fortschritt ist oft durch Miniaturisierung gekennzeichnet, wofür Nanotechnologie ein prominentes Beispiel ist. Im START-Projekt "PDE-Modelle für die Nanotechnologie" wurden neue mathematische Verfahren und Computerprogramme entwickelt, um nanotechnologische Bauteile wie Sensoren und Transistoren zu designen und um so viel Information wie möglich aus Messungen zu extrahieren. In zwei Bereichen sind die Resultate diese Projekts die ersten weltweit, die wichtige Ziele in diesem Gebiet erreicht haben. Erstens sind Rauschen, Fluktuationen und Prozessvariationen im Nanometerbereich zunehmend wichtig, machen aber traditionelle Simulationstechniken unmöglich. Deshalb wurden neue Algorithmen entwickelt, um auf diese Herausforderungen einzugehen und Computersimulationen zu ermöglichen, die zuvor nicht möglich waren. Zweitens, um bessere Sensoren zu entwickeln und die Analyse der Daten zu verbessern, wurde gezeigt, dass Computersimulationen in Verbindung mit Methoden der Bayesschen Statistik als mathematische Lupe dienen können und es ermöglichen, Information zu extrahieren, die zuvor unerreichbar war. Ein führendes Beispiel einer realistischen Anwendung sind Feldeffektsensoren, die kleinste Konzentrationen von Biomolekülen wie Tumormarkern und DNA-Strängen detektieren können. Diese Kombination von Halbleitertechnologie und der biologischen Welt führt zu einer Reihe von Herausforderungen, was Modellierung und Simulation betrifft. Ladungstransport durch Nanometerstrukturen muss berechnet werden; Variationen während der Herstellung beeinflussen die Bauteile, das heißt, jeder Transistor und jeder Sensor ist auf Grund der inhärenten Zufälligkeiten in den Herstellungsprozessen verschieden; und es kommt zu Rauschen und Fluktuationen auf Grund Brownscher Bewegung und im Halbleiter. Je kleiner die Bauteile sind, desto wichtiger werden diese Effekte. Diese Aspekte resultieren auch in extrem rechenaufwändigen Simulationen. Um diese Probleme zu lösen, wurden neue mathematische Algorithmen entwickelt, die den Rechenaufwand um Größenordnungen reduzieren. Nachdem diese Computersimulationen entwickelt worden waren, stellten wir die Frage, wie viel aus den Sensormessungen und Simulationen gelernt werden kann. Wie genau kann die Anzahl von Biomolekülen in einem Sensor gemessen werden? Wie viel Information kann extrahiert werden und wie zuverlässig? Wie sich herausstellt, können diese Fragen durch Vergleich von Messungen und Simulationen beantwortet werden, was die Nützlichkeit der Computersimulationen vergrößert. Einfach gesagt ist eine gewisse Molekülkonzentration wahrscheinlich, wenn die Simulation für diese Konzentration gut mit der Messung übereinstimmt; andernfalls sie ist unwahrscheinlich. In Anbetracht all des Rauschens und der Fluktuationen können wir auf diese Art Wahrscheinlichkeitsverteilungen von Molekülkonzentrationen berechnen und damit auch Konfidenzintervalle. Kleine Konfidenzintervalle bedeuten, dass ein Sensor sehr gut funktioniert. Durch diese Kombination von mathematischer Modellierung, Computersimulationen und Bayesscher Statistik haben wir es zum ersten Mal ermöglicht, so viel Information wie möglich aus Sensormessungen zu extrahieren. Dies unterstreicht die Wichtigkeit und Nützlichkeit der Theorie in der Interpretation von Messungen. Natürlich kann diese Vorgehensweise auch auf andere Sensortechnologien angewendet werden.
