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Biologisch inspirierte Alkenspaltung - BioZone

Bioinspired alkene cleavage - BioZone

Florian Rudroff (ORCID: 0000-0002-6680-8200)
  • Grant-DOI 10.55776/P33687
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.02.2021
  • Projektende 31.07.2025
  • Bewilligungssumme 399.872 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (20%); Industrielle Biotechnologie (80%)

Keywords

    Fluorescence Activated Droplet Sorting, C=C bond cleaving enzymes, High Throughput Assay, Fragrance And Flavour, Oxygenases

Abstract Endbericht

Das Ziel dieses Projektes ist es, eine biologische (enzym-unterstützte) Methode für die Spaltung von Kohlenstoff/Kohlenstoff Doppelbindungen zu entwickeln, ohne dabei auf das gefährliche Ozon zurückgreifen zu müssen. Die sogenannte Ozonolyse ist eine weit verbreitete Methode für die Herstellung von sogenannten Carbonylverbindungen wie etwa Aromastoffe (Vanillin) oder Duftstoffe (Lilial) und wird hauptsächlich im Labormaßstab verwendet. Der Grund dafür ist die Giftigkeit von Ozon und die Explosionsgefahr der Zwischenprodukte. Letztere haben schon dazu geführt, dass Industriereaktoren explodiert sind. Wir wollen Enzyme, die bei Raumtemperatur, in Wasser und mittels Sauerstoff C=C Doppelbindungen spalten können finden und untersuchen. Dabei verwenden wir ein Hochdurchsatz-Nachweisverfahren, welches spezifisch auf die Detektion von Aldehyden (Carbonylverbindungen) ausgelegt ist, um unterschiedliche Proteinsequenzen auf Ihre Fähigkeit zur Doppelbindungsspaltung zu untersuchen. Dieses Nachweisverfahren ist hoch sensitiv, völlig Struktur unabhängig, einfach in der Handhabung und extrem spezifisch für Aldehyde. Mit diesem Nachweisverfahren und einer speziellen Technik, wird es möglich werden, an einem Tag bis zu einer Million Proteinsequenzen zu untersuchen. Somit gelingt es, in sehr kurzer Zeit bekannte Enzyme auf ihre Substratvielfältigkeit und neue Enzyme auf ihre Aktivität, möglichst quantitativ zu untersuchen. Sobald passende Enzyme identifiziert worden sind, werden wir diese für die Herstellung potentieller neuer Pharmawirkstoffe oder Aromastoffe anwenden.

Das Projekt BioZone hat sich mit der Entwicklung einer umweltfreundlichen Alternative für die Herstellung von Aldehyden aus ungesättigten Kohlenwasserstoffen beschäftigt. Diese "Aldehyde" sind wichtige chemische Verbindungen, die in der Duft- oder Geschmackstoffindustrie Anwendung finden. Ein Beispiel ist Vanille, das gerade in der Weihnachtszeit in keiner Küche fehlen darf. Ein weiteres Beispiel ist Zimtaldehyd, das ebenfalls ein häufig verwendetes Gewürz mit charakteristischem Geruch ist. Die chemische Herstellung dieser Verbindungen ist teuer, beinhaltet oft sehr toxische oder gefährliche Reagenzien und ist nicht sehr effizient. Darum haben wir in diesem Projekt eine Methode entwickelt, die auf Enzymen, sogenannten "Biokatalysatoren", basiert. Dazu haben wir neue Enzyme hergestellt, diese im Labormaßstab getestet und die besten Kandidaten für eine echte industrielle Anwendung weiterentwickelt. Zusätzlich haben wir versucht, einen tieferen Einblick in die Funktion dieses Biokatalysators zu gewinnen. Dazu haben wir das Enzym kristallisiert und so die genaue Struktur aufgeklärt. Mit diesem Wissen haben wir das Enzym weiter verbessert und schließlich in Kombination mit anderen Biokatalysatoren für die Herstellung von Vanille ausgehend von den nachwachsenden Rohstoffen Lignin oder Ferrulsäure verwendet. Somit ist es uns gelungen, eine nachhaltigere Herstellungsmethode für Vanille zu etablieren. Die nächsten Schritte sind nun, diese Methode in den industriellen Kontext zu überführen.

