Mikrobelle Ozeanographie, Marine Biogeochemie
Microbial Oceanography, Marine Biogeochemistry
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Marine Prokaryotes,
Marine Biogeochemical Cycles,
Marine Carbon Cycle,
Microbial Food Web,
Carbon Flux,
Nutrient Cycling
Seit Beginn seiner wissenschaftlichen Arbeit hat sich Gerhard Herndl mit Fragen mikrobieller Meeresökologie beschäftigt und in diesen mehr als 25 Jahren essenzielle Beiträge zu einem besseren Verständnis mikrobieller Vorgänge und Zusammenhänge in den Weltmeeren geleistet. Wissenschaftlich bekannt wurde er unter anderem mit den Untersuchungen zum Phänomen des "Marine Snow" in der Oberen Adria. Beispielsweise konnte Gerhard Herndl zeigen, dass Bakterien in "Marine Snow" deutlich höhere Exo-Enzym-Aktivitäten aufweisen als frei lebende Bakterien. Dadurch können Bakterien im "Marine Snow" organisches Material schneller zersetzen und auf diesem Wege Nährstoffe (wieder) herstellen. Zudem konnte von der Arbeitsgruppe um Gerhard Herndl die Entstehung von "Marine Snow" geklärt werden. Wurde ursprünglich angenommen, dass "Marine Snow" durch Algen am Boden der Nordadria entsteht, konnte Gerhard Herndl und sein Team zeigen, dass diese Partikel von pflanzlichem Plankton produziert wird. Diese und andere von Gerhard Herndl erarbeiteten Forschungsergebnisse haben dazu geführt, dass Lehrbücher neu bzw. umgeschrieben werden mussten. Obwohl Gerhard Herndl sich mit sehr spezifisch anmutenden Fragestellungen der Meeresbiologie beschäftigt, wird schnell klar, dass Prozesse wie die Stoffwechselaktivität von Tiefsee-Mikroorganismen und deren Rolle in den Stoffkreisläufen von essenzieller Bedeutung für das Verstehen der größten Ökosysteme auf der Erde sind, zumal die Tiefsee ca. 80% des gesamten Wasservolumens der Ozeane darstellt. Die Rolle der Mikroorganismen in der Tiefsee besser zu verstehen ist nicht nur ein Gebot der Gegenwart - Stichworte "Fukushima" und "Deepwater Horizon" - sondern trägt dazu bei, die Bedeutung des Ökosystems "Meer" für das System "Erde" genauer einschätzen zu können. Gerhard Herndls ganzheitlicher Ansatz, mikrobielle Meeresökologie zu betreiben führt dazu, dass in seiner Forschung Komplexitätsgrade erreicht werden, die sich nur mittels einer Fülle methodischer Zugänge und unterschiedlichster Fragestellungen bewältigen lassen. Die Tiefsee beherbergt eine Vielzahl noch unbekannter Mikroben, von denen nur ihre Nukleinsäure-Signatur bekannt ist, mit physiologischen Eigenschafen, die es ihnen ermöglicht unter widrigen Umständen wie extrem hohem (Wasser-)Druck und tiefen Temperaturen zu leben. Diese Charakteristika sollten eine mögliche Quelle für neue, biotechnologische Anwendungen sein, deren Potenzial sich einer Einschätzung heute noch weitgehend entzieht. Es ist ein Glücksfall, dass es gelungen ist, Gerhard Herndl und sein gesamtes Team nach Österreich zu holen, um das Wissen, die Erfahrung und das Know how in Bereichen wie Biogeochemie, mikrobieller Ozeanographie um Aspekte der Biotechnologie zu erweitern. "Wir wissen heute mehr über die Oberfläche des Mondes als über die Tiefsee. Daran möchte ich etwas ändern", sagt Gerhard Herndl. Und: "Der Wittgenstein-Preis soll dazu beitragen, die unbekannten, dunklen Tiefen der Weltmeere und ihre zentrale Rolle für die biogeochemischen Flüsse und Kreisläufe der sich im Wandel befindlichen Ozeane und ihre Bedeutung für das Weltklima besser zu verstehen", gibt Gerhard Herndl die Perspektive für seine weitere Forschung vor. Sein Ziel ist es, unter anderem aus Mitteln des Wittgenstein-Preises an der Universität Wien ein weltweit anerkanntes und sichtbares Zentrum für Mikrobielle Ozeanographie zu etablieren, das auf den bereits bestehenden Stärken in der Ökologie und Mikrobiologie an der Universität Wien aufbaut.