- Technische Universität Wien - 100%
- Christian Ringhofer, Arizona State University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Guillaume Bal, University of Chicago - Vereinigte Staaten von Amerika
- Mark A. Reed, Yale University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Pierre Degond, Imperial College London - Vereinigtes Königreich
- Peter Markowich, University of Cambridge - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 764 Zitationen
- 121 Publikationen
- 1 Software
- 10 Disseminationen
- 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 1 Weitere Förderungen
-
2021
Titel Optimal Bayesian experimental design for electrical impedance tomography in medical imaging DOI 10.1016/j.cma.2020.113489 Typ Journal Article Autor Karimi A Journal Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering Seiten 113489 -
2021
Titel A reduced-order variational multiscale interpolating element free Galerkin technique based on proper orthogonal decomposition for solving Navier–Stokes equations coupled with a heat transfer equation: Nonstationary incompressible Boussinesq equations DOI 10.1016/j.jcp.2020.109875 Typ Journal Article Autor Abbaszadeh M Journal Journal of Computational Physics Seiten 109875 -
2020
Titel A Bayesian estimation method for variational phase-field fracture problems DOI 10.15488/10991 Typ Other Autor Khodadadian A Link Publikation -
2020
Titel Frequency dependence of dielectrophoretic fabrication of single-walled carbon nanotube field-effect transistors DOI 10.15488/12613 Typ Other Autor Khodadadian A Link Publikation -
2019
Titel A new method for selective functionalization of silicon nanowire sensors and Bayesian inversion for its parameters DOI 10.1016/j.bios.2019.111527 Typ Journal Article Autor Mirsian S Journal Biosensors and Bioelectronics Seiten 111527 -
2019
Titel Bayesian inversion for nanowire field-effect sensors DOI 10.48550/arxiv.1904.09848 Typ Preprint Autor Khodadadian A -
2019
Titel A multilevel Monte Carlo finite element method for the stochastic Cahn-Hilliard-Cook equation DOI 10.15488/4741 Typ Other Autor Khodadadian A Link Publikation -
2018
Titel Calibration, compensation, parameter estimation, and uncertainty quantification for nanoelectrode array biosensors Typ Conference Proceeding Abstract Autor Cossettini A. Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2018) Seiten 81 Link Publikation -
2018
Titel Optimal multi-level Monte Carlo and adaptive grid refinement for the stochastic drift-diffusion-Poisson System Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2018), Garden Grove, CA, USA Seiten 81-82 -
2018
Titel Uncertainty quantification for the Boltzmann-Poisson system Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Heitzinger Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2018), Garden Grove, CA, USA Seiten 93 -
2018
Titel Bayesian estimation for a tomography problem Typ Conference Proceeding Abstract Autor Jose Morales Escalant Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2018), Garden Grove, CA, USA Seiten 138 -
2018
Titel Bayesian estimation for transport equations for nanocapacitors Typ Conference Proceeding Abstract Autor Stadlbauer Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2018) Seiten 69-70 Link Publikation -
2018
Titel Utilizing multisymmetry properties in uncertainty quantification Typ Conference Proceeding Abstract Autor Gudmund Pammer Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2018), Garden Grove, CA, USA, 16--19 April 2018 Seiten 23--24 -
2018
Titel Bayesian estimation and machine learning: current problems and challenges with examples in electrical impedance tomography and nanosensors Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C Konferenz Proc. Workshop on Research Challenges and Opportunities at the interface of Machine Learning and Uncertainty Quantification, University of Southern California, Los Angeles, CA, USA, Link Publikation -
2018
Titel Optimization centric approach for electromagnetic scattering from metamaterials Typ Conference Proceeding Abstract Autor Boaz Blankrot Konferenz Proc. 2018 SIAM Annual Meeting (AN18), Portland, OR, USA -
2021
Titel Homogenization of Boundary Layers in the Boltzmann--Poisson System DOI 10.1137/18m1193888 Typ Journal Article Autor Heitzinger C Journal Multiscale Modeling & Simulation Seiten 506-532 -
2016
Titel Optimal Approximation of the First-Order Corrector in Multiscale Stochastic Elliptic PDE DOI 10.1137/16m106011x Typ Journal Article Autor Geiersbach C Journal SIAM/ASA Journal on Uncertainty Quantification Seiten 1246-1262 -
2016
