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Mikrobelle Ozeanographie, Marine Biogeochemie

Microbial Oceanography, Marine Biogeochemistry

Gerhard J. Herndl (ORCID: 0000-0002-2223-2852)
  • Grant-DOI 10.55776/Z194
  • Förderprogramm FWF-Wittgenstein-Preis
  • Status beendet
  • Projektbeginn 15.08.2011
  • Projektende 14.01.2017
  • Bewilligungssumme 1.500.000 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Marine Prokaryotes, Marine Biogeochemical Cycles, Marine Carbon Cycle, Microbial Food Web, Carbon Flux, Nutrient Cycling

Abstract Endbericht

Seit Beginn seiner wissenschaftlichen Arbeit hat sich Gerhard Herndl mit Fragen mikrobieller Meeresökologie beschäftigt und in diesen mehr als 25 Jahren essenzielle Beiträge zu einem besseren Verständnis mikrobieller Vorgänge und Zusammenhänge in den Weltmeeren geleistet. Wissenschaftlich bekannt wurde er unter anderem mit den Untersuchungen zum Phänomen des "Marine Snow" in der Oberen Adria. Beispielsweise konnte Gerhard Herndl zeigen, dass Bakterien in "Marine Snow" deutlich höhere Exo-Enzym-Aktivitäten aufweisen als frei lebende Bakterien. Dadurch können Bakterien im "Marine Snow" organisches Material schneller zersetzen und auf diesem Wege Nährstoffe (wieder) herstellen. Zudem konnte von der Arbeitsgruppe um Gerhard Herndl die Entstehung von "Marine Snow" geklärt werden. Wurde ursprünglich angenommen, dass "Marine Snow" durch Algen am Boden der Nordadria entsteht, konnte Gerhard Herndl und sein Team zeigen, dass diese Partikel von pflanzlichem Plankton produziert wird. Diese und andere von Gerhard Herndl erarbeiteten Forschungsergebnisse haben dazu geführt, dass Lehrbücher neu bzw. umgeschrieben werden mussten. Obwohl Gerhard Herndl sich mit sehr spezifisch anmutenden Fragestellungen der Meeresbiologie beschäftigt, wird schnell klar, dass Prozesse wie die Stoffwechselaktivität von Tiefsee-Mikroorganismen und deren Rolle in den Stoffkreisläufen von essenzieller Bedeutung für das Verstehen der größten Ökosysteme auf der Erde sind, zumal die Tiefsee ca. 80% des gesamten Wasservolumens der Ozeane darstellt. Die Rolle der Mikroorganismen in der Tiefsee besser zu verstehen ist nicht nur ein Gebot der Gegenwart - Stichworte "Fukushima" und "Deepwater Horizon" - sondern trägt dazu bei, die Bedeutung des Ökosystems "Meer" für das System "Erde" genauer einschätzen zu können. Gerhard Herndls ganzheitlicher Ansatz, mikrobielle Meeresökologie zu betreiben führt dazu, dass in seiner Forschung Komplexitätsgrade erreicht werden, die sich nur mittels einer Fülle methodischer Zugänge und unterschiedlichster Fragestellungen bewältigen lassen. Die Tiefsee beherbergt eine Vielzahl noch unbekannter Mikroben, von denen nur ihre Nukleinsäure-Signatur bekannt ist, mit physiologischen Eigenschafen, die es ihnen ermöglicht unter widrigen Umständen wie extrem hohem (Wasser-)Druck und tiefen Temperaturen zu leben. Diese Charakteristika sollten eine mögliche Quelle für neue, biotechnologische Anwendungen sein, deren Potenzial sich einer Einschätzung heute noch weitgehend entzieht. Es ist ein Glücksfall, dass es gelungen ist, Gerhard Herndl und sein gesamtes Team nach Österreich zu holen, um das Wissen, die Erfahrung und das Know how in Bereichen wie Biogeochemie, mikrobieller Ozeanographie um Aspekte der Biotechnologie zu erweitern. "Wir wissen heute mehr über die Oberfläche des Mondes als über die Tiefsee. Daran möchte ich etwas ändern", sagt Gerhard Herndl. Und: "Der Wittgenstein-Preis soll dazu beitragen, die unbekannten, dunklen Tiefen der Weltmeere und ihre zentrale Rolle für die biogeochemischen Flüsse und Kreisläufe der sich im Wandel befindlichen Ozeane und ihre Bedeutung für das Weltklima besser zu verstehen", gibt Gerhard Herndl die Perspektive für seine weitere Forschung vor. Sein Ziel ist es, unter anderem aus Mitteln des Wittgenstein-Preises an der Universität Wien ein weltweit anerkanntes und sichtbares Zentrum für Mikrobielle Ozeanographie zu etablieren, das auf den bereits bestehenden Stärken in der Ökologie und Mikrobiologie an der Universität Wien aufbaut.