Das Projekt widmete sich der Aufklärung des organischen Kohlenstofflusses in der Tiefsee am Beispiel des Atlantiks. Das Kohlenstoffbudget der Tiefsee konnte bisher nicht geschlossen werden, da laut all den verfügbaren Daten weniger organischer Kohlenstoff, der von pflanzlichem Plankton in den sonnendurchfluteten Wasserschichten produziert wird, in die Tiefsee gelangen als notwendig wäre, um die gemessenen Atmungsraten der Tiefseeorganismen zu erklären. Dies bedeutet, dass scheinbar mehr organischer Kohlenstoff in der Tiefsee veratmet als aus dem Oberflächengewässer exportiert wird, was natürlich darauf schließen lässt, dass einige der Parameter nicht richtig gemessen werden. So wurde bisher die mikrobielle Konsumation von organischem Kohlenstoff fast ausschließlich unter Oberflächendruckbedingungen gemessen. Im Rahmen des Projektes wurden drei einmonatige Forschungsfahrten im Atlantik durchgeführt und entsprechende, für den organischen Kohlenstofffluss entscheidende Parameter, gemessen. Mikroorganismen sind die hauptsächlichen Konsumenten von organischem Kohlenstoff in der Tiefsee. Daher wurde die mikrobielle Konsumation von organischem Kohlenstoff unter den Druckbedingungen der Tiefsee gemessen und mit denen unter Oberflächenbedingungen verglichen. Unsere Messungen zeigten, dass die Mikroben der Tiefsee durch die dort herrschenden Druckbedingungen massiv in ihrer Konsumation von organischem Kohlenstoff eingeschränkt werden. Die Druckverhältnisse in 2000 m Tiefe führen dazu, dass die mikrobielle Aktivität auf ca 20 % der Aktivität gemessen an der Oberfläche reduziert wird. Je höher der hydrostatische Druck, desto grösser ist auch die Reduktion der mikrobiellen Aktivität. Das heißt, dass die mikrobielle Aktivität der Tiefseemikroben in den bisherigen Messungen massiv überschätzt wurde. Unsere Messungen zeigten auch, dass der überwiegende Teil der Tiefseemikroben-Gemeinschaft nicht an die dort herrschenden Druckverhältnisse angepasst ist. Ein weiterer Teil des Projektes befasste sich mit der autotrophen Mikrobengemeinschaft der Tiefsee. Wir konnten zeigen, dass die Kohlendioxidfixierung der autotrophen Gemeinschaft der Tiefsee etwa so hoch ist wie jene der heterotrophen Mikrobengemeinschaft. Diese autotrophen Mikroben verwenden teilweise die selben Enzyme zur Kohlendioxidfixierung wie autotrophe Pflanzen. Als Energiequelle zur Kohlendioxidfixierung verwenden diese autotrophen Tiefseemikroben reduzierte Schwefelverbindungen, Wasserstoff und eine Vielzahl weiterer anorganischer reduzierter Verbindungen. Aufgrund dieser Arbeiten, konnten wir den organischen Kohlenstoffkreislauf der Tiefsee aufklären.