Titel Basis adaptation for the stochastic nonlinear Poisson–Boltzmann equation DOI 10.1007/s10825-016-0922-2 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Journal of Computational Electronics Seiten 1393-1406 -
2016
Titel The optimal multilevel Monte-Carlo approximation of the stochastic drift-diffusion-Poisson system DOI 10.48550/arxiv.1610.04521 Typ Preprint Autor Taghizadeh L -
2021
Titel Application of direct meshless local Petrov–Galerkin method for numerical solution of stochastic elliptic interface problems DOI 10.1002/num.22742 Typ Journal Article Autor Abbaszadeh M Journal Numerical Methods for Partial Differential Equations Seiten 1271-1292 -
2021
Titel Protein Transport through Nanopores Illuminated by Long-Time-Scale Simulations DOI 10.1021/acsnano.1c01078 Typ Journal Article Autor Mitscha-Baude G Journal ACS Nano Seiten 9900-9912 Link Publikation -
2015
Titel Noise and Fluctuations in Nanowire Biosensors? DOI 10.1016/j.ifacol.2015.05.079 Typ Journal Article Autor Tulzer G Journal IFAC-PapersOnLine Seiten 761-765 Link Publikation -
2015
Titel A transport equation for confined structures applied to the OprP, Gramicidin A, and KcsA channels DOI 10.1007/s10825-015-0680-6 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Journal of Computational Electronics Seiten 524-532 -
2018
Titel Optimal multilevel randomized quasi-Monte-Carlo method for the stochastic drift–diffusion-Poisson system DOI 10.1016/j.cma.2017.10.015 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering Seiten 480-497 -
2018
Titel Three-dimensional optimal multi-level Monte–Carlo approximation of the stochastic drift–diffusion–Poisson system in nanoscale devices DOI 10.1007/s10825-017-1118-0 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Journal of Computational Electronics Seiten 76-89 -
2018
Titel Cubature Formulas for Multisymmetric Functions and Applications to Stochastic Partial Differential Equations DOI 10.1137/17m1125418 Typ Journal Article Autor Heitzinger C Journal SIAM/ASA Journal on Uncertainty Quantification Seiten 213-242 -
2017
Titel The Stochastic Drift-Diffusion-Poisson System for Modeling Nanowire and Nanopore Sensors DOI 10.1007/978-3-319-63082-3_48 Typ Book Chapter Autor Taghizadeh L Verlag Springer Nature Seiten 309-317 -
2017
Titel Computing cubature formulas for multisymmetric functions and applications to stochastic partial differential equations Typ Conference Proceeding Abstract Autor Gudmund Pammer Konferenz Proc. 13th Austrian Numerical Analysis Day 2017 -
2017
Titel Optimal multi-level Monte Carlo method for the stochastic drift-diffusion-Poisson system Typ Conference Proceeding Abstract Autor Khodadadian A. Konferenz Proc. 13th Austrian Numerical Analysis Day 2017 Seiten 16 Link Publikation -
2017
Titel Multiple scattering approach for dielectric metamaterial analysis Typ Conference Proceeding Abstract Autor Boaz Blankrot Konferenz Proc. 13th Austrian Numerical Analysis Day 2017 -
2017
Titel Optimal sensitivity of nanowire field-effect troponin sensors Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. 14th US National Congress on Computational Mechanics (USNCCM), Montreal, Canada -
2017
Titel Optimal multi-level randomized-quasi-Monte-Carlo methods for the stochastic drift-diffusion-Poisson system and for stochastic homogenization Typ Conference Proceeding Abstract Autor Khodadadian A. Konferenz Proc. International Conference on Scientific Computation and Differential Equations (SciCADE 2017) Seiten 129 Link Publikation -
2017
Titel Optimal multi-level Monte-Carlo methods for the stochastic drift-diffusion-Poisson system and for stochastic homogenization Typ Conference Proceeding Abstract Autor Khodadadian A. Konferenz Proc. 14th US National Congress on Computational Mechanics (USNCCM) Link Publikation -
2017
Titel Approximation of multisymmetric functions Typ Conference Proceeding Abstract Autor Gudmund Pammer Konferenz Proc. 13th Austrian Numerical Analysis Day 2017 -
2017
Titel Optimal numerical methods for stochastic PDEs Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. SIAM Conference on Computational Science and Engineering (CSE 2017) -
2017
Titel Integral equation solver for metamaterial design Typ Conference Proceeding Abstract Autor Boaz Blankrot Konferenz Proc. SIAM Conference on Computational Science and Engineering (CSE 2017}, -
2017
Titel Brownian-dynamics simulations of nanopore protein sensing Typ Conference Proceeding Abstract Autor Benjamin Stadlbauer Konferenz Proc. 13th Austrian Numerical Analysis Day 2017 -
2017
Titel Simulation of nanopores with the {Poisson-Nernst-Planck-Stokes} and {Fokker-Planck} equations and adaptive finite elements Typ Conference Proceeding Abstract Autor Benjamin Stadlbauer Konferenz Proc. 13th Austrian Numerical Analysis Day 2017 -