Das Projekt widmete sich der Aufklärung des organischen Kohlenstofflusses in der Tiefsee am Beispiel des Atlantiks. Das Kohlenstoffbudget der Tiefsee konnte bisher nicht geschlossen werden, da laut all den verfügbaren Daten weniger organischer Kohlenstoff, der von pflanzlichem Plankton in den sonnendurchfluteten Wasserschichten produziert wird, in die Tiefsee gelangen als notwendig wäre, um die gemessenen Atmungsraten der Tiefseeorganismen zu erklären. Dies bedeutet, dass scheinbar mehr organischer Kohlenstoff in der Tiefsee veratmet als aus dem Oberflächengewässer exportiert wird, was natürlich darauf schließen lässt, dass einige der Parameter nicht richtig gemessen werden. So wurde bisher die mikrobielle Konsumation von organischem Kohlenstoff fast ausschließlich unter Oberflächendruckbedingungen gemessen. Im Rahmen des Projektes wurden drei einmonatige Forschungsfahrten im Atlantik durchgeführt und entsprechende, für den organischen Kohlenstofffluss entscheidende Parameter, gemessen. Mikroorganismen sind die hauptsächlichen Konsumenten von organischem Kohlenstoff in der Tiefsee. Daher wurde die mikrobielle Konsumation von organischem Kohlenstoff unter den Druckbedingungen der Tiefsee gemessen und mit denen unter Oberflächenbedingungen verglichen. Unsere Messungen zeigten, dass die Mikroben der Tiefsee durch die dort herrschenden Druckbedingungen massiv in ihrer Konsumation von organischem Kohlenstoff eingeschränkt werden. Die Druckverhältnisse in 2000 m Tiefe führen dazu, dass die mikrobielle Aktivität auf ca 20 % der Aktivität gemessen an der Oberfläche reduziert wird. Je höher der hydrostatische Druck, desto grösser ist auch die Reduktion der mikrobiellen Aktivität. Das heißt, dass die mikrobielle Aktivität der Tiefseemikroben in den bisherigen Messungen massiv überschätzt wurde. Unsere Messungen zeigten auch, dass der überwiegende Teil der Tiefseemikroben-Gemeinschaft nicht an die dort herrschenden Druckverhältnisse angepasst ist. Ein weiterer Teil des Projektes befasste sich mit der autotrophen Mikrobengemeinschaft der Tiefsee. Wir konnten zeigen, dass die Kohlendioxidfixierung der autotrophen Gemeinschaft der Tiefsee etwa so hoch ist wie jene der heterotrophen Mikrobengemeinschaft. Diese autotrophen Mikroben verwenden teilweise die selben Enzyme zur Kohlendioxidfixierung wie autotrophe Pflanzen. Als Energiequelle zur Kohlendioxidfixierung verwenden diese autotrophen Tiefseemikroben reduzierte Schwefelverbindungen, Wasserstoff und eine Vielzahl weiterer anorganischer reduzierter Verbindungen. Aufgrund dieser Arbeiten, konnten wir den organischen Kohlenstoffkreislauf der Tiefsee aufklären.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%