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 3834 Zitationen
- 47 Publikationen
-
2011
Titel Potential for Chemolithoautotrophy Among Ubiquitous Bacteria Lineages in the Dark Ocean DOI 10.1126/science.1203690 Typ Journal Article Autor Swan B Journal Science Seiten 1296-1300 -
2022
Titel Prokaryotic Life in the Deep Ocean's Water Column DOI 10.1146/annurev-marine-032122-115655 Typ Journal Article Autor Herndl G Journal Annual Review of Marine Science Seiten 461-483 Link Publikation -
2022
Titel Impact of hydrostatic pressure on organic carbon cycling of the deep-sea microbiome DOI 10.1101/2022.03.31.486587 Typ Preprint Autor Amano C Seiten 2022.03.31.486587 Link Publikation -
2022
Titel Limited carbon cycling due to high-pressure effects on the deep-sea microbiome DOI 10.1038/s41561-022-01081-3 Typ Journal Article Autor Amano C Journal Nature Geoscience Seiten 1041-1047 Link Publikation -
2022
Titel A device for assessing microbial activity under ambient hydrostatic pressure: The in situ microbial incubator (ISMI) DOI 10.1002/lom3.10528 Typ Journal Article Autor Amano C Journal Limnology and Oceanography: Methods Seiten 69-81 Link Publikation -
2021
Titel Reviews and syntheses: Heterotrophic fixation of inorganic carbon – significant but invisible flux in environmental carbon cycling DOI 10.5194/bg-18-3689-2021 Typ Journal Article Autor Braun A Journal Biogeosciences Seiten 3689-3700 Link Publikation -
2021
Titel Microbes mediating the sulfur cycle in the Atlantic Ocean and their link to chemolithoautotrophy DOI 10.1111/1462-2920.15759 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Seiten 7152-7167 Link Publikation -
2018
Titel Differential Response of Cafeteria roenbergensis to Different Bacterial and Archaeal Prey Characteristics DOI 10.1007/s00248-018-1293-y Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Microbial Ecology Seiten 1-5 Link Publikation -
2020
Titel Reviews and syntheses: Heterotrophic fixation of inorganic carbon – significant but invisible flux in global carbon cycling DOI 10.5194/bg-2020-465 Typ Preprint Autor Braun A Seiten 1-18 Link Publikation -
2020
Titel Functional Seasonality of Free-Living and Particle-Associated Prokaryotic Communities in the Coastal Adriatic Sea DOI 10.3389/fmicb.2020.584222 Typ Journal Article Autor Steiner P Journal Frontiers in Microbiology Seiten 584222 Link Publikation -
2017
Titel Metagenomic insights into zooplankton-associated bacterial communities DOI 10.1111/1462-2920.13944 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Seiten 492-505 Link Publikation -
2017
Titel Crustacean zooplankton release copious amounts of dissolved organic matter as taurine in the ocean DOI 10.1002/lno.10603 Typ Journal Article Autor Clifford E Journal Limnology and Oceanography Seiten 2745-2758 Link Publikation -
2017
Titel SAR202 Genomes from the Dark Ocean Predict Pathways for the Oxidation of Recalcitrant Dissolved Organic Matter DOI 10.1128/mbio.00413-17 Typ Journal Article Autor Landry Z Journal mBio Link Publikation -
2016
Titel Connectivity between surface and deep waters determines prokaryotic diversity in the North Atlantic Deep Water DOI 10.1111/1462-2920.13237 Typ Journal Article Autor Frank A Journal Environmental Microbiology Seiten 2052-2063 Link Publikation -
2017
Titel Organic matter processing by microbial communities throughout the Atlantic water column as revealed by metaproteomics DOI 10.1073/pnas.1708779115 Typ Journal Article Autor Bergauer K Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2017
Titel Microbial proteins for organic material degradation in the deep ocean DOI 10.1073/pnas.1720765115 Typ Journal Article Autor Kirchman D Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 445-447 Link Publikation -
2019