2017
Titel Analysis of the drift-diffusion-Poisson–Boltzmann system for nanowire and nanopore sensors in the alternating-current regime DOI 10.4310/cms.2017.v15.n8.a8 Typ Journal Article Autor Heitzinger C Journal Communications in Mathematical Sciences Seiten 2303-2325 -
2017
Titel The optimal multilevel Monte-Carlo approximation of the stochastic drift–diffusion-Poisson system DOI 10.1016/j.cma.2017.02.014 Typ Journal Article Autor Taghizadeh L Journal Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering Seiten 739-761 Link Publikation -
2017
Titel Optimal design of nanowire field-effect troponin sensors DOI 10.1016/j.compbiomed.2017.05.008 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Computers in Biology and Medicine Seiten 46-56 -
2017
Titel Adaptive and iterative methods for simulations of nanopores with the PNP–Stokes equations DOI 10.1016/j.jcp.2017.02.072 Typ Journal Article Autor Mitscha-Baude G Journal Journal of Computational Physics Seiten 452-476 Link Publikation -
2016
Titel Simulation of the flow through nanopores DOI 10.34726/hss.2016.33104 Typ Other Autor Buttinger-Kreuzhuber A Link Publikation -
2018
Titel ParticleScattering: Solving and optimizing multiple-scattering problems in Julia DOI 10.21105/joss.00691 Typ Journal Article Autor Blankrot B Journal Journal of Open Source Software Seiten 691 Link Publikation -
2018
Titel Existence, Uniqueness, and a Comparison of Nonintrusive Methods for the Stochastic Nonlinear Poisson--Boltzmann Equation DOI 10.1137/17m1127375 Typ Journal Article Autor Heitzinger C Journal SIAM/ASA Journal on Uncertainty Quantification Seiten 1019-1042 -
2018
Titel Automated Design of Photonic Crystal Demultiplexers DOI 10.1109/metamaterials.2018.8534050 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Blankrot B Seiten 55-57 -
2018
Titel Efficient computational design and optimization of dielectric metamaterial devices DOI 10.48550/arxiv.1804.09489 Typ Preprint Autor Blankrot B -
2022
Titel Evaluation of Hyperparameter-Optimization Approaches in an Industrial Federated Learning System DOI 10.1007/978-3-658-36295-9_1 Typ Book Chapter Autor Holly S Verlag Springer Nature Seiten 6-13 -
2022
Titel Comprehensive Approach to Distinguish Patients with Solid Tumors from Healthy Controls by Combining Androgen Receptor Mutation p.H875Y with Cell-Free DNA Methylation and Circulating miRNAs DOI 10.3390/cancers14020462 Typ Journal Article Autor Tomeva E Journal Cancers Seiten 462 Link Publikation -
2022
Titel Rational Design of Field-Effect Sensors Using Partial Differential Equations, Bayesian Inversion, and Artificial Neural Networks DOI 10.3390/s22134785 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Sensors Seiten 4785 Link Publikation -
2022
Titel Autoencoder Based Anomaly Detection and Explained Fault Localization in Industrial Cooling Systems DOI 10.36001/phme.2022.v7i1.3349 Typ Journal Article Autor Holly S Journal PHM Society European Conference Seiten 200-210 Link Publikation -
2022
Titel Stochastic Galerkin methods for the Boltzmann-Poisson system DOI 10.1016/j.jcp.2022.111400 Typ Journal Article Autor Escalante J Journal Journal of Computational Physics Seiten 111400 Link Publikation -
2020
Titel Analysis and application of the interpolating element free Galerkin (IEFG) method to simulate the prevention of groundwater contamination with application in fluid flow DOI 10.1016/j.cam.2019.112453 Typ Journal Article Autor Abbaszadeh M Journal Journal of Computational and Applied Mathematics Seiten 112453 Link Publikation -
2020
Titel Interpreting impedance spectroscopy data by using Poisson-Nernst-Planck anomalous models Typ Conference Proceeding Abstract Autor Evangelista L. R. Konferenz Proc. DPG (Deutsche physikalische Gesellschaft) Spring Meeting of the Condensed Matter Section Link Publikation -
2020
Titel Computational Bayesian inversion for nanocapacitor-array biosensors and electrical-impedance tomography Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C Konferenz SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2020), Munich, Germany Link Publikation -
2020
Titel Bayesian inversion for variational phase-field fracture problems Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2020), Munich, Germany -
2022
Titel Speedy Categorical Distributional Reinforcement Learning and Complexity Analysis DOI 10.1137/20m1364436 Typ Journal Article Autor Böck M Journal SIAM Journal on Mathematics of Data Science Seiten 675-693 -
2022