Research Output

  • 3834 Zitationen
  • 47 Publikationen
Publikationen
  • 2020
    Titel Reviews and syntheses: Heterotrophic fixation of inorganic carbon – significant but invisible flux in global carbon cycling
    DOI 10.5194/bg-2020-465
    Typ Preprint
    Autor Braun A
    Seiten 1-18
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Functional Seasonality of Free-Living and Particle-Associated Prokaryotic Communities in the Coastal Adriatic Sea
    DOI 10.3389/fmicb.2020.584222
    Typ Journal Article
    Autor Steiner P
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 584222
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Highly variable mRNA half-life time within marine bacterial taxa and functional genes
    DOI 10.1111/1462-2920.14737
    Typ Journal Article
    Autor Steiner P
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 3873-3884
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Seasonal dynamics of marine snow-associated and free-living demethylating bacterial communities in the coastal northern Adriatic Sea
    DOI 10.1111/1758-2229.12783
    Typ Journal Article
    Autor Steiner P
    Journal Environmental Microbiology Reports
    Seiten 699-707
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Reviews and syntheses: Heterotrophic fixation of inorganic carbon – significant but invisible flux in environmental carbon cycling
    DOI 10.5194/bg-18-3689-2021
    Typ Journal Article
    Autor Braun A
    Journal Biogeosciences
    Seiten 3689-3700
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Dissolved organic carbon leaching from plastics stimulates microbial activity in the ocean
    DOI 10.1038/s41467-018-03798-5
    Typ Journal Article
    Autor Romera-Castillo C
    Journal Nature Communications
    Seiten 1430
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Development and deployment of a point-source digital inline holographic microscope for the study of plankton and particles to a depth of 6000 m
    DOI 10.4319/lom.2013.11.28
    Typ Journal Article
    Autor Bochdansky A
    Journal Limnology and Oceanography: Methods
    Seiten 28-40
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Thick-shelled, grazer-protected diatoms decouple ocean carbon and silicon cycles in the iron-limited Antarctic Circumpolar Current
    DOI 10.1073/pnas.1309345110
    Typ Journal Article
    Autor Assmy P
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 20633-20638
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Spatial patterns of bacterial and archaeal communities along the Romanche Fracture Zone (tropical Atlantic)
    DOI 10.1111/1574-6941.12142
    Typ Journal Article
    Autor Lekunberri I
    Journal FEMS Microbiology Ecology
    Seiten 537-552
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Response to Comment on “Dilution limits dissolved organic carbon utilization in the deep ocean”
    DOI 10.1126/science.aac7249
    Typ Journal Article
    Autor Arrieta J
    Journal Science
    Seiten 1483-1483
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Fracture zones in the Mid Atlantic Ridge lead to alterations in prokaryotic and viral parameters in deep-water masses
    DOI 10.3389/fmicb.2014.00264
    Typ Journal Article
    Autor Muck S
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 264
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Drivers shaping the diversity and biogeography of total and active bacterial communities in the South China Sea
    DOI 10.1111/mec.12739
    Typ Journal Article
    Autor Zhang Y
    Journal Molecular Ecology
    Seiten 2260-2274
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Potential for Chemolithoautotrophy Among Ubiquitous Bacteria Lineages in the Dark Ocean
    DOI 10.1126/science.1203690
    Typ Journal Article
    Autor Swan B
    Journal Science
    Seiten 1296-1300
  • 2020
    Titel Prokaryotic communities and plastic pollution in the ocean
    DOI 10.25365/thesis.64850
    Typ Other
    Autor Gomes Ribeiro Teixeira Pinto M
    Link Publikation
  • 2017
    Titel SAR202 Genomes from the Dark Ocean Predict Pathways for the Oxidation of Recalcitrant Dissolved Organic Matter
    DOI 10.1128/mbio.00413-17
    Typ Journal Article
    Autor Landry Z
    Journal mBio
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Crustacean zooplankton release copious amounts of dissolved organic matter as taurine in the ocean
    DOI 10.1002/lno.10603
    Typ Journal Article
    Autor Clifford E
    Journal Limnology and Oceanography
    Seiten 2745-2758
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Metagenomic insights into zooplankton-associated bacterial communities
    DOI 10.1111/1462-2920.13944
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 492-505
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Microbial proteins for organic material degradation in the deep ocean
    DOI 10.1073/pnas.1720765115
    Typ Journal Article
    Autor Kirchman D
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 445-447
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Organic matter processing by microbial communities throughout the Atlantic water column as revealed by metaproteomics
    DOI 10.1073/pnas.1708779115
    Typ Journal Article
    Autor Bergauer K
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A device for assessing microbial activity under ambient hydrostatic pressure: The in situ microbial incubator (ISMI)
    DOI 10.1002/lom3.10528
    Typ Journal Article
    Autor Amano C
    Journal Limnology and Oceanography: Methods
    Seiten 69-81
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Limited carbon cycling due to high-pressure effects on the deep-sea microbiome
    DOI 10.1038/s41561-022-01081-3
    Typ Journal Article
    Autor Amano C
    Journal Nature Geoscience
    Seiten 1041-1047
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Taurine Is a Major Carbon and Energy Source for Marine Prokaryotes in the North Atlantic Ocean off the Iberian Peninsula
    DOI 10.1007/s00248-019-01320-y
    Typ Journal Article
    Autor Clifford E
    Journal Microbial Ecology
    Seiten 299-312
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Differential Response of Cafeteria roenbergensis to Different Bacterial and Archaeal Prey Characteristics
    DOI 10.1007/s00248-018-1293-y
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal Microbial Ecology
    Seiten 1-5
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Prokaryotic Life in the Deep Ocean's Water Column
    DOI 10.1146/annurev-marine-032122-115655
    Typ Journal Article
    Autor Herndl G