Titel Seasonal dynamics of marine snow-associated and free-living demethylating bacterial communities in the coastal northern Adriatic Sea DOI 10.1111/1758-2229.12783 Typ Journal Article Autor Steiner P Journal Environmental Microbiology Reports Seiten 699-707 Link Publikation -
2019
Titel Highly variable mRNA half-life time within marine bacterial taxa and functional genes DOI 10.1111/1462-2920.14737 Typ Journal Article Autor Steiner P Journal Environmental Microbiology Seiten 3873-3884 Link Publikation -
2019
Titel Taurine Is a Major Carbon and Energy Source for Marine Prokaryotes in the North Atlantic Ocean off the Iberian Peninsula DOI 10.1007/s00248-019-01320-y Typ Journal Article Autor Clifford E Journal Microbial Ecology Seiten 299-312 Link Publikation -
2018
Titel Dissolved organic carbon leaching from plastics stimulates microbial activity in the ocean DOI 10.1038/s41467-018-03798-5 Typ Journal Article Autor Romera-Castillo C Journal Nature Communications Seiten 1430 Link Publikation -
2016
Titel Geographic Distribution of Archaeal Ammonia Oxidizing Ecotypes in the Atlantic Ocean DOI 10.3389/fmicb.2016.00077 Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Frontiers in Microbiology Seiten 77 Link Publikation -
2016
Titel Dragon kings of the deep sea: marine particles deviate markedly from the common number-size spectrum DOI 10.1038/srep22633 Typ Journal Article Autor Bochdansky A Journal Scientific Reports Seiten 22633 Link Publikation -
2015
Titel Response to Comment on “Dilution limits dissolved organic carbon utilization in the deep ocean” DOI 10.1126/science.aac7249 Typ Journal Article Autor Arrieta J Journal Science Seiten 1483-1483 Link Publikation -
2020
Titel Prokaryotic communities and plastic pollution in the ocean DOI 10.25365/thesis.64850 Typ Other Autor Gomes Ribeiro Teixeira Pinto M Link Publikation -
2016
Titel Erythromycin and GC7 fail as domain-specific inhibitors for bacterial and archaeal activity in the open ocean DOI 10.3354/ame01792 Typ Journal Article Autor Frank A Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 99-110 Link Publikation -
2016
Titel Large-scale distribution of microbial and viral populations in the South Atlantic Ocean DOI 10.1111/1758-2229.12381 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Reports Seiten 305-315 Link Publikation -
2016
Titel Eukaryotic microbes, principally fungi and labyrinthulomycetes, dominate biomass on bathypelagic marine snow DOI 10.1038/ismej.2016.113 Typ Journal Article Autor Bochdansky A Journal The ISME Journal Seiten 362-373 Link Publikation -
2016
Titel Depth Dependent Relationships between Temperature and Ocean Heterotrophic Prokaryotic Production DOI 10.3389/fmars.2016.00090 Typ Journal Article Autor Lønborg C Journal Frontiers in Marine Science Seiten 90 Link Publikation -
2016
Titel Prokaryotic Responses to Ammonium and Organic Carbon Reveal Alternative CO2 Fixation Pathways and Importance of Alkaline Phosphatase in the Mesopelagic North Atlantic DOI 10.3389/fmicb.2016.01670 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Frontiers in Microbiology Seiten 1670 Link Publikation -
2013
Titel Development and deployment of a point-source digital inline holographic microscope for the study of plankton and particles to a depth of 6000 m DOI 10.4319/lom.2013.11.28 Typ Journal Article Autor Bochdansky A Journal Limnology and Oceanography: Methods Seiten 28-40 Link Publikation -
2013
Titel Abundance and distribution of archaeal acetyl-CoA/propionyl-CoA carboxylase genes indicative for putatively chemoautotrophic Archaea in the tropical Atlantic's interior DOI 10.1111/1574-6941.12073 Typ Journal Article Autor Bergauer K Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 461-473 Link Publikation -
2013