Titel Bayesian approach for inverse problems in tomographic imaging. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Ahmad Karimi Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (UQ 2022), Atlanta, Georgia, USA, 12--15 April 2022. Seiten 83 -
2020
Titel A Bayesian estimation method for variational phase-field fracture problems DOI 10.1007/s00466-020-01876-4 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Computational Mechanics Seiten 827-849 Link Publikation -
2020
Titel Frequency dependence of dielectrophoretic fabrication of single-walled carbon nanotube field-effect transistors DOI 10.1007/s10825-020-01562-x Typ Journal Article Autor Sadabad Y Journal Journal of Computational Electronics Seiten 1516-1526 Link Publikation -
2020
Titel Frequency dependence of dielectrophoresis fabrication of single-walled carbon nanotube field-effect transistor DOI 10.48550/arxiv.2008.10368 Typ Preprint Autor Sadabad Y -
2020
Titel Bayesian inversion for electrical-impedance tomography in medical imaging using the nonlinear Poisson–Boltzmann equation DOI 10.1016/j.cma.2020.112959 Typ Journal Article Autor Taghizadeh L Journal Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering Seiten 112959 -
2020
Titel Error analysis of interpolating element free Galerkin method to solve non-linear extended Fisher–Kolmogorov equation DOI 10.1016/j.camwa.2020.03.014 Typ Journal Article Autor Abbaszadeh M Journal Computers & Mathematics with Applications Seiten 247-262 Link Publikation -
2019
Titel Design of aperiodic demultiplexers and optical diodes by optimizing photonic crystals DOI 10.1364/osac.2.002244 Typ Journal Article Autor Blankrot B Journal OSA Continuum Seiten 2244 Link Publikation -
2019
Titel A direct meshless local collocation method for solving stochastic Cahn–Hilliard–Cook and stochastic Swift–Hohenberg equations DOI 10.1016/j.enganabound.2018.10.021 Typ Journal Article Autor Abbaszadeh M Journal Engineering Analysis with Boundary Elements Seiten 253-264 -
2019
Titel Bayesian inversion for nanoscale field-effect sensors using the stochastic drift-diffusion-Poisson-Boltzmann system Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. 90th Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM) Seiten 423 -
2019
Titel Bayesian PDE inversion in electrical-impedance tomography. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C Konferenz Proc. 9th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2019) Seiten 352 Link Publikation -
2019
Titel Modeling and simulation of nanotechnological sensors Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C Konferenz Proc. 9th International Congress on Industrial and Applied Mathematics (ICIAM 2019) Seiten 309 Link Publikation -
2019
Titel Bayesian inference for two inverse problems in tomography and biofilms Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C Konferenz Proc. International Conference on Scientific Computation and Differential Equations 2019 (SciCADE 2019) Link Publikation -
2019
Titel Efficiently optimizing inclusion rotation angle for maximal power flow Typ Conference Proceeding Abstract Autor Blankrot B Konferenz Proceedings of the 14th International Conference on Mathematical and Numerical Aspects of Wave Propagation Seiten 480-481 Link Publikation -
2019
Titel A clustering algorithm for single-molecule localization in super-resolution microscopy Typ Conference Proceeding Abstract Autor Magdalena Schneider Konferenz Proc. 90th Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM), Vienna, Austria Seiten 532 -
2019
Titel Bayesian analysis for the Poisson-Boltzmann equation modeling electrical-impedance tomography devices Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Heitzinger Konferenz Proc. 90th Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM), Vienna, Austria -
2019
Titel A multilevel Monte Carlo finite element method for the stochastic Cahn–Hilliard–Cook equation DOI 10.1007/s00466-019-01688-1 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Computational Mechanics Seiten 937-949 Link Publikation -
2022
Titel Autoencoder based Anomaly Detection and Explained Fault Localization in Industrial Cooling Systems DOI 10.48550/arxiv.2210.08011 Typ Preprint Autor Holly S -
2022
Titel Hyper-Parameter Optimization of Stacked Asymmetric Auto-Encoders for Automatic Personality Traits Perception DOI 10.3390/s22166206 Typ Journal Article Autor Zaferani E Journal Sensors Seiten 6206 Link Publikation -
2022
Titel Superhuman performance on sepsis MIMIC-III data by distributional reinforcement learning DOI 10.1371/journal.pone.0275358 Typ Journal Article Autor Böck M Journal PLOS ONE Link Publikation -
2022