Forschungsstätte(n)
  • Technische Universität Wien - 58%
  • Technische Universität Graz - 42%
Nationale Projektbeteiligte
  • Margit Winkler, Technische Universität Graz , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Oliver Spadiut, Technische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in

Research Output

  • 8 Publikationen
  • 4 Datasets & Models
  • 3 Disseminationen
  • 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Structural and Functional Characteristics of Potent Dioxygenase from Moesziomyces aphidis.
    DOI 10.1021/jacsau.5c00456
    Typ Journal Article
    Autor Plewka J
    Journal JACS Au
    Seiten 3014-3020
  • 2024
    Titel Unlocking the potential of cyanobacteria: a high-throughput strategy for enhancing biocatalytic performance through genetic optimization
    DOI 10.1016/j.tibtech.2024.07.011
    Typ Journal Article
    Autor Jodlbauer J
    Journal Trends in Biotechnology
  • 2024
    Titel Harnessing nature's catalysts: Advances in enzymatic alkene cleavage.
    DOI 10.1016/j.jbiotec.2024.09.020
    Typ Journal Article
    Autor Schiefer A
    Journal Journal of biotechnology
    Seiten 189-204
  • 2024
    Titel Nature stays natural: two novel chemo-enzymatic one-pot cascades for the synthesis of fragrance and flavor aldehydes.
    DOI 10.1039/d3gc04191c
    Typ Journal Article
    Autor Giparakis S
    Journal Green chemistry : an international journal and green chemistry resource : GC
    Seiten 1338-1344
  • 2023
    Titel Enlightening the Path to Protein Engineering: Chemoselective Turn-On Probes for High-Throughput Screening of Enzymatic Activity.
    DOI 10.1021/acs.chemrev.2c00304
    Typ Journal Article
    Autor Hecko S
    Journal Chemical reviews
    Seiten 2832-2901
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Enzymatic reactions towards aldehydes: An overview.
    DOI 10.1002/ffj.3739
    Typ Journal Article
    Autor Dobiašová H
    Journal Flavour and fragrance journal
    Seiten 221-242
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Co-enzyme-free, enzymatic synthesis of aldehydes from renewable resources with a new and highly efficient alkene cleaving dioxygenase.
    DOI 10.1039/d5gc01848j
    Typ Journal Article
    Autor Schiefer A
    Journal Green chemistry : an international journal and green chemistry resource : GC
    Seiten 10234-10241
  • 2025
    Titel Discovery, Characterisation and Engineering of a Novel Oxygenase as an Enzymatic Alternative to Ozonolysis for Generating Aldehydes from Alkenes
    Typ PhD Thesis
    Autor Lukas Schober
Datasets & Models
  • 2025 Link
    Titel pdb9G8A Crystal structure of Carotenoid cleavage oxygenase from Moesziomyces aphidis bound to p-hydroxybenzaldehyde
    DOI 10.2210/pdb9g8a/pdb
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2025 Link
    Titel pdb 9G89 Crystal Structure of Carotenoid cleavage oxygenase from Moesziomyces aphidis bound to vanillin
    DOI 10.2210/pdb9g89/pdb
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2025 Link
    Titel pdb 9G8F Crystal Structure of Carotenoid cleavage oxygenase from Moesziomyces aphidis bound to orto vanillin
    DOI 10.2210/pdb9g8f/pdb
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2025 Link
    Titel pdb 9G88 Crystal Structure of Carotenoid cleavage oxygenase from Moesziomyces aphidis bound to acetate
    DOI 10.2210/pdb9g88/pdb
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 2024
    Titel Lange Nacht der Forschung 2024
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2023
    Titel European Researchers Night
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2025 Link
    Titel European Researchers Night
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2025
    Titel Lecture at Gordon Research Conference Biomass to Biobased Chemicals and Materials
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2024
    Titel Keynot at 34th Annual meeting of the Catalysis Society of South Africa (CATSA)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2026
    Titel machinE LEarning for inteGrated multi-parAmetric eNzyme and bioproCess dEsign
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2026
    Geldgeber Technical University of Denmark

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