    Journal Annual Review of Marine Science
    Seiten 461-483
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Microbes mediating the sulfur cycle in the Atlantic Ocean and their link to chemolithoautotrophy
    DOI 10.1111/1462-2920.15759
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 7152-7167
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Impact of hydrostatic pressure on organic carbon cycling of the deep-sea microbiome
    DOI 10.1101/2022.03.31.486587
    Typ Preprint
    Autor Amano C
    Seiten 2022.03.31.486587
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Geographic Distribution of Archaeal Ammonia Oxidizing Ecotypes in the Atlantic Ocean
    DOI 10.3389/fmicb.2016.00077
    Typ Journal Article
    Autor Sintes E
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 77
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Connectivity between surface and deep waters determines prokaryotic diversity in the North Atlantic Deep Water
    DOI 10.1111/1462-2920.13237
    Typ Journal Article
    Autor Frank A
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 2052-2063
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Production and degradation of fluorescent dissolved organic matter in surface waters of the eastern north Atlantic ocean
    DOI 10.1016/j.dsr.2014.11.001
    Typ Journal Article
    Autor Lønborg C
    Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers
    Seiten 28-37
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Dilution limits dissolved organic carbon utilization in the deep ocean
    DOI 10.1126/science.1258955
    Typ Journal Article
    Autor Arrieta J
    Journal Science
    Seiten 331-333
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Links between viruses and prokaryotes throughout the water column along a North Atlantic latitudinal transect
    DOI 10.1038/ismej.2011.214
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1566-1577
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Archaeal amoA gene diversity points to distinct biogeography of ammonia-oxidizing Crenarchaeota in the ocean
    DOI 10.1111/j.1462-2920.2012.02801.x
    Typ Journal Article
    Autor Sintes E
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 1647-1658
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Eukaryotic microbes, principally fungi and labyrinthulomycetes, dominate biomass on bathypelagic marine snow
    DOI 10.1038/ismej.2016.113
    Typ Journal Article
    Autor Bochdansky A
    Journal The ISME Journal
    Seiten 362-373
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Depth Dependent Relationships between Temperature and Ocean Heterotrophic Prokaryotic Production
    DOI 10.3389/fmars.2016.00090
    Typ Journal Article
    Autor Lønborg C
    Journal Frontiers in Marine Science
    Seiten 90
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Dragon kings of the deep sea: marine particles deviate markedly from the common number-size spectrum
    DOI 10.1038/srep22633
    Typ Journal Article
    Autor Bochdansky A
    Journal Scientific Reports
    Seiten 22633
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Prokaryotic Responses to Ammonium and Organic Carbon Reveal Alternative CO2 Fixation Pathways and Importance of Alkaline Phosphatase in the Mesopelagic North Atlantic
    DOI 10.3389/fmicb.2016.01670
    Typ Journal Article
    Autor Baltar F
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 1670
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Erythromycin and GC7 fail as domain-specific inhibitors for bacterial and archaeal activity in the open ocean
    DOI 10.3354/ame01792
    Typ Journal Article
    Autor Frank A
    Journal Aquatic Microbial Ecology
    Seiten 99-110
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Large-scale distribution of microbial and viral populations in the South Atlantic Ocean
    DOI 10.1111/1758-2229.12381
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal Environmental Microbiology Reports
    Seiten 305-315
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Physiological and genomic characterization of two novel marine thaumarchaeal strains indicates niche differentiation
    DOI 10.1038/ismej.2015.200
    Typ Journal Article
    Autor Bayer B
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1051-1063
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Conservation of dissolved organic matter molecular composition during mixing of the deep water masses of the northeast Atlantic Ocean
    DOI 10.1016/j.marchem.2015.06.001
    Typ Journal Article
    Autor Hansman R
    Journal Marine Chemistry
    Seiten 288-297
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Macroecological patterns of archaeal ammonia oxidizers in the Atlantic Ocean
    DOI 10.1111/mec.13365
    Typ Journal Article
    Autor Sintes E
    Journal Molecular Ecology
    Seiten 4931-4942
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Microbial control of the dark end of the biological pump
    DOI 10.1038/ngeo1921
    Typ Journal Article
    Autor Herndl G
    Journal Nature Geoscience
    Seiten 718-724
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Diversity and distribution of microbial eukaryotes in the deep tropical and subtropical North Atlantic Ocean
    DOI 10.1016/j.dsr.2013.04.010
    Typ Journal Article
    Autor Morgan-Smith D
    Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers
    Seiten 58-69
  • 2013
    Titel Abundance and distribution of archaeal acetyl-CoA/propionyl-CoA carboxylase genes indicative for putatively chemoautotrophic Archaea in the tropical Atlantic's interior
    DOI 10.1111/1574-6941.12073
    Typ Journal Article
    Autor Bergauer K
    Journal FEMS Microbiology Ecology
    Seiten 461-473
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Major Effect of Hydrogen Peroxide on Bacterioplankton Metabolism in the Northeast Atlantic
    DOI 10.1371/journal.pone.0061051
    Typ Journal Article
    Autor Baltar F
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Impact of water mass mixing on the biogeochemistry and microbiology of the Northeast Atlantic Deep Water
    DOI 10.1002/2013gb004634
    Typ Journal Article
    Autor Reinthaler T
    Journal Global Biogeochemical Cycles
    Seiten 1151-1162
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Linkage between copepods and bacteria in the North Atlantic Ocean
    DOI 10.3354/ame01696
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal Aquatic Microbial Ecology
    Seiten 215-225
    Link Publikation

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