Titel Algorithms for and Challenges in the Analysis of Markers in Personalized Health Care DOI 10.1007/978-3-031-10153-3_9 Typ Book Chapter Autor Heitzinger C Verlag Springer Nature Seiten 203-229 -
2019
Titel An adaptive multilevel Monte Carlo algorithm for the stochastic drift-diffusion-Poisson system DOI 10.48550/arxiv.1904.05851 Typ Preprint Autor Khodadadian A -
2019
Titel Bayesian estimation of physical and geometrical parameters for nanocapacitor array biosensors DOI 10.1016/j.jcp.2019.108874 Typ Journal Article Autor Stadlbauer B Journal Journal of Computational Physics Seiten 108874 -
2019
Titel Reliability of Poisson–Nernst–Planck Anomalous Models for Impedance Spectroscopy DOI 10.1021/acs.jpcb.9b06263 Typ Journal Article Autor Lenzi E Journal The Journal of Physical Chemistry B Seiten 7885-7892 -
2019
Titel Galerkin proper orthogonal decomposition-reduced order method (POD-ROM) for solving generalized Swift-Hohenberg equation DOI 10.1108/hff-11-2018-0647 Typ Journal Article Autor Dehghan M Journal International Journal of Numerical Methods for Heat & Fluid Flow Seiten 2642-2665 -
2019
Titel Bayesian inversion for a biofilm model including quorum sensing DOI 10.1016/j.compbiomed.2019.103582 Typ Journal Article Autor Taghizadeh L Journal Computers in Biology and Medicine Seiten 103582 -
2019
Titel Determination of Micro- and Nano-particle Properties by Multi-Frequency Bayesian Methods and Applications to Nanoelectrode Array Sensors DOI 10.1109/sensors43011.2019.8956529 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Cossettini A Seiten 1-4 Link Publikation -
2019
Titel Existence and local uniqueness for the Stokes-Nernst-Planck-drift-diffusion-Poisson system modeling nanopore and nanowire sensors DOI 10.4310/cms.2019.v17.n8.a2 Typ Journal Article Autor Taghizadeh L Journal Communications in Mathematical Sciences Seiten 2089-2112 -
2019
Titel A Bayesian estimation method for variational phase-field fracture problems DOI 10.48550/arxiv.1910.09863 Typ Preprint Autor Khodadadian A -
2019
Titel Modeling single-molecule stochastic transport for DNA exo-sequencing in nanopore sensors DOI 10.1088/1361-6528/ab513e Typ Journal Article Autor Stadlbauer B Journal Nanotechnology Seiten 075502 -
2019
Titel Bayesian inversion for nanowire field-effect sensors DOI 10.1007/s10825-019-01417-0 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Journal of Computational Electronics Seiten 147-159 Link Publikation -
2019
Titel Efficient Computational Design and Optimization of Dielectric Metamaterial Structures DOI 10.1109/jmmct.2019.2950569 Typ Journal Article Autor Blankrot B Journal IEEE Journal on Multiscale and Multiphysics Computational Techniques Seiten 234-244 -
2014
Titel Julia and the Numerical Homogenization of PDEs DOI 10.1109/hptcdl.2014.8 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Haitzinger C Seiten 36-40 -
2014
Titel Hierarchies of transport equations for nanopores DOI 10.1007/s10825-014-0586-8 Typ Journal Article Autor Heitzinger C Journal Journal of Computational Electronics Seiten 801-817 -
2014
Titel Fluctuations due to association and dissociation processes at nanowire-biosensor surfaces and their optimal design DOI 10.1088/0957-4484/26/2/025502 Typ Journal Article Autor Tulzer G Journal Nanotechnology Seiten 025502 -
2014
Titel A convergent 2D finite-difference scheme for the Dirac–Poisson system and the simulation of graphene DOI 10.1016/j.jcp.2013.09.052 Typ Journal Article Autor Brinkman D Journal Journal of Computational Physics Seiten 318-332 -
2014
Titel Multiscale modeling of fluctuations in stochastic elliptic PDE models of nanosensors DOI 10.4310/cms.2014.v12.n3.a1 Typ Journal Article Autor Heitzinger C Journal Communications in Mathematical Sciences Seiten 401-421 Link Publikation -
2014
Titel Quasi-Monte-Carlo methods for the linear and nonlinear stochastic Poisson-Boltzmann equations Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. 11th International Conference on Monte Carlo and Quasi-Monte Carlo Methods in Scientific Computing (MCQMC2014) Seiten 167 Link Publikation -
2014
Titel Uncertainty quantification in nanowire sensors using the stochastic nonlinear Poisson-Boltzmann equation Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification (SIAM UQ14), Savannah, Georgia, USA -
2014
Titel Monte-Carlo and quasi-Monte-Carlo approaches for the numerical stochastic homogenization of elliptic partial differential equations Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. 11th International Conference on Monte Carlo and Quasi-Monte Carlo Methods in Scientific Computing (MCQMC2014) Seiten 168 Link Publikation -
2014