Titel Impact of water mass mixing on the biogeochemistry and microbiology of the Northeast Atlantic Deep Water DOI 10.1002/2013gb004634 Typ Journal Article Autor Reinthaler T Journal Global Biogeochemical Cycles Seiten 1151-1162 Link Publikation -
2013
Titel Major Effect of Hydrogen Peroxide on Bacterioplankton Metabolism in the Northeast Atlantic DOI 10.1371/journal.pone.0061051 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal PLoS ONE Link Publikation -
2013
Titel Diversity and distribution of microbial eukaryotes in the deep tropical and subtropical North Atlantic Ocean DOI 10.1016/j.dsr.2013.04.010 Typ Journal Article Autor Morgan-Smith D Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers Seiten 58-69 -
2012
Titel Archaeal amoA gene diversity points to distinct biogeography of ammonia-oxidizing Crenarchaeota in the ocean DOI 10.1111/j.1462-2920.2012.02801.x Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Environmental Microbiology Seiten 1647-1658 Link Publikation -
2014
Titel Drivers shaping the diversity and biogeography of total and active bacterial communities in the South China Sea DOI 10.1111/mec.12739 Typ Journal Article Autor Zhang Y Journal Molecular Ecology Seiten 2260-2274 Link Publikation -
2014
Titel Fracture zones in the Mid Atlantic Ridge lead to alterations in prokaryotic and viral parameters in deep-water masses DOI 10.3389/fmicb.2014.00264 Typ Journal Article Autor Muck S Journal Frontiers in Microbiology Seiten 264 Link Publikation -
2015
Titel Physiological and genomic characterization of two novel marine thaumarchaeal strains indicates niche differentiation DOI 10.1038/ismej.2015.200 Typ Journal Article Autor Bayer B Journal The ISME Journal Seiten 1051-1063 Link Publikation -
2015
Titel Conservation of dissolved organic matter molecular composition during mixing of the deep water masses of the northeast Atlantic Ocean DOI 10.1016/j.marchem.2015.06.001 Typ Journal Article Autor Hansman R Journal Marine Chemistry Seiten 288-297 Link Publikation -
2015
Titel Production and degradation of fluorescent dissolved organic matter in surface waters of the eastern north Atlantic ocean DOI 10.1016/j.dsr.2014.11.001 Typ Journal Article Autor Lønborg C Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers Seiten 28-37 Link Publikation -
2015
Titel Dilution limits dissolved organic carbon utilization in the deep ocean DOI 10.1126/science.1258955 Typ Journal Article Autor Arrieta J Journal Science Seiten 331-333 Link Publikation -
2014
Titel Linkage between copepods and bacteria in the North Atlantic Ocean DOI 10.3354/ame01696 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 215-225 Link Publikation -
2013
Titel Thick-shelled, grazer-protected diatoms decouple ocean carbon and silicon cycles in the iron-limited Antarctic Circumpolar Current DOI 10.1073/pnas.1309345110 Typ Journal Article Autor Assmy P Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 20633-20638 Link Publikation -
2013
Titel Spatial patterns of bacterial and archaeal communities along the Romanche Fracture Zone (tropical Atlantic) DOI 10.1111/1574-6941.12142 Typ Journal Article Autor Lekunberri I Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 537-552 Link Publikation -
2013
Titel Microbial control of the dark end of the biological pump DOI 10.1038/ngeo1921 Typ Journal Article Autor Herndl G Journal Nature Geoscience Seiten 718-724 Link Publikation -
2015
Titel Macroecological patterns of archaeal ammonia oxidizers in the Atlantic Ocean DOI 10.1111/mec.13365 Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Molecular Ecology Seiten 4931-4942 Link Publikation -
2012
Titel Links between viruses and prokaryotes throughout the water column along a North Atlantic latitudinal transect DOI 10.1038/ismej.2011.214 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal The ISME Journal Seiten 1566-1577 Link Publikation