Titel The stochastic Poisson and Poisson-Boltzmann equations applied to quantifying noise and fluctuations in nanoscale sensors Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. 18th European Conference on Mathematics for Industry (ECMI 2014) Seiten 150-151 Link Publikation -
2014
Titel Various strategies for the numerical stochastic homogenization of the stochastic Poisson and Helmholtz equations Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Heitzinger Konferenz Proc. SIAM Annual Meeting 2014, Chicago, IL, USA -
2014
Titel Transport in confined structures as a multiscale problem and numerical results for nanopores Typ Conference Proceeding Abstract Autor Christian Ringhofer Konferenz Proc. SIAM Annual Meeting 2014, Chicago, IL, USA Seiten 6 -
2014
Titel Using the stochastic Poisson-Boltzmann equation to quantify noise in nanowire bio- and gas sensors Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz 11th World Congress on Computational Mechanics (WCCM XI) Link Publikation -
2016
Titel Brownian-motion based simulation of stochastic reaction–diffusion systems for affinity based sensors DOI 10.1088/0957-4484/27/16/165501 Typ Journal Article Autor Tulzer G Journal Nanotechnology Seiten 165501 Link Publikation -
2016
Titel Serum Creatinine Back-Estimation in Cardiac Surgery Patients: Misclassification of AKI Using Existing Formulae and a Data-Driven Model DOI 10.2215/cjn.03560315 Typ Journal Article Autor Bernardi M Journal Clinical Journal of the American Society of Nephrology Seiten 395-404 Link Publikation -
2016
Titel Optimal method for calculating solutions of the stochastic drift-diffusion-Poisson system Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Heitzinger Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification 2016 (SIAM UQ16), Lausanne, Switzerland -
2016
Titel Non-intrusive stochastic {Galerkin} method for the stochastic nonlinear Poisson-Boltzmann equation Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Heitzinger Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification 2016 (SIAM UQ16), Lausanne, Switzerland -
2016
Titel Optimal approach for the calculation of stochastically homogenized coefficients of elliptic PDEs Typ Conference Proceeding Abstract Autor Caroline Geiersbach Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification 2016 (SIAM UQ16), Lausanne, Switzerland Link Publikation -
2016
Titel Modeling the expected time to reach the recognition element in nanopore DNA sequencing Typ Conference Proceeding Abstract Autor Andreas Buttinger-Kreuzhuber Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification 2016 (SIAM UQ16) -
2016
Titel Optimal numerical approaches to the stochastic homogenization of elliptic equations and to the stochastic drift-diffusion-Poisson system Typ Conference Proceeding Abstract Autor Geiersbach C. Konferenz Proc. SIAM Conference on Mathematical Aspects of Materials Science (MS16) Seiten 136 Link Publikation -
2016
Titel Stochastic modeling of dopant atoms in nanoscale transistors using multi-level Monte Carlo Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. SIAM Conference on Uncertainty Quantification 2016 (SIAM UQ16) -
2016
Titel Adaptive and Iterative Methods for Simulations of Nanopores with the PNP-Stokes Equations DOI 10.48550/arxiv.1608.05313 Typ Preprint Autor Mitscha-Baude G -
2015
Titel Computational Multiscale Methods DOI 10.4171/owr/2014/30 Typ Journal Article Autor Carstensen C Journal Oberwolfach Reports Seiten 1625-1681 Link Publikation -
2015
Titel Optimal multi-level {Monte-Carlo} method for a system of stochastic PDEs Typ Conference Proceeding Abstract Autor Amirreza Khodadadian Konferenz Proc. SIAM Conference on the Analysis of Partial Differential Equations (SIAM PD15) -
2015
Titel Julia and partial differential equations: being faster than M*TL*B Typ Conference Proceeding Abstract Autor Clemens Heitzinger Konferenz Proc. JuliaCon 2016, Boston, MA, USA Link Publikation -
2015
Titel Optimal approach for the numerical stochastic homogenization of elliptic problems Typ Conference Proceeding Abstract Autor Caroline Geiersbach Konferenz Proc. SIAM Conference on Analysis of Partial Differential Equations (SIAM PD15) -
2015
Titel The stochastic drift-diffusion-Poisson system for modeling nanoscale devices and a multi-level Monte-Carlo method Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. 24th International Conference on Transport Theory (ICTT 2015) Seiten 115-116 Link Publikation -
2015
Titel Existence and uniqueness for the Stokes-Nernst-Planck-drift-diffusion-Poisson system for modeling nanowire sensors and nanopores Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. 24th International Conference on Transport Theory (ICTT 2015) Seiten 117-118 Link Publikation -
2015
Titel Ionic currents through transmembrane proteins calculated by a transport equation for confined structures Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. 4th International Conference on Computational and Mathematical Biomedical Engineering (CMBE 2015) Seiten 460-463 Link Publikation -
2015
Titel Nonlinear coupling of the drift-diffusion-Poisson and Stokes systems for nanopore simulations Typ Conference Proceeding Abstract Autor Buttinger-Kreuzhuber A. Konferenz Proc. 13th US National Congress on Computational Mechanics Seiten 707 Link Publikation -
2015
Titel The signal-to-noise ratio due to biological noise in field-effect sensors calculated using the stochastic Poisson equation and polynomial-chaos expansion Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. 13th US National Congress on Computational Mechanics Seiten 501 Link Publikation -
2015
Titel Advances in numerical methods for stochastic partial differential equations and stochastic homogenization Typ Conference Proceeding Abstract Autor Heitzinger C. Konferenz Proc. New Directions in Numerical Computation: In Celebration of Nick Trefethen´s 60th Birthday Link Publikation -
2020
Titel Uncertainty quantification in epidemiological models for the COVID-19 pandemic DOI 10.1016/j.compbiomed.2020.104011 Typ Journal Article Autor Taghizadeh L Journal Computers in Biology and Medicine Seiten 104011 Link Publikation -
2020
Titel An adaptive multilevel Monte Carlo algorithm for the stochastic drift–diffusion–Poisson system DOI 10.1016/j.cma.2020.113163 Typ Journal Article Autor Khodadadian A Journal Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering Seiten 113163 Link Publikation
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2021
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Titel Article in Austrian national newspaper "Die Presse" 11 Dec 2021 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2016
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Titel Article in Austrian national newspaper "Der Standard" 30 Mar 2016 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2015
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Titel Article in our university's magazine "TU Wien News" 1 June 2015 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2017
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Titel Podium discussion "Science Talk" 20 Feb 2017 Typ A talk or presentation Link Link -
2015
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Titel Exhibition "Wunderkammer" 2015 Celebrating 200 Years TU Wien Typ Participation in an open day or visit at my research institution Link Link -
2021
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Titel Article our university's magazine "TUW Magazine" 2021 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2019
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Titel Article in "Austria Innovativ Spezial" March 2019 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2021
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Titel Article in online magazine "Future Zone" 29 Nov 2021 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2021
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Titel Article in Austrian national newspaper "Kurier" 30 Nov 2021 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2013
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Titel Article in ASU magazine "ASU News" 12 Dec 2013 Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link
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2021
Titel Deputy Representative of TU Wien at AIDA (International Artificial Intelligence Doctoral Academy) Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad Regional (any country) -
2020
Titel Distinguished International Member on the Academic Board of the PhD Program in "Information and Communication Technologies" (ICT) at the Department of Engineering "Enzo Ferrari" of the University of Modena and Reggio Emilia Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad Regional (any country) -
2020
Titel Hannspeter Winter Prize 2020 for best PhD thesis by a female student Typ Research prize Bekanntheitsgrad Regional (any country) -
2014
Titel Keynote lecture at the 11th World Congress on Computational Mechanics (WCCM XI) in Barcelona, Spain Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Regional (any country)
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2021
Titel (ENROL) - Engineering for life sciences doctoral programme Